单细胞多组学整合技术有了新突破

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516674.shtm近日,军事科学院军事医学研究院应晓敏团队在国际著名学术期刊《自然·生物技术》以Article类长文形式在线发表重大原创研究成果。该团队自主研发的用于单细胞多组学数据马赛克整合的人工智能算法取得新突破。细胞是生物体内发挥功能的基本结构单元。单细胞测序技术是近年来生命科学领域的突破性技术,能够检测单个细胞内的多种遗传物质与功能分子,有助于更加深入地理解细胞功能,探索生命发育和疾病发生等机制。然而,不同组学组合、不同测序技术、不同测序样本的“马赛克”式单细胞数据的整合是巨大的挑战。 为此,应晓敏团队自主研发了基于生成式人工智能的新算法,在国际上首次实现了通用的单细胞多组学马赛克数据的模态对齐、数据补全、批次校正等整合功能,为构建大规模多组学细胞图谱、实现大规模单细胞多组学分析与知识迁移......阅读全文

水稻多器官单细胞多组学图谱问世

  记者杨舒从中国农业科学院生物技术研究所获悉,该所作物耐逆性调控与改良创新团队日前联合国内外研究机构,构建了首个水稻的多器官单细胞多组学图谱,系统解析了水稻不同细胞类型的功能及其对复杂性状的调控作用,有力助力水稻设计育种。相关研究成果近日发表在国际学术期刊《自然》上。  单细胞组学是近年来生命科学

单细胞多组学高通量测序平台(一)

一单细胞多组学高通量测序技术简介通过测序手段检测细胞多层次信息,如基因组、表观组、转录组甚至蛋白组已经成为生物学研究的重要手段。几乎一切生命体的活动都围绕着DNA->RNA->蛋白质的过程,而现有的组学技术也围绕这一过程获取信息(如DNA层面的基因序列),从而解读生物体运行机制,应用于疾病的诊断和治

单细胞多组学高通量测序平台(二)

虽然single-cell sequencing的方法仍在不断推出,但是目前使用最为广泛、商业化成熟的方法仍是10×Genomics公司推出的ChromiumTM系统。1.2以RNA-seq为例介绍高通量单细胞测序技术单细胞测序的最主要难点是如何在短时间内分离得到最可能多的单个细胞,早期的技术代表F

我国科学家自主研发,单细胞多组学整合技术有了新突破

  近日,军事科学院军事医学研究院应晓敏团队在国际著名学术期刊《自然·生物技术》以Article类长文形式在线发表重大原创研究成果。该团队自主研发的用于单细胞多组学数据马赛克整合的人工智能算法取得新突破。  细胞是生物体内发挥功能的基本结构单元。单细胞测序技术是近年来生命科学领域的突破性技术,能够检

单细胞多组学整合技术有了新突破

近日,军事科学院军事医学研究院应晓敏团队在国际著名学术期刊《自然·生物技术》以Article类长文形式在线发表重大原创研究成果。该团队自主研发的用于单细胞多组学数据马赛克整合的人工智能算法取得新突破。细胞是生物体内发挥功能的基本结构单元。单细胞测序技术是近年来生命科学领域的突破性技术,能够检测单个细

单细胞多组学整合技术有了新突破

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516674.shtm近日,军事科学院军事医学研究院应晓敏团队在国际著名学术期刊《自然·生物技术》以Article类长文形式在线发表重大原创研究成果。该团队自主研发的用于单细胞多组学数据马赛克整合的人工智能

如何选择技术方法来进行单细胞多组学研究

现阶段,科学家们已经开始以单细胞分辨率组合多层信息。这些“多组学”技术可以更仔细地观察细胞之间的可变性,更清楚地识别特定细胞及其功能。分析基因组DNA揭示了单细胞基因组,甲基化组织或染色质,而分析RNA和蛋白质则能分别产生转录组和蛋白质组数据。如何做出选择有了这么多种的检测方法可供选择,研究人员还需

犬科动物多组学资源库iDog-2.0建立

近日,国家生物信息中心研究员赵文明团队与昆明动物研究所副研究员柳延虎团队合作,发布犬科动物多组学资源库iDog 2.0,提供了更加全面的多组学数据资源及更加丰富的在线分析工具,为全球犬类研究者提供更高质量的数据服务。家犬是自然界中种内遗传多样性最为丰富的物种之一,也是研究人类遗传性疾病的重要动物模型

