Nature构建蛋白质分子“搜索网”

来自华盛顿大学的科学家们,在实验室中利用计算机设计并建造出了能够识别和结合小分子的蛋白质分子“搜索网”。 用计算机设计出能够识别生物学小分子并能与之相互作用的蛋白质现在成为了现实。科学家们成功地构建出了一种蛋白质分子,其编程后可以结合三种不同的类固醇。这一成果有可能更广泛地应用于医学和其他领域。 主要研究人员之一、华盛顿大学生物化学博士后Christine E. Tinberg说:“这是朝着构建出可用作生物传感器或分子海绵的蛋白质迈出的重要一步。” 在9月4日《自然》(Nature)杂志上的论文中作者们详细描述了所采用的方法。来自亚利桑那州立大学的Giovanna Ghirlanda针对这篇Nature论文发表了一篇评论“Computational biology: A recipe for ligand binding proteins”。他写到:“开发出这种方法来设计出带有理想识别位点的蛋白......阅读全文

球状蛋白质的分子特性

  球状蛋白质分子形状接近球形,水溶性较好,种类很多,可行使多种多样的生物学功能。具有球形或近于椭球体分子形状的蛋白质之总称。是纤维状蛋白质的对应词。凡不属于纤维状蛋白质,而一般的单纯蛋白质(清蛋白、球蛋白等)和许多复合蛋白质均属于此类,与纤维状蛋白质相比,溶液的粘度低,流动双折射弱。

分子克隆蛋白表达实验指南(五)

8. TA质粒转化菌落的验证  与表达载体的验证不同,转化TA质粒时不用双酶切验证。只需用目的基因引物和TA载体引物PCR验证即可。TA载体引物PCR片段比插入片段大约长150bp。  目的基因退火温度与之前胶回收时温度相同,TA退火温度60C即可,但可在55~70之间变动,不会影响结果。  挑取至

分子克隆蛋白表达实验指南(十四)

RbCl制备感受态细胞  需准备的灭菌器具和培养液:  SOB,Buffer 1,Buffer 2,3×200ml广口瓶,1.5ml   EP管,1×500ml离心瓶(按200ml摇菌量计算),2×50ml离心管,2×移液管(用于加Buffer 1),液氮,冰  离心管,EP管,移液管使用前均需要放

分子克隆蛋白表达实验指南(八)

15. 小量蛋白诱导表达      该步骤的目的是检测蛋白是否在上清存在表达。低温时蛋白易于表达于上清,因此小量蛋白诱导表达以20或30C为培养温度。  1. 挑一单克隆的菌落于5ml含有相应的抗生素的LB培养液中,37℃振荡培养过夜(8-16h)。  2.   过夜培养液加入三瓶50ml含

挑战高分子量蛋白——MALDI质谱分子成像技术

在对组织或生物体进行成像,分析小分子构成的时候,有一个“拦路虎”总是阻碍实验的进程,那就是多肽,这些多肽体积十分大,要想对它们进行分子成像几乎是不可能的,比如,想要研究肿瘤边缘的分子微环境,如果直接成像是不可能获得清晰图像的。来自范德堡大学的质谱方法专家Richard Caprioli博士因

蛋白质根据蛋白质分子的外形进行分类

1.球状蛋白质分子形状接近球形,水溶性较好,种类很多,可行使多种多样的生物学功能。2.纤维状蛋白质分子外形呈棒状或纤维状,大多数不溶于水,是生物体重要的结构成分,或对生物体起保护作用。3.膜蛋白质一般折叠成近球形,插入生物膜,也有一些通过非共价键或共价键结合在生物膜的表面。生物膜的多数功能是通过膜蛋

蛋白质芯片技术生物分子反应

使用时将待检的含有蛋白质的标本如尿液、血清、精液、组织提取物等,按一定程序做好层析、电泳、色谱等前处理,然后在每个芯池里点入需要的种类。一般样品量只要2-10μL即可。根据测定目的不同可选用不同探针结合或与其中含有的生物制剂相互作用一段时间,然后洗去未结合的或多余的物质,将样品固定一下等待检测即可。

绿色荧光蛋白分子标记的研究

  分子标记  作为一种新型的报告基因,GFP已在生物学的许多研究领域得到应用。利用绿色荧光蛋白独特的发光机制,可将GFP作为蛋白质标签(protein tagging),即利用DNA重组技术,将目的基因与GFP基因构成融合基因,转染合适的细胞进行表达,然后借助荧光显微镜便可对标记的蛋白质进行细胞内

