基因组所成功开发整合网络工具iBIG

近日,中科院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”研究员雷红星,带领其团队成功开发网页版整合网络工具——iBIG (integrative BIoloGy),该研究成果iBIG: An Integrative Network Tool for Supporting Human Disease Mechanism Studies发表在Genomics, Proteomics & Bioinformatics (GPB)2013年第3期Gene Regulatory Networks(GRN,基因调控网络)专刊上。该工具整合了多种基因相互作用和调控信息,生成的基因网络可以进行各类信息注释并在线直接完成可视化,这种网页版的可视化方式为网络的完善提供了极大的方便。 此外,该工具还提供了一个附件R软件包ArrayPro。利用该软件包中提供的一系列函数可以对微阵列数据进行预处理;可以寻找差异......阅读全文

基因组所肝癌全基因组合作研究取得新进展

  近日,由中国科学院北京基因组研究所所长吴仲义及其科学团队与国立台湾大学医学院陈定信院士、陈培哲院士共同合作开展的“肝癌癌症基因组合作研究”计划获最新进展,相关学术论文在在最新出版的PNAS杂志上发表。  “肝癌癌症基因组合作研究”计划于2009启动,作为基因组所一项长期的癌症基因

北京基因组所揭示线粒体基因组氧化损伤修复分子机制

  线粒体是真核生物细胞主要的能量代谢场所,其中呼吸链氧化磷酸化过程伴随有高水平的氧自由基(ROS)的产生。线粒体基因组缺乏组蛋白结合保护,所以容易受到ROS攻击而发生损伤,其突变的累积已证实与多种人类疾病(如神经退行性病变、糖尿病、心血管疾病和癌症等)的发生密切相关。有关核基因组DNA损伤修复分子

北京基因组研究所Plant-cell基因组研究新成果

  来自中科院北京基因组研究所、荷兰瓦赫宁根大学和中科院/马普学会等10多家机构的研究人员组成的一个研究小组,通过测序及分析醉蝶花(Tarenaya hassleriana)的基因组提供了关于十字花科植物繁殖性状和基因组进化的新认识。相关研究发表在植物学权威期刊The Plant Cell杂志上

易于整合的分析仪:新开发将Malvern-Link-II系统优势扩展

  (2013年2月6日,马尔文,英国) 马尔文仪器在其Malvern Link II产品中增加了新功能——强大的软件包可在自动化控制平台中整合多套分析仪。最新开发的技术将Malvern Link II软件系统的优势扩展到马尔文Mastersizer和Zetasizer系列分析仪中

生物与梅奥医学-合作推动整合全基因组测序和临床治疗

  1月9日,位于开发区的杭州奕真生物宣布与梅奥医学中心签署合作协议,共同为健康人群提供全基因组测序服务。   奕真生物,技术源于哈佛大学医学院,由哈佛大学医学院基因组学专家于2014年创立,其科学创始人乔治邱其教授(George Church)为哈佛大学“个人基因组计划”首席负责人,公司通过北美

研究揭示人逆转座子LINE1靶向整合基因组机制

中国科学院生物物理研究所许瑞明、朱冰和薛愿超课题组合作,系统揭示了人逆转座子LINE-1靶向整合基因组的重要机制。该研究刷新了对LINE-1逆转座机制的认知,也为基于逆转座调控的药物研发提供了新的理论依据。相关研究成果10月9日发表于《科学》杂志。类基因组中存在大量具有“跳跃”能力的逆转座子序列。这

荧光原位杂交技术检测植物基因组中整合的转基...(一)

荧光原位杂交技术检测植物基因组中整合的转基因片段实验实验材料 核苷酸试剂、试剂盒 冰水8-羟基喹啉秋水仙素固定剂酶解缓冲液仪器、耗材 载玻片玻璃盖玻片解剖针及镊子实验步骤 原位杂交的基本操作方法(图 14 .2 ) 演化自 Southern 杂交:标底是玻片上的染色体和细胞核,探针是带标记的待测

科学研究!新冠病毒RNA是否能够整合进宿主基因组?

  新型冠状病毒SARS-CoV-2是造成COVID-19在全球范围肆虐的病因。该病毒为一种单股正链RNA病毒,具有高传染性特性,能够感染人体各代谢系统的多种组织器官,并引发严重的临床症状,深入研究新冠病毒基因组RNA的特性十分必要。  2021年8月2日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中

荧光原位杂交技术检测植物基因组中整合的转基因片段...

