常用的βactin引物序列

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常用的βactin-引物序列

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常用的βactin-引物序列

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设计引物用cds序列和cdna序列的区别

cDNA和mRNA的序列是互补的,如果用两个引物,最后的两条DNA序列分别对应于mRNA和cDNA中的一段。由于引物方向从5‘至3’,所以两个引物对应于mRNA和cDNA中相应序列即可。

序列特异性引物的作用

序列特异性引物指一种测定基因突变的方法。即利用针对点突变的2个等位特异性寡核苷酸(ASO)引物(A、B标记其中之一)与另一共同引物(C)组成引物系统;在引物延伸时,A与B同时竞争靶序列上同一复性位点,扩增反应后,经凝胶电泳及放射自显影,胶片上的显带是标记同位素的引物所扩增的产物。

序列特异性引物的概念

中文名称序列特异性引物英文名称sequence specific primer;SSP定  义一种测定基因突变的方法。即利用针对点突变的2个等位特异性寡核苷酸(ASO)引物(A、B标记其中之一)与另一共同引物(C)组成引物系统;在引物延伸时,A与B同时竞争靶序列上同一复性位点,扩增反应后,经凝胶电泳

序列特异性引物的概念

中文名称序列特异性引物英文名称sequence specific primer;SSP定  义一种测定基因突变的方法。即利用针对点突变的2个等位特异性寡核苷酸(ASO)引物(A、B标记其中之一)与另一共同引物(C)组成引物系统;在引物延伸时,A与B同时竞争靶序列上同一复性位点,扩增反应后,经凝胶电泳

如何在NCBI上查找引物序列

在NCBI中BLAST引物(注意选择BLAST的数据库),然后再Blast结果中找寻符合要求的序列。后面会列出很多链接,直接就能看到NCBI号 进入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/Blast.cgi?PAGE=Nucleotides&PROGRAM=blastn&

如何在NCBI上查找引物序列

在NCBI中BLAST引物(注意选择BLAST的数据库),然后再Blast结果中找寻符合要求的序列。后面会列出很多链接,直接就能看到NCBI号 进入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/Blast.cgi?PAGE=Nucleotides&PROGRAM=blastn&

引物的质量是否跟序列有关?

四种碱基的性质和各自保护基的性质都有差别。所以合成难度是不一样的。难度最大的当属GC重复多的和序列中还有多个连续的G的引物。尤其对于后者,国内公司一般都做不了20个G以上的引物。实验证明,如果引物中有超过三个连续G的结构,传统方法得到的产物质量就会开始下降。而且目前通用的脱盐、OPC和PAGE方法都

关于引物序列碱基随机分布的介绍

  引物序列在模板内应当没有相似性较高,尤其是3’端相似性较高的序列,否则容易导致错误引发(False priming)。降低引物与模板相似性的一种方法是,引物中四种碱基的分布最好是随机的,不要有聚嘌呤或聚嘧啶的存在。尤其3′端不应超过3个连续的G或C,因为这样会使引物在GC富集序列区错误引发。

如何设计基因cds序列的pcr引物

提取细胞总RNA然后用试剂盒反转录成cDNA,用cDNA作为模板扩增基因的CDS区,然后想要转染进细胞中。比如MYOD1基因,首先在NCBI找到它的mRNA序列,然后找到它的CDS序列,全部复制下来,在primer5.0中。正向引物直接从CDS的第一个核酸开始(比如18bp),反向引物从CDS最后一

引物的质量是不是和序列有关?

 四种碱基的性质和各自保护基的性质都有差别。所以引物设计后合成难度是不一样的。难度最大的当属GC重复多的和序列中还有多个连续的G的引物。尤其对于后者,一般公司都做不了20个G以上的引物。实验证明,如果引物中有超过三个连续G的结构,传统方法得到的产物质量就会开始下降。而且目前通用的脱盐、OPC和PAG

怎么样通过引物序列找目的基因

你先看看你引物序列是什么吧,如果是巢氏PCR的引物,很有可能一部分序列是不在靶基因中的。即使是一般的PCR引物,也可以只有3'端的一部分序列与靶基因匹配即可。如果你想验证,直接合成后PCR,然后测序,验证下是不是得到EGFR序列即可。当然,你也可以根据EGFR基因自己设计引物,这个很容易。

已知引物序列,怎么得到PCR目的片段大小

进入NCBI网站,点击BLAST,输入一段引物序列,进行BLAST,会得到一些与之匹配的基因;然后再用另一段引物序列进行BLAST.比较两次结果,找到引物所匹配的基因,BLAST的时候会告诉你引物在这个基因中的位置,自己计算一下就可以了.