测序牛人发布蛋白单分子测序技术

  人类生命的蓝图是三十亿碱基对组成的人类基因组。而DNA编码的蛋白质是几乎所有生命过程的主要执行者。   现在,美国亚利桑纳州立大学Biodesign研究所的Stuart Lindsay及其同事,在纳米孔DNA测序技术的基础上,开发了能够精确鉴定氨基酸的蛋白单分子测序技术。这一技术不仅可以用

分子遗传学词汇珠蛋白基因

中文名称:珠蛋白基因外文名称:globin gene定义:珠蛋白基因 globin gene 血红蛋白含2个α和2个β链,分别由α链珠蛋白基因和β链珠蛋白基因的信息而形成。哺乳动物的α链基因和β链基因在结构上相似,都是由2个内含子而分为3个外显子部分。

分子伴侣参与蛋白运送的作用介绍

  在蛋白跨膜运送过程中,也有分子伴侣的参与。核糖体上新合成的多肽在定向跨膜运送到不同细胞器时,要维持非折叠状态。分子伴侣Hsp70家族在蛋白移位中就能打开前体蛋白的折叠,这时跨膜蛋白疏水基团外露,分子伴侣能够识别并与之结合,保护疏水面,防止相互作用而凝聚,直至跨膜运送开始。跨膜运送后,分子伴侣又参

蛋白凝胶大分子成像仪

  蛋白凝胶大分子成像仪是一种用于畜牧、兽医科学领域的分析仪器,于2017年5月8日启用。  技术指标  1系统模式 *双通道同时扫描,同时输出。 2硬件构成 *2.1光 源: 2根独立的波长特异性的激光器,激发波长分别为685nm和785nm,使用寿命为40000小时,激发强度可调。 *2.2检测

蛋白质与生物小分子结合

生物大分子,首先先说一下什么是生物大疯子,生物大分子指的是作为生物体内主要活性成分的各种分子量达到上万或更多的有机分子.高相对分子量的生物有机化合物(生物大分子)主要是指蛋白质、核酸以及高相对分子量的碳氢化合物.常见的生物大分子包括蛋白质、核酸、多糖.但是,这只是相对的说法,这个定义只是概念性的,与

如何查询已知蛋白的分子量

分子筛-高效液相色谱联用这两个是实验室主要应用的方法,如果是在家简易测定,可以试试花百把块几十毫升分子筛,用个注射器装柱,然后去弄点天然存在的较便宜的纯蛋白(比如说鸡蛋清的盐析产物是较纯的鸡卵清蛋白、盐析法提取的羊igg、等电点沉淀法制备牛奶中的酪蛋白和人igm),染色考马斯亮蓝g250后透析去除染

蛋白质分子稳定性测量

      采用标准       测量类型:温度中点Tm测量类型:焓∆H测量类型:热容变化∆CpSample capacity:576(六个96-孔板)样品量:370µL样品池容积:130µL样品展示选件:96-孔板Sample capacity:50个样品 / 24小时(自动系统

关于蛋白与分子的结合的讨论

Docking相关A:新手想问一下,docking结果怎么判断小分子和蛋白产生了结合呀,形成了疏水键或氢键吗?B:打分越低越好,一般会设置一个已知的配体用来做参照,或者说用来检验参数是否合理。A:我是选择了有配体的蛋白,处理了蛋白和分子后进行docking,得到这个结果。B:只要比这个配体的打分低,

质谱法鉴定蛋白质分子量

质谱法鉴定蛋白质分子量对样品的消耗很少,且具有更高的灵敏度、分辨率和准确度,有利于对复杂混合物样品的分析。目前广泛使用的用干蛋白质鉴定的质谱分析主要使用两种类型质谱:一种是MALDI-TOF直接对分子量进行测量,MALIDI离子源产生的离子多带单电荷,质谱图中的峰与样品各组分质量数是一-对应的,不用

免疫球蛋白分子的基本结构

轻链为免疫球蛋白分子中相对分子量较小的链。免疫球蛋白分子的基本结构是由二硫键连接的四条多肽链组成的对称结构,称为单体,呈“Y”或“T”字形。其中两条相同的长链,由450 ~550个氨基酸残基组成,相对分子量较大,称为重链。另两条相同的短链,由214个氨基酸残基组成,相对分子量较小,称为轻链。每条多肽

鉴定80个蛋白-揭示分子机理-睡眠相关潜在分子靶点出现

  据英国《自然》杂志近日在线发表的一项神经科学研究,美国科学家团队发现,大脑中的蛋白质磷酸化水平可能驱动着睡眠欲望。该研究揭示了睡眠需求的分子基础,强调了与睡眠有关的疗法的潜在分子靶点。同时,也让人们距离揭开睡眠的奥秘又近了一步。图片来源于网络   昼夜节律可以使我们感知到地球自转所引发环境的改变

