研究揭示人逆转座子LINE1靶向整合基因组机制

中国科学院生物物理研究所许瑞明、朱冰和薛愿超课题组合作,系统揭示了人逆转座子LINE-1靶向整合基因组的重要机制。该研究刷新了对LINE-1逆转座机制的认知,也为基于逆转座调控的药物研发提供了新的理论依据。相关研究成果10月9日发表于《科学》杂志。类基因组中存在大量具有“跳跃”能力的逆转座子序列。这些序列在胚胎发育、免疫及神经系统等特定阶段和环境下会被激活,发挥重要生理功能;但在病毒感染、肿瘤发生和机体衰老等状态下,也可能异常活化,导致基因调控紊乱和基因组不稳定。人体中唯一具有自主转座活性的逆转座子是长散在元件1,即LINE-1,也是绝大多数逆转座子的迁移载体。然而,其靶向整合的分子机制一直不清楚。该研究从结构和生化角度阐明了LINE-1逆转座过程中核酸底物的结合模式以及DNA结构介导的靶向切割机制。研究团队发现,LINE-1编码的逆转录酶ORF2p主要通过电荷相互作用与DNA骨架结合,而非依赖特定序列识别;并通过单颗粒冷冻电镜......阅读全文

研究揭示人逆转座子LINE1靶向整合基因组机制

中国科学院生物物理研究所许瑞明、朱冰和薛愿超课题组合作,系统揭示了人逆转座子LINE-1靶向整合基因组的重要机制。该研究刷新了对LINE-1逆转座机制的认知,也为基于逆转座调控的药物研发提供了新的理论依据。相关研究成果10月9日发表于《科学》杂志。类基因组中存在大量具有“跳跃”能力的逆转座子序列。这

中国医学科学院最新文章:关键逆转录转座子与癌症

  LINE-1是现今人体内存在的唯一具有自主转座活性的转座子,约有 500 000个拷贝,占人类基因组总量的17%。LINE-1是通过转录和逆转录在内的转座过程产生新的DNA拷贝,并使新产生的DNA拷贝插入基因组的不同位 置。LINE-1转座会影响基因组中其他基因的表达或调控,因而会对基因组的稳定

中国医学科学院最新文章:关键逆转录转座子与癌症

  “核心刊物”栏目创办于2002年,主旨在于向国内专业人士展示科研核心刊物,以及生命科学领域杂志每期重点内容,为读者呈现精彩纷呈的国内科研动向,和重大科研进展。目前包括《遗传》、《中国生物工程杂志》、《科学通报》等重点期刊,也欢迎生物类期刊联系合作(联系邮箱:journal@ebiotrade.c

许瑞明研究组合作揭示-人逆转座子LINE1靶向整合基因组的重要机制

  人类基因组中存在大量具有"跳跃"能力的逆转座子(retrotransposon)序列。在胚胎发育早期、免疫和神经系统等特定阶段和环境下,它们会被激活,发挥重要生理功能;在病毒感染、肿瘤发生和机体衰老等状态下,他们常常会持续异常活化,导致基因调控紊乱和基因组不稳定。  人体唯一具有自主转座活性的逆

科学家揭示去甲基化酶在肿瘤中的致病机理

   11月21日,肿瘤学研究领域的国际权威杂志《癌症研究》在线发表了武汉大学李枫教授团队和中国科学院北京基因组所吕雪梅研究员最新合作研究成果。该研究以“KDM4B通过激活LINE-1促进DNA损伤”为题,解析了组蛋白去甲基化酶(KDM4B)在肿瘤中所扮演的新角色,从全新角度揭示了KDM4B在肿瘤细

天津大学Cell子刊揭示反转座子调控新机制

  来自天津大学及约翰霍普金斯大学的研究人员在新研究中证实,与自身免疫病Aicardi-Goutières综合征相关的一种蛋白质SAMHD1调节了反转座子LINE-1及其LINE-1介导的Alu/SVA反转录转座。相关研究论文发表在9月12日的《Cell Reports》杂志上。   文章的通

天津大学Cell子刊揭示反转座子调控新机制

  来自天津大学及约翰霍普金斯大学的研究人员在新研究中证实,与自身免疫病Aicardi-Goutières综合征相关的一种蛋白质SAMHD1调节了反转座子LINE-1及其LINE-1介导的Alu/SVA反转录转座。相关研究论文发表在9月12日的《Cell Reports》杂志上。   文章的通

于晓方课题组Nature子刊揭示蛋白活化机制

  来自天津大学、天津大学第一附属医院、中科院高能物理研究所等机构的研究人员,在新研究中报告了分辨率为1.8埃,同源四聚体SAMHD1与变构激活体及底物dGTP/dATP的复合物晶体结构,由此揭示了dGTP依赖性四聚体SAMHD1脱氧核苷三磷酸酶(dNTPase) 活化的结构机制。这一成果发表在

