非人灵长类动物完整染色体序列首次发布

由美国宾夕法尼亚州立大学和美国国家人类基因组研究所领导的国际合作小组首次生成了非人灵长类动物的完整染色体序列,相关论文发表在29日的《自然》杂志上。这些序列揭示了不同物种Y染色体之间的显著差异,显示出它们快速进化的历史,还揭示了以前未被研究过的类人猿基因组区域,为物种多样性和进化提供了重要见解。 灵长类物种是现存与人类最接近的“亲戚”。此次,研究人员对黑猩猩、倭黑猩猩、大猩猩、婆罗洲猩猩、苏门答腊猩猩,以及另一种与人类关系较远的灵长类物种——合趾猿的染色体进行了测序,重点研究了它们的X和Y染色体。 结果发现,在6种猿类中,Y染色体在各种特征(包括大小)上的变异性都比X染色体大得多。X染色体所含核苷酸字母的数量从黑猩猩的1.54亿个到大猩猩的1.78亿个不等,相差约2400万;相比之下,Y染色体所含核苷酸字母数量从合趾猿的3000万个到苏门答腊猩猩的6800万个不等,相差约3800万。 物种间共享的DNA序列数量在Y染色......阅读全文

重叠基因的调控序列

①在5′端转录起始点上游约20~30个核苷酸的地方,有TATA框(TATA box)。TATA框是一个短的核苷酸序列,其碱基顺序为TATAATAAT。TATA框是启动子中的一个顺序,它是RNA聚合酶的重要的接触点,它能够使酶准确地识别转录的起始点并开始转录。当TATA框中的碱基顺序有所改变时,mRN

低度重复序列的概念

低度重复序列在单倍体基因组中只出现一次或数次,因而复性速度很慢。单拷贝顺序在基因组中占50-80%,如人基因组中,大约有60-65%的顺序属于这一类。单拷贝顺序中储存了巨大的遗传信息,编码各种不同功能的蛋白质。尚不清楚单拷贝基因的确切数字,但是是有其在单拷贝顺序中只有一小部份用来编码各种蛋白质,其他

常用的βactin-引物序列

human actin f ctc cat cct ggc ctc gct gt human actin r gct gtc acc ttc acc gtt cc product size:268 rabbit actin r agt gcg acg tgg aca tcc g rabbit act

简述回文序列的释义

  如果一个(单链)核苷酸的序列和它的反向互补链的序列一样,那么这个核苷酸序列就是回文序列。回文序列结构不仅在DNA中存在,在RNA中也常因碱基的互补而常出现类似的结构,有利于稳定RNA的结构和行使功能。回文序列也经常出现在组成蛋白质的肽序列中,但它们在蛋白质功能中的作用尚不清楚。  短的回文结构可

细胞化学词汇匹配序列

中文名称:匹配序列英文名称:matched sequence定  义:在序列排比中,两条多核苷酸链或两条多肽链上彼此相同的核苷酸或氨基酸序列。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

SD序列的翻译影响

  一般来说,mRNA与核糖体的结合程度越强,翻译的起始效率就越大,而这种结合程度主要取决于SD序列与16S rRNA的碱基互补性,其中以GGAG 4个碱基序列尤为重要。其中,大肠杆菌的SD序列为AGGAGGU。对多数基因而言,这4个碱基中任何一个换成C或T,均会导致翻译效率大幅度降低。SD序列与起

什么是表达序列标签?

表达序列标签从互补DNA(cDNA)分子所测得部分序列的短段DNA(通常300~500bp)。从cDNA文库所得到的许多表达序列标签集合组成表达序列标签数据库,代表在一定的发育时期或特定的环境条件下,特定的组织细胞基因表达的序列。可用于验证基因在特定组织中的表达,推导全长cDNA序列,或作为标签标志

DNA序列分析技术2

3)电泳电极缓冲液 1 倍TBE(pH 值8.0)预电泳 30 分钟至1 小时恒温方式 测序胶板上夹盖铝恒温板电泳温度 50℃左右电泳条件 恒功率 90~110W电泳时间 2.5 小时至5 小时4)干胶制备和压片电泳结束后取下胶板,用工具撬开玻璃板,使胶留在其中一块板上。将裁剪好的新华3 号滤纸在胶

简述SD序列的作用

  SD序列的作用是与16S rRNA的3'端上一段富含嘧啶的序列结合,小亚基16S rRNA的3'端的这个小片段就被称为反SD序列。当mRNA中的SD序列于16S rRNA上的反SD序列结合后,就指示了下游的AUG,即是蛋白质合成的起始密码子。

表达序列标签的方法

首先从样品组织中提取mRNA,在逆转录酶的作用下用oligo(dT)作为引物进行RT-PCR合成cDNA,再选择合适的载体构建cDNA 文库,对各菌株加以整理,将每一个菌株的插入片段根据载体多克隆位点设计引物进行两端一次性自动化测序,这就是EST序列的产生过程。

重复[DNA]序列的概念

中文名称重复[DNA]序列英文名称repetitive [DNA] sequence定  义DNA分子中重复出现的核苷酸序列。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

