苏州大学医学院周哲敏教授为中国疾控中心作学术报告
2023年12月13日，应中国疾控中心传染病所的邀请，苏州大学医学院周哲敏教授作了题为“基于遗传大数据的流行病主动防御技术研究”的科技学术报告，重点是微生物群体遗传学、生物信息学及微生物组学等领域的最新成果和创新方法，中心总部和相关直属单位的科研人员、研究生等参加学术活动。 周教授长期从事微生物群体遗传学、生物信息学及微生物组学研究，建立了多种重要食源性疾病病原体基因组分型（cgMLST）及暴发溯源体系，创立了全球最大的基因组分型数据库——EnteroBase。提出了新研发的分布式全基因组分型方案（dcgMLST），该方案可以在不需要中央数据库的情况下进行快速、准确和高效的菌株鉴定和分类。他以奈瑟氏菌、肺炎克雷伯菌、沙门氏菌等为例，展示了这些病原体在百年内发生变化和演化的规律，提出流行菌株之间存在着共同进化模式，并揭示了现代富集养殖对于菌株耐药水平升高及快速远距离传播的影响。 周教授还介绍了基于“超保守单拷贝基因（USC......阅读全文
迄今最久微生物基因组草图出炉
英国《自然》杂志日前在线发表的一项演化学研究报告，近乎完整地构建出了一种口腔细菌的基因组，这个有48000年历史的微生物的基因组，是迄今为止历史最悠久的微生物基因组草图，研究同时揭示了尼安德特人的饮食结构。 尼安德特人的DNA序列和现代人类的DNA序列非常相似。他们是现代欧洲人祖先的近亲，从1
质疑：肥胖真的与微生物组有关么？
我们体内生活着不计其数的微生物，它们组成的生态系统就是微生物组。近几年人们发现微生物组对人体健康有着重要的影响，微生物组研究因此受到了极大的重视，甚至被称为是人体的“第二基因组”。 研究者们普遍认为微生物组参与了许多重要的生理活动，比如消化食物、合成营养物质和抵御疾病。包括肥胖在内的许多人类疾
微生物组影响免疫反应复杂化
这项研究今天发表在Journal of Clinical Investigation该研究还表明，这种抗微生物免疫反应可以由免疫细胞对之前与细菌接触的记忆触发，这进一步复杂化了身体接受救命新器官的能力。“以前，我们认为人类器官移植比受保护的实验室动物更不容易被接受的原因是，人类可以在器官细胞上产生交
北京生科院提出微生物组解析新技术
1月23日，国际学术期刊《自然-通讯》（Nature Communications）在线发表了中国科学院北京生命科学研究院计算基因组学实验室赵方庆团队题为MetaSort untangles metagenome assembly by reducing microbial community
Gastroenterology：微生物组与肠癌发生的关系
最近，根据来自George Washington大学研究者们在《Gastroenterology》杂志上发表的一项新研究，患有结肠癌的患者体内的一种蛋白突变体阻断了调节细胞增殖和扩张的信号通路，从而增加了促进结肠癌发展的肠道微生物种群，这最终导致肠癌恶化的后果。这些发现表明了微生物组中细菌与结肠
The－Scientist：肺部微生物组决定你的健康
近年来，肺部微生物组对呼吸道健康的重要性逐渐受到了科学家们的重视。The Scientist杂志特别撰文介绍了这一领域的最新进展。 如果将人类的消化系统看作是从口腔延伸至胃和肠道的一条河流，那么肺就是河流旁的湖泊，常常被湍急的水流波及，密歇根大学的Gary Huffnagle说。Huffnag
免疫球蛋白－影响肠道微生物组
IgA（免疫球蛋白A）是最丰富的黏膜抗体，动物模型实验表明它可以强化肠道屏障，防止危险细菌破坏宿主。然而，缺乏特异性IgA的人通常只有轻微的症状。法国巴黎免疫与疾病研究中心珍妮·法德拉等科学家，比较了健康个体与缺乏IgA个体的粪便微生物组，发现在缺乏IgA的不同患者中，不同属的细菌占不同的主导地
生殖健康方向微生物组研究进展
近年来，微生物组学的研究提升了关于身体各部位共生微生物的认识。中国科学院北京生命科学研究院研究员赵方庆团队发现微生物组学或进一步拓展对女性生理和生殖健康方面的认识，并有助于提升治疗水平。 作为人体最主要的菌库之一，阴道菌群及其对女性生理和生殖健康的作用显而易见。作为“生命摇篮”的宫腔像一个黑箱
