成都生物所发现一种单核苷酸多态性新型检测方法

单核苷酸多态性(SNP)是指在基因组水平上,由于单个核苷酸的转换、颠换、插入或缺失等引起DNA序列的多态性,它与许多疾病直接相关。因此,快速、准确、廉价的SNP检测技术的开发,对药物研究、个体化医疗、临床试验和分子诊断等至关重要,而目前大多数的SNP检测方法均需要复杂的探针标记,并依靠高成本的检测设备。中国科学院成都生物研究所唐卓研究员课题组,以有机化学、核酸化学及化学生物学为研究方向,一直致力于基于核酶开发核酸检测生物传感器的研究,最近报道了一种新型的基于DNAzyme和Gap-LCR的SNP检测技术。 唐卓课题组向Gap-LCR探针中引入了一条短的功能DNA序列(DNAzyme),进而避免了对探针的化学修饰;然后利用两种核酸外切酶依次降解体系中没有发生连接反应的磷酸化探针和释放Gap-LCR扩增产物中的DNAzyme序列;最后利用DNAzyme与卟啉铁(hemin)或者卟啉铁类似物的结合物具有类似于过氧化物酶活性的......阅读全文

分子遗传学词汇单链DNA

中文名称:单链DNA外文名称:single-stranded DNA定义:大部分DNA以双螺旋结构存在,但一经热或碱处理就会变为单链状态。

单链DNA结合蛋白的功能简介

  单链DNA结合蛋白(Single-stranded DNA-binding protein,缩写SSB或SSBP)又称单链结合蛋白,是专门负责与DNA单链区域结合的一种蛋白质,为DNA复制、重组和修复所必需的成分。  防止两条互补单链再次结合为双螺旋,维持单链状态。防止单链区域形成链内二级结构。

单链DNA文库的SELEX筛选实验

            实验方法原理 SELEX 技术除了可以使用 RNA 文库以外,还可以使用单链 DNA 文库进行筛选。单链 DNA 形成高级结构的丰富性也足够用于对许多靶分子的筛选,而且 DNA 文库具有更好的稳定性,操作也相对简便。

逆转录病毒研究Nature发文:双核苷酸序列的神奇作用

  来自洛克菲勒大学的研究人员发表了题为“CG dinucleotide suppression enables antiviral defence targeting non-self RNA”的文章,发现一种我们人体和病毒中相似的遗传密码拼写方式,可以帮助病毒从人体的免疫系统防御中逃脱出来。这意

简述回文序列的释义

  如果一个(单链)核苷酸的序列和它的反向互补链的序列一样,那么这个核苷酸序列就是回文序列。回文序列结构不仅在DNA中存在,在RNA中也常因碱基的互补而常出现类似的结构,有利于稳定RNA的结构和行使功能。回文序列也经常出现在组成蛋白质的肽序列中,但它们在蛋白质功能中的作用尚不清楚。  短的回文结构可

分子杂交技术的核酸探针标记法

核酸探针根据核酸的性质,可分为DNA和RNA探针;根据是否使用放射性标记物的与否,可分为放射性标记探针和非放射性标记探针;根据是否存在互补链,可分为单链和双链探针;根据放射性标记物掺入情况,可分为均匀标记和末端标记探针。下面将介绍各种类型的探针及标记方法。 分子生物研究中,最常用的探针即为双链DNA

PCR的原理是什么

PCR的原理:该技术是在模板DNA、引物和四种脱氧核糖核苷酸存在下,依赖于DNA聚合酶的酶促合成反应。DNA聚合酶以单链DNA为模板,借助一小段双链DNA来启动合成,通过一个或两个人工合成的寡核苷酸引物与单链DNA模板中的一段互补序列结合,形成部分双链。在适宜的温度和环境下,DNA聚合酶将脱氧单核苷

PCR的基本原理

PCR的原理:该技术是在模板DNA、引物和四种脱氧核糖核苷酸存在下,依赖于DNA聚合酶的酶促合成反应。DNA聚合酶以单链DNA为模板,借助一小段双链DNA来启动合成,通过一个或两个人工合成的寡核苷酸引物与单链DNA模板中的一段互补序列结合,形成部分双链。在适宜的温度和环境下,DNA聚合酶将脱氧单核苷