科学家鉴定一类跨越无脊椎脊椎动物基因复制机制

  基因既可以通过DNA水平的复制,也可以通过RNA水平的复制来产生新的拷贝,后者又称为逆转录基因,产生的过程称为逆转录。有实验证明在哺乳动物中,逆转录基因由一种non-LTR类型的逆转座子介导产生,但是在其他动物中却并不明确。日前,中科院动物所张勇研究组在逆转座子介导的复制过程研究取得进展,相关成

武汉大学:建立体外高效CRISPR/Cas9靶向DNA编辑系统

  在我们的DNA深处潜伏着许多“寄生虫”,那就是被称为跳跃基因的转座子。这些尾巴很长的家伙如果插入健康的基因,就可能会引发疾病。不过迄今为止,人们还不清楚这种尾巴对于转座子的跳跃有何作用。  密西根大学医学院的研究团队在十一月十二日的Molecular Cell杂志上发表文章指出,没有尾巴的转座子

Cell子刊解决跳跃基因之谜

  在我们的DNA深处潜伏着许多“寄生虫”,那就是被称为跳跃基因的转座子。这些尾巴很长的家伙如果插入健康的基因,就可能会引发疾病。不过迄今为止,人们还不清楚这种尾巴对于转座子的跳跃有何作用。  密西根大学医学院的研究团队在十一月十二日的Molecular Cell杂志上发表文章指出,没有尾巴的转座子

-三大杂志同时揭示胃肠癌中的跳跃基因

  近日刊登在Nature Medicine、Genome Research及PNAS上的三篇研究论文中,来自约翰霍普金斯大学等处的科学家们通过对人类癌症组织进行活检均发现了在许多胃肠癌发生期间患者机体所谓的LINE-1跳跃基因处于激活的状态;研究者指出,目前并没有证据表明,人类基因组常规元件中跳跃

分子的重复机制逆转录转座子

复制中的逆元件或逆转录病毒侵入细胞时,病毒蛋白通过将RNA逆转录为DNA来复制其基因组。如果病毒蛋白异常附着于细胞mRNA,可以逆转录它们成为返座基因(Retrogenes)。返座基因通常缺乏内含子序列,并且通常含有整合到基因组中的poly序列。与其亲本基因序列相比,许多返座基因的基因调控的有明显的

Neuron揭示精神分裂症的病因根源

  常被称之为“垃圾DNA”的反转录转座子DNA片段,有可能在精神分裂症中发挥了重要的作用。在一项发表在《神经元》(Neuron)杂志上的研究中,一个日本的研究小组揭示了LINE-1反转录转座子在精神分裂症大脑中异常的丰富,在大脑发育过程中改变了与精神分裂症相关的一些基因的表达,有可能是精神分裂症的

跳跃基因:物种跨越,人类进化的新型遗传方式?

  Source: University of Adelaide  跳跃基因  跳跃基因(或转座子)是指能够进行自我复制,并能在生物染色体间移动的基因物质。它们具有扰乱被介入基因组成结构的潜力,并被认为是导致生物基因发生渐变(有时候是突变),并最终促使生物进化的根本原因。  转座因子约占人类基因组的

今年杀疯了!张锋团队接连发表Science、Nature和Cell

  non-LTR逆转录转座子,或Long Interspersed Nuclear Elements(LINEs),是一类丰富的真核转座子,通过靶启动逆转录(TPRT)插入基因组。在TPRT过程中,一个目标DNA序列被切割并启动逆转录转座子RNA的逆转录。  2023年4月6日,博德研究所张锋团队

跳跃基因或会威胁胎儿的卵细胞质量

  女性从出生以来,其机体中卵子的储备是非常有限的,因此确保卵子中遗传物质的质量就显得尤为重要了。近日,一项刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中,来自卡内基科学研究所等机构的科学家们通过研究阐明了一种特殊机制,即利用这种机制,个体在出生前就能够尝试消除质量较差的卵细

转座子及转座子标签法克隆基因的改进

1 转座子及转座子标签法克隆基因基因标签法克隆植物组织中的基因是较为常用的一种方法,T-DNA和转座子均可作为基因标签。转座子最早由美国的细胞遗传学家Mc-clintock在玉米中发现,它是指基因组中一段特定DNA片段,能在转位酶的作用下从基因组的一个位点转移到另一个位点。转座子不仅能在本基因组中转

科学家开发逆转座子基因工程新技术 实现全RNA介导的基因精准写入

  基因组DNA是生命的蓝图,对基因组DNA实现任意尺度的精准操作代表对生命蓝图进行修改绘制的底层能力,是基因工程技术发展的核心。以CRISPR基因编辑技术为代表的技术进步实现了基因组单碱基和短序列尺度的精准编辑,基本解决了基因组精准编辑的挑战。然而,如何针对应用场景的需求,实现大片段DNA在基因组

白水牛为什么是白的?