序列特异性引物的定义和技术特点

序列特异性引物指一种测定基因突变的方法。即利用针对点突变的2个等位特异性寡核苷酸(ASO)引物(A、B标记其中之一)与另一共同引物(C)组成引物系统;在引物延伸时,A与B同时竞争靶序列上同一复性位点,扩增反应后,经凝胶电泳及放射自显影,胶片上的显带是标记同位素的引物所扩增的产物。

AluPCR:用重复序列引物扩增来源复杂的人DNA

引言  聚合酶链反应PCR使不同来源的特异核酸片段的分离及分析发生了革命,但应用PCR分 离,分析特定DNA区域需要了解靶区域的边侧序列,这使扩增局限于已知DNA序列。我 们研究了从复杂的人和其他种DNA混合物中扩增未知DNA序列。特别是,我们应用PCR 分离出了在啮齿类细胞背景中含有人染色体片段的

一步步教你利用Blast分析验证引物序列

引物设计完成之后,需要用软件 进行分析,找到最佳的引物对,采用Blast分析验证引物,可以知道序列的正确性,也能知道引物的特异性状况、引物的具体位置以及PCR产物的大小。先找到需要设计引物的目标基因的在有引物序列的mRNA序列,可以通过全文(如最先发现该基因的文章),全文中有时可以找到大鼠c-jun

一步步教你利用Blast分析验证引物序列

引物设计完成之后,需要用软件 进行分析,找到最佳的引物对,采用Blast分析验证引物,可以知道序列的正确性,也能知道引物的特异性状况、引物的具体位置以及PCR产物的大小。先找到需要设计引物的目标基因的在有引物序列的mRNA序列,可以通过全文(如最先发现该基因的文章),全文中有时可以找到大鼠c-jun

引物一般需要2030个核苷酸序列,为什么?

引物一般需要20-30个核苷酸序列,原因是增强识别序列的特异性。

引物溶解引物保存

1. 如何测定引物的OD值?用紫外分光光度计在260nm波长测定溶液的吸光度来定量,请注意紫外分光光度计的使用,测定时溶液的吸光度最好稀释到0.2~0.8之间(吸光度太高或太低会有较大的误差)。DNA干粉用一定体积的水充分振荡溶解以后,取部分溶液稀释到1 ml 并在1 ml 标准比色皿中测定其吸光度

引物溶解引物保存

1.  如何测定引物的OD值? 用紫外分光光度计在260nm波长测定溶液的吸光度来定量,请注意紫外分光光度计的使用,测定时溶液的吸光度最好稀释到0.2~0.8之间(吸光度太高或太低会有较大的误差)。DNA干粉用一定体积的水充分振荡溶解以后,取部分溶液稀释到1 ml 并在1 ml 标准比色皿中测定其

引物设计的引物设计原则

1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3

引物设计的引物设计原则

1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3

引物设计的引物设计原则

1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3

引物设计的引物设计原则

1、长度:15—30bp,其有效长度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38,否则PCR的最适延伸温度会超过Taq酶的最佳作用温度(74度),从而降低产物的特异性。2、G十C含量:应在40%一60%之间,PCR扩增中的复性温度一般较Tm值低等于引物的Tm值减去5—10度。引物长度小于20时,

什么是上游引物和下游引物

虽然这个问题很简单,但我怎么发觉挺难回答的......上游引物就是和要扩增基因片断上游序列结合的引物(引物就是单链寡聚核苷酸,基因扩增需要从引物开始),同理,下游引物指与目的基因片断下游序列结合者。具体示意如下:(上下两条长线代表DNA模板)5'-----------------------

快速了解反转录引物随机引物

  随机引物是指当特定mRNA由于含有使逆转录酶终止的序列而难于拷贝其全长序列时,可采用随机六聚体这一非特异的引物来拷贝全长mRNA。  1.特异性引物一般在增低丰度目的基因才选择使用,用得比较少。一般都推荐用Oligo(dT)或随机引物代替基因特异性引物。由于rna的二级结构破坏不完全,导致特异性

设计引物遵循原则、引物保存和各种PCR的引物设计

一 设计引物应遵循以下原则1 、引物长度: 15-30bp,常用为20bp左右。2 、引物扩增跨度: 以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。3 、引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC最好随机分布,避免5个以上

PCR引物

PCR Primer Design and Reaction Optimization (Molecular Biology Techniques Manual)  PCR Primer Design (Newman Lab)  PCR Primer Design (Eppendorf)Detail

PCR引物

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