科研人员利用大语言模型解释调节睡眠的分子机制

华中科技大学生命学院张珞颖团队和薛宇团队在Nature Communications杂志上合作发表了题为“Large-language models facilitate discovery of the molecular signatures regulating sleep and activity”的研究论文,利用大型语言模型G PT-3.5与提示词工程技术,结合基于多目标视频追踪的果蝇表型定量装置,对果蝇基因组进行系统解释与功能筛选,预测并验证了758个果蝇基因参与调控群体/个体睡眠和活动。尤其是使用基于思维链提示方法的机器推理,发现了仅在同伴存在情况下发挥睡眠调节功能的mre 11基因,揭示了MRE11可能通过调节多巴胺信号通路而影响睡眠、运动和社交活动。 因此,本项工作通过利用大型语言模型生成的上下文信息进行计算解释和推理,结合使用多目标视频跟踪范式进行基因筛选,系统揭示了调节睡眠、运动和社交活动的分子机制。在自然......阅读全文

华大基因发布大语言模型驱动新方法,助力罕见病精准防控

  人工智能(AI)技术随着科技的飞速发展已广泛渗透至多个领域。在生命健康层面,AI凭借其独特优势在推动基因组医学的创新发展中扮演着重要角色,尤其是在罕见遗传疾病诊断中展现出了巨大的潜力。然而,利用基因测序技术对海量的基因组变异进行大规模、高效精准的致病因素识别,仍然是一个挑战。因此,基于基因检测大

调节植物响应光周期开花的分子机制阐明

  无论对被子植物还是对动物来说,植物开花时间调控的重要性不言而喻,但在这个过程中仍存在诸多未解之谜。中科院昆明植物研究所研究人员与上海大学合作,最新阐明了植物通过协调一氧化碳的活性与稳定性以调节开花时间的分子机制。  植物响应季节变化的开花时间,通常是通过植物对日照长度变化的感知来完成的。在基因高

研究揭示特殊蛋白调节肿瘤生长的分子机制

  免疫检查点是癌细胞表面的特殊蛋白,其能被癌细胞用来躲避宿主机体的免疫反应,这些表面蛋白对于癌细胞的生长非常重要,靶向作用这些蛋白的药物能够彻底改变多种癌症患者的治疗,而阐明降解这些免疫检查点的机制或能帮助宿主机体免疫系统来杀灭癌细胞。  图片来源:CC0 Public Domain  近日,一项

什么是Gs调节模型?

G蛋白受体的一种模型。当细胞没有受到激素刺激,Gs处于非活化态,α亚基与GDP结合,;当激素配体与Rs结合后,导致Rs构象改变,使激素-受体复合物与Gs结合,Gs的α亚基构象改变,结合GTP而活化。

科研人员开发出RNA基础语言模型

  在真核生物中,RNA转录、剪接、翻译和降解等生物学过程受到顺式调控元件、RNA结构和反式作用因子的调控。解析RNA多层次调控,对研究基因表达分子机制和设计RNA药物具有重要意义。但是,由于调控复杂和数据量不足,构建RNA调控的预测模型面临挑战。  近日,中国科学院上海营养与健康研究所研究员张国庆

研究揭示拟南芥孤儿基因调节花粉发育的分子机制

开花植物中,花粉的形成以及随后的花粉管生长和受精在植物的育性中具有关键作用。花粉的适当发育和成熟对种子植物的遗传多样性具有重要影响,对农业作物生产产生重要作用。植物中孤儿基因的出现可能是植物不断适应环境的进化结果,其功能可能促进植物的生存。近年来,拟南芥特异性孤儿基因Qua Quine Starch

植物细胞:月季响应乙烯调节花朵开放的分子机制

   近日,中国农业大学园艺学院教授高俊平和马男团队在《植物细胞》杂志上在线发表最新研究论文。该研究揭示了月季响应乙烯调节花朵开放的分子机制。  花朵是被子植物的繁殖器官。花朵开放是花瓣展开、暴露出雌雄蕊的生物学过程,对于完成授粉和繁育后代至关重要。花朵开放也是花卉观赏品质形成的过程,直接决定了花卉

人工智能新模型可解码DNA隐藏“语言”

DNA包含了维持生命所需的基础信息。理解这些信息是如何存储和组织的,一直是20世纪最大的科学挑战之一。现在,借助GROVER这一基于人类DNA训练的新型大型语言模型,研究人员有望解码基因组中隐藏的复杂信息。GROVER由德国德累斯顿工业大学生物技术中心开发,它将人类DNA视为文本,通过学习其规则和上

