Proton和HiSeq测序平台比较：SNPs检测均表现良好
美国国家癌症研究所的研究人员在近日发表的有关Proton和HiSeq 平台的对比研究显示，在进行外显子组测序时，Life Technologies的Ion Proton和Illumina的HiSeq 2000在单核苷酸变异(SNPs)检测方面均表现良好，但在准确检测插入缺失时存在某些问题。 该研究于本月初刊载在《人类遗传学》上，很可能是首个发表的有关这两个平台性能对比的研究。该研究将采用Proton和HiSeq对HapMap CEPH三元家族生成的全外显子组测序数据检测到的变异进行了比较。此外，还对从Complete Genomics公司获得的全基因组测序数据的变异以及相同三元家族的Illumina SNP微阵列数据的变异进行了对比。 比较Proton和HiSeq测序平台 美国国家癌症研究所(NCI)癌症基因组学研究实验室的研发部主任和该研究的首席作者Joe Boland声称，本项目旨在......阅读全文
BGISEQ500测序应用性能测试结果发表于GigaScience
深圳华大生命科学研究院宏基因组研究所转化应用实验团队首次公开了使用BGISEQ-500对健康人群肠道样本进行深度宏基因组测序的数据，并通过一系列的性能评估，展示了BGISEQ-500宏基因组测序应用性能的优异性、准确性、稳定性及跨平台一致性，相应成果发表于GigaScience。 BGIS
如何评估单细胞测序数据分析软件的性能？
评估单细胞测序数据分析软件的性能可以考虑以下几个方面：准确性比较软件分析结果与已知的生物学事实或已验证的实验结果的一致性。例如，细胞类型注释结果与通过其他独立方法确定的细胞类型的匹配程度。重复性使用相同的数据集在不同的运行中或在不同的计算环境中，评估结果的稳定性和可重复性。处理速度对于大规模的单细胞
不同二代测序平台用于临床肿瘤样本体细胞突变检测的...
使用二代测序技术检测肿瘤组织FFPE样品中的DNA体细胞突变用于临床分子诊断存在的问题是，DNA质量和数量的变异较大，以及检测到的低频突变难以用二代测序以外的其他技术予以验证。以下实验测评了MiSeq和Ion Proton两个平台检测体细胞突变的表现，分别选用了 TruSeq Amplicon
高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析－5
图5: 长读长实时测序原理。长reads的合成与真正测序的平台不同的是，合成长读长技术依赖于一个barcode系统来结合不同的片段，通过已有的短读长测序仪来获得长读长reads61。该方法将大的DNA分子分割成若干个小片段到微孔中或者乳液中。每个微孔或者乳液中的模板被切割并且加上了barcodes。
高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析－1
随着人类基因组计划（human genome project ）在2003年顺利完成，基因组测序技术取得了长足的进步，这直接导致了每兆基因组成本的大幅下降以及检测的基因组数量越来越多。人们对基因组的复杂性深感震惊，这也引导着测序技术的进一步发展。最近的一些突破性技术使得测序技术在更短的时间内可以
Enpicom完成120万欧元融资－致力于开发测序数据分析平台
近日，生物医学软件开发公司Enpicom宣布完成A轮120万欧元融资。本轮融资由BOM Brabant Ventures领投，Nextgen Ventures和Arches Capital跟投，所融资金将用于ImmunoGenomix（IGX）平台的开发，以及市场推广。 Enpicom成立于2
直击精准医疗四大挑战：测序平台多样化成为发展障碍
2016年1月12日，奥巴马提出了癌症“登月计划”，将精准医疗、个性化医学或癌症医学推向了另一高度。事实上，精准医疗是一个美好的愿景：即能详细读取肿瘤患者的缺陷，并开发出靶向缺陷的新一代药物，医生给患者最有效的治疗方案。 使用新型靶向药物如厄洛替尼（erlotinib）和西妥昔单抗（cetux
高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析－3
边合成边测序：SNA（454，Ion Torrent）与CRT不同的是，SNA方法依赖于单信号标记dNTP来对链进行延伸。四种核糖核酸都必须反复添加到测序反应过程中。不仅如此，SNA不需要将dNTP屏蔽，因为测序反应过程中下一个碱基的缺失会阻止链的延伸。碱基的寡聚体则是一个例外，在这种情况下，信号的
华大智造加速公司测序平台在国内存量市场的替换速度
