全球最大癌症基因数据库发布

美国国家癌症研究所(NCI)科学家发布了有史以来规模最大的癌症相关基因变异数据库,为研究者们提供了迄今为止最全面的方式,搞清楚如何将治疗药物靶向疾病。 周一NCI在一份声明中称,基于基因组学研究的新数据库,将对全球开放获取,预计将有助于研究人员加快新药的开发,同时能够更好地将患者与疗法进行匹配。 当前所使用的大多数抗癌药物,都是基于其实证作用(empirical activity)。其中的大多数药物,我们知道存在作用靶标,但这些药物并没有与任何基因组学联系起来。 大多数的癌症治疗涉及很多的猜测工作,因为医生也没有办法确定某一特定患者是否有可能对当前许多常用药物或化疗有响应,抑或其癌症是否会对所用药物产生抗性。 为了创建数据库,NCI研究团队对60株人类癌细胞系进行了测序,得到了一张针对身体不同部位癌症特异性基因突变的详尽列表。 该项研究的成果已发表于美国癌症研究协会期刊《......阅读全文

癌症相关的基因突变类型及临床解释ASMTL

该基因编码的蛋白有一个N-末端,与枯草芽孢杆菌的多拷贝相关丝状(maf)蛋白和大肠杆菌的orfE相似,而C-末端与N-乙酰5-羟色胺O-甲基转移酶相似该基因位于X染色体和Y染色体的假常染色体区1(PAR1)。已经发现了三个编码不同亚型的转录变体。

癌症相关的基因突变类型及临床解释-BCR

断裂簇区域蛋白(BCR)也称为肾癌抗原NY-REN-26,是人类中由BCR基因编码的蛋白质。 BCR是BCR-ABL复合物中的两个基因之一,其与费城染色体相关。 已经发现了编码该基因的不同同种型的两种转录物变体。 虽然BCR-ABL融合蛋白已被广泛研究,但正常BCR基因产物的功能尚不清楚。 该蛋白质

癌症相关的基因突变类型及临床解释BLK

该基因编码src原癌基因家族的一个非受体酪氨酸激酶,典型地参与细胞增殖和分化该蛋白在b细胞受体信号传导和b细胞发育中起作用。该蛋白还刺激胰岛素的合成和分泌,对葡萄糖作出反应,并增强一些胰腺β细胞转录因子的表达。

癌症相关的基因突变类型及临床解释-BTLA

这个基因编码免疫球蛋白超家族的一个成员编码的蛋白质包含一个免疫球蛋白(Ig)结构域,是一个受体,通过传递抑制信号来抑制免疫应答选择性剪接导致多个转录变体这个基因的多态性与类风湿关节炎的风险增加有关。

癌症相关的基因突变类型及临床解释​ZAn

该基因编码一种蛋白质,在精子粘附卵透明带的物种特异性中发挥作用。编码蛋白位于顶体,可能参与信号传递或配子识别。该基因的等位基因多态性导致功能性和框移等位基因;参考基因组代表功能性等位基因。该基因的选择性剪接导致多个转录变体。

癌症相关的基因突变类型及临床解释​YWHSZ

该基因产物属于14-3-3蛋白家族,通过与含磷酸丝氨酸的蛋白质结合介导信号转导。这种高度保守的蛋白质家族在植物和哺乳动物中都有发现,这种蛋白质与小鼠、大鼠和绵羊的同源基因99%相同编码蛋白与IRS1蛋白相互作用,提示其在调节胰岛素敏感性中起作用在5’UTR中有几个不同但编码相同蛋白质的转录变体已经被

癌症相关的基因突变类型及临床解释-BRAF

该基因编码蛋白属于raf/mil家族的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,参与调控MAP/ERKs信号通路,在细胞分裂、分化和分泌起重要作用。BRAF基因的突变与各种癌症相关,包括非霍奇金淋巴瘤,结直肠癌,恶性黑色素瘤,甲状腺癌,非小细胞肺癌,肺腺癌。

癌症相关的基因突变类型及临床解释-AURKA

该基因编码的蛋白是一种细胞周期调节激酶,在染色体分离过程中似乎与纺锤体极的微管形成和/或稳定有关。编码蛋白存在于有丝分裂的间期细胞的中心体和纺锤体两极。该基因可能在肿瘤的发展和进展中起作用。在1号染色体上发现一个经过加工的假基因,在10号染色体上发现一个未经加工的假基因。已发现该基因的多个编码相同蛋

癌症相关的基因突变类型及临床解释-AXL

酪氨酸蛋白激酶受体UFO是一种人类由AXL基因编码的酶。 该基因最初被命名为UFO,因为这种蛋白质的功能不明。 然而,自其发现以来的几年中,对AXL表达谱和机制的研究使其成为一个越来越有吸引力的目标,特别是对于癌症治疗。 近年来,AXL已成为癌症细胞免疫逃逸和耐药性的关键促进因素,导致侵袭性和转移性

