Nature子刊:最大、最精确的RNA编辑位点列表

由布朗大学领导的一个研究小组编译出了一份最大型、经最严格验证的果蝇RNA编辑位点列表。该研究生成了关于这一模式生物基础生物学的一些新见解,研究结果发表在9月29日的《自然结构和分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)杂志上。 这一“主列表”总共包含了3,581个位点,在这些位点ADAR酶可以将RNA分子中的“A”核苷酸换成“G”核苷酸。这样看似很小的改变意义却很大,因为它改变了果蝇DNA中的遗传指令执行的方式, 影响了包括正常的神经和性发育在内许多基础功能。在人类,RNA编辑混乱与肌萎缩性侧索硬化症(ALS)及Acardi-Gutieres病密切相关。 这一新的编辑位点列表因此有可能帮助到数以千计从事“转录组”(transcriptome,由DNA转录生成的RNA分子)研究的科研人员,为他们提供了有关成千上万可能发生的编辑改变的可靠信息。 论......阅读全文

大脑RNA编辑位点“辞典”发布

美国西奈山伊坎医学院研究人员对大脑中的数千个位点进行了编目,在这些位点中,RNA在整个人类生命周期中被修饰,这个过程被称为腺苷到肌苷(A-to-I)编辑,其为理解大脑发育的细胞和分子机制以及它们如何影响健康和疾病提供了重要的新途径。在《细胞报告》上发表的论文中,研究团队描述了大脑中RNA编辑的速率如

Nature子刊:最大、最精确的RNA编辑位点列表

  由布朗大学领导的一个研究小组编译出了一份最大型、经最严格验证的果蝇RNA编辑位点列表。该研究生成了关于这一模式生物基础生物学的一些新见解,研究结果发表在9月29日的《自然结构和分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)杂志上。   这一“主列

CRISPR新工具开辟更多可编辑基因组位点

  据最新一期《科学进展》报道,美国麻省理工学院(MIT)研究人员发现了一种可靶向几乎一半基因组位点的Cas9酶,从而极大地扩展了基因编辑工具的适用范围。  尽管基因编辑工具近年来取得了相当大的成功,但CRISPR-Cas9在基因组上可访问的位点数量仍然有限。这是因为CRISPR需要在基因组靶向位点

核糖体结合位点生物合成

抗体是由核糖体合成细胞内定位核糖体的功能就是将mRNA上的遗传密码(核苷酸顺序)翻译成多肽链上的氨基酸顺序。因此,它是肽链的装配机,即细胞内蛋白质合成的场所,细胞合成的蛋白质可分为两类:外输性蛋白和内源性蛋白。1.外输性蛋白:主要在固着核糖体上合成,分泌到细胞外发挥作用,如抗体蛋白、蛋白类激素、酶原

核糖体结合位点的生物合成

  抗体是由核糖体合成  细胞内定位  核糖体的功能就是将mRNA上的遗传密码(核苷酸顺序)翻译成多肽链上的氨基酸顺序。因此,它是肽链的装配机,即细胞内蛋白质合成的场所,细胞合成的蛋白质可分为两类:外输性蛋白和内源性蛋白。  1.外输性蛋白:主要在固着核糖体上合成,分泌到细胞外发挥作用,如抗体蛋白、

识别位点

中文名称识别位点英文名称recognition site定  义限制性内切酶特异结合的核苷酸序列。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

剪接位点

中文名称剪接位点英文名称splicing site;splice site定  义剪接体可识别的RNA前体中内含子和外显子连接边界的序列和接头位点。根据位置不同可以分为供体和接纳体剪接位点。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

进入位点

中文名称进入位点英文名称entry site定  义特指氨酰tRNA进入核糖体的部位。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科) 

加帽位点

中文名称加帽位点英文名称cap site定  义mRNA中加帽结构的部位,该位点在前体mRNA的5'端。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

Detectseq技术为碱基编辑领域内提供了CBE脱靶位点

  2021年6月8日,北大-清华生命科学联合中心、北京大学生命科学学院伊成器教授课题组在Nature Methods杂志发表了题为“Detect-seq reveals out-of-protospacer editing and target-strand editing by cytosine

核糖体结合位点生物合成的简要过程

  蛋白质生物合成是一个复杂而重要的生命活动,它在细胞中有粗细的结构基础,进行得十分迅速有效,是依靠分子水平上的严密组织和准确控制进行的。  蛋白质合成不仅要有合成的场所,而且还必须有mRNA、tRNA、20种氨基酸原料和一些蛋白质因子及酶。Mg、K+离子等参与,并由ATP、GTP提供能量,合成中m

