香港基因组计划细节公布!将进行两万人全基因组测序

基因大数据是精准医学的基础,全世界已经启动了众多大规模基因组学计划,朝着精准医疗的目标迈进。根据香港特区政府食物及卫生局本周提交的一份文件,作为香港基因组计划(Hong Kong Genome Project,HKGP)的一部分,香港计划对20,000名参与者进行基因组测序和分析。相关文件将于下周一提交香港立法会讨论。 此前,香港基因组医学督导委员会曾于去年建议一项大规模基因组测序计划,以加强基因组医学的临床应用和研究。在香港特区行政长官林郑月娥去年10月发布的《施政报告》中,她表示会按照这项建议,为该项目提供政府拨款。此外,香港特区政府食物及卫生局将成立一个专家工作小组,以确定有关详情,包括在本周发布的草案文件。在2018年11香港举办的第二届人类基因组编辑国际峰会上,林郑月娥曾表示,香港将设立大数据平台,以收集临床数据协助基因组编辑医学发展,并将拨款在香港推行大型基因组测序计划,建立本地人口的基因组数据。同时,香港还将......阅读全文

不止于遗传病和癌症,靶向测序还有这些用途

二代测序(NGS)的快速发展加速了遗传病、癌症等领域的研究,其本身也作为一种更为先进的基因检测手段逐步走进临床。在NGS的众多技术中,靶向测序正在成为新时代的“宠儿”。遗传病诊断(WES/Panel)、肿瘤伴随诊断(肿瘤多基因Panel)、免疫治疗疗效预测(WES/Panel),这些NGS应用热点都

Cell新文章:癌症全基因组测序

  根据华盛顿大学医学院的一项新研究,具有吸烟史的肺癌患者相比于不吸烟的肺癌患者肿瘤中的遗传突变要多10倍。这一研究在线发表在9月13日的《细胞》(Cell)杂志上。   论文的资深作者、华盛顿大学基因组研究所主任Richard K. Wilson 说:“吸烟者基因组具有比不吸烟的肺癌患者基因

证实基因组测序成功鉴定癌症相关突变

  最近,UT西南医学中心的癌症研究人员表明,全基因组测序可以用来确定患者遗传性癌症的风险,这可能会促进癌症的预防、诊断和护理。  这项研究首次采用全基因组测序来评估258名癌症患者的基因组,以提高癌症诱发突变的诊断能力。相关研究结果发表在12月份的国际期刊《EBioMedicine》。  UT西南

全基因组测序有望改善癌症预防与诊断

  美国德州大学(UT)西南医学中心研究人员证明,全基因组测序可识别病人患遗传性癌症的风险,有望改善癌症的预防、诊断和护理。这项研究首次用全基因组测序评估了258个癌症病人的基因组,提高了诊断出有癌变倾向的基因变异的能力。相关论文在线发表于最近的《E生物医学》杂志上。  “全基因组测序是一种新的基因

Nature:全基因组测序重新定义癌症之王基因组突变蓝图

  近日,一项发表于国际著名杂志Nature上的研究论文中,来自英国和澳大利亚的研究人员对100位胰腺癌患者癌症组织的基因组进行了深入分析,结果发现了4种不同的亚型,这或许可以帮助后期开发治疗胰腺癌患者的新型疗法。文章中研究人员利用全基因组测序技术揭示了肿瘤基因组结构性改变的光谱模式,该技术可以帮助

全基因组测序是癌症诊断的强有力工具

  一位没有明显癌症家族史的妇女却罹患了早发性乳腺癌和卵巢癌,以及与治疗有关的急性髓细胞样白血病。研究人员对这名妇女进行了全基因组测序,所用的是从该患者的皮肤和骨髓中获取的DNA。在许多被怀疑患癌症可能性增加了的病人中,常规性的候选基因测试(如BRCA1  和  BRCA2突变检测)无法显示出有用的

震惊!全基因组测序还能这样用在癌症治疗上?

