生物学技术—RTPCR技术的影响因素分析

(一)生物学技术—RT-PCR技术— 组织或细胞样本 不是每种组织或细胞都表达所有的基因,即某些基因的mRNA不存在于某些组织或细胞中。因此,确定所选用的材料中是否含有需扩增的目标mRNA模板是实验成败的关键。 (二)生物学技术—RT-PCR技术— 引物 合成cDNA第一条链时,引物可用随机6聚核苷酸,或下游引物,或poly(dT),其中以6聚核苷酸的随机引物效果最好。 (三)生物学技术—RT-PCR技术— 反转录酶 不同来源的反转录酶均可较好地用于第一链cDNA的合成,其合成受不同RNA模板的影响。提高反转录温度(55℃)、增加1~3倍的酶量可克服RNA二级结构的影响。 (四)生物学技术—RT-PCR技术— cDNA反应产物 合成eDNA第一链所用的RNA模板不影响PCR反应,无需用碱或RNase处理去除。另外,没有必要将cDNA反应产物全部用于PCR,用其1/25~1/10即可......阅读全文

常用分子生物学和细胞生物学实验技术介绍(二)

核酸原位杂交用特定标记的已知顺序核酸作为探针与细胞级或组织切片中核酸进行复性杂交并对其实行检测的方法,称为核酸原位杂交(nucleic acid hybridization in situ)。用来检测DNA在细胞核或染色休上的分布,与细胞内RNA进行杂交以研究该组织细胞中特定基因表达水闰;还

最前沿的分子生物学技术

自然科学的发展从20世纪以来有过两次重大变革,第一次是在物理学领域,它不仅全面推动了自然科学的发展,所引起的技术革命也已经给人类生活带来了巨大影响。第二次变革发生在生物学领域,是由于物理学和化学广泛而又深刻地渗入生物学的结果。这次变革以50年代中脱氧核糖核酸(DNA)双螺旋结构的确定和蛋白质晶体结构

分子生物学实验诊断技术(二)

(三)Northern blot用于RNA分析,电泳条件与转膜方法与Southern blot不同外,RNA不必变性与中和,电泳时加电醛防止RNA发夹结构形成。其它步骤相同。为了防止RNase水解需分析的mRNA,尽可能将器皿在160-180℃干热灭菌8小时以上,也可加0.1%焦碳酸二乙酯(DEPC

分子生物学实验诊断技术(一)

一、核酸杂交技术        检验方法建立的基本要素是特异性和灵敏度,在复杂的物体中,使无法感觉的特定物质进入人类的观察范围。核酸杂交检测技术就是利用核酸碱基严格配对的特异性,核酸标记物的灵敏度而建立的检测核酸结构与功能的方法。该法建立以来已有二十年,目前研究实验室用得多,临床实验室用得较少,除成

猪丹毒分子生物学诊断技术

  常规细菌培养检测猪丹毒至少要3天,鉴定血清型大约要lo天,而这种PCR法可在5h内完成。它使用两步扩增法,先用高度特异性引物组M0101-M0102进行初步扩增之后,再添加4种特异性寡核苷酸引物组对4种不同血清型猪丹毒的16SrRNA序列进行扩增。     rRNA基因簇包括16SrRNA、23

分子生物学常用实验技术(十)

第二节RFLP 技术一、材料   基因组DNA(大于50kb,分别来自不同的材料)。二、设备  电泳仪及电泳槽, 照相用塑料盆5 只,玻璃或塑料板(比胶块略大) 4 块,吸水纸若干,尼龙膜(依胶大小而定),滤纸,eppendorf 管(0.5ml)若干。三、试剂:1、限制性内切酶(BamHⅠ, Ec

分子生物学常用实验技术(五)

第四章RNA 的提取和cDNA 合成  第一节概述  从真核生物的组织或细胞中提取mRNA,通过酶促反应逆转录合成cDNA 的第一链和第二链,将双链cDNA 和载体连接,然后转化扩增, 即可获得cDNA 文库,构建的cDNA 文库可用于真核生物基因的结构、表达和调控的分析;比较cDNA 和相

PCR技术在种群生物学的应用

序列的快速扩增使在DNA序列水平上进行大量的种群研究成为可能。单链扩增对 几十或十百个个体进行快速测序而不经过以前所需的繁琐的克隆步骤。一旦得到了一 组具代表性的序列数据,可用更方便而简单的分析方法,如用等位基因寡聚核苷酸探 针(见16章)来获得等位基因的序列数据。 对博物馆标本进行测序的工作使对过

分子生物学常用实验技术(十三)

