Nature发布轮虫基因组研究新成果

有一群动物放弃了性,但却在进化过程中生成了460多种物种。本周的《自然》(Nature)杂志上发表了一篇关于蛭形轮虫(bdelloid rotifer)全基因组的研究论文,为揭示这一进化机制减少了些许神秘。 Woods Hole海洋生物学实验室(MBL)David Mark Welch说,没有采用普通的有性生殖方式来清除掉它DNA中的有害突变,数千年来这一微小的水生动物似乎采用了其他的策略来维持谱系,避免受遗传损伤所累或是因其而灭绝。 Mark Welch和他MBL的同事Irina Arkhipova,是这一国际项目的美国研究团队的领导者。在这项研究中,研究人员对轮虫基因组进行了测序和分析。 在蛭形轮虫中研究人员从未观察到过雄性及减数分裂。反而,后代是由未受精卵分裂生成。轮虫的基因组证实,其确实采用了这一对于大多数动物而言是进化死胡同的生殖策略。 “轮虫基因组的结构与预期看到的完全相符,长期......阅读全文

关于全基因组测序的基本信息介绍

  全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。 1986年, Renato Dulbecco是最早提出人类基因组测序的科学家之一。他认为如果能够知道所有人类基因的序列,对癌症的研究将会很有帮助。美国能源部(DOE)与美国国家卫生研究院(NIH),分别在1986年与1987年加入人类基

15000年前“农民”全基因组数据出炉

  英国《自然·通讯》杂志近日发表的一项遗传学报告中,德国科学家公布了生活在15000年前的安纳托利亚“农民”的首个全基因组数据。该研究结果有助于认识欧亚大陆的农业起源。图片来源于网络   农业在公元前10000年至9000年左右起源于亚洲西南部的新月沃土(Fertile Crescent),随后传

自闭症谱系障碍家庭全基因组测序

  近日,国际生物学顶尖期刊nature medicine在线刊登了加拿大科学家的一项最新研究成果,他们通过对85个有两个自闭症谱系障碍(ASD)孩子的四成员家庭和170个患有ASD的个体进行了全基因组测序,发现在ASD疾病中存在大量遗传异质性。根据他们的实验结果,在研究和临床中应用全基因组测序诠释

中国梅花鹿全基因组测序计划启动

  日前,由中国农业科学院特产所牵头的中国梅花鹿全基因组测序计划启动。  该计划将采用测序深度达30X的新一代高通量测序技术(鸟枪法),联合新西兰皇家农业科学院茵沃梅农业研究中心、加拿大阿尔伯塔大学以及国内外相关单位,合作完成中国梅花鹿基因组的测序、组装和注释工作,以奠定中国梅花鹿功能基因

首张非洲人全基因组图谱问世

据《自然》杂志报道,2月6日,美国加州Illumina生物技术公司宣布,他们首次对一位非洲男子进行了完整的基因组测序。 在此之前,科学家已经对两位白人男性(James Watson和Craig Venter)和一位中国男性进行了全基因组测序,但从未对非洲人进行研究。因此,这位匿名的尼日利亚约鲁巴人男

全基因组甲基化定量检测技术LUMA

  LUMA介绍   基因组DNA甲基化(Genomic DNA Methylation, GDM)的变化被认为是正常和病理细胞过程中的重要的事件,有助于正常发育和分化以及癌症和其他疾病。在此,我们介绍一种新的方法评估全基因组DNA甲基化,称为荧光甲基化检测(Luminometric Methyl

全基因组测序解读重要甲基化机制

  DNA看起来只是AGTC四种碱基的简单排列,可一旦它与组蛋白包装形成染色质,情况就复杂得多了。组蛋白主要有四种,分别是H2A、H2B、H3和H4。这些组蛋白要么令DNA盘绕起来保持沉默,要么将DNA解开允许基因表达。组蛋白上的化学修饰(如甲基化),能够影响它对基因的控制。   H3K4me3是

RNA测序技术如何绘制全基因组转录终止?