癌症相关的基因突变类型及临床解释ALB

这个基因编码人类血液中最丰富的蛋白质。这种蛋白质在调节血浆胶体渗透压中发挥作用,并作为一种载体蛋白,用于多种内源性分子,包括激素、脂肪酸、代谢物以及外源性药物。此外,该蛋白具有广泛的底物特异性和酯酶样活性。编码的前蛋白经蛋白质水解处理生成成熟蛋白。从这种蛋白质衍生的肽epi-x4是cxcr4趋化因子

癌症相关的基因突变类型及临床解释-BAX

该基因编码的蛋白属于bcl2蛋白家族。BCL2家族成员形成异二聚体或同二聚体,并作为抗或促凋亡调节因子参与多种细胞活动。该蛋白与bcl2形成异二聚体,并作为凋亡激活剂发挥作用。据报道,该蛋白与线粒体电压依赖性阴离子通道(vdac)相互作用并增加其开放性,导致膜电位下降和细胞色素c的释放。该基因的表达

癌症相关的基因突变类型及临床解释--ALCAM

该基因编码激活的白细胞粘附分子(alcam),也称为CD166(分化簇166),是免疫球蛋白受体的一个亚家族的成员,在细胞外区域有五个免疫球蛋白样结构域(vvc2c2c2)。该蛋白与T细胞分化抗原CD6结合,参与细胞粘附和迁移过程。发现了编码不同亚型的多种选择性剪接转录变体。

癌症相关的基因突变类型及临床解释-ACADSB

短/支链酰基辅酶a脱氢酶(ACADSB)是脂肪酸或支链氨基酸代谢中催化酰基辅酶a衍生物脱氢的酶家族中的一员底物特异性是定义该基因家族成员的主要特征。acadsb基因产物对短支链酰基辅酶a衍生物(s)-2-甲基丁基辅酶a具有最大的活性,但也与其他2-甲基支链底物和短直链酰基辅酶a发生显著反应。该cDN

同日两篇《自然》:基因突变可能抑制癌症?

  今日,《自然》杂志在线发表了两篇来自日本科研团队的最新研究论文。研究中,科学家们使用一系列遗传学的手段,找到了溃疡性结肠炎背后的常见突变基因。令人意外的是,其中一些基因突变,看起来似乎有抑制癌症的效果!  溃疡性结肠炎是一种常见的慢性炎症性疾病,病情常为带血的腹泻。如果患者的病情无法得到长期控制

癌症相关的基因突变类型及临床解释ACTB

这个基因编码六种不同的肌动蛋白中的一种。肌动蛋白是高度保守的蛋白质,参与细胞运动、结构、完整性和细胞间信号传导。编码蛋白是收缩装置的主要组成部分,也是两种广泛表达的非肌肉细胞骨架肌动蛋白之一。该基因突变导致Baraitser-Winter综合征1,其特征是人类患者的智力残疾和独特的面部外观。在整个人

癌症相关的基因突变类型及临床解释--ASNS

这个基因编码的蛋白质参与天冬酰胺的合成。这个基因补充了温度敏感型仓鼠突变体TS11的突变,该突变体在非耐受温度下阻止细胞周期G1期的进展。另外,还描述了该基因的剪接转录变体。

癌症相关的基因突变类型及临床解释BMX

该基因编码一个属于Tec激酶家族的非受体酪氨酸激酶该蛋白包含一个PH样结构域,通过结合磷脂酰肌醇3,4,5-三磷酸(PIP3)介导膜靶向性,以及一个结合酪氨酸磷酸化蛋白和信号转导功能的SH2结构域该蛋白参与多种信号转导途径,包括stat途径,并调节多种癌细胞的分化和致瘤性。另外,已经发现该基因的剪接

癌症相关的基因突变类型及临床解释-ACACA

乙酰辅酶a羧化酶(acc)是一个复杂的多功能酶系统。acc是一种生物素酶,催化乙酰辅酶a羧化为丙二酰辅酶a,这是脂肪酸合成的限速步骤。ACC有两种形式,α和β,由两种不同的基因编码ACCα在成脂组织中高度富集该酶在转录和翻译水平上处于长期控制之下,通过靶向丝氨酸残基的磷酸化/去磷酸化和柠檬酸盐或棕榈

癌症相关的基因突变类型及临床解释-ATRX

该基因编码的蛋白含有一个atpase/螺旋酶结构域,因此属于染色质重塑蛋白的swi/snf家族。这种蛋白被发现经历了细胞周期依赖性磷酸化,它调节其核基质和染色质的结合,并表明它参与有丝分裂的间期基因调节和染色体分离。该基因突变与X连锁精神发育迟滞(XLMR)综合征有关,通常伴有α-地中海贫血(ATR