2. 从RNA 合成单链cDNA 探针cDNA 单链探针主要用来分离cDNA 文库中相应的基因。用RNA为模板合成cDNA 探针所用的引物有两种: (1)用寡聚dT 为引物合成cDNA 探针。本方法只能用于带Poly(A)的mRNA,并且产生的探针极大多数偏向于mRNA 3'末端序列

分子生物学常用实验技术(十八)

五、操作步骤:(一)、模板制备1、M13 单链模板制备:在转化入合适的大肠杆菌宿主菌且在含有指示剂如X-gal/IPTG 的培养基上铺板之后, 含有M13 重组子的细胞将表现出无色的"噬菌斑",事实上受感染的细胞并非被噬菌体溶菌或杀死,出现噬菌斑是因为被感染的细菌在生长速度上比其周围未感染的

分子生物学实验小技术(二)

1 、 各供应商送货时往往会提供冰袋,在室温下将化冻的大冰袋平整的一面整齐地插入1.5ml 或0.5ml 、0.2ml 的废弃离心管;或将几个化冻后的小冰袋填料塞入一个小泡沫盒中压实,再插入各种大小的试管,放在-20 摄氏度下冻24小时后取出,拔出插入的废管(可加点热水以助拔管)即可做成一个

分子生物学常用实验技术(十七)

第二节T7 DN A 聚合酶测序技术一、概述  T7 DNA 聚合酶最初具有5'→3'聚合酶活性以及单链和双链3'→5'外切酶活性。当T7 DNA 聚合酶用适当方法处理后,可使3'→5'外切酶活力明显下降。改造后的T7 DNA 聚合酶又称T7

分子生物学常用实验技术(二)

  第三节操作步骤  一、细菌的培养和收集  将含有质粒pBS 的DH5α菌种接种在LB 固体培养基(含50μg/ml Amp)中, 37℃培养12-24 小时。用无菌牙签挑取单菌落接种到5ml LB 液体培养基(含50μg/ml Amp)中,37℃振荡培养约12 小时至对数生长后期。  二、质粒D

分子生物学常用实验技术(七)

(四) 电泳分析  通常合成的cDNA 第一链和第二链长度为350-6000 碱基,需进行1.4%碱性琼脂糖电泳。将第一链和第二链掺入测定管中的反应液先用酚抽提,乙醇沉淀,方法见本章(二)第二链合成中的9-12 步,一般第一链和第二链上样量相同。1. 标准分子量DNA 参照物的同位素标记(1) 通常

分子生物学常用实验技术(九)

第三节从动物组织提取基因组DNA一、材料  哺乳动物新鲜组织。二、设备  移液管、高速冷冻离心机、台式离心机、水浴锅。三、试剂1、分离缓冲液:10mmol/L Tris?Cl pH7.4, 10mmol/L NaCl, 25mmol/L EDTA。2、其它试剂:10% SDS,蛋白酶K (20mg/

分子生物学常用实验技术(十五)

第十章测序技术  在分子生物学研究中,DNA 的序列分析是进一步研究和改造目的基因的基础。目前用于测序的技术主要有Sanger 等(1977)发明的双脱氧链末端终止法和Maxam 和Gilbert(1977)发明的化学降解法。这二种方法在原理上差异很大,但都是根据核苷酸在某一固定的点开始,随

微生物学检验基本技术(六)

二、沉淀反应可溶性抗原(如细菌的培养滤液、含细菌的患者血清、脑脊液及组织浸出液等)与相应抗体相混合,在比例适合和适量电解质的存在等条件下,形成肉眼可见的沉淀物,称沉淀反应。利用沉淀反应进行血清学试验的方法称为沉淀试验。沉淀反应有环状、絮状和琼脂扩散法3种基本类型。1.环状沉淀试验将已知的抗血清加于内

分子生物学常用实验技术(十六)

(三)电泳:1、预电泳(1)当凝胶聚合完全后,拨出鲨鱼齿梳,将该梳子反过来,把有齿的一头插入凝胶中,形成加样孔。(2)立即将胶板固定在测序凝胶槽中,一般测序凝胶槽的上下槽是分开的,因而只有在固定好凝胶板后,方能加入TBE 缓冲液。(3)稀释10×TBE 缓冲液至1×TBE,将该缓冲液加入上下二个电泳

分子生物学常用实验技术(六)

一、材料  提纯TMV 病毒液(10mg/ml)。二、设备  冷冻台式离心机,低温真空干燥仪,电泳仪,电泳槽。三、试剂  TE-饱和酚:氯仿(1:1),氯仿,3M NaAc(pH5.2),乙醇(100%和70%),TE 缓冲液,无RNA 酶的双菌水。四、操作步骤1、取一eppendorf 管加入提纯

分子生物学常用实验技术(八)