实验材料核苷酸                                                          试剂、试剂盒冰水                                                                  8-羟基喹啉    

荧光原位杂交技术检测植物基因组中整合转基因片段实验

实验材料核苷酸试剂、试剂盒冰水8-羟基喹啉秋水仙素固定剂酶解缓冲液仪器、耗材载玻片玻璃盖玻片解剖针及镊子实验步骤原位杂交的基本操作方法(图 14 .2 ) 演化自 Southern 杂交:标底是玻片上的染色体和细胞核,探针是带标记的待测 DNA 序列 [ 本书中即是转基因和对照,图 14.3(a)

荧光原位杂交技术检测植物基因组中整合的转基...(三)

3.5 杂交混合变性和杂交( 1 ) 离心管中准备杂交液,见表14. 1,充分混合。 ( 2 ) 在离心管中加入 34 μl 杂交液、2 μl 转基因探针、1 μl 指示探针或对照探针,蒸馏水补齐至 40 μl,作为探针混合液。( 3 ) 探针变性,放入 70°C 水浴锅 10 min , 然后置冰

荧光原位杂交技术检测植物基因组中整合的转基...(二)

3.2 染色体制备无论是荧光染色还是 FISH,分裂期和分裂间期的染色体制备均于载物片上进行。建议使用蛋白水解酶对材料进行预处理,以去除细胞壁和细胞质,再将样品置于载玻片上,滴上乙酸,然后盖上玻片压片。所有操作均于室温下进行,除非是特殊说明。在洗涤和材料准备时使用小培养皿,方法见 2. 2 节。(

新型冠状病毒RNA不具备整合进宿主基因组的能力

       SARS-CoV-2是一种具有高度传播性的单股正链RNA病毒,是COVID-19严重流行的病因。SARS-CoV-2具备高传染性特性,并通过侵犯多器官系统而引起严重临床症状。本研究聚焦新冠病毒RNA基因组是否整合到受其感染的宿主细胞基因组的可能性。       2021年8月2日,中国

成功研制新型木质纤维素整合生物糖化生物催化剂

  木质纤维素具有储量大、可再生的特点,发展木质纤维素的高效转化技术不仅可以实现低值农业废弃生物质的高效利用,而且有望从根本上提出全新的能源与产粮出口。能源所开发新型木质纤维素整合生物糖化生物催化剂。 课题组供图  木质纤维素的复杂结构和组成形成了天然拮抗降解作用的屏障。因此,如何实现木质纤维素高效

基因组系统解析工具开发研究取得重要进展

近日,中国工程院院士、南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)教授包振民团队开发国际首个整合宏观/微观进化基因组和功能基因组的综合分析工具(PanSyn,https://github.com/yhw320/PanSyn)。相关成果发表于《自然-实验手册》。该成果是包振民团队长期积累的丰富基因组学分析方

中国石化成功开发全新结构分子筛

  人民网北京6月13日电(余璐)日前,国际分子筛协会网站公布,由中国石化上海石油化工研究院杨为民团队开发的全新结构的分子筛材料SCM-14(SINOPEC Composite Material 14),正式获得国际分子筛协会(IZA)授予的结构代码SOR。专家认为,这意味着中国石化成为我国首个获得

新型减污降碳催化氧化技术成功开发

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500263.shtm近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员孙承林和研究员卫皇曌等在废水催化氧化研究方面取得新进展,并开发了新型减污降碳催化氧化技术。相关成果发表在ACS Applied Material

英国成功开发超薄量子发光二级管

  英国剑桥大学研究人员近日成功开发出仅几个原子厚层状材料的超薄量子发光二极管(LED)。由于具有不同超薄材料组成的构造层,原件可以用于开发新的计算与感应技术。   具备仅用电流生产单光子的能力是建设紧凑型芯片量子网络的重要环节,基于量子力学原理开发的计算机比现有技术更加强大和安全。为了实现这种元件

芬兰成功开发世界首款高光谱移动设备

   芬兰VTT国家技术研究中心通过将iPhone摄像机转换为新型光学传感器,成功开发出世界上第一个高光谱移动设备,这将为低成本高光谱成像的消费应用带来新的前景,例如消费者将能够使用移动电话进行食品质量检测或健康监测。   光谱成像广泛用于各种物体感测和材料属性分析。高光谱成像对图像中每个像素点进行

光活性抗菌硅橡胶材料开发成功

  英国伦敦大学研究人员最近在《化学科学》杂志上发表论文称,他们研发出一种新型光活性抗菌硅橡胶材料,在光照条件下对细菌产生致命效果,在黑暗环境中则具有很好的抗菌作用。现代医院如广泛使用这种抗菌材料,可有效降低院内感染。   硅橡胶是一种在医院中被广泛使用的材料,可作为密封剂或防护层用于各种医疗用品