抗生素干扰婴儿肠道微生物组
在我们的肠道里，生活着许多微生物群落，它们在调控机体代谢和免疫防御功能上起着关键作用。这些微生物群落的集合被称为肠道微生物组。美国《科学转化医学》杂志6月15日发表的研究结果显示，使用抗生素会降低婴儿肠道微生物组的多样性和稳定性。 在世界大部分地区，对患病婴幼儿用抗生素治疗已成常规做法，美国孩
科学家在酿酒酵母生态和群体遗传学研究方面取得新进展
在发酵工业中广为应用的酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)，也是一种在生命科学研究中常用的模式生物。由于其较清晰的遗传背景、相对较小的基因组、完善的基因组和功能基因组学研究积累、明确的有性生殖循环等优势，除分子生物学领域外，正在成为比较与进化基因组学、生物地理学、群体
生物信息学在人类基因组计划中的应用
生物信息学是当前生物学领域的研究热点，预计在未来的若干年它将变得越来越重要、越来越引起人们的重视。近期任务由于未来几年蛋白质和核酸的测序数据将以指数方式增加，近期生物信息学将在以下几方面迅速发展：大规模基因组测序中的信息分析大规模测序是基因组研究的最基本任务，它的每一个环节都与信息分析紧密相关。目前
癌遗传学
Serial Analysis of Gene Expression (SAGE) SAGE is a powerful tool that allows the analysis of overall gene expression patterns with digital analysis.
融智生物发布全球首个商用化生物组学微生物质谱数据库
近日，融智生物宣布建设完成基于全新生物组学理念的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商品化生物组学微生物质谱数据库。 传统上，基于不同的细菌或真菌内蛋白组成分特别是核糖体蛋白有显著的差异，对核糖体蛋白组的质谱测试，可用于快速、高准确度鉴定微生物。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TO
中科院微生物所等在油棕基因组学研究获进展
中科院微生物所叶健课题组与中科院外籍院士、美国洛克菲勒大学教授蔡南海和新加坡淡马锡生命科学研究院教授岳根华等人合作，完成了高产母本厚壳Dura基因组的高质量的序列测定和多个种质资源的基因组重测序以及进化分析。研究为油棕分子辅助育种和基因组编辑抗性育种工作奠定了坚实基础，对日趋竞争激烈的全球食用
微生物学技术:微生物的分离纯化及稀释平板菌落计数
实验原理稀释平板测数是根据微生物在高度稀释条件下固体培养基上所形成的单个菌落是由一个单细胞繁殖而成这一培养特征设计的计数方法，即一个菌落代表一个单细胞。计数时，首先将待测样品制成均匀的繁殖稀释液，尽量使样品中的微生物细胞分散开，使其成单个细胞存在，否则一个菌落就不只是代表一个细胞，再取一定稀释度、一
上海交通大学权威期刊最新综述介绍微生物群体调控机制
上海交通大学微生物代谢国家重点实验室、生命科学技术学院何亚文团队周莲副研究员以第一作者在国际微生物领域综述期刊《微生物学进展》(Trends In Microbiology, 2015年影响因子9.5)上发表了最新综述论文。文章针对农作物病原黄单胞菌的群体感应调控机制，全面系统地总结了DSF-家
微生物所在链霉菌群体感应信号合成调控方面取得新进展
细菌能自发产生、释放一些特定的信号分子，并能感知其浓度变化，调节微生物的群体行为，这一调控系统称为群体感应(quorum sensing，QS)。细菌群体感应在细菌和宿主之间的相互作用中起着重要的调控作用。 在链霉菌中，γ-丁酸内酯(gamma-butyrolactone) 类群体
基因测序产业百家争鸣－测序仪器市场被欧美垄断
基因测序全产业链划分为上游的测序仪器与试剂耗材市场，中游的基因测序服务市场和下游的生物信息学分析市场。中下游市场面向群体包括医院、药厂、科研机构以及消费者等，医疗领域可分为医疗和非医疗两个领域。人体基因组和人体微生物基因组两个子领域。针对人体基因组的主要产品有肿瘤学（诊断筛查与治疗、靶向用药、伴