中度重复序列的概念

中度重复序列(moderately repetitive sequence )一般是非编码序列,有十个到几百个拷贝,如 rRNA基因和 tRNA 基因等。这类重复序列的平均长度大约为 300bp ,往往构成序列家族,常以回文序列形式出现在基因组的许多位置上,有些同单一序列间隔排列。大部分中度重复序列

染色体病:结构性染色体畸变

  结构性染色体畸变 这种畸变是在细胞分裂过程中曾有染色体断裂所致。常见的结构异常有缺失、环状染色体、易位、重复、倒位和等臂染色体。  (1)缺失:指染色体丢失一段。即染色体一处断裂,其无着丝粒的一端常丢失,成为末端缺失;染色体两处断裂,可造成中间段的丢失,为中间缺失。由于遗传基因随染色体断片而丢失

染色体病:结构性染色体畸变

  结构性染色体畸变 这种畸变是在细胞分裂过程中曾有染色体断裂所致。常见的结构异常有缺失、环状染色体、易位、重复、倒位和等臂染色体。  (1)缺失:指染色体丢失一段。即染色体一处断裂,其无着丝粒的一端常丢失,成为末端缺失;染色体两处断裂,可造成中间段的丢失,为中间缺失。由于遗传基因随染色体断片而丢失

如何区分x染色体与y染色体

  X,Y是相对概念,在核型分析时,配对结束后会有两个形态大小有差异的染色体,较大的是x。也可利用细胞学手段,用基因定位,定位x或y的特有基因。

什么是基因的核心序列?

中文名称核心序列英文名称core sequence定  义重复序列共有的核苷酸序列。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

细胞化学词汇间插序列

中文名称:间插序列英文名称:intervening sequence;IVS定  义:基因间或基因内的非编码序列。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

简单重复序列的功能特点

SSR 标记具有高度重复性、丰富的多态性、共显性、高度可靠性等优点,但由于其需要对所研究物种的一系列微卫星位点进行克隆和测序分析,以便设计相应的引物,这是非常费时、费力和代价昂贵的工作,没有足够的投资、人力和时间,是不可能实现的,因而给它的利用带来了一定困难。

非编码序列的定义

中文名称非编码序列英文名称non-coding sequence定  义基因中不具有编码功能的序列。如真核生物基因的内含子、启动子等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

SD序列的基本信息

SD序列还存在于一些叶绿体和线粒体的转录本中 。由6个碱基组成的SD序列的保守序列为AGGAGG。SD序列是由澳大利亚科学家John Shine和Lynn Dalgarno提出。

随机序列库的纯化实验

            实验方法原理 实验材料 DNA 库 试剂、试剂盒 氢氧化铵

RGD序列的主要组成成分

RGD序列由精氨酸、甘氨酸和天冬氨酸组成,存在于多种细胞外基质中,可与11种整合素特异性结合,能有效地促进细胞对生物材料的粘附。

共有序列的结构特点

共有序列(consensus sequence) 决定启动序列的转录活性大小。各种原核启动序列特定区域内(通常在转录起始点上游-10及-35区域)存在共有序列(consensus sequence)。

DNA-下游序列的结构特点

中文名称下游序列英文名称downstream sequence定  义DNA或RNA分子中,相对于某一序列的3′方向的序列。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),总论(二级学科)

细胞化学词汇质粒维持序列

中文名称:质粒维持序列英文名称:plasmid maintenance sequence定  义:存在于重组质粒中的、与保持其在宿主中稳定复制有关的序列。如乳酸菌质粒pGT232的一段由双链复制起点和编码复制起始蛋白repA的基因所组成的1.7 kb的序列。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科)

表达序列标签的应用原理

EST是从一个随机选择的cDNA克隆进行5’端和3’端单一次测序获得的短的cDNA部分序列,代表一个完整基因的一小部分,在数据库中其长度一般从20到7000bp不等,平均长度为360±120bp 。EST来源于一定环境下一个组织总mRNA所构建的cDNA文库,因此EST也能说明该组织中各基因的表达水

远侧序列的功能特点

中文名称远侧序列英文名称distal sequence定  义一般指处于基因上游200 bp以上位置的DNA序列。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

回文序列的特征和功能

特征有对称中心。例如,DNA序列ACCTAGGT之所以是回文序列,是因为它的互补序列是TGGATCCA,而反向互补序列是ACCTAGGT,和其原来序列一致。功能1)是限制性内切酶的识别位点;2)具有调节基因的表达作用,如色氨酸操纵子的前的弱化子;3)转录终止时的识别结构;4)基因工程的"手术刀"。

什么是序列标签位点?

序列标签位点(sequence-tagged site),是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间。

序列标签位点的简介

任何DNA序列,只要知道它在基因组中的位置,都能被用作STS标签。作为基因组中的单拷贝序列,是新一代的遗传标记系统,其数目多,覆盖密度较大,达到平均每1kb一个STS或更密集。这种序列在染色体上只出现一次,其位置和碱基顺序都是已知的。在PCR反应中可以检测出STS来,STS适宜于作为人类基因组的一种