白水牛 梁正文摄  贵州白水牛,这个“萌物”全身被毛白色而有光泽,角和蹄亦为白色,皮肤呈粉红色,但眼睛为黑色。作为地方水牛品种,看到白水牛的第一眼就让人不禁赞叹它的可爱。  白水牛为什么这么白?11月3日,中国农业大学动物科技学院张毅课题组联合国际家畜研究所—中国农业科学院北京畜牧兽医研究所畜禽牧草

“跳跃基因”对人脑早期发育有积极作用

长期以来,人类基因组中约98.5%的非编码DNA被视为“垃圾”,因为它们缺乏明确功能。然而越来越多的研究表明,这些区域在基因调控、发育过程和进化中扮演着关键角色。发表于最新一期《细胞·基因组学》的研究中,一个国际团队结合类器官与“基因魔剪”技术,阐明了重复DNA序列——特别是被称为“跳跃基因”的转座

Gene-Dev:研究发现抗癌基因有助于控制“跳跃”基因

  所有肿瘤中约有一半具有基因p53的突变,通常负责抵御癌症。现在,UT西南大学的科学家发现了p53在对抗肿瘤中的新作用:防止逆转座子或“跳跃基因”在人类基因组中跳跃。研究小组发现,在p53缺失或突变的细胞中,逆转座子的移动与扩增比平时更为常见。这一发现可能会导致检测或治疗具有p53突变的癌症的新方

报道转座子的定义

中文名称报道转座子英文名称reporter transposon定  义在转座子处插入报道基因,如某种抗性基因和酶基因等,作为这段序列是否发生转座的标记。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

报道转座子的定义

中文名称报道转座子英文名称reporter transposon定  义在转座子处插入报道基因,如某种抗性基因和酶基因等,作为这段序列是否发生转座的标记。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

需要RNA中间物的复制型转座的介绍

  逆转录转座子都需要RNA中间物,但LTR逆转录转座子和无LTR逆转录转座子在转座的具体步骤上有很大的差别。   LTR逆转录转座子进行转座时,形成cDNA的过程与逆转录病毒合成cDNA相同,双链cDNA通过剪切一黏接转座插入靶序列。无LTR逆转录转座子的转座过程较复杂,以LINE为例,转座的基

需要RNA中间物的复制型转座

逆转录转座子都需要RNA中间物,但LTR逆转录转座子和无LTR逆转录转座子在转座的具体步骤上有很大的差别。LTR逆转录转座子进行转座时,形成cDNA的过程与逆转录病毒合成cDNA相同,双链cDNA通过剪切一黏接转座插入靶序列。无LTR逆转录转座子的转座过程较复杂,以LINE为例,转座的基本过程如下:

研究揭示SAMHD1蛋白重要细胞学新功能

  来自吉林大学第一医院的声音:让我们再一次领先于世界!   吉林大学白求恩第一医院艾滋病与病毒研究所再次传来喜讯:该团队在世界上首次证明人SAMHD1蛋白具有调控内源逆转录转座子活性的能力,成功揭示了SAMHD1蛋白在人体内的一大重要细胞学功能。这一重大发现已于九月十二日以在线发表的形式刊登在世

Nature:转座子编码的核酸酶利用向导RNA促进转座子自身的传播

  基因组工程可能是医学的未来,但它依赖于数十亿年前在原始细菌中取得的进化进步,而原始细菌是最初的基因编辑大师。科学家们对这些古老的基因编辑系统进行改造,推动它们完成更加复杂的基因编辑任务。然而,要发现新工具,有时需要回顾过去,了解细菌最初如何创建原始的基因编辑系统,以及构建的原因。  在一项新的研

凭借一个突变,小菜蛾进化出稳定抗药性

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/497511.shtm苏云金芽胞杆菌(Bt)能产生多种杀虫蛋白,高效特异的杀死多种宿主昆虫。然而目前,全世界已经有9种重要的农业害虫对Bt生物杀虫剂或转Bt基因抗虫作物产生了抗药性。   ?小菜蛾。

跳跃基因或能帮助在培养皿中制造活性神经元细胞

  近日,一项刊登在国际杂志Stem Cell Reports上的研究报告中,来自阿卜杜拉国王科技大学等机构的科学家们通过研究表示,在实验室培养皿中制造功能性脑细胞的过程需要对自私遗传元件LINE-1(L1)逆转录转座子的精确激活,相关研究结果或有望帮助开发安全有效的再生疗法来治疗帕金森疾病和其它脑