  近日,南方科技大学生命科学学院翟继先团队利用纳米孔单分子RNA测序技术绘制了拟南芥全基因组水平转录终止图谱。该方法能同时捕获包括已转录过polyA位点的 readthrough转录本、完成3’末端切割的5’或3’切割产物、以及已完成或正在进行多腺苷酸化(polyadenylation)的转录本在

全基因组测序揭示肝癌相关基因突变

  由亚洲癌症研究组织(ACRG)、深圳华大基因研究院等多家单位合作完成的与肝细胞癌相关的基因突变研究成果于2013年6月20日在《基因组研究》(Genome Research)杂志上发表。这是继2012年3月份在《自然-遗传学》上发表的乙肝病毒整合机制研究之后,该研究团队在肝癌研究中所取得的又

科研论文|Sikun-2000全基因组测序性能卓越

上海交通大学联合思昆生物在国际期刊Scientific Reports发表了题为“Comparative assessment of the Sikun 2000 sequencing platform for whole genome sequencing”的研究成果。研究成果表明Sikun 20

Nature发布大型全基因组RNA分析研究

  由来自宾夕法尼亚州立大学的化学家和植物生物学家领导的一个研究小组开发出了一种分子技术,将有助于科学团体以从前不可能达到的规模,来分析在基因表达调控中起重要作用的分子。   科学家们开发出了一种方法,能够更精确预测在活细胞内核糖核酸分子(RNAs)的折叠情况,由此阐明植物以及其他的活体生物对环境

基因是否表达:cfDNA全基因组测序可揭晓

  《Nature Genetics》杂志上的研究表明,血循环游离DNA(cfDNA)可提供线索来预测基因的表达。  全基因组测序就能知道基因是否表达  基因表达(gene expression)是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中的遗传信息经过转录和翻译,最后转变成具有生物活性的蛋白质分子的

全基因组测序揭示蒙古族遗传结构

  内蒙古民族大学生命科学学院白海花团队对175名蒙古人进行了全基因组测序,从而揭示了蒙古族的遗传结构。11月6日,相关成果发表于《自然—遗传学》。  历史上,蒙古族的统治疆域曾北至俄罗斯的西伯利亚,南至中国南海,东北至黑龙江,西南至缅甸泰国境内,蒙古族民众也因此四散各地。不过,对于蒙古族人如何影响

川蛭通络胶囊的性状及功能主治

  性状  本品为胶囊剂(肠溶)。  功能主治  活血化瘀,益气通络。用于中风病中经络(脑梗塞)恢复期血瘀气虚证。症见半身不遂,口舌歪斜,语言蹇涩或不语,偏身麻木,气短乏力、口角流涎,手足肿胀,舌暗或有瘀斑,苔薄白。

芪蛭通络胶囊的注意事项及贮藏

  注意事项  1、用药期间避风,有出血倾向者慎用。  2、建议在医生指导下使用。  贮藏  密封,置阴凉通风干燥处。

噬菌蛭弧菌、噬菌体和细菌素(5)

蛭弧菌、噬菌体和细菌素作用敏感细菌,在含有敏感细菌的双层琼脂上均可形成透明的噬菌斑。形成的噬菌斑随敏感菌株的生长代谢停止而停止扩展。蛭弧菌噬菌斑可随培养时间而扩展,直至宿主菌耗尽。蛭弧菌在死菌上形成噬菌斑的速度更快、数目更多。用检查噬菌体、细菌素的方法很难检出蛭弧菌,用检查蛭弧菌的方法不能检出噬菌体

噬菌蛭弧菌、噬菌体和细菌素(4)

噬菌体侵入宿主细胞进行系列合成反应时,宿主菌细胞本身进行了一系列工作,以修复噬菌体侵入所引起的创伤,并加固胞壁的结构,阻止细胞质的继续渗出。噬菌体巧妙地利用宿主菌细胞的“机器”而有效地合成自身。 (三)细菌素对敏感菌株的作用 细菌素的作用范围很窄,与噬菌体一样有很强的特异性。有的细菌素

噬菌蛭弧菌、噬菌体和细菌素(1)

在流行病学和细菌学的研究中,噬菌蛭弧菌(Bdellovibrio bacteriovorus,简称蛭弧菌)、噬菌体、细菌素的研究及其应用已越来越引起人们的关注。蛭弧菌、噬菌体、细菌素是分属于细菌、病毒、抗菌物质3种不同的有机物,但它们有许多相似的生物特性,而且往往引起人们产生错误的概念。蛭弧菌是

噬菌蛭弧菌、噬菌体和细菌素(2)

(二)噬菌体的形态与结构噬菌体不能在光学显微镜下观察到,因此,对噬菌体形态、结构的认识,得从电子显微镜开始,这一点与细菌素是相同的。噬菌体个体叫做病毒粒子,它的形状有3种,包括蝌蚪形、微球形和纤丝形。目前已知大部分噬菌体是属于蝌蚪形,它由头和尾两部分组成。噬菌体尾部的结构比较复杂,是感染、吸附、侵入

噬菌蛭弧菌、噬菌体和细菌素(3)