基因测序：上游三四代技术是趋势，下游样本积累是关键
基因测序全产业链划分为上游的测序仪器与试剂耗材市场，中游的基因测序服务市场和下游的生物信息学分析市场。中下游市场面向群体包括医院、药厂、科研机构以及消费者等，可分为医疗和非医疗两个领域。 医疗领域可分为人体基因组和人体微生物基因组两个子领域。针对人体基因组的主要产品有肿瘤学（诊断筛查与治疗、靶
浙江大学构建叶际微生物组精准设计策略
叶际是地球上最大的生物表面，也为功能微生物提供了广阔的栖息地。高效挖掘和发现抵御植物病害的叶际微生物组，不仅为植物抗病性丧失治理提供潜在方案，也对保障我国粮食安全生产和可持续发展具有重要意义。然而，目前对于叶际微生物群落组装机制和功能方面的理解仍不充分，这极大限制了抗病叶际微生物组的精准设计及其在农
后微生物组时代－首次发现人体特有的病毒组
我们人体中的病毒会影响微生物群体的结构和行为，但是关于身体许多区域的噬菌体，也就是感染细菌的病毒，科学家们所知甚少。近期一组研究人员发现，在膀胱中整合进细菌基因组的是噬菌体要比细菌本身多得多，这项出乎人意料的研究发现公布在1月29日的the Journal of Bacteriology杂志上。
生物信息学技术的技术原理
生物信息学在生命科学研究中起着越来越重要的作用。利用生物信息学对蛋白质组的各种数据进行处理和分析，也是蛋白质组研究的重要内容。生物信息学是蛋白质组学研究中不可缺少的一部分。生物信息学的发展，已不仅是单纯的对基因组、蛋白质组数据的分析，而且可以对已知的或新的基因产物进行全面分析。在蛋白质组数据库中储存
生物信息学—促动BT与IT双赢
无论是与结构基因组学对应的“基因时代”，还是与功能基因组学、蛋白质组学相应的“后基因时代”；无论你称呼21世纪是“信息时代”、“后信息时代”，还是“生物时代”，所有这一切，都将BT(生物技术)与IT(信息技术)紧密结合起来。而这其中，无疑“生物信息学”占据了天时地利、出尽了风头，虽然它自身及其相
微生物学检验基本问题
一、现代感染性疾病在病原学上有哪些特点?在医学高度发展，新的抗菌药物不断涌现的今天，感染性疾病的发病率和病死率仍然居高不下。主要原因之一是当代的感染性疾病，在病原上发生了较大的变化，形成了现代感染性疾病在病原学上的新特点，它们是：1、以条件致病菌为主：很多低致病、弱毒的细菌，在外环境、人体体表以及
微生物学的直接镜检
微生物学的直接镜检是检验主管技师考试辅导的部分内容，以下是医学教育网对这块内容的整理，希望对考生有所帮助： 1.初步诊断； 2.指导进一步检出步骤和鉴定方法的选择； 3.评价标本的质量。
微生物学机制解决农耕保护
中国农业科学院草原研究所草地土壤健康评价与功能提升研究创新团队联合比利时根特大学环境学院和荷兰瓦赫宁根大学植物科学学院，共同开展了长达21年的不同耕作措施下作物—土壤养分—土壤微生物互作效应的研究。近日，他们揭示了长期保护性耕作促进作物生长的微生物学机制，相关研究成果发表在《植物与土壤》（Plant
酶标仪在微生物学的应用
蛋白浓度，细菌浓度等。
痢疾杆菌微生物学诊断
（一）标本在用药前取粪便的脓血或粘液部分，标本不能混有尿液。如不能及时送检，应将标本保存于30%甘油缓冲盐水或增菌培养液中。中毒性菌痢可取肛门拭子检查。（二）分离培养与鉴定接种肠道杆菌选择性培养基，37℃孵育18～24小时，挑取无色半透明的可疑菌落，作生化反应和血清学凝集试验，确定菌群和菌型。如遇非
微生物学检验染色标本检查
细菌标本经染色后，由于细菌与周围环境间在颜色上形成鲜明对比，故在普通光学显微镜下可清楚地观察到细菌的形态特征（如细菌的大小、形状、排列等）和某些特殊结构（如荚膜、鞭毛、芽孢等），并可根据染色反应性对细菌加以分类鉴定。（一）细菌染色的一般程序 细菌染色的一般程序是：涂片（干燥）—固定—染色（媒染）—
炭疽杆菌微生物学检查方法
收集皮肤炭疽的脓液、渗出物，吸入性炭疽的咯痰，肠炭疽的粪便以及病人的的血液等送检，兽尸禁止解剖，可割取耳朵或舌尖一片送检。将标本直接涂片，沙黄荚膜染色镜检，观察形态及荚膜特征，可以初步帮助诊断，确诊应进行血平板分离培养，37℃孵育12～15小时，钩取可疑菌落，进行青霉素串珠试验，噬菌体裂解试验，碳酸