宏基因组研究新突破,复旦最新研究发Nature

近年来伪狂犬、猴痘等病毒从动物向人类外溢引发新发传染病甚至全球大流行的频率正在显著增加如何精准预测和预报动物源新发传染病是关系绿色健康养殖与公共卫生防控的重要科学问题复旦大学公共卫生学院粟硕教授团队与合作者运用前沿交叉研究方法揭示多种哺乳动物宏基因组数据中的病毒基因组组成、生态学特征与跨物种传播规律在“同一健康”理念下为构建人-动物-环境一体化多维度新发传染病预测预警体系奠定重要数据基础成果于北京时间9月4日以题为“Farmed fur animals harbor viruseswith zoonotic spillover potential”的研究长文在《自然》杂志(Nature)发表聚焦养殖哺乳动物发现潜在“风险”病毒21世纪以来,人类多次经历由动物源新发传染病原引发的大流行疫情。2014年西非埃博拉病毒疫情、2015年寨卡病毒在南美暴发并蔓延全球,以及近期起源非洲的猴痘疫情等,接连不断地给全球公共卫生体系带来严峻挑战。......阅读全文

Nature:基因组研究让两类癌症合而为一

  根据癌症基因组图谱(TCGA)计划一项针对结肠与直肠癌组织样本的大型研究,尽管解剖位置不同分别起源于结肠或直肠,结肠和直肠组织的基因组改变模式是相同的,这使得研究人员得出结论可将这两种癌症类型合而为一。   在多种类型的基因组分析中,结肠癌与直肠癌的结果几乎是难以区分的。最初,TCGA研究网络

韩斌院士Nature子刊发表基因组研究新文章

  来自中科院上海生命科学研究院、中国农业科学院等处的研究人员报告称,他们通过对杂交水稻品种进行基因组分析,揭示出了大批促成杂种优势( Heterosis)的优异等位基因(superior alleles)。研究结果发布在2月5日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。 

Nature:基因组错误折叠或提供新的癌症研究思路

  近日,发表在Nature杂志上的一篇研究论文中,来自麻省总医院和博德研究所的科学家揭示了隐藏在癌症背后的一种新型生物学机制,文章中,通过对携带异柠檬酸脱氢酶基因(IDH)突变的脑瘤进行研究,研究者揭开了指导基因组自身折叠指令的罕见改变,这些指令改变可以靶向作用基因组的关键部分—绝缘子,绝缘子可以

Nature公布最大规模肥胖全基因组研究成果

  一些时尚杂志总是在说,如果你不能控制好你的体重,那么更加就无法控制住自己的人生,但是肥胖真的是可以完全由人为意志控制的吗,为什么还会有一些人怎么吃也不胖,或者脂肪堆积的地方也不相同呢?近期一组研究人员在迄今为止最大规模的肥胖全基因组研究中追溯了其中的遗传成因,相关成果以两篇论文的形式发表在Nat

Nature:从基因到功能,红细胞全基因组关联研究

  一项新研究正揭示机体如何生成红血细胞,以及随时调控红细胞中血红蛋白(haemoglobin)量的机制。利用全基因组分析技术,研究人员将有可能与红细胞形成相关的遗传区域数量增加了一倍,随后的果蝇研究获得了关于这些区域功能的一些新认识。相关成果发表在《自然》(Nature)杂志上。   血红蛋白是

Nature公布实体瘤的最大规模全基因组研究

  在一项新的研究中,来自荷兰和澳大利亚的多个研究机构的研究人员对转移性实体瘤开展了有史以来最大规模的全基因组研究。相关研究结果近期发表在Nature期刊上,论文标题为“Pan-cancer whole-genome analyses of metastatic solid tumours”。他们在

Nature公布大麦基因组图谱

  大麦是世界上最重要的粮食作物之一,17日Nature公布了目前为止最完善的大麦基因组测序图谱。这项由美国农业部主导的大工程,在德国、日本、芬兰、澳大利亚、英国、美国和中国科学家们的共同努力下,历经六年终于取得了重大进展。大麦基因组图谱将成为人们提高大麦产量、增强大麦抗虫抗病能力、增加大麦营养价值

Nature突破:香蕉基因组测序

  由法国的研究人员领导的一个国际小组近日完成了对香蕉品种小果野蕉(Musa acuminata)的基因组测序,并开始分析这一基因组草图。相关研究成果发布在了7月11日的《自然》(Nature)杂志上。   研究人员采用Roche 454、Sanger和Illumina的测序方法绘制出了双单倍