T偶数噬菌体除头部蛋白和可收缩尾部蛋白质外,还有一些功能不明的内部蛋白占总蛋白质的3%,此外还含有少量其他物质,如酸溶性肽类,主要为门冬氨酸、谷氨酸和赖氨酸;两种酸溶性多胺——腐胺和精胺。 (三)细菌素的化学组分及理化性质 细菌素是一种具有生物活性蛋白质类物质。大多数细菌素是含有蛋白质

香港基因组计划细节公布!将进行两万人全基因组测序

  基因大数据是精准医学的基础,全世界已经启动了众多大规模基因组学计划,朝着精准医疗的目标迈进。根据香港特区政府食物及卫生局本周提交的一份文件,作为香港基因组计划(Hong Kong Genome Project,HKGP)的一部分,香港计划对20,000名参与者进行基因组测序和分析。相关文件将于下

基因组所参与的人类全基因组关联分析合作研究获重要进展

与血小板数量相关的GWAS SNP与222 kb 以外的JAK2基因相关联  日前,中科院北京基因组研究所重大疾病基因组与个体化医疗实验室“百人计划”方向东研究员项目组助理研究员渠鸿竹博士等参与开展的国际合作研究“人类疾病全基因组关联分析研究”获得重大进展。相关研究成果Systema

香港中大破解鼻咽癌全基因组图谱

  香港中文大学7日宣布,该校医学院研究人员成功破解鼻咽癌的全基因组图谱,这一突破性发现有助评估鼻咽癌病人的预后情况,并向鼻咽癌的个人化治疗迈出一大步。  鼻咽癌是华南地区常见的癌症,也是一种极具侵略性的头颈癌。据介绍,鼻咽癌大多与感染EB病毒相关。由于缺乏早期病征,60%至70%患者于确诊时已届晚

我国首次完成寨卡病毒全基因组序列测定

  2月22日,记者从军事医学科学院获悉,该院与广州市第八人民医院、出入境检验检疫系统相关单位密切合作,在获得从委内瑞拉归国患者临床标本后,采用高通量测序技术,于2月21日直接从尿液中获得病毒全基因组序列。  寨卡病毒属黄病毒科,是一种主要由伊蚊传播的虫媒病毒。1947年首次在乌干达寨卡丛林中的恒河

Genome-Res:全基因组测序追踪耐药细菌传播机制

  耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)是一种常见的引发院内感染的致病菌,其也是资源不足医院感染的一大负担,此前当资源较好的临床机构运用全基因组测序来追踪MRSA的扩散时,针对有限的感染控制的传播动力学常常并不清楚,近日,来自剑桥大学的研究人员就利用全基因组测序的技术揭示了高传播率的资源受限医院中M

中国诞生全球首张水稻全基因组育种芯片

  中国中化集团公司下属中国种子集团有限公司联合华中农业大学、北京大学近日共同研制出全球首张水稻全基因组育种芯片,将大幅提高种子真实性检测准确性,有助提高育种效率,杜绝假种子危害。     中种公司生命科技中心喻辉辉博士表示,目前业内判断水稻种子真实性通常采用国标推荐的24个SSR标记检测结果,

张强峰博士Nature解析全基因组蛋白互作

  来自美国哥伦比亚大学,同济大学等处的研究人员发表了题为“Structure-based prediction of proteinCprotein interactions on a genome-wide scale”的文章,提出了一种基于三维结构信息的全基因组蛋白质相互作用计算预测方

我科学家主导完成白菜全基因组研究

  8月29日,由多国科学家共同合作完成的白菜全基因组研究成果在《自然—遗传学》上在线发表。这是由中国科学家主导,通过国际合作完成的又一重大成果。   白菜类蔬菜包括结球白菜、小白菜、菜心和芜菁等形态各异的一大类蔬菜。据了解,科学家开展了白菜基因组注释、比较基因组学、基因组进化和各种

全基因组测序是癌症诊断的强有力工具

  一位没有明显癌症家族史的妇女却罹患了早发性乳腺癌和卵巢癌,以及与治疗有关的急性髓细胞样白血病。研究人员对这名妇女进行了全基因组测序,所用的是从该患者的皮肤和骨髓中获取的DNA。在许多被怀疑患癌症可能性增加了的病人中,常规性的候选基因测试(如BRCA1  和  BRCA2突变检测)无法显示出有用的

玉米全基因组选择育种973项目启动

  2月18日,由中国农业科学院作物科学研究所牵头的973项目“玉米产量和品质性状全基因组选择育种的基础研究”启动会在京召开。科技部基础司副处长钱万强、农业部科教司巡视员石燕泉、中国农科院副院长刘旭、中国农科院科技局局长梅旭荣等领导出席了会议。中国农科院作科所所长万建民致欢迎辞,对各级领导及各位专家