成都生物所发现一种单核苷酸多态性新型检测方法
单核苷酸多态性(SNP)是指在基因组水平上,由于单个核苷酸的转换、颠换、插入或缺失等引起DNA序列的多态性,它与许多疾病直接相关。因此,快速、准确、廉价的SNP检测技术的开发,对药物研究、个体化医疗、临床试验和分子诊断等至关重要,而目前大多数的SNP检测方法均需要复杂的探针标记,并依靠高成本的检测设备。中国科学院成都生物研究所唐卓研究员课题组,以有机化学、核酸化学及化学生物学为研究方向,一直致力于基于核酶开发核酸检测生物传感器的研究,最近报道了一种新型的基于DNAzyme和Gap-LCR的SNP检测技术。 唐卓课题组向Gap-LCR探针中引入了一条短的功能DNA序列(DNAzyme),进而避免了对探针的化学修饰;然后利用两种核酸外切酶依次降解体系中没有发生连接反应的磷酸化探针和释放Gap-LCR扩增产物中的DNAzyme序列;最后利用DNAzyme与卟啉铁(hemin)或者卟啉铁类似物的结合物具有类似于过氧化物酶活性的......阅读全文
-新技术可确定DNA序列源于母亲还是父亲
生活中常听到这样的对话:张家闺女真漂亮,和她妈一模一样;李家儿子小眼睛,像他爸。张妈妈到底是不是“无功空受禄”,而李爸爸又有没有蒙受“不白之冤”?有了本文的新技术,一切自有分晓。当然,这只是玩笑。正如文中所说,新技术的真本事,在于评估染色体病患病风险等方面。举个例子,具有较高患癌风险的人通常有多
Nature:DNA重复序列是否致病取决于什么?
DNA重复序列在人类基因组中是很常见的。重复序列已经被提出作为一种进化机制,但是它们可能与人类疾病相关。现在,马克斯-普朗克分子遗传学研究所和Charité – Universitätsmedizin Berlin的科学家已经证明,DNA重复序列是否与人类疾病相关,取决于它们在基因组中的位置,序
DNA序列测定技术(Sanger双脱氧链终止法与Maxam-Gilbert-...
选择随机定向测定策略的影响因素(1)计算设备 任何大规模的测序计划将在很大程度上依赖计算机程序对原始序列资料进行分类、整理和排列(Staden,1986)。在权衡随机法的利与弊之时,必须将与适当的计算机设备进行联机的问题放到压倒一切的位置上来考虑。如果这些设备尚无从适当的计算机设备进行联机的问题
基因诊断技术的DNA测序的相关介绍
目前在实验室手工测序常用Sanger双脱氧链终止法。Sanger法就是使用DNA聚合酶和双脱氧链终止物测定DNA核苷酸序列的方法。它要求使用一种单链的DNA模板或经变性的双链DNA模板和一种恰当的DNA合成引物。其基本原理是DNA聚合酶利用单链的DNA模板,合成出准确互补链,在合成时,某种dNT
抗单链DNA抗体的概述
抗ssDNA是抗DNA抗体中临床意义和重要性都不如抗dsDNA的一种,DNA是一个大分子的复合物,由两条核苷酸链形成的双螺旋结构。加热时碱基间的氢键断裂,DNA变性产生ssDNA。抗ssDNA的反应位点主要是ssDNA上的嘌呤和嘧啶构成的碱基。
细胞化学词汇单链互补DNA
中文名称:单链互补DNA英文名称:single-strand cDNA;sscDNA定 义:在逆转录酶催化下,以信使核糖核酸(mRNA)为模板合成与mRNA序列互补的单链DNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
引物一般需要2030个核苷酸序列,为什么?