解密十大军事生物技术

  美国国防部本月2日宣布新成立“生物技术办公室”,开启新国防之门以来,生物技术在军事上的应用再一次引起大众的关注。   本文盘点了10大生物技术在军事国防上的应用。10大生物技术   一、基因武器   基因武器是指运用遗传工程技术,在一些致病细菌或病毒中,接入能对抗普通疫苗或药物的基因,产生

-解密十大军事生物技术

  美国国防部本月2日宣布新成立“生物技术办公室”,开启新国防之门以来,生物技术在军事上的应用再一次引起大众的关注。   本文盘点了10大生物技术在军事国防上的应用。  一、基因武器   基因武器是指运用遗传工程技术,在一些致病细菌或病毒中,接入能对抗普通疫苗或药物的基因,产生具有显著抗药性的致

大咖云集,共襄单细胞多组学及空间组学线上峰会

  2009年,第一篇单细胞mRNA测序的文章的发表,标志着单细胞转录组测序的时代正式来临。2013年,单细胞测序技术被《Nature Methods》评为年度技术。同年,《Science》将单细胞测序列为年度最值得关注的六大领域榜首,认为该技术将改变生物界和医学界的许多领域。  目前,基于单细胞技

大咖云集,共襄单细胞多组学及空间组学线上峰会

  2009年,第一篇单细胞mRNA测序的文章的发表,标志着单细胞转录组测序的时代正式来临。2013年,单细胞测序技术被《Nature Methods》评为年度技术。同年,《Science》将单细胞测序列为年度最值得关注的六大领域榜首,认为该技术将改变生物界和医学界的许多领域。  目前,基于单细胞技

碧迪医疗与NanoString战略合作,推动单细胞空间多组学

2022年12月1日,上海——今日,全球领先的医疗技术公司碧迪医疗与全球空间生物学的先锋NanoString联合宣布,将在单细胞空间多组学领域开启战略合作,结合双方优势,为国内基础科研、临床研究和生物医药研发提供一站式的技术工具和服务。此次合作将把国际领先的单细胞多组学和空间组学技术相结合,着眼于面

Cell-Res重点论文:单细胞表观多组学测序技术最新突破

  2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

Cell-Res重点论文:单细胞表观多组学测序技术最新突破

  2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

《自然》盘点2022年科学事件

从俄乌冲突,到用人工智能预测蛋白质结构,再到将猪器官移植到人体内,日前,《自然》杂志盘点了2022年科学界的决定性时刻。俄乌冲突 今年2月俄乌冲突爆发,导致许多研究机构切断了与俄罗斯的联系,停止了资助和合作。 俄乌冲突还影响了太空和气候科学的研究,扰乱了实地考察,并在全球能源危机中扮演了重要

《自然》预测2023年科学大事

技术人员正在薇拉·鲁宾天文台安装光纤电缆,该天文台将于2023年拍摄第一批图像。图片来源:H Stockebrand/Rubin Obs/NSF/AURA 登月、mRNA疫苗和气候基金等可能是2023年重点研究的发展方向。近日,《自然》杂志盘点了未来一年值得关注的科学事件。新一代疫苗

《自然》预测2018年科学“大事”

  新一年科学界有什么值得我们关注的事情?从各国耗资巨大的太空任务到基因编辑,英国《自然》杂志1月2日选出了多项可能会在2018年给科学界带来影响的事件。  宇宙数据  当加拿大的氢强度测绘实验(CHIME)在今年开始全面运作后,快速射电爆发可能就不再那么神秘了。天文学家希望每天都能使用CHIME观

聚焦单细胞多组学-布鲁克宣布以1亿美元现金收购Phenomex

  马萨诸塞州比勒里卡和加利福尼亚州埃默里维尔--(美国商业资讯)--布鲁克公司(纳斯达克股票代码:BRKR)和PhenomeX Inc.(纳斯达克股票代码:CELL)今天宣布,他们已签署最终协议,布鲁克将以每股1.00美元的价格以全现金交易收购PhenomeX。拟议的收购对PhenomeX的总股权

