电泳分离的蛋白质肽谱和序列分析实验

实验材料 冻干的纯化蛋白样品试剂、试剂盒 甲酸氢溴酸过氧化氢NaOH 固体仪器、耗材 旋转蒸发器小试管实验步骤 1.加入 100ul 过氧化氢到 900ul 甲酸中,在室温下放置让,将反应产生过甲酸 (HCOOOH)。2.在冰上冷冻过甲酸至 0°C。3.在预冷的小试管中,将蛋白质溶解于 50ul 过甲酸中(500ug/ml)。4.盖上帽子,0°C 孵育混合物 4 h。如果蛋白质不溶,把反应延长到 20 h。5.加入 30ul 氢溴酸,去除多余的过甲酸。要特别小心,可能会释放出来少量的溴。6.用旋转蒸发器或离心冷冻干燥机彻底干燥样品。在浓缩器中加入少量的 NaOH 固体,以去掉多余的溴和甲酸。蒸发干燥约需要 10 min。由于许多氨基酸被修饰,推荐用过甲酸氧化的蛋白质用于 S—S/S—H(半胱磺酸)和甲硫氨酸基团(甲硫氨酸砜)的定量分析,而不是序列分析。......阅读全文

电泳分离的蛋白质肽谱和序列分析实验

方案1 蛋白质的过甲酸氧化实验 方案2 蛋白质还原和S-羧甲基化:大规模方法 方案3 蛋白质还原和S-羧甲基化:微量方法 方案4 用Ellman 试剂测定自由巯基和二硫键实验 方案5 蛋白质的胰酶消化实验 方案6 用溴化氰切割 M

电泳分离的蛋白质肽谱和序列分析实验

实验材料 冻干的纯化蛋白样品试剂、试剂盒 甲酸氢溴酸过氧化氢NaOH 固体仪器、耗材 旋转蒸发器小试管实验步骤 1.加入 100ul 过氧化氢到 900ul 甲酸中,在室温下放置让,将反应产生过甲酸 (HCOOOH)。2.在冰上冷冻过甲酸至 0°C。3.在预冷的小试管中,将蛋白质溶解于 50ul 过

蛋白质序列分析和结构预测实验

实验步骤 1.  人脂联素蛋白质序列的检索(1)调用Internet浏览器并在其地址栏输入Entrez网址(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez);(2)在Search后的选择栏中选择protein;(3)在输入栏输入homo sapiens adiponectin;

蛋白质序列分析和结构预测实验

实验步骤1.  人脂联素蛋白质序列的检索(1)调用Internet浏览器并在其地址栏输入Entrez网址(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez);(2)在Search后的选择栏中选择protein;(3)在输入栏输入homo sapiens adiponectin;(

蛋白质序列分析和结构预测实验

蛋白质序列分析和结构预测实验             实验步骤 1.  人脂联素蛋白质序列的检索(1)调用Internet浏览器并在其

蛋白质内序列分析用肽段的分离与纯化实验

分子生物学中最重要的环节之一是对微量蛋白质进行分析,使对编码待研究蛋白的 cDNA 序列的克隆成为可能。为有效地做到这一点,通常需要知道蛋白质的内序列。在这一方面,肽段的有效分离是极重要的。本实验来源于蛋白质纯化与鉴定实验指南,作者:朱厚础。试剂、试剂盒考马斯亮蓝 G乙酸甲醇Achromobacte

蛋白质内序列分析用肽段的分离与纯化实验

试剂、试剂盒 考马斯亮蓝 G乙酸甲醇Achromobacter 胰蛋白酶 I 三氟乙酸乙腈2-丙醇仪器、耗材 SpeedVac 型旋转浓缩器Tween-20UltrafreeTM MC 滤器C18 反相 HPLC 柱实验步骤 材料与设备考马斯亮蓝 G(0.05% 的乙酸-20% 甲醇溶液)乙酸 (5

蛋白质内序列分析用肽段的分离与纯化实验

            试剂、试剂盒 考马斯亮蓝 G 乙酸 甲醇 Achromobacter 胰蛋白酶 I 三氟乙酸 乙腈 2-丙醇

核酸和蛋白质序列分析1

在获得一个基因序列后,需要对其进行生物信息学分析,从中尽量发掘信息,从而指导进一步的实验研究。通过染色体定位分析、内含子/外显子分析、ORF分析、表达谱分析等,能够阐明基因的基本信息。通过启动子预测、CpG岛分析和转录因子分析等,识别调控区的顺式作用元件,可以为基因的调控研究提供基础。通过蛋白质基本