   近年来,随着全基因组测序所需时间和成本的降低,个体化治疗将造福更多的癌症患者。近日发表于《Nature Medicine》的一项研究表明,开发新的机器学习算法对肿瘤全基因组序列信息进行分析,有助于预测患者的预后,帮助患者选择最佳的治疗方案。  全基因组测序(Whole-genome seque

遗传病家系的高通量测序

摘要 高通量测序技术的出现与普及,为遗传病的研究带来了前所未有的机会。它提高了遗传病致病基因克隆和鉴定的效率,使人类对自身基因功能的认识大大加速。本文对遗传病家系的高通量测序分析提出一些注意事项,希望有助于相关的研究。 前言 我国是一个多民族的人口大国,也是遗传病家系资源比较丰富的国家之一。遗传病家

EBioMedicine:全基因组测序高效识别癌症相关基因突变

  UT西南医学中心癌症研究人员已经证明,全基因组测序可用于识别癌症的遗传性风险,其可以潜在地改善癌症的预防,诊断和治疗。  这是首次研究使用了全基因组测序以评估一系列258癌症患者的基因组,诊断其癌症倾向性突变情况。这项研究发表在杂志EBioMedicine上。全基因组测序是新的基因工具,能够确定

基因组测序

如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的

如何确保遗传病和癌症不再漏检

  为了人类的优生优育,医学界早已建立防范遗传病患儿意外出生的产前诊断技术,其中羊水穿刺配合染色体镜检术,对常见染色体数目异常的检出准确率已经达到100%。   最近备受关注的湖南孕妇做了华大基因的无创产前DNA检测,仍生下缺陷婴儿的事件,问题出在用血液基因检测术取代羊水穿刺—染色体镜检术,导致胎

如何确保遗传病和癌症不再漏检

  为了人类的优生优育,医学界早已建立防范遗传病患儿意外出生的产前诊断技术,其中羊水穿刺配合染色体镜检术,对常见染色体数目异常的检出准确率已经达到100%。   最近备受关注的湖南孕妇做了华大基因的无创产前DNA检测,仍生下缺陷婴儿的事件,问题出在用血液基因检测术取代羊水穿刺—染色体镜检术,导致胎

全基因组测序可识别癌症相关变异-有助预防护理

  美国德州大学(UT)西南医学中心研究人员证明,全基因组测序可识别病人患遗传性癌症的风险,有望改善癌症的预防、诊断和护理。这项研究首次用全基因组测序评估了258个癌症病人的基因组,提高了诊断出有癌变倾向的基因变异的能力。相关论文在线发表于最近的《E生物医学》杂志上。   “全基因组测序是一种新

Nature子刊:对年轻癌症患者进行全基因组测序势在必行

  相关研究最近以“Clinical cancer genomic profiling by three-platform sequencing of whole genome, whole exome and transcriptome”为题发表在《Nature Communications》杂志

DNA测序打破罕见遗传病诊断速度纪录

美国斯坦福大学医学院科学家领导的联合团队开发的一种新的超快速基因组测序方法,可在平均8小时内诊断出罕见遗传疾病,这是标准临床护理领域中几乎闻所未闻的壮举。相关研究论文日前发表在《新英格兰医学杂志》上。基因组测序可让科学家看到病人的完整DNA组成,包含从眼睛颜色到遗传病的所有信息。这对于诊断植根于患者

DNA测序打破罕见遗传病诊断速度纪录

  美国斯坦福大学医学院科学家领导的联合团队开发的一种新的超快速基因组测序方法,可在平均8小时内诊断出罕见遗传疾病,这是标准临床护理领域中几乎闻所未闻的壮举。相关研究论文日前发表在《新英格兰医学杂志》上。  基因组测序可让科学家看到病人的完整DNA组成,包含从眼睛颜色到遗传病的所有信息。这对于诊断植

-PNAS:半导体测序助力胎儿遗传病检测

  日前,来自中国广州医科大学等机构的科研人员报告了一种基于半导体的DNA测序平台可能有助于增加胎儿遗传病检测的速度并减少成本,研究报告被发表在5月5日的PNAS网络先行版上。   什么是基于半导体的DNA测序?   半导体DNA测序平台是使用半导体生物传感器芯片,对DNA复制期间产生的氢离子进

如何研究复杂遗传病的机制

  说到遗传病,大家最熟悉的可能是地中海贫血、血友病。这些疾病由单个基因突变而引起,又称为孟德尔遗传病。然而,近十年来,随着DNA分析技术的发展,人们逐渐意识到更多遗传病有着更为复杂的遗传机制。致病变异,上可至大的拷贝数变异(CNV),下可至单个点突变。   这一下,情况变得很复杂,“单个突变 –