PCR技术是什么

PCR技术的基本原理:该技术是在模板DNA、引物和四种脱氧核糖核苷酸存在下,依靠于DNA聚合酶的酶促合成反应。DNA聚合酶以单链DNA为模板,借助一小段双链DNA来启动合成,通过一个或两个人工合成的寡核苷酸引物与单链DNA模板中的一段互补序列结合,形成部分双链。在适宜的温度和环境下,DNA聚合酶将脱

PCR技术的原理是什么

PCR技术的基本原理:该技术是在模板DNA、引物和四种脱氧核糖核苷酸存在下,依靠于DNA聚合酶的酶促合成反应。DNA聚合酶以单链DNA为模板,借助一小段双链DNA来启动合成,通过一个或两个人工合成的寡核苷酸引物与单链DNA模板中的一段互补序列结合,形成部分双链。在适宜的温度和环境下,DNA聚合酶将脱

PCR技术的原理

PCR的原理:该技术是在模板DNA、引物和四种脱氧核糖核苷酸存在下,依赖于DNA聚合酶的酶促合成反应。DNA聚合酶以单链DNA为模板,借助一小段双链DNA来启动合成,通过一个或两个人工合成的寡核苷酸引物与单链DNA模板中的一段互补序列结合,形成部分双链。在适宜的温度和环境下,DNA聚合酶将脱氧单核苷

关于化学词语引物的基本信息介绍

  引物是人工合成的两段寡核苷酸序列,一个引物与目的基因一端的一条DNA模板链互补,另一个引物与目的基因另一端的另一条DNA模板链互补。在PCR(聚合酶链式反应)技术中,已知一段目的基因的核苷酸序列,根据这一序列合成引物,利用PCR扩增技术,目的基因DNA受热变性后解链为单链,引物与单链相应互补序列

寡核苷酸引物的作用

PCR技术中的引物的本质和作用。引物是一小段单链DNA或RNA,引物可以做为DNA复制开始时DNA聚合酶的结合位点,在细胞外的条件下,只有通过引物,DNA才可以开始进行复制。引物是人工合成的两段寡核苷酸序列,一个引物与感兴趣区域一端的一条DNA模板链互补,另一个引物与感兴趣区域另一端的另一条DNA模

绘图说明pcr技术的主要原理

pcr技术的基本原理: 该技术是在模板dna、引物和四种脱氧核糖核苷酸存在下,依赖于dna聚合酶的酶促合成反应。dna聚合酶以单链dna为模板,借助一小段双链dna来启动合成,通过一个或两个人工合成的寡核苷酸引物与单链dna模板中的一段互补序列结合

启动子克隆方法研究进展(2)

 1.3 环状PCR  环状PCR包括I-PCR(Inverse-PCR)和P-PCR(Panhandle-PCR)。这2种PCR都是根据一端已知序列设计的嵌套式引物进行PCR。  1.3.1 I-PCR I-PCR是1988年由Triglia最早提出的一种基于PCR的改进的染色体步行方法。    

PCR技术的基本原理

⑴PCR技术的基本原理:该技术是在模板DNA、引物和四种脱氧核糖核苷酸存在下,依赖于DNA聚合酶的酶促合成反应。DNA聚合酶以单链DNA为模板,借助一小段双链DNA来启动合成,通过一个或两个人工合成的寡核苷酸引物与单链DNA模板中的一段互补序列结合,形成部分双链。在适宜的温度和环境下,DNA聚合酶将

核酸分子杂交法介绍

这是最早用于性病诊断的重组DNA技术。基本原理是具有一定同源性的两条核酸单链在一定条件下(适宜的温度及离子强度等)可按碱基互补原则形成双链,此杂交过程是高度特异的。杂交的双方是待测核酸及探针。待测核酸序列为性病病原体基因组或质粒DNA。探针以放射核素或非放射性核素标记,以利于杂交信号的检测。  所谓

Sanger法测序原理

  Sanger法是根据核苷酸在某一固定的点开始,随机在某一个特定的碱基处终止,并且在每个碱基后面进行荧光标记,产生以A、T、C、G结束的四组不同长度的一系列核苷酸,然后在尿素变性的PAGE胶上电泳进行检测,从而获得可见DNA碱基序列的一种方法。  在分子生物学研究中,DNA的序列分析是进一步研究和

分子杂交技术(一)