今年2月，基因测序仪制造商因美纳（Illumina）被中国商务部列入“不可靠实体清单”后，3月4日商务部发布处理措施，禁止因美纳向中国出口基因测序仪。这一事件如同导火索，进一步点燃了国产基因测序仪的替代热情。3月11日，因美纳针对此事件进行回应，公司表示，因美纳充分尊重中国商务部的决定，并将继续遵循
高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析－6
应用WGS正在成为NGS中最广泛的应用。通过该技术并且结合生物学应用，研究人员可以获得基因组信息中最值得注意的信息73。举例来说，2012年，Ellis等报道了基因与乳腺癌患者芳香酶抑制剂（aromatase inhibitor）治疗法之间的关联。他们指出突变，后果与诊断之间的关联，同样还有
高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析－2
边连接边测序（SOLiD和Complete Genomics）从根本上来说，SBL法包含了杂交和对标记的探针的连接15。探针包含了一到两个特定碱基序列和一系列通用序列，这可以使得探针与模板之间进行互补配对。锚定的片段则包含一段已知的和接头互补的序列用于提供连接位点。连接之后，模板被系统进行测序反应1
高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析－4
表一：NGS平台概述。单分子长读长测序（PacBio和ONT）最近这段时间，最常用的长读长测序法平台就是使用PacBio Biosciences（PacBio）57的单分子实时测序法（single-molecule real-time sequencing, SMRT）（图5a）。该设备使用
我国科研人员研发出高性能AI边缘计算平台“鸢目”
11月12日，第十五届中国国际航空航天博览会在珠海开幕。记者从湖南湘江新区获悉，北京大学长沙计算与数字经济研究院（以下简称“北大长沙院”）联合北京中科航星科技有限公司自主研发的“鸢目智能边缘计算平台”正式亮相这一博览会。鸢目智能边缘计算平台是一款具有低延迟、高性能、强算力等技术优势的高性能AI边缘计
划线平台铸铁材质的分类、材质性能及其实用性
划线平台铸铁材质的分类、材质性能及其实用性 铸铁按断口颜色可分为： ①灰口铸铁。含碳量较高（2.7%～4.0%），碳主要以片状石墨形态存在，断口呈灰色，简称灰铁。 熔点低（1145～1250℃），凝固时收缩量小，抗压强度和硬度接近碳素钢，减震性好。 有一定的力学
赛默飞联合TransMIT－GmbH发布高性能－Orbitrap－质谱成像平台
美国时间2022年6月5-9日，ASMS 2022暨第70届美国质谱年会将在明尼苏达州Minneapolis会议中心召开。赛默飞和 TransMIT GmbH质谱开发中心联合发布了营销协议，以促进质谱成像 ( MSI）平台，用于制药和临床实验室中的空间多组学应用。 作为合作关系的一部分，Tra
划线平台铸铁材质的分类、材质性能及其实用性
划线平台铸铁材质的分类、材质性能及其实用性 铸铁按断口颜色可分为： ①灰口铸铁。含碳量较高（2.7%～4.0%），碳主要以片状石墨形态存在，断口呈灰色，简称灰铁。 熔点低（1145～1250℃），凝固时收缩量小，抗压强度和硬度接近碳素钢，减震性好。 有一定的力学
单细胞测序数据分析软件的性能评估指标有哪些？
以下是一些用于评估单细胞测序数据分析软件的性能指标：细胞类型分类准确性计算软件所识别的细胞类型与已知的真实细胞类型之间的一致性，常用指标如准确率、召回率、F1 值等。聚类准确性评估软件对细胞聚类的效果，例如通过调整兰德系数（Adjusted Rand Index）、归一化互信息（Normalized
遗传分析走向大众生物学家为解释遗传测序数据开发平台
我们可以在现场获得可操作信息，从而让我们很快地就如何向前推进做出决策。 对于设法治疗无明显致病原因患者的医生来说，基因测序技术可能会为他们指点迷津。但大量的信息也会使其很难快速找到答案。 两三年前，位于秘鲁利马的美国海军医学研究六所（NAMRU-6）的医生必须将其测序数据送往美国分析，这一过
赛默飞世尔推出新一代测序平台离子激流Genexus系统
分析测试百科网讯 日前，赛默飞世尔宣布推出其Ion Torrent Genexus系统，这是第一个完全集成的下一代测序（NGS）平台，具有自动样本报告工作流程，可在一天内经济地交付结果在分子病理学协会（AMP）2019年年会上推出的这一交钥匙解决方案重新定义了基因组分析范式，使当地医院能够在未来