引物一般需要20-30个核苷酸序列,原因是增强识别序列的特异性。
DNA序列测定技术(Sanger双脱氧链终止法与Maxam-Gilbert...4
序列测定的技术和策略Sanger双脱氧链终止法Maxam-Gilbert DNA 化学降解法测序策略目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都是同样生成互相独立的若干组带放射性标记的
连接酶链反应的原理及应用介绍
1.定义:连接酶链反应(Ligase chain reaction,LCR),是一种新的DNA体外扩增和检测技术,主要用于点突变的研究及靶基因的扩增。2.LCR的基本原理:利用DNA连接酶.特异地将双链DNA 片段连接,经变性-退火-连接三步骤反复循环,从而使靶基因序列大量扩增。其程序为:在模DNA
基因多态性的检测方法
1.限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP):由DNA 的多态性,致使DNA 分子的限制酶切位点及数目发生改变,用限制酶切割基因组时,所产生的片段数目和每个片段的长度就不同,即所谓的限制性片段长度多态性,导致限制片段长度发生改
关于寡聚核苷酸的定点诱变技术介绍
是由加拿大的生物化学家M·史密斯(Michael Smith,1932—)发明的。其基本原理如下: 应用寡聚核苷酸进行DNA的定点诱变时,首先要把含有待突变的DNA片断段克隆到MI3噬菌体载体中,MI3噬菌体的正链可以感染具有纤毛的细菌,并在细菌体内进行复制后,以出芽的形式形成新的带有正链DN
简述基因扩增技术的基本原理
PCR扩增DNA的原理是:先将含有所需扩增分析序列的靶DNA双链经热变性处理解开为两个寡聚核苷酸单链,然后加入一对根据已知DNA序列由人工合成的与所扩增的DNA两端邻近序列互补的寡聚核苷酸片段作为引物,即左右引物。此引物范围就在包括所欲扩增的DNA片段,一般需20-30个碱基对,过少则难保持与D
新方法可批量生产高质量DNA分子
据物理学家组织网6月3日(北京时间)报道,瑞典卡罗林斯卡研究所和美国哈佛大学合作开发出一种用于制造短的单链DNA分子的新方法,可以解决许多目前生产中的问题。新方法对DNA纳米技术以及开发由DNA片段组成的药物都很有价值。相关论文发表在最近的科学期刊《自然·方法学》上。 短的单链D
关于基因扩增技术的基本原理介绍
基因扩增技术的原理是:先将含有所需扩增分析序列的靶DNA双链经热变性处理解开为两个寡聚核苷酸单链,然后加入一对根据已知DNA序列由人工合成的与所扩增的DNA两端邻近序列互补的寡聚核苷酸片段作为引物,即左右引物。此引物范围就在包括所欲扩增的DNA片段,一般需20-30个碱基对,过少则难保持与DNA
关于分子生物学分型方法的基本介绍
在序列特异性引物(SSP)存在的条件下,用已知的一段DNA与从细胞核提取的DNA混合,通过PCR扩增技术可获得序列特异性寡核苷酸(SSO)。目前HLA-DNA分型均以PCR技术为基础,主要包括:聚合酶链反应寡核苷酸探针杂交(PCR/SSO)、顺序特异引物聚合酶链反应技术(PCR/SSP)、限制性
《自然》:美开发DNA序列分拣碳纳米管新法
碳纳米管为长形细小的石墨圆筒,具有电子学和热力学等多方面的特征,这些特征随着碳纳米管的形状和结构变化而有所不同。人们发现,碳纳米管多重性特征致使其本身有能力应用于电子学、激光器、传感器和生物医学,同时也能作为复合材料中的增强元素。 目前用于生产碳纳米管的方法所获得的是由粗细各异和对
DNA微阵列检测基因表达水平及识别基因序列
Schena等1996年用拟南芥光调基因微阵列,以不同器官中的mRNA为探针,检测其基因表达水平,结果表明叶mRNA的表达水平是根的500倍。Shelon等1996年将酿酒酵母基因组DNA克隆制成微阵列,用6条最大染色体和10条最小染色体DNA探针分别标记上红,绿荧光标记进行杂交检测,结果表明9
将四字校训变成DNA序列进行存储读取
当摩尔定律逐渐接近极限时,寻找新的存储介质就显得迫在眉睫。12月5日,记者从东南大学获悉,该校师生将“止于至善”的校训翻译成英文后进行四进制编码,并以DNA(脱氧核糖核酸)分子形式存储在电极表面,再最终读取出来,这引发了未来对高通量自动化DNA存储的无限想象。相关成果近日发表于国际学术期刊《科学
新算法将更好组装DNA序列-检测特殊遗传突变
