遗传发育所在水稻联会复合体结构研究中取得新进展
减数分裂过程中,配对的同源染色体间要形成拉链状的联会复合体。虽然联会复合体在结构上具有高度保守性,但其蛋白质序列的保守性却很低。目前已鉴定的联会复合体相关蛋白,在真菌、动物和植物之间几乎没有同源性。 中科院遗传与发育生物研究所程祝宽研究组长期从事植物减数分裂研究,该研究组在水稻中鉴定出了一个新的联会复合体蛋白CRC1。CRC1与横丝元件 ZEP1共定位于联会复合体的中央区域,两者的定位相互依赖。研究表明,CRC1与ZEP1的N端直接互作,共同形成联会复合体的中央组分。CRC1是一个序列保守的AAA-ATPase家族蛋白,其同源基因广泛地存在于真菌、动物和植物中,因此可能是一个保守的联会复合体蛋白。CRC1除了参与联会复合体的形成外,还是同源染色体重组的起始因子,在crc1突变体中,DNA的双链断裂不能形成,进而导致同源染色体重组不能发生。 该研究结果于8月14日在线发表于Plant Cell杂志上(DOI:1......阅读全文
蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验6
方案6 羧基端序列分析实验实验材料利用一维或二维聚丙烯酰胺凝胶分离的蛋白质或溶液中的蛋白质试剂、试剂盒乙酸酐 二甲基吡啶烷基化乙内硫酰脲 (ATH) 氨基酸标准品溴甲基萘的乙腈溶液考马斯亮蓝(R250)二异丙基乙胺(DIEA)的庚烷溶液乙酸乙酯甲醇N-甲基咪唑的乙腈溶液异氰酸苯酯的乙腈溶液哌嗪硫氰酸
电泳分离的蛋白质肽谱和序列分析实验
实验材料 冻干的纯化蛋白样品试剂、试剂盒 甲酸氢溴酸过氧化氢NaOH 固体仪器、耗材 旋转蒸发器小试管实验步骤 1.加入 100ul 过氧化氢到 900ul 甲酸中,在室温下放置让,将反应产生过甲酸 (HCOOOH)。2.在冰上冷冻过甲酸至 0°C。3.在预冷的小试管中,将蛋白质溶解于 50ul 过
蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验4
方案4 浓缩聚丙烯酰胺凝胶上的蛋白质点实验实验材料包含目的蛋白的二维电泳凝胶点试剂、试剂盒丙烯酰胺混合物(30%)琼脂糖 50g L考马斯亮蓝染色液脱色液平衡缓冲液10 X 聚丙烯酰胺电泳缓冲液浓缩胶仪器、耗材巴氏滴管聚丙烯管Protean II xi 2-D 电泳槽(Bio-Rad)注射器试管管式
核酸和蛋白质序列分析的内容和方法有哪些
核酸和蛋白质序列分析的内容和方法有哪些蛋白质结构分析方法:X射线晶体衍射分析和核磁共振x 射线衍射法的分辨率可达到原子的水平,使它可以测定亚基的空间结构、各亚基间的相对拓扑布局,还可清楚的描述配体存在与否对蛋白质的影响。多维核磁共振波谱技术已成为确定蛋白质和核酸等生物分子溶液三维结构的唯一有效手段。
染色体中的蛋白质有什么用
染色体上的蛋白质包括组蛋白和非组蛋白。组蛋白是染色体的结构蛋白,它与DNA组成核小体。通常可以用2mol/LNaCl或0.25mol/L的HCl/H2SO4处理使组蛋白与DNA分开。组蛋白分为H1、H2A、H2B、H3及H4。这些组蛋白都含有大量的赖氨酸和精氨酸,其中H3、H4富含精氨酸,H1富含赖
清华大学团队提出蛋白质序列功能空间压缩的概念
蛋白质作为最重要的生命构建单元之一,其序列和功能之间的映射(适应性景观,Fitness landscape)的针对性研究对于蛋白质理性设计以及工程应用都有极大的意义。目前人们只能对于蛋白质序列-功能关系进行少量低纬度的点采样,例如深度突变搜索(DMS)、单位点饱和突变等,或是利用随机建库等方式以极低
蛋白质内序列分析用肽段的分离与纯化实验
试剂、试剂盒 考马斯亮蓝 G 乙酸 甲醇 Achromobacter 胰蛋白酶 I 三氟乙酸 乙腈 2-丙醇
蛋白质内序列分析用肽段的分离与纯化实验
分子生物学中最重要的环节之一是对微量蛋白质进行分析,使对编码待研究蛋白的 cDNA 序列的克隆成为可能。为有效地做到这一点,通常需要知道蛋白质的内序列。在这一方面,肽段的有效分离是极重要的。本实验来源于蛋白质纯化与鉴定实验指南,作者:朱厚础。试剂、试剂盒考马斯亮蓝 G乙酸甲醇Achromobacte
蛋白质内序列分析用肽段的分离与纯化实验
试剂、试剂盒 考马斯亮蓝 G乙酸甲醇Achromobacter 胰蛋白酶 I 三氟乙酸乙腈2-丙醇仪器、耗材 SpeedVac 型旋转浓缩器Tween-20UltrafreeTM MC 滤器C18 反相 HPLC 柱实验步骤 材料与设备考马斯亮蓝 G(0.05% 的乙酸-20% 甲醇溶液)乙酸 (5
前导序列
中文名前导序列外文名leader sequence前导序列是结构基因中编码区之前的一段序列,这部分序列能被转录,但不被翻译,在mRNA是从5′端起至结构基因第一编码子开始点(通常 AUG)为止,在蛋白质合成过程中不被翻译。
基因组所开发出编码蛋白质DNA序列并行比对工具ParaAT
中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”章张研究员,带领其团队成功开发出“编码蛋白质DNA序列并行比对工具—ParaAT(Parallel Alignment and back-Translation)”。该研究成果发表在Biochemical and Biop