我国学者提出用好大语言模型实用策略

当前,大语言模型的应用日益广泛,覆盖从文本生成到复杂问题解决等多个领域,如何更好利用AI工具?记者10日从中国科学技术大学获悉,该校心理学系林志成特任研究员近日在其评论文章中研究提出一项实用策略,帮助更好理解和利用先进的人工智能工具,有效发挥人工智能模型交互的最大潜力。在《自然人类行为》(Natur

人工智能新模型可解码DNA隐藏“语言”

DNA包含了维持生命所需的基础信息。理解这些信息是如何存储和组织的,一直是20世纪最大的科学挑战之一。现在,借助GROVER这一基于人类DNA训练的新型大型语言模型,研究人员有望解码基因组中隐藏的复杂信息。GROVER由德国德累斯顿工业大学生物技术中心开发,它将人类DNA视为文本,通过学习其规则和上

我国学者提出用好大语言模型实用策略

中新网合肥5月10日电 (记者 吴兰)当前,大语言模型的应用日益广泛,覆盖从文本生成到复杂问题解决等多个领域,如何更好利用AI工具?记者10日从中国科学技术大学获悉,该校心理学系林志成特任研究员近日在其评论文章中研究提出一项实用策略,帮助更好理解和利用先进的人工智能工具,有效发挥人工智能模型交互的最

人工智能新模型可解码DNA隐藏“语言”

DNA包含了维持生命所需的基础信息。理解这些信息是如何存储和组织的,一直是20世纪最大的科学挑战之一。现在,借助GROVER这一基于人类DNA训练的新型大型语言模型,研究人员有望解码基因组中隐藏的复杂信息。GROVER由德国德累斯顿工业大学生物技术中心开发,它将人类DNA视为文本,通过学习其规则和上

人工智能新模型可解码DNA隐藏“语言”

  DNA包含了维持生命所需的基础信息。理解这些信息是如何存储和组织的,一直是20世纪最大的科学挑战之一。现在,借助GROVER这一基于人类DNA训练的新型大型语言模型,研究人员有望解码基因组中隐藏的复杂信息。GROVER由德国德累斯顿工业大学生物技术中心开发,它将人类DNA视为文本,通过学习其规则

人工智能新模型可解码DNA隐藏“语言”

科技日报北京8月6日电 (记者张佳欣)DNA包含了维持生命所需的基础信息。理解这些信息是如何存储和组织的,一直是20世纪最大的科学挑战之一。现在,借助GROVER这一基于人类DNA训练的新型大型语言模型,研究人员有望解码基因组中隐藏的复杂信息。GROVER由德国德累斯顿工业大学生物技术中心开发,它将

探索小分子RNA-OsmiR393调节水稻分蘖、耐旱的分子机制

华南植物园探索小分子RNA OsmiR393调节水稻分蘖、耐旱的分子机制        小分子RNA(MicroRNA)是一类内源非编码的单链小分子RNA(21~24nt),以序列特异性的方式在转录、转录后和翻译水平上对靶基因表达进行调控,是生物体内基因表达自我调控的一种重要手段。miR3

有关生命起源的分子语言成功重建

加拿大蒙特利尔大学科学家开创性地重建了生命起源的两种分子语言,并进行了数学验证。《美国化学会志》最新发表的这一突破,为纳米技术的发展打开了新的大门,其应用范围包括生物传感、药物输送和分子成像。人们可以把生物体看成由数十亿个纳米机器和纳米结构所组成的,这些纳米机器和结构之间的通信,能创建移动、思考、生

睡眠中调节脑波可增强或削弱记忆

一个国际科研团队发现,在实验鼠睡眠过程中调节其丘脑部位特定脑波的数量,可以增强或削弱记忆。这有助于理解睡眠与长期记忆形成过程之间的关系,记忆力不足的患者可能会从中受益。 这项成果是韩国基础科学研究所和德国蒂宾根大学的研究人员取得的,论文发表在新一期美国《神经元》杂志上。 与人类一样,实验鼠的

睡眠中调节脑波可增强或削弱记忆

  一个国际科研团队发现,在实验鼠睡眠过程中调节其丘脑部位特定脑波的数量,可以增强或削弱记忆。这有助于理解睡眠与长期记忆形成过程之间的关系,记忆力不足的患者可能会从中受益。  这项成果是韩国基础科学研究所和德国蒂宾根大学的研究人员取得的,论文发表在新一期美国《神经元》杂志上。  与人类一样,实验鼠的

研究抗病毒蛋白质信号分子功能调节机制

  中科院上海生科院生物化学与细胞生物学研究所侯法建研究组,揭示了参与抗病毒天然免疫反应的蛋白质分子MAVS发挥功能的分子机制。相关成果日前在线发表于《自然—通讯》杂志。   天然免疫是机体抵御病原体侵染的第一道防线。其中,RIG-I-MAVS介导的信号转导通路在细胞响应RNA病毒侵染的免疫应答过程