Nature完成桉树基因组测序

  一个横跨五大洲的科学团队宣布,巨桉(Eucalyptus grandis)的基因组测序已经完成,巨桉是世界上最广泛种植的树木之一。这一成果于六月十一日发表在Nature杂志上。  巨桉生长速度快,可以用作燃料和木材,是纤维、纸浆、生物燃料、药物和工业用油的重要可再生原料。这种树木原产于澳大利亚东

Nature破解甜菜基因组秘密

  由德国比勒费尔德大学、西班牙基因组调控中心(CRG)、马克思普朗克分子遗传学研究所(MPIMG)等机构的研究人员组成的一个国际研究小组,第一次测序并分析了甜菜的甜味基因,并阐明了人工选择塑造这一基因组的机制。研究结果发表在12月18日的《自然》(Nature)杂志上。   如松饼、面包或番茄酱

Nature:深入解析绦虫基因组

  第一次研究人员绘制出了绦虫(tapeworm)的基因组图谱,揭示出了一些现有药物可能发挥作用的潜在药物靶点。这一基因组为我们提供了一个新的资源,为开发出针对这些致人衰弱的疾病急需的有效治疗提供了更快捷的途径。这一研究发表在《自然》(Nature)杂志上。   在世界卫生组织标注的17种遭受忽视

Nature:大规模基因组研究,揭示智商高的人通常更健康

  之前,有研究表明不良的健康状况与较低的社会经济地位及低下的教育水平息息相关。然而,健康与智商的联系却一直是有争议的。对此,一个研究团队给出了答案, 他们的研究表明,对我们的健康状况产生影响的基因同时也对我们的认知能力产生影响。  为了给这种联系找到证据,这个由爱丁堡大学的领导的研究团队将目光转向

王文研究组连发Science,Nature子刊文章解析基因组

  在“973”项目的支持下,中国科学院昆明动物研究所研究员王文领导的团队继2013年解析山羊基因组揭示羊绒生长的基因基础之后,近日再次携手华大基因研究院、澳大利亚联邦科学与工业研究组织等国内外机构“破译”了绵羊基因组。至此,所有重要家畜动物的基因组密码全部告破。  山羊和绵羊是反刍动物的典型代表动

何厚胜/卫功宏/任善成合作发现调控前列腺癌的新机制

  Nature子刊 |   既往众多的大规全基因组关联研究(GWAS)在人类基因组上发现了 269 个与前列腺癌发病风险密切相关的风险区域,其中包含了大量单核苷酸多态性 (SNP) 位点,但是其中约 98% 的 SNP 位点位于基因组上的非编码区。  这些非编码区的位点与前列腺癌之间究竟仅仅是统计

复旦大学发表Nature表观遗传学新文章

  来自复旦大学、中国科学院等机构的研究人员在新研究中揭示出了,从头甲基化转移酶DNMT3A自抑制以及组蛋白H3诱导DNMT3A激活的机制。研究结果发表在11月10日的《自然》(Nature)杂志上。  领导这一研究的是复旦大学上海医学院,生科院的徐彦辉(Yanhui Xu)教授,其早年毕业于清华大

复旦大学Nature子刊发布环状RNA重要发现

  来自复旦大学、上海交通大学医学院的研究人员借助分析环状RNA,揭示出了丰富的circHIPK3通过像海绵般结合多种miRNAs调控了细胞生长。这一重要的研究发现发布在4月6日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。  复旦大学的黄胜林(Shenglin Huang)研

复旦大学Nature子刊发布表观遗传新成果

  来自复旦大学、香港浸会大学的研究人员证实,在低氧条件下醋酸作为一种表观遗传代谢产物促进了脂质合成。这一研究发现发布在6月30日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。  复旦大学的雷群英(Qun-Ying Lei)教授与杨芃原(Peng-Yuan Yang)教授是这篇

复旦大学Nature子刊绘制大鼠转录组图谱

  来自复旦大学、美国食品药品监督管理局(FDA)国家毒理学研究中心、洛马林达大学等机构的研究人员,成功绘制出了涵盖11种器官和4个发育阶段的大鼠RNA测序转录组图谱,这一重要的研究成果发表在2月10日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。   复旦大学的石乐明(

Nature发布基因组测序重要发现

  由科隆大学Roman Thomas领导的一个国际研究小组,对110个小细胞肺癌(SCLC)样本进行了测序,发现除了两个样本其余所有的均包含失活的TP53和RB1基因。通过调查这一疾病的基因组景观,他们还发现有不少的肿瘤具有与TP73基因相关的基因组重排或突变,以及激酶基因突变和Notch家族基因