在含氧阴离子调控催化位点配位环境研究中获进展

  为实现零碳经济,设计高效、低成本的阳极催化剂是达成电解水绿色制氢和生物质电氧化升级的关键。由于固有的氧化还原特性,镍基非贵金属电催化剂被认为是潜在的候选者,但关于镍位点配位环境的活性调控机制尚缺乏深入研究。   近日,中国科学院上海硅酸盐研究所研究员王家成团队前期研究发现磷酸根阴离子可有效调控镍

nut-位点的定义

中文名称nut 位点英文名称nut site定  义噬菌体基因组中抗终止因子N蛋白的识别位点。N蛋白对nut位点的识别和随之发生的相互作用,使RNA聚合酶能忽略终止信号而持续通过终止子。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

什么是活性位点

者一般用在大分子化学中,活性位点指的是可以发生化学反应的集团。活性位点少,发生有效碰撞的机率就少,也就是说反应比较单一,容易被控制

研究团队开发糖结合位点预测精准新算法

  6月17日,中国科学院上海药物研究所研究员程曦、文留青等与临港实验室青年研究员王鼎言合作,通过开发基于深度学习模型的糖结合位点预测算法DeepGlycanSite,精准预测了蛋白质结构上的糖类结合位置,有助于解决糖类与蛋白质相互作用的难题。相关研究发表于《自然—通讯》。  糖类不仅为生物体提供能

研究团队开发糖结合位点预测精准新算法

6月17日,中国科学院上海药物研究所研究员程曦、文留青等与临港实验室青年研究员王鼎言合作,通过开发基于深度学习模型的糖结合位点预测算法DeepGlycanSite,精准预测了蛋白质结构上的糖类结合位置,有助于解决糖类与蛋白质相互作用的难题。相关研究发表于《自然—通讯》。糖类不仅为生物体提供能量供应和

磷酸化位点分析实验磷酸化位点的确定

实验方法原理 磷酸化位点的确定也使用一些通用方法;磷酸化蛋白质被纯化,如果可能蛋白质要均一;磷蛋白被特异性的化学或酶反应切断、产生肽混合物,其中含有一到两个磷酸肽不同之处在干其分离磷酸肽的策略是为了确定氨基酸序列,定位肽段内磷酸化的残基。上面所述的分离方法, 2D-PP 作图、 HPLC 或 l

磷酸化位点分析实验磷酸化位点的确定

磷酸肽的化学测序 磷酸肽的质谱分析 源后衰变 用酶和化学方法去磷酸化             实验方法原理 磷酸化位点的确定也使用一

研究提出离子补偿重构策略强化催化位点构筑

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498817.shtm

研究确定IgA肾病-30个独立显著的风险位点

  IgA肾病(IgAN)是一种常见的原发性肾小球疾病,由IgA免疫球蛋白在肾小球异常沉积而得名。美国哥伦比亚大学研究团队通过全基因组关联分析,揭示IgAN的致病信号通路和潜在药物靶点。该研究成果于近日发表在《Nature Genetics》杂志上,题为:Genome-wide associatio

无嘧啶位点的概念

中文名称无嘧啶位点英文名称apyrimidinic site定  义核酸中脱去嘧啶碱的部位。产生的醛基,易发生β消除反应而使核酸链在该处断裂。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

阴离子位点显示实验

实验方法原理 实验材料 组织样品试剂、试剂盒 磷酸缓冲液阳离子化铁蛋白液体戊二醛锇酸实验步骤 1. 0.1 mol/L磷酸缓冲液配制阳离子化铁蛋白,浓度为0.2~0.5 mg/ml。2. 组织样品悬浮于阳离子化铁蛋白液体中,室温下反应30 min。3. 0.1 mol/L磷酸缓冲液充分漂洗。4. 3

加帽位点的概念

中文名称加帽位点英文名称cap site定  义mRNA中加帽结构的部位,该位点在前体mRNA的5'端。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

无嘌呤位点的定义

中文名称无嘌呤位点英文名称apurinic site定  义核酸中脱去嘌呤碱的部位。产生的醛基,易发生β消除反应而使核酸链在该处断裂。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

无碱基位点的定义

中文名称无碱基位点英文名称abasic site定  义核酸中失去碱基的部位。该部位碱基失去后,产生一个醛基,易发生β消除反应而使核酸链在该处断裂。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学词汇nut-位点

中文名称:nut 位点英文名称:nut site定  义:噬菌体基因组中抗终止因子N蛋白的识别位点。N蛋白对nut位点的识别和随之发生的相互作用,使RNA聚合酶能忽略终止信号而持续通过终止子。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

什么是序列标签位点?

序列标签位点(sequence-tagged site),是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间。

核糖体结合位点

核糖体结合位点(ribosomebinding site,简称RBS),是指mRNA的起始AUG上游约8~13核苷酸处,存在一段由4~9个核苷酸组成的共有序列-AGGAGG-,可被16SrRNA通过碱基互补精确识别的序列。

序列标签位点的定义

序列标签位点(sequence-tagged site),是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间。

SNP位点的选择原则

1,如果是检测基因的所有已知的SNP,那么首先要去了解并查询到这些SNP位点,SNP位点可以通过查询dbSNP数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/)和TSC(The SNP Consortium)数据库(http://snp.cshl.org/),可以获知基因及上