核酸序列分析
【实验目的】1、 掌握已知或未知序列接受号的核酸序列检索的基本步骤;2、 掌握使用BioEdit软件进行核酸序列的基本分析;3、 熟悉基于核酸序列比对分析的真核基因结构分析(内含子/外显子分析);4、 了解基因的电子表达谱分析。【实验原理】针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找基因,找出基因的位置和
设计引物用cds序列和cdna序列的区别
cDNA和mRNA的序列是互补的,如果用两个引物,最后的两条DNA序列分别对应于mRNA和cDNA中的一段。由于引物方向从5‘至3’,所以两个引物对应于mRNA和cDNA中相应序列即可。
冲激序列信号与阶跃序列信号各有什么特性
单位脉冲序列只在n=0 处有一个单位值1,其余点上皆为0;单位阶跃序列只有在n>=0时,才取非零值1,当n
利用质谱技术测蛋白质的氨基酸序列成本多少
基于质谱的蛋白分析成本主要取决于两个方面:第一、质谱仪及其联用设备的类型,高分辨率高灵敏度质谱通常都大几百万甚至上千万人民币的;第二,数据处理方法,如果你用商业的数据分析软件比如mascot等;第三,样品处理方式,是简单鉴定还是相对定量或者绝对定量。ps:质谱技术很少能做氨基酸测序的(少部分如mal
DNA微序列技术
· Protocols for Making Drosophila Arrays (Stanford U.)Detailed protocol for making arrays including PCR Amplification of cDNAs for Printing,
转化序列的概念
中文名称转化序列英文名称transforming sequence定 义起变化作用的基因或序列。应用学科遗传学(一级学科),发育遗传学(二级学科)
RGD序列的定义
RGD序列由精氨酸、甘氨酸和天冬氨酸组成,存在于多种细胞外基质中,可与11种整合素特异性结合,能有效地促进细胞对生物材料的粘附。
互补序列的定义
中文名称互补序列英文名称complementary sequence定 义在双链核酸中,一条多核苷酸链可与另一条多核苷酸链互补的那部分序列。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
转化序列的概念
中文名称转化序列英文名称transforming sequence定 义起变化作用的基因或序列。应用学科遗传学(一级学科),发育遗传学(二级学科)
DNA-序列分析技术
实验方法原理 本节描述运用Perkin-Elmer 公司的373 和377 型全自动DNA 测序仪进行双链DNA 测序的方法。热循环测序反应使用 Applied Biosystems Inc.的DyeDeoy TM Terminator
同位序列的概念
同位序列(Homeobox)或称同源异型盒,是某些影响动物、真菌及植物发育的基因所拥有的一段DNA序列,拥有homeobox的基因称作homeobox基因,统称homeobox基因家族。同源异形盒模体在进化中广泛存在。其重要意义是通过同源异形盒探针与很多真核的基因组进行杂交而获得。在蛙,小鼠和人的D
DNA-序列分析技术
DNA序列分析技术可用于:(1)分析物种的遗传多样性;(2)鉴定新的物种;(3)用于比较基因组学。实验方法原理本节描述运用Perkin-Elmer 公司的373 和377 型全自动DNA 测序仪进行双链DNA 测序的方法。热循环测序反应使用 Applied Biosystems Inc.的DyeDe
DNA序列测定技术
DNA序列测定技术序列测定的技术和策略Sanger双脱氧链终止法Maxam-Gilbert DNA化学降解法测序策略目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都是同样生成互相独立的若干
什么是回文序列?
遗传学上讲的回文序列指的是双链DNA或RNA分子中的特定的核苷酸片段,该片段在其中一条链上按5'到3'读取的序列与其互补链上按相同的5'到3'读取的序列一致。回文序列的单链DNA或RNA,存在对称中心,对称中心两侧碱基关于该对称中心对称,可形成互补。故回文序列能够形成
DNA-序列分析技术
试剂、试剂盒 琼脂糖TE 水饱和酚无水乙醇70%乙醇TEMED测序酶溴化乙锭仪器、耗材 电泳仪离心管离心机冰浴箱恒温板DNA 测序仪
序列排比额概念
中文名称序列排比英文名称sequence alignment定 义核酸或蛋白质序列的比较分析法。将序列之间的相同和不同部分排列出来,由此显示序列间的相关性或同源性程度。常借助计算机软件进行分析。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)
AluI序列的定义
人基因组约有50万~70万份拷贝,AluI序列长282个核苷酸,由两个同源但略有差别的亚基组成。
核心序列的概念
中文名称核心序列英文名称core sequence定 义重复序列共有的核苷酸序列。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
信号序列的概念
信号序列是引导蛋白质定向转移的线性序列,通常有16-26个氨基酸残基,对所引导的蛋白质没有特异性要求。