蛋白质分子检测技术取得突破进展

  据德国卡塞尔大学网站报道,近日,该校科学家研制的一种带磁场的微型传感器获得突破,样机在年内即能完成。该传感器通过遥控牵引磁化纳米生物分子,可将检测液中极少量的蛋白质分子检测出来。该技术有望革新医疗诊断方式,其中利用磁性纳米粒子运送生物分子的方法已申请了专利。   一般情况下,病人体内某些

稻米蛋白品质形成分子机制获揭示

  近日,《植物细胞》在线发表中国工程院院士、中国农业科学院作物科学研究所研究员万建民团队揭示的稻米蛋白品质形成分子机制。该研究克隆了水稻蛋白品质形成新基因GPA5,并从细胞、遗传和生化层面阐明了GPA5在水稻贮藏蛋白后高尔基体转运中的关键作用,对稻米蛋白品质改良具有重要指导意义。  论文第一作者、

免疫球蛋白分子的结构有哪些?

  (1)VL和VH是与抗原结合的部位,其中HVR(CDR)是V区中与抗原决定簇(或表位)互补结合的部位。VH和VL通过非共价相互作用,组成一个FV区。单位Ig分子具有2个抗原结合位点(antigen-bindingsite),二聚体分泌型IgA具有4个抗原结合位点,五聚体IgM可有10个抗原结合位

免疫球蛋白G的分子结构

  Ig分子的基本结构是对称的四条多肽链,即两条相同的轻链(L链)和两条相同的重链(H链),借链间二硫键连结而成“Y”字型单体分子。Ig分子不同类别是由各自重链的结构决定的。重链分为γ、μ、α、δ及ε链五类,又可按重链抗原性的不同分为若干亚类。五类Ig分子的轻链都相同,可分为κ型和λ型,两型间的氨基

“分子胶水”可黏住促癌蛋白质

  多伦多大学密西索加分校研究人员开发出一种“分子胶水”,能将促癌蛋白质黏在细胞膜上,从而阻断癌细胞的生长,但不会影响正常细胞。该研究作为封面文章发表在最新出版的《应用化学》杂志上。   如果在满是油脂的水池里加入些肥皂,肥皂中的憎水基会排开水,吸附油脂退居到水池边缘。倘若水池是癌细胞,一滴滴的油

Nature构建蛋白质分子“搜索网”

  来自华盛顿大学的科学家们,在实验室中利用计算机设计并建造出了能够识别和结合小分子的蛋白质分子“搜索网”。   用计算机设计出能够识别生物学小分子并能与之相互作用的蛋白质现在成为了现实。科学家们成功地构建出了一种蛋白质分子,其编程后可以结合三种不同的类固醇。这一成果有可能更广泛地应用于医学和其他

低分子蛋白尿的诊断及鉴别

  诊断  尿中低分子蛋白占70%左右,而白蛋白仅占15~25%。尿蛋白定量一般在1g/24h,很少超过2g/24h。  鉴别  与肾小球性蛋白尿的最大区别是尿中低分子蛋白占70%左右,而白蛋白仅占15~25%。尿蛋白定量一般在1g/24h,很少超过2g/24h。  尿中低分子蛋白占70%左右,而白

血红蛋白分子结构和特点

(1)结构:由两对珠蛋白肽链和4个亚铁血红素构成。①珠蛋白:4条肽链(α、β链)②亚铁血红素:原卟啉、铁(2)特点①正常情况下,99%血红蛋白为还原血红蛋白,1%为高铁血红蛋白。②只有Fe2+状态的血红蛋白才能与氧结合,称为氧合血红蛋白。③出生后3个月,HbA占95%以上,而HbF<1%。④血红蛋白

分子激活人体蛋白可加速伤口愈合

  英国帝国理工学院发布了一项新研究:一种特殊材料能通过与伤口周边组织的互动,激活身体内在修复系统,从而促进伤口愈合。这一发现有望带来更高效的伤口护理方案。  当前已有不少用于辅助伤口愈合的医用材料,而科学家希望找到能与身体周边组织互动的生物材料来加速辅助多种类型的伤口愈合。人体受伤后,细胞会像蜘蛛

Nature子刊:蛋白单分子测序技术问世

最近,美国学者在纳米孔DNA测序技术的基础上,开发了能够精确鉴定氨基酸的蛋白单分子测序技术。这一技术不仅可以用来在临床上测序蛋白质和检测新生物指标,还有望给医疗领域带来彻底的改变,在单分子水平上精确监控患者对治疗的应答情况        人类生命的蓝图是三十亿碱基对组成的人类基因组。而DNA编码的蛋