刊登在国际杂志Bioinformatics上的一项研究论文中,来自杨百翰大学(Brigham Young University)的研究人员开发了一种新方法来进行人类基因组的装配,而且这或许可以帮助鉴别引发常见遗传障碍的新型突变。 这种新方法依赖于一种新算法,其可以非常敏感地检测DNA序列的特异
分子杂交的原理和技术特点
不同的DNA片段之间,DNA片段与RNA片段之间,如果彼此间的核苷酸排列顺序互补也可以复性,形成新的双螺旋结构。这种按照互补碱基配对而使不完全互补的两条多核苷酸相互结合的过程称为分子杂交。分子杂交(molecular hybridization)确定单链核酸碱基序列的技术。其基本原理是待测单链核酸与
分子杂交技术原理
不同的DNA片段之间,DNA片段与RNA片段之间,如果彼此间的核苷酸排列顺序互补也可以复性,形成新的双螺旋结构。这种按照互补碱基配对而使不完全互补的两条多核苷酸相互结合的过程称为分子杂交。分子杂交(molecular hybridization)确定单链核酸碱基序列的技术。其基本原理是待测单链核酸与
序列特异性DNA结合蛋白亲和层析纯化实验DNA亲和介质制备
实验材料两种带有结合位点的合成寡核苷酸各440μg试剂、试剂盒TE缓冲液 pH 7.810×T4噬菌体多核苷酸激酶缓冲液20 mmol L ATP (钠盐) pH 7.0150 m Ci mL [γ-32P] ATP (6000 Ci mmol)10 U μL T4噬菌体多核苷酸激酶(New Eng
DNA测序新突破:新纳米孔通过电流变化检测DNA序列
在个体化医疗前景的诱惑下,研究人员将研发出更有效的基因测序新方法视为首要任务。如今,宾夕法尼亚大学物理学家利用固态的纳米孔区分单链DNA分子,这一有前景的技术,在DNA穿过纳米孔时,通过检测电流变化进而读取DNA序列。相关研究发表在《ACS Nano》期刊上。 领导这项研究的是艺术与科学学院物
探针和引物区别
基因探针,即核酸探针,是一段带有检测标记,且顺序已知的,与目的基因互补的核酸序列(DNA或RNA)。基因探针通过分子杂交与目的基因结合,产生杂交信号,能从浩翰的基因组中把目的基因显示出来。根据杂交原理,作为探针的核酸序列至少必须具备以下两个条件:①应是单链,若为双链,必须先行变性处理。②应带有容易被
基因诊断的原理(一)
核酸分子杂交是基因诊断的最基本的方法之一。它的基本原理是:互补的DNA单链能够在一定条件下结合成双链,即能够进行杂交。这种结合是特异的,即严格按照碱基互补的原则进行,它不仅能在DNA和DNA之间进行,也能在DNA和RNA之间进行。因此,当用一段已知基因的核酸序列作出探针,与变性后的单链基因组D
关于HLA分型的DNA分型方法介绍
DNA分型主要分为两种方法:基于核酸序列识别的方法和基于序列分子构型的方法,常用的方法大致可分为大类: ①限制性片段长度多态性分析(restriction fragment length polymorphism,RFP)。其原理是不同的DNA膜板山于序列的差异在限制性内切酶作用下将被切成大小
逆转录病毒研究Nature发文:双核苷酸序列的神奇作用
来自洛克菲勒大学的研究人员发表了题为“CG dinucleotide suppression enables antiviral defence targeting non-self RNA”的文章,发现一种我们人体和病毒中相似的遗传密码拼写方式,可以帮助病毒从人体的免疫系统防御中逃脱出来。这意
分子杂交技术的核酸探针标记法
核酸探针根据核酸的性质,可分为DNA和RNA探针;根据是否使用放射性标记物的与否,可分为放射性标记探针和非放射性标记探针;根据是否存在互补链,可分为单链和双链探针;根据放射性标记物掺入情况,可分为均匀标记和末端标记探针。下面将介绍各种类型的探针及标记方法。 分子生物研究中,最常用的探针即为双链DNA
单链DNA文库的SELEX筛选实验
单链DNA文库的SELEX筛选实验可用于:(1)体外诊断;(2)体内治疗等。实验方法原理SELEX 技术除了可以使用 RNA 文库以外,还可以使用单链 DNA 文库进行筛选。单链 DNA 形成高级结构的丰富性也足够用于对许多靶分子的筛选,而且 DNA 文库具有更好的稳定性,操作也相对简便。实验材料3
分子遗传学词汇单链DNA
中文名称:单链DNA外文名称:single-stranded DNA定义:大部分DNA以双螺旋结构存在,但一经热或碱处理就会变为单链状态。