之江生物与千研所联手打造“一站式高通量测序平台”
上海之江生物科技股份有限公司（以下简称“之江生物”）近日正式与韩国ChunLab， Inc.（千·研所）战略结盟，联手打造“一站式高通量测序平台”，进军微生物基因测序领域，致力于为临床诊断和病情分析提供重要依据和判断，推动现代医学技术发展。 2015年初，美国政府颁布“精准医疗计划”；今年3月
清华大学仪器共享平台Zeiss－Merlin－高性能场发射扫描电镜
仪器名称：高性能场发射扫描电镜 Zeiss Merlin仪器编号：16005773产地：德国生产厂家：Zeiss型号：Merlin出厂日期：201306购置日期：201603样品要求：常规样品：1.类型：固体、真空下无挥发物； 2.尺寸：一般直径小于80mm，高度小于3
清华大学仪器共享平台Zeiss－Merlin－高性能场发射扫描电镜
仪器名称：高性能场发射扫描电镜 Zeiss Merlin仪器编号：16005773产地：德国生产厂家：Zeiss型号：Merlin出厂日期：201306购置日期：201603所属单位：材料学院>材料中心 >电镜中心放置地点：主楼11-108固定电话：固定手机：固定email：联系人：胡蓉（010-6
清华大学仪器共享平台Zeiss－Merlin－高性能场发射扫描电镜
仪器名称：高性能场发射扫描电镜 Zeiss Merlin仪器编号：16005773产地：德国生产厂家：Zeiss型号：Merlin出厂日期：201306购置日期：201603所属单位：材料学院>材料中心 >电镜中心放置地点：主楼11-108固定电话：固定手机：固定email：联系人：胡蓉（010-6
DNA测序PCR测序反应
1. 取0.2 ml的PCR管，用记号笔编号，将管插在颗粒冰中，按下表加试剂： 所加试剂 测定模板管 标准对照管 BigDye Mix 1 μl 1 μl 待测的质粒DNA 1 μl － pGEM-3Zf (+) 双链DNA － 1 μl 待测DNA的正向引物 1 μl － M13(
DNA测序的测序技术
高通量测序技术（High-throughput sequencing）又称“下一代”测序技术（Next-generation sequencing technology），以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等，主要有以
DNA测序的测序原理
DNA测序的测序原理是：利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物。直到掺入一种链终止核苷酸为止。每一次序列测定由一套四个单独的反应构成，每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP)，并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基团，使延长的寡聚核苷酸
英特尔联手华大基因等构建医疗平台：24小时内完成基因测序
2001年，6个国家的科学家花了11年的时间，花费30亿美金，共同发表首个人类基因组工作草图。如今，除了时间大大缩短外，测序成本下降至1000美元。而在英特尔看来，完成包括基因序列检测、数据分析、疾病诊断，以及制定个性化治疗方案在内的精准医疗的主要过程也许用不了24小时。 4月13日，英特尔公
金唯智引入Illumina－X10及PacBio测序平台－深化基因组领域业务
近日，金唯智宣布引进全球最高通量的测序平台Illumina HiSeq X-10及最新的单分子基因测序系统PacBio Sequel。这些新平台的加入使得金唯智拥有市场上最先进的高通量测序平台，从而全面加强金唯智在基因组学研究、精准医疗与其它应用领域里的服务范围和能力。 新平台能为客户减低成本
韩春雨沉默6年突破PCR平台系统，它具备这些独特性能
Argonaute 蛋白的特点是高效的指导 DNA/RNA 定向结合目标核酸。 2022年2月22日，河北科技大学韩春雨团队在预印版bioRxiv 在线发表未经同行评审的题为“Introducing an argonaute-facilitated PCR platform”的研究论文，该研究
TiM：兼具高性能及低功耗的移动式平台防撞与导航解决...
TiM：兼具高性能及低功耗的移动式平台防撞与导航解决方案 新式电动升降车、拣选叉车、牵引车和移动运输平台通过半自动化运行方式，为用户带来额外应用潜力。SICK TiM系列的2D LiDAR传感器不仅能确保车辆平稳行驶，还能提供精确的导航测量数据。除此之外，更首次针对相应的安全类应用提供了性能等