推动学术交流-共话领域未来|首届单细胞多组学分析技术及应用会议通知

  单细胞多组学是指利用高通量测序技术,从基因组、转录组、表观遗传组、蛋白质组、代谢组等多个层面,对单个细胞进行全面的分析,揭示细胞的异质性、功能和相互作用。单细胞多组学技术在癌症、免疫、神经、发育、微生物等领域具有广泛的应用前景,是生命科学研究的前沿领域之一。  为了促进单细胞多组学领域的学术交流

《自然》预测2017年科学热点领域

  《自然》杂志日前对2017年全球热点科学领域进行了预测。  气候变化  如果美国新当选总统唐纳德·特朗普像他承诺的那样取消该国的气候承诺,那么中国将带头缓解全球气候变化。中国限制温室气体排放的国家限额交易系统将在2017年推出。过去3年里,全球碳排放已经达到平衡,得益于经济停滞以及绿色技术激增,

2023(第六届)单细胞多组学研究与临床应用峰会

  为响应我国加大发展前沿生物技术创新发展的政策号召,生物谷、梅斯医学联合有关单位将于2023年9月14-15日举办“2023(第六届)单细胞多组学研究与临床应用峰会”。  本次大会诚邀临床应用科学家、科研人员及企业研究人员共同探索单细胞多组学的技术发展前景,助力单细胞多组学技术快速进入临床应用,推

北京基因组所开发新型高通量单细胞多组学新技术

  单细胞测序已成为生物医学领域的关键共性技术。然而,由于缺乏高效的手段降低“假单细胞率”,主流微流控平台的单通道细胞通量通常在1万细胞以下,空载率达到90%以上,且成本高昂,限制了对数百万个细胞或上千例样本的人群队列进行大规模研究。  近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)蒋岚研究组

单细胞多组学测序公司Mission-Bio获7千万美元C轮融资

总部位于加州的美国基因诊断初创公司Mission Bio宣布已经获得了新一轮7000万美元的C轮融资,由Novo Growth领投,Soleus Capital和现有投资者Mayfield、Cota和Agilent跟投。历经三次融资,目前该公司共融得1.2亿美元。Mission Bio成立于2012

《自然》预测2013年科学进展与事件

  大型地下氙探测器正在寻找暗物质。 NASA计划向火星发射MAVEN探测器,目的是对火星上层大气展开研究。   新年伊始,《自然》杂志展望了2013年可能出现的一些重要发现和重大事件。   干细胞试验   一项利用人类胚胎干细胞(hESC)进行的早期临床试验应该在2013年产生具有里程碑意

Webinar单细胞和空间多组学微流控样品制备和质谱分析

2022年CASMS系列网络研讨会——推进单细胞和空间多组学微流控样品制备和质谱分析美国东部时间2022年8月18日12:00-13:00北京时间2022年8月19日0:00-1:00注册链接:https://casms.org/index.php/webinar演讲者      单细胞蛋白

全球首个奶牛多组织单细胞表达图谱诞生

中国农业大学动物科学技术学院教授孙东晓团队构建了覆盖奶牛59种组织、179万个细胞的多组织单细胞表达图谱,为解析牛重要性状遗传调控机制、推进精准育种及探索人类疾病的牛模型研究提供了重要资源。9月5日,相关研究成果发表于《自然-遗传》。作为人类最早驯化的家畜之一,奶牛在全球粮食安全与农业生态系统中占据

北大汤富酬课题组发表单细胞表观多组学测序技术新成果

  2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

研究提出单细胞多组学新方法实现胰腺癌循环肿瘤细胞多维度解析

近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员林达等报道了新开发的单细胞多组学技术——Uni-C。该方法可在一个细胞中同时解析基因组大尺度结构变异(如SV、CNV、ecDNA)、小尺度突变(SNP/INDEL)及染色质三维构象,实现高分辨率、多维度的联合分析。胰腺癌异质性强、进展迅速,临床面临早筛困

测序技术再现新进展,已开发基于单分子测序平台的单细胞多组学测序技术

  单细胞多组学测序技术是指对一个单细胞同时检测多个组学层面(例如基因组、表观基因组和转录组)的测序技术。这类技术可以更系统、全面地探索细胞异质性以及同一个细胞内的不同组学层面之间的互动关系,有利于更深入地解析复杂的生理、病理过程中细胞类型特异性的分子调控机制1, 2。2019年,Nature Me