超薄低相位差PC膜开发成功

  近日,日本旭硝子公司通过注塑成形方式成功开发出厚度薄至100微米、相位差更低的聚碳酸酯(PC)薄膜CarbogalssC110C-LR。该产品主要设计用途为氧化铟锡(ITO)、透明导电膜的基本膜等,相位差在10纳米以下。  据介绍,以往面向智能手机等电子设备的透明导电膜基材中,多在聚对苯二甲酸乙

新型双荧光共定位系统开发成功

北京航空航天大学生物与医学工程学院和北京大学化学与分子工程学院等研究人员以绿色荧光蛋白(GFP)和红色荧光蛋白(RFP)为材料,开发出一种新的用于活细胞内检测蛋白质相互作用的检测系统。研究论文近期发表在《科技导报》上。    荧光蛋白是目前细胞分子生物学广泛应用的分子探针,在细胞生物学、组织工程、基

利用发光细菌监测水质技术开发成功

位于以色列海法的Checklight公司利用地中海沿岸一种夜间会发光的细菌开发出一种对水中污染物极为敏感的物质,将这种物质做成的基底与发光细菌相结合,再配上一个光度计,即可快速便捷地对水质进行实时监测。只要将这种发光细菌放到含有害物质的水中,它们就会发出报警光信号,对这种信号测量分析,即可对污染物性

研究成功开发新型病毒样颗粒递送系统——ENVLPE

  在生命的蓝图中,DNA就像一本写满遗传信息的“天书”。然而,这本天书中偶尔也会出现“错别字”,导致各种遗传疾病的发生。近年来,基因编辑技术成为科学家手中的一把“分子剪刀”。它能够精准地修改DNA中的错误片段,从而有望在根本上治愈疾病。  其中,CRISPR-Cas9的出现,彻底改变了基因编辑领域

中国科学家成功绘制人参基因组图谱

  3月4日,在钓鱼台国宾馆中国人参基因组图谱新闻发布会上,中科院基因组所副所长、世界知名基因组学专家于军向媒体公布:经过吉林省通化市政府、中科院北京基因组研究所、吉林紫鑫药业的共同努力,于2月底成功绘制出人参基因组图谱,揭开了人参的神秘面纱,为人参的种植、防病、开发与人参产业发展振兴提供

首个韩国人基因组图谱绘制成功

据韩国联合通讯报道,韩国研究机构日前宣布,第一个完整的韩国人基因组图谱已经绘制成功。 报道指出,这是人类染色体碱基序列第四次被完整破译,这项成果是由韩国嘉泉医科大学和韩国生命工程研究院的两个研究团队通过共同研究取得的。研究人员宣布,分析测序中使用的基因物质来自于嘉泉医科大学教授金圣镇。 研究的目的是

植物线粒体基因组组装新工具研发成功

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494540.shtm近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所绿色轻简超级稻遗传解析与分子育种创新团队开发出一套新型植物线粒体基因组组装工具GSAT。该工具能够快速组装图形化植物线粒体基因组,更好地评估其泛

科学家成功绘制出大麦基因组草图

  据物理学家组织网10月17日报道,一个国际科学家小组在《自然》杂志上公布了高分辨率的大麦基因组草图。这项突破是朝着研发更优良的大麦新品种迈出的关键一步,不仅有助于防治禾谷类作物疾病,满足气候变化条件下的粮食需求,同时也会对啤酒和威士忌行业产生重要影响。   大麦基因组的大小几乎是人类基因组的两

世界首个深纹核桃基因组测序成功

   日前,由中国科学院昆明植物研究所研究员、中国西南野生生物种质资源库副主任李唯奇博士带领的联合研究团队,与摩尔农庄生物科技开发公司、云南省林业科学院和基迪奥生物科技有限公司合作,完成了首个深纹核桃(Juglans sigillata D.)基因组测序。我国核桃栽培面积世界第一,云南的核桃栽培面积

中国科学家成功破译树鼩基因组

  2013年2月6日,中科院昆明动物所、深圳华大基因研究院等单位对树进行了全基因组测序,并对其分类地位和相关生物学特征进行了深度解析。树基因组的完成,将为其在生物医学研究中用作动物模型奠定重要的遗传学基础,进而使其更好的应用于生物医药研究。研究成果在《自然•通讯》(Nature Communi