香港基因组计划将启动,测序2万名患者

  根据香港食物及卫生局近日提交的一份文件,香港计划对2万名患者(在某些情况下包括家属)的基因组进行测序和分析,作为香港基因组计划(Hong Kong Genome Project,简称HKGP)的一部分。  根据香港食物及卫生局近日提交的一份文件,香港计划对2万名患者(在某些情况下包括家属)的基因

解码“基因组学之父”桑格:测序,测序,测序

  “桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’,他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础,彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、   有一天,65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验,转身走出实验室,宣布自己正式退休。那一年是1983

基因测序前景:上游市场增速放缓-中下游市场潜力巨大

  基因测序服务市场增速快,预计2016年超过测序仪器市场。据Markets&Markets预测,2014-2020年上游市场中测序仪的复合增长率是15.4%。中游测序服务市场重资产、技术附加值低,将是产业链中增速最快的,据BCC Research预测2011-2016年复合增长率为29%。下游生物

国内三代测序技术瞄准遗传病诊断

  在过去的2016年,第三代测序获得了完美突破,首次登上了太空,首次完成人类基因组测序,首次确定了二代测序未能检测到的致病性大片段缺失突变,最终确诊了一种罕见遗传病......第三代测序也被Science纳入2016年十大科学突破之一。  第三代测序技术避免了第二代测序读长短的缺点,在临床上具有无

外显子测序成诊断遗传病新希望

  当一个婴儿迟迟不会爬或说话,或者出现其他症状表明其可能有遗传性疾病时,家长寻找答案的过程通常是漫长且令人沮丧的。医生可能会安排一系列的测试,但仍不能得出一个特定的诊断结果。   现在,价格便宜的DNA测序能有助于揭示这些神秘疾病的原因。该方法是对病人编码蛋白质的DNA中的1%(外显子组)进行测

《Nature》子刊:从你的基因组测序结果告知你是否会得癌症

  许多遗传因素都会导致癌症,有些突变来自你的父母,有些是从其他外因或你自身DNA复制来的。大规模基因组测序已经有能力区分体细胞突变(somatic mutations)所引起的癌症,但是在鉴定哪些癌症可能来自父母遗传变异方面并没有那么有效。目前,我们对这类癌症相关突变的了解仍基于几个关键的家族研究

基因组测序仪简介

  基因组测序仪是一种用于生物学领域的分析仪器,于2012年12月19日启用。  技术指标  个体化基因组测序仪主机/ION TORRENT主机。  主要功能  样品处理、快速的运行时间以分析单个或多个样品 支持多重文库,从而实现最大的效率和经济性 可在必要时禁用个别测序通道,以节约试剂用量。

认识泛基因组测序

什么是泛基因组?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念(pangenome,pan源自希腊语‘παν’,全部的意思),泛基因组即某一物种全部基因的总称。2009 年,Li等人首次采用新全基因组组装方法对多个人类个体基因组进行拼接,发现了个体独有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“

PNAS:甜瓜基因组测序

  甜瓜在世界范围具有很高的经济价值,日前西班牙的九个研究中心通力合作,利用罗氏454平台完成了甜瓜基因组的测序。除了甜瓜的全基因组,科学家还得到了 7个特定甜瓜品种的基因组,文章发表在Proceedings of the National Academy杂志上。   联合国粮农组织2009年

Nature子刊:外显子测序助力遗传病诊断

  德州大学健康科学中心休斯顿UTHealth和巴黎的研究人员发现,TGFB2基因突变会引起一系列系统性并发症,包括致命的胸主动脉瘤和颅内动脉瘤。这一新综合症具有与Marfan综合症和Loeys-Dietz综合症类似的症状,但并不完全相同。文章于7月8日发表在Nature Genetics杂志网

基因测序仪的定义和应用

基因测序仪又称DNA测序仪,是测定DNA片段的碱基顺序、种类和定量的仪器。主要应用在人类基因组测序、人类遗传病、传染病和癌症的基因诊断、法医的亲子鉴定和个体识别、生物工程药物的筛选、动植物杂交育种等方面。

基因测序仪定义

  基因测序仪又称DNA测序仪,是测定DNA片段的碱基顺序、种类和定量的仪器。主要应用在人类基因组测序、人类遗传病、传染病和癌症的基因诊断、法医的亲子鉴定和个体识别、生物工程药物的筛选、动植物杂交育种等方面。