第五章重组质粒的连接、转化及筛选第一节概述  质粒具有稳定可靠和操作简便的优点。如果要克隆较小的DNA 片段(<10kb)且结构简单,质粒要比其它任何载体都要好。在质粒载体上进行克隆,从原理上说是很简单的,先用限制性内切酶切割质粒DNA 和目的DNA 片段, 然后体外使两者相连接, 再用所得

微生物学检验基本技术(1)

随着现代医学及相关科学技术的发展,各学科相互交叉和渗透,医学微生物学检验技术已深入到细胞、分子和基因水平,许多新技术、新方法已在临床微生物实验室得到广泛应用。医学微生物学实验室的基本任务之一是利用微生物学检验技术,准确、快速检验和鉴定临床标本中的微生物,并对引起感染的微生物进行耐药性监测,为临床对感

分子生物学常用实验技术(一)

第一章质粒DNA 的分离、纯化和鉴定第二章DNA 酶切及凝胶电泳第三章大肠杆菌感受态细胞的制备和转化第四章RNA 的提取和cDNA 合成第五章重组质粒的连接、转化及筛选第六章基因组DNA 的提取第七章RFLP 和RAPD 技术第八章聚合酶链式反应(PCR)扩增和扩增产物克隆第九章分子杂交技术第十章测

分子生物学常用实验技术(十四)

三、菌落原位杂交  对分散在若干个琼脂平板上的少数菌落(100-200)进行克隆筛选时,可采用本方法。将这些菌落归并到一个琼脂主平板以及已置于第二个琼脂平板表面的一张硝酸纤维素滤膜上。经培养一段时间后,对菌落进行原位裂解。主平板应贮存于4℃直至得到筛选结果。1、材料:待检测的细菌平皿,已标记好的探针

微生物学检验基本技术(十一)

三、自动化的血液细菌培养系统正常血液是无菌的,细菌侵入可导致菌血症、败血症、脓毒血症,及时准确地进行病原学诊断极为重要。传统的血培养是抽取5ml血液注入血培养瓶中,放入孵箱,每天观察结果,费时费力,不能及时发阳性结果,易延误诊断。全自动血液细菌培养仪主要优点是可以在较短培养时间内提示出血液培养瓶中有

分子生物学常用实验技术(三)

第二章DNA 酶切及凝胶电泳第一节概述一. DNA 的限制性内切酶酶切分析  限制性内切酶能特异地结合于一段被称为限制性酶识别序列的DNA 序列之内或其附近的特异位点上,并切割双链DNA。它可分为三类:Ⅰ类和Ⅲ类酶在同一蛋白质分子中兼有切割和修饰(甲基化)作用且依赖于ATP 的存在。Ⅰ类酶结

分子生物学常用实验技术(十二)

第九章分子杂交技术   互补的核苷酸序列通过Walson-Crick 碱基配对形成稳定的杂合双链分子DNA 分子的过程称为杂交。杂交过程是高度特异性的,可以根据所使用的探针已知序列进行特异性的靶序列检测。杂交的双方是所使用探针和要检测的核酸。该检测对象可以是克隆化的基因组DNA,也可以是细胞总D

微生物学检验基本技术(九)

3.16S rRNA同源性分析(1) rRNA-DNA杂交:变性rRNA与变性DNA混合时,rRNA与其互补的DNA链形成杂交双链,rRNA分子与异源DNA杂交时,也能在其同源区形成互补双链,这种杂交双链的稳定性与其同源性成正相关,适于细菌属及属上水平的分类研究。现最常用的是硝酸纤维膜结合法。(

分子生物学常用实验技术(四)

第三章大肠杆菌感受态细胞的制备和转化第一节概述  在自然条件下,很多质粒都可通过细菌接合作用转移到新的宿主内,但在人工构建的质粒载体中,一般缺乏此种转移所必需的mob 基因,因此不能自行完成从一个细胞到另一个细胞的接合转移。如需将质粒载体转移进受体细菌,需诱导受体细菌产生一种短暂的感受态以摄取外

微生物学检验基本技术(一)

随着现代医学及相关科学技术的发展,各学科相互交叉和渗透,医学微生物学检验技术已深入到细胞、分子和基因水平,许多新技术、新方法已在临床微生物实验室得到广泛应用。医学微生物学实验室的基本任务之一是利用微生物学检验技术,准确、快速检验和鉴定临床标本中的微生物,并对引起感染的微生物进行耐药性监测,为临床对感

微生物学检验基本技术(1)

第一节 微生物形态学检查   细菌形态学检查是细菌检验的重要方法之一,它是细菌分类和鉴定的基础,可根据其形态、结构和染色反应性等,为进一步鉴定提供参考依据。 一、显微镜检查   由于细菌个体微小,肉眼不能看到,必须借助显微镜的放大才能看到。一般形态和结构可用光学显微镜观察,其内部的超微结构则需用电