癌症相关的基因突变类型及临床解释AMOT

该基因属于血管抑制素结合蛋白的motin家族,具有保守的螺旋结构域和C末端PDZ结合基序编码蛋白主要在毛细血管内皮细胞和胎盘大血管中表达,可能介导血管抑制素对血管形成的抑制作用,以及在新生血管形成过程中内皮细胞向生长因子的迁移。选择性剪接导致编码不同亚型的多个转录变体。

癌症相关的基因突变类型及临床解释ALDOC

该基因编码一类果糖二磷酸醛缩酶基因家族成员编码蛋白在大脑海马和浦肯野细胞中特异表达,是一种糖酵解酶,催化果糖-1,6-二磷酸和果糖1-磷酸分别可逆地切割为二羟基丙酮磷酸和甘油醛-3-磷酸或甘油醛。

癌症相关的基因突变类型及临床解释-ARNT

该基因编码一个含有一个基本螺旋环螺旋结构域和两个特征性PAS结构域以及一个PAC结构域的蛋白质编码的蛋白质与配体结合的芳香烃受体结合,并有助于该复合物向细胞核移动,在细胞核中促进参与外源代谢的基因的表达该蛋白也是缺氧诱导因子1转录调控的共因子。该位点与12号染色体上的etv6(ets变异体6)基因的

癌症相关的基因突变类型及临床解释-ARAF

丝氨酸/苏氨酸 - 蛋白激酶A-Raf或简称A-Raf是人类中由ARAF基因编码的酶。[5] A-Raf是丝氨酸/苏氨酸特异性蛋白激酶的Raf激酶家族的成员。 与该家族的其他成员(Raf-1和B-Raf)相比,对A-Raf知之甚少。它似乎具有其他同种型的许多特性,但其生物学功能尚未得到彻底研究。所有

癌症相关的基因突变类型及临床解释-AGK

该基因编码的蛋白质是一种参与脂质和甘油脂质代谢的线粒体膜蛋白。编码蛋白是一种脂质激酶,催化磷脂酸和溶血磷脂酸的形成这个基因的缺陷与线粒体DNA缺失综合征10有关。

癌症相关的基因突变类型及临床解释ASPM

该基因是果蝇“纺锤体异常”基因(asp)的人类同源基因,对胚胎神经母细胞的正常有丝分裂纺锤体功能至关重要在小鼠中的研究也表明该基因在有丝分裂纺锤体调控中的作用,在调节神经发生中具有优先作用。该基因突变与小头畸形原发性5型相关。已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。

癌症相关的基因突变类型及临床解释AHNAK

该基因编码的蛋白是一个大的(700kda)结构支架蛋白,由一个具有128个a a重复序列的中心结构域组成。编码蛋白可能在血脑屏障形成、细胞结构和迁移、心肌钙通道调节、肿瘤转移等多种过程中发挥作用。编码该基因的17 kDa亚型存在更短的变体,更短的异构体启动调节该基因的选择性剪接的反馈环。

癌症相关的基因突变类型及临床解释BLCAP

该基因编码一种通过刺激细胞凋亡来减少细胞生长的蛋白质。选择性剪接和选择性启动子的使用导致编码同一蛋白质的多个转录变体。该基因印在大脑中,每个亲本等位基因表达不同的转录变体。从上游启动子启动的转录变体优先从母体等位基因表达,而从散布的NNAT基因(GeneID:4826)下游启动的转录变体则从父等位基

癌症相关的基因突变类型及临床解释-ATR

该基因编码的蛋白属于PI3/PI4激酶家族,与ATM(一种在共济失调性毛细血管扩张症中突变的基因编码的蛋白激酶)关系最为密切。这种蛋白和atm与pombe-rad3裂殖酵母菌(schizosaccharomyces pombe rad3)具有相似性,后者是细胞周期停滞和DNA损伤修复反应中所需的细胞

癌症相关的基因突变类型及临床解释-BCOR

该基因编码的蛋白被鉴定为bcl6的相互作用共压子,bcl6是一种POZ/锌指转录抑制因子,是生发中心形成所必需的,可能影响细胞凋亡。这种蛋白选择性地与bcl6的poz结构域相互作用,但不与其他8种poz蛋白相互作用。特定的I类和II类组蛋白脱乙酰基酶(hdacs)与这种蛋白相互作用,这表明这两类hd

癌症相关的基因突变类型及临床解释-ATRIP

这个基因编码DNA损伤检查点的一个重要组成部分。编码的蛋白质结合到具有复制蛋白A的单链DNA上。该蛋白质还与共济失调毛细血管扩张症和RAD3相关蛋白激酶相互作用,导致其在DNA损伤引起的核内聚集。已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。