深度剖析基因组自我调节的新型分子机制

  近日,两篇刊登在国际杂志Molecular Cell上的研究报告中,来自加州理工学院等机构的科学家们通过研究揭示了基因组自我调节的分子机制。生物体的基因组中包含了每个细胞和组织发育和发挥正常功能所需要的所有信息,当被写入DNA后,每个基因都会进行信息编码,包括帮助确定组织形状的结构蛋白、催化生命

J Immunol:鉴别出机体免疫调节的新型分子机制

  近日,一项刊登在国际杂志The Journal of Immunology上的研究报告中,来自布里斯托大学的研究人员获取了一项重要的研究发现,该研究或为后期开发新型疗法抵御慢性炎症提供了一定的线索和希望。  这项研究由威康信托基金会等机构提供资助,文章中研究者重点对一种所谓的诸如活性氧分子等危险

Mol-Cell:参与肿瘤进展的基因调节的新型分子机制

  基因中包含多种机体细胞、组织和器官维持功能所需要的信息,基因的表达会像流水线一样被彻底控制着,一个接着一个发生;近日,一项刊登在国际杂志Molecular Cell上的研究报告中,来自巴塞罗那基因调控中心等机构的科学家们通过研究发现了一种控制癌症中某些基因表达的重要步骤;研究者指出,乳腺癌细胞需

研究揭示MLL家族蛋白复合物活性调节分子机制

  中科院上海生科院生化与细胞所国家蛋白质科学中心(上海)雷鸣、陈勇研究组和中科院大连化学物理研究所李国辉研究组在最新的合作研究中,解析了一类重要的组蛋白甲基转移酶MLL家族蛋白复合物的结构,并阐释了其活性调控的分子机制。相关研究成果2月18日以长文形式在线发表于《自然》。  以基因组DNA和组蛋白

文斐:研究解决大型语言模型的存储瓶颈问题

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/497858.shtm“由于半导体器件的物理限制,摩尔定律已经难以为继;今后计算机芯片的效率提升将主要来源于体系架构的创新。”华南理工大学计算机科学与工程学院原院长、广东省计算机学会理事长韩国强对《中国科学

Nat-Commun:调节机体免疫系统“岗哨”细胞的新型分子机制

  日前,一篇发表在国际杂志Nature Communications上的研究报告中,来自西班牙马德里的国立心血管病研究中心等机构的科学家们通过研究发现了一种细胞核受体介导的新型分子机制,其或能帮助确定巨噬细胞的识别和扩张,巨噬细胞在机体中扮演着“免疫岗哨”的角色,这种新型机制或能特异性地影响浆膜腔

遗传发育所揭示可变剪切调节ABA信号通路的分子机制

  Pre-mRNA的剪切是mRNA去除内含子连接外显子生成成熟mRNA的过程,可变剪切就是利用可变的剪切位点,生成不同的mRNA的过程。可变剪切可以增加生物体蛋白质组丰度,是一种非常重要的基因转录后调控机制介导各种生物学过程。最近几年,pre-mRNA可变剪切及其调控机制已成为植物科学中的一个研究

面对大模型应用门槛高-如何大模型发挥更大价值?

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/9/485510.shtm 人工智能预训练大模型的研发,面临着数据规模大、数据质量参差不齐、模型体积大、训练难度高、算力需求大等一系列挑战。在这样的背景下,如何加速大模型的产业落地,让大模型发挥更大价值?

MOFormer:无需3D结构、基于Transformer的预测语言模型

金属有机框架(MOF)是具有高比表面积、高孔隙率和结构可设计的结晶性多孔材料,可用于气体吸附、气体储存、气体分离、催化剂等领域。  然而,MOF 的化学空间非常巨大。发现适合特定应用的最佳 MOF 需要对无数潜在候选材料进行高效、准确的搜索。快速且低成本地为特定任务选择性能最佳的 MOF 一直具有挑

原核生物基因表达调控大的调节机制有哪些类型

上述问题决定于DNA的结构、RNA聚合酶的功能、蛋白因子及其他小分子配基的互相作用,在转录调控中,现已搞清楚了细菌的几个操纵子模型,现以乳糖操纵子和色氨酸操纵子为例予以说明。法国巴斯德研究所著名的科学家Jacob和Monod在实验的基础上于1961年建立了乳糖操纵子学说。大肠杆菌乳糖操纵子包括4类基

睡眠猝死的遗传学机制

  Brugada综合症为常染色体显性遗传性疾病。研究认为编码钠电流、瞬时外向钾电流(Ito)、ATP依赖的钾电流、钙-钠交换电流等离子通道的基因突变都可能是Brugada综合症的分子生物学基础。  1998年Chen等最早证实了编码心脏钠通道基因(SCN5A)的alpha;亚单位突变是Brugad