核酸和蛋白质序列分析2

(2)输出:除了以文本形式外,还可以通过JalView显示和编辑结果。此外,还可以另外使用GeneDoc(常见于文献)及DNAStar软件等显示结果。多序列比对的结果还用于进一步绘制进化树。3、ORF(Open Reading Frame)分析从核酸序列翻译得到蛋白质序列,需要进行ORF分析,每个生

蛋白质序列分析和结构预测

【实验目的】   1、掌握蛋白质序列检索的操作方法;  2、熟悉蛋白质基本性质分析;  3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测,了解基于motif、结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测;  4、了解蛋白质结构预测。【实验内容】   1、使用Entrez或SRS信息查询系统检索人脂联素(ad

蛋白质序列分析和结构预测

【实验目的】1、掌握蛋白质序列检索的操作方法;2、熟悉蛋白质基本性质分析;3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测,了解基于motif、 结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测;4、了解蛋白质结构预测。【实验内容】1、使用Entrez或SRS信息查询系统检索人脂联素 (adiponectin)

核酸和蛋白质序列分析的内容和方法有哪些

核酸和蛋白质序列分析的内容和方法有哪些蛋白质结构分析方法:X射线晶体衍射分析和核磁共振x 射线衍射法的分辨率可达到原子的水平,使它可以测定亚基的空间结构、各亚基间的相对拓扑布局,还可清楚的描述配体存在与否对蛋白质的影响。多维核磁共振波谱技术已成为确定蛋白质和核酸等生物分子溶液三维结构的唯一有效手段。

核酸和蛋白质序列分析的内容和方法有哪些

核酸和蛋白质序列分析的内容和方法有哪些蛋白质结构分析方法:X射线晶体衍射分析和核磁共振x 射线衍射法的分辨率可达到原子的水平,使它可以测定亚基的空间结构、各亚基间的相对拓扑布局,还可清楚的描述配体存在与否对蛋白质的影响。多维核磁共振波谱技术已成为确定蛋白质和核酸等生物分子溶液三维结构的唯一有效手段。

PK120-的纯化及肽段氨基酸序列分析实验

实验材料PK-120试剂、试剂盒Q-Sepharose 树脂S-Sepharose 树脂Hudroxyapatite 羟基磷灰石Sephacryl S-200 凝胶赖氨酸内切酶乙腈三氯醋酸仪器、耗材Applied Biosystems model 477A 气相蛋白质测定仪Applied Biosy

PK120-的纯化及肽段氨基酸序列分析实验

实验方法原理 实验材料 PK-120试剂、试剂盒 Q-Sepharose 树脂S-Sepharose 树脂Hudroxyapatite 羟基磷灰石Sephacryl S-200 凝胶赖氨酸内切酶乙腈三氯醋酸仪器、耗材 Applied Biosystems model 477A 气相蛋白质测定仪A

PK120-的纯化及肽段氨基酸序列分析实验

基本方案             实验方法原理 实验材料 PK-120

核酸序列分析实验

实验方法原理针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找基因,找出基因的位置和功能位点的位置,以及标记已知的序列模式等过程。在此过程中,确认一段 DNA 序列是一个基因需要有多个证据的支持。一般而言,在重复片段频繁出现的区域里,基因编码区和调控区不太可能出现;如果某段 DNA 片段的假想产物与某个已知的蛋

磷酸化位点分析实验——高分辨凝胶电泳分离磷酸肽

实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤在聚丙烯酰胺凝胶上用 2-DE 纯化磷酸肽是最近发表的制备技术,其结果与 2D-PP 结果相似。非变性凝胶等电聚焦结合碱性 40%PAGE 胶用于磷酸肽分离及比较分析。 32p 标记样品用放射自显影或磷储屏检测。用 Edman 测序方法鉴定蛋白质并确定磷酸化位

蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验

方案1 两相柱测序仪的样品上样实验实验材料样品溶液试剂、试剂盒甲醇(HPLC级)三氟乙酸(TFA)仪器、耗材双向测序柱(Agilent)氮气供应设备聚丙烯试管样品加样器上样漏斗实验步骤一、浸润层析柱1.将准备好的两相柱的亲水段(凸向接头)移开,放在一边。2.将柱的疏水段(凹向接头)和上样漏斗装配在一

蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验

方案1 两相柱测序仪的样品上样实验 方案2 将蛋白质从凝胶电转移至 PVDF 膜实验 方案3 检测 PVDF 膜上的蛋白质实验 方案4 浓缩聚丙烯酰胺凝胶上的蛋白质点实验 方案5 磷酸化多肽的固相微量测序实验 方案6 羧基端序列分

蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验6

方案6 羧基端序列分析实验实验材料利用一维或二维聚丙烯酰胺凝胶分离的蛋白质或溶液中的蛋白质试剂、试剂盒乙酸酐 二甲基吡啶烷基化乙内硫酰脲 (ATH) 氨基酸标准品溴甲基萘的乙腈溶液考马斯亮蓝(R250)二异丙基乙胺(DIEA)的庚烷溶液乙酸乙酯甲醇N-甲基咪唑的乙腈溶液异氰酸苯酯的乙腈溶液哌嗪硫氰酸

蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验5

方案5 磷酸化多肽的固相微量测序实验实验材料放射性标记的多肽试剂、试剂盒碳二亚胺试剂偶联缓冲液甲醇-水多肽溶剂S3 (氯丁烷 正丁醇)闪烁液仪器、耗材ATZ-收集器加热块小滴管Mylar 聚酯薄膜蛋白质测序仪闪烁计数器Sequelon-AA 试剂盒测试管实验步骤1.将放射性标记的肽段在小试管中溶解于

蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验2

方案2 将蛋白质从凝胶电转移至 PVDF 膜实验实验材料含目的蛋白样品的聚丙烯酰胺凝胶( 未染色)试剂、试剂盒CAPS甲醇转移缓冲液仪器、耗材电印迹设备塑料容器聚偏二氟乙烯(PVDF)膜实验步骤要点:为了避免凝胶或膜的蛋白质污染,进行以下操作时需戴手套。1.凝胶电泳之后,立即将凝胶转移到一个塑料容器

蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验3

方案3 检测 PVDF 膜上的蛋白质实验实验材料含目的蛋白的 PVDF 膜试剂、试剂盒考马斯亮蓝染色液脱色液仪器、耗材塑料容器实验步骤1.依方案2 电转移后,将 PVDF膜迅速放于塑料容器中,并加人考马斯亮蓝染色液浸没膜。室温下染 5〜10 min 。2.弃去染色液,加人脱色液浸没膜,在 PVDF

蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验4

方案4 浓缩聚丙烯酰胺凝胶上的蛋白质点实验实验材料包含目的蛋白的二维电泳凝胶点试剂、试剂盒丙烯酰胺混合物(30%)琼脂糖 50g L考马斯亮蓝染色液脱色液平衡缓冲液10 X 聚丙烯酰胺电泳缓冲液浓缩胶仪器、耗材巴氏滴管聚丙烯管Protean II xi 2-D 电泳槽(Bio-Rad)注射器试管管式

蛋白质组学主要包括哪些分析技术及各自特点

  双向凝胶电泳  双向凝胶电泳的原理是第一向基于蛋白质的等电点不同用等电聚焦分离,第二向则按分子量的不同用SDS-PAGE分离,把复杂蛋白混合物中的蛋白质在二维平面上分开。由于双向电泳技术在蛋白质组与医学研究中所处的重要位置,它可用于蛋白质转录及转录后修饰研究,蛋白质组的比较和蛋白质间的相互作用,

蛋白质组学主要包括哪些分析技术及各自特点

  双向凝胶电泳  双向凝胶电泳的原理是第一向基于蛋白质的等电点不同用等电聚焦分离,第二向则按分子量的不同用SDS-PAGE分离,把复杂蛋白混合物中的蛋白质在二维平面上分开。由于双向电泳技术在蛋白质组与医学研究中所处的重要位置,它可用于蛋白质转录及转录后修饰研究,蛋白质组的比较和蛋白质间的相互作用,

分泌肽能系统干扰中的蛋白质组学分析实验

实验步骤 一、材料 1 细胞培养和裂解 (1)小鼠脑垂体 AtT20 和 AtT20 (proSAAS) 细胞系。 AtT20 .(proSAAS) 细胞系通过用包含一个新霉素抗性基因的 proSAAS 表达载体转染 A

质谱技术在蛋白组研究中的应用(一)

[摘要] 质谱对于现代蛋白质化学研究是一项重要的技术。也可用于蛋白组分析,在同一时间监控上千种蛋白的表达情况。首先蛋白质混合物可以用双向凝胶电泳分开,再用质谱及随后的蛋白质数据库检索对单个蛋白进行鉴定和分析。最近几年,质谱领域取得了令人鼓舞的进展,使得全自动、高通量的蛋白检测成为可能。质谱也