一、概述  前面已经介绍了核酸分子单链之间有互补的碱基顺序,通过碱基对之间非共价键(主要是氢键)的形成即出现稳定的双链区,这是核酸分子杂交的基础。杂交分子的形成并不要求两条单链的碱基顺序完全互补,所以不同来源的核酸单链只要彼此之间有一定程度的互补顺序(即某种程度的同源性)就可以形成杂交双链。分子杂交

分子杂交技术(一)

一、概述  前面已经介绍了核酸分子单链之间有互补的碱基顺序,通过碱基对之间非共价键(主要是氢键)的形成即出现稳定的双链区,这是核酸分子杂交的基础。杂交分子的形成并不要求两条单链的碱基顺序完全互补,所以不同来源的核酸单链只要彼此之间有一定程度的互补顺序(即某种程度的同源性)就可以形成杂交双链。分子杂交

常见RNA探针及其特点

常见RNA探针及其特点:RNA探针是指带有标记的能与组织内相对应的核苷酸序列互补结合的一段单链cDNA或cRNA分子。根据在RNA杂交中所使用的探针依其来源可分为三种:即特异性cDNA、cRNA探针和人工合成寡核苷酸探针。 cRNA探针:是以cDNA为模板,通过体外转录而获得的。因为它是一种单链探针

序列标签位点的定义

序列标签位点(sequence-tagged site),是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间。

什么是序列标签位点?

序列标签位点(sequence-tagged site),是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间。

分子杂交

一、杂交通过碱基对之间非共价键(主要是氢键)的形成即出现稳定的双链区,这是核酸分子杂交的基础。杂交分子的形成并不要求两条单链的碱基顺序完全互补,所以不同来源的核酸单链只要彼此之间有一定程度的互补顺序(即某种程度的同源性)就可以形成杂交双链。分子杂交可在DNA与DNA、RNA与RNA或RNA与DNA的

常用基因诊断技术

   当细胞的基因组DNA用特定的内切酶如Eco RⅠ切割时,凡有GAATTC的地方都被切开,得到许多长度一定但互不相等的片段,需要分析、分离的基因或DNA片段就在其中某一特定的的片段上。  然而许多长短不同的DNA片段混合在一起是很难分析的。因此首先必需将它们按大小(长短)分离开来,这可借助凝胶电

基因诊断的常用技术

综述当细胞的基因组DNA用特定的内切酶如Eco RⅠ切割时, 基因诊断凡有GAATTC的地方都被切开,得到许多长度一定但互不相等的片段,需要分析、分离的基因或DNA片段就在其中某一特定的的片段上。 然而许多长短不同的DNA片段混合在一起是很难分析的。因此首先必需将它们按大小(长短)分离开来,这可借助

了解PCR生物学分子技术

  1、PCR基本要素   PCR基本要素与DNA复制的基本要素是一致的。   ①DNA模板:待拷贝的 DNA 称为模板,它可以是双链 DNA 也可是单链DNA,最后扩增得到的产物是双链状态的。   ②引物:是 DNA 复制的先锋,就象结晶过程中的晶核,引导 DNA 的合成。在 PCR 扩增中

分子杂交技术--1

互补的核苷酸序列通过Walson-Crick碱基配对形成稳定的杂合双链分子DNA分子的过程称为杂交。杂交过程是高度特异性的,可以根据所使用的探针已知序列进行特异性的靶序列检测。  杂交的双方是所使用探针和要检测的核酸。该检测对象可以是克隆化的基因组DNA,也可以是细胞总DNA或总RNA。根据使用的方

DNA序列测定技术(Sanger双脱氧链终止法与Maxam-Gilbert...2

二、Maxam-Gilbert DNA 化学降解法与包括合成反应的链终止技术不同,Maxam-Gilbert法要对原DNA 进行化学降解。这一方法是在体外研究lac阻抑制与lac操纵基因相互作用时酝酿发展起来的。时至今日,可以探测DNA 构象的蛋白质-DNA 相到作用,仍然是Maxam- G

关于探针标记方法的介绍

  ①缺口平移标记法。利用的是DNA聚合酶I能修复DNA链的功能。该法先由DNaseI在DNA双链上随机切出切口,然后DNA聚合酶I沿缺口水解5´;端核苷酸,同时在3´;端修复加入被标记核苷酸,切口平行推移。缺口平移法快速、简便、成本相对较低、比活性相对较高、标记均匀,多用于大分