Nature发布基因组测序惊人发现

  来自冲绳科学技术研究院大学(OIST)的一支研究团队与合作者们,完成了对两个称作为柱头虫(acorn worm)的小水生生物物种的测序,显示相比于许多其他动物,我们与柱头虫共享了更多的基因,确立了它们是我们的远亲。研究结果发布在《自然》(Nature)杂志上。  研究发现,所有后口动物(deut

Nature子刊:解码钩虫基因组

  当你不穿鞋,赤脚走在非洲、亚洲和南美洲部分地区的土地上时,你极有可能会遭受钩虫感染。据估计全球大约有7亿的钩虫感染者。这种寄生物生活在土壤之中,通过手足接触进入到人体。以吸取受害者的血液为生,钩虫可导致儿童出现贫血、生长发育迟缓以及学习问题。   现在,来自华盛顿大学医学院的研究人员破译了美洲

Nature公布800个癌症基因组

  来自癌症基因组计划的科学家们近期报告了他们最新的癌症基因组研究成果,他们公布了800个乳腺癌的遗传特征,包括发现了导致乳腺癌最常见的形式的遗传原因,为新的治疗靶点提供线索,并确定乳腺癌和卵巢癌一种亚型之间的分子遗传相似性。   这项研究结果有助于更全面的了解每种乳腺癌亚型背后的分子机制,相关成

Nature:藻类基因组解读叶绿体秘史

  我们初学生物时接触得最早的就是光合作用,光合作用利用二氧化碳、水和太阳能合成有机物。世界上最重要的光合作用真核生物(植物)多半并不是自己演化出光合作用能力的,它们的叶绿体是从其他生物中“拿来”的。   这些叶绿体来源于真核宿主吞食的光合细菌,这一过程被称为初级内共生。随后,红藻和绿藻中的叶绿体

Nature解析基因组的水平转移

  在自然界中,两种不同的植物偶尔会发生杂交。这可能会引发一些问题,因为父本和母本的遗传信息并不相配。不过这个问题很容易解决。 只要亲本植物将完整的遗传信息传递给下一代(而不是一半),这样染色体就能够在减数分裂中正确配对,减数分裂是生殖细胞的形成途径。在这种情况下,杂交形成的植物仍有繁殖能力,并形成

Nature子刊:最大规模的全基因组肺癌易感性研究

  在一项由多国研究人员组成的国际研究组项目中,研究人员利用OncoArray基因分型平台,完成了最大规模的全基因组肺癌易感性研究,从中发现了一些新的癌症易感位点。这一研究成果公布在6月12日的Nature Genetics杂志上。  肺癌是全世界发病率和死亡率最高的癌症之一。每年有超过500万例新

南京师范大学Nature子刊基因组研究新成果

  来自南京师范大学、华大基因研究院等处的研究人员,报告称绘制出了白鱀豚 (baiji)的高质量基因组图谱,由此揭示出了白鱀豚的低遗传变异性,提供了关于水生生活适应的一些新认识。相关成果发表在10月29日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。   南京师范大学

Nature子刊公布癌症基因组研究重要成果:新的遗传突变

  在一项多达10万人(包括17,000名最常见类型的卵巢癌患者)的遗传分析研究中,研究人员确定了12种新的增加卵巢癌患病风险的遗传变异,并找到了它们与以前发表的18种变异之间的关联。  这项研究成果公布在3月27日的Nature Genetics杂志上,由OncoArray Consortium联

两院院士Nature子刊携手发表基因组研究新成果

  来自中国农业科学院棉花研究所、深圳华大基因研究所、北京大学等机构的研究人员,报告称他们成功对栽培陆地棉(TM-1)进行了基因组测序,揭示出了其基因组进化的一些重要见解。研究论文发表在4月20日的《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上。  中国工程院院士、农业科学院棉花

Nature系列10篇,清华、复旦、武大、西南交大等成果速递

  1. Nature Photonics:光学镊子声子激光器  声子激光器是普遍存在的光学激光器的类似物,并且其已经在各种环境中实现。然而,对于介观悬浮光机械系统还没有相关报道,并且这些系统正在成为量子力学和重力的基本测试的重要平台,以及发展为机械运动耦合到电子自旋和电荷的传感模式。受到Arthu

中科院、复旦Nature子刊解析RNA甲基化

  在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以调控基因的表达,并由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现,mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。  N6-methyladenosine(m6A)是真