Nature公布大麦基因组图谱
大麦是世界上最重要的粮食作物之一,17日Nature公布了目前为止最完善的大麦基因组测序图谱。这项由美国农业部主导的大工程,在德国、日本、芬兰、澳大利亚、英国、美国和中国科学家们的共同努力下,历经六年终于取得了重大进展。大麦基因组图谱将成为人们提高大麦产量、增强大麦抗虫抗病能力、增加大麦营养价值的有力工具。美国农业部此前主导的多项测序研究就大大推动了番茄玉米等作物的改良、改善了牛的育种并提高了奶牛产量。 “大麦基因组测序取得的重大成果,在全球食品保障方面应用前景巨大。在遗传学和基因组学的帮助下,我们能够保证农民的利益和食物供给充足。”美国农业部首席科学家Catherine Woteki说。 大麦的基因组几乎是人类或玉米基因组的两倍大,这对于测序来说是个挑战。大麦基因组的复杂性和大量重复区域更增添了基因组有序装配的难度。研究人员开发并应用了一系列创新策略,终于克服了这些困难,利用Illumina和Roche ......阅读全文
美国农业部加入地球生物基因组计划
美国农业部(USDA)近日宣布,将正式加入“地球生物基因组计划”(EBP)的合作研究。USDA认为通过加入这个生物学领域的“登月计划”,必将给未来农业发展带来数百万个强大的、全新的应对挑战解决方案。 EBP是一项国际合作倡议,将在未来10年内对超过150万种物种的DNA进行测序。2018年4月
美国农业部加入地球生物基因组计划
美国农业部(USDA)近日宣布,将正式加入“地球生物基因组计划”(EBP)的合作研究。USDA认为通过加入这个生物学领域的“登月计划”,必将给未来农业发展带来数百万个强大的、全新的应对挑战解决方案。 EBP是一项国际合作倡议,将在未来10年内对超过150万种物种的DNA进行测序。2018年
基因组测序
如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的
美国科学家开发全基因组测序水稻变体
水稻不仅是全球一半人口的主食,也为研究能源作物提供了模型。为优化生物燃料作物,科学家正寻找决定水稻产量、抗病性和灌溉效率等性状的基因。 最近在《植物细胞》杂志刊登的一篇论文中,美国加州大学戴维斯分校的研究团队与来自能源部联合基因组研究所的合作者,宣布开发出粳稻Kitaake的第一个全基因组测
美国成功完成地中海果蝇的全基因组测序
美国农业部农业研究局(ARS)近日宣布,其组织的一个由来自全球25个研究机构的64位科学家组成的研究团队成功完成了地中海果蝇的全基因组测序。地中海果蝇对全球260余种水果、蔬菜和坚果形成危害,每年因其形成的农产品出口制裁、市场准入限制和其它成本增加等因素,对全球农作物造成数十亿美元的直接损失。
美国首次公布全外显子测序参保标准-但对全基因组测序拒保
日前,美国保险公司Cigna公布了一项关于基因测序的新参保政策,该政策强调全外显子测序(WES)和全基因组测序(WGS)的参保条件等问题。该政策由美国保险公司Cigna与InformedDNA公司的遗传学专家共同制定,是美国国家健康体系首次发布全外显子测序的参保标准。 全外显子测序参保标准
美国完成团藻基因组测序-有望破解光合作用玄机
在为交通运输提供碳中性(平衡)燃料这条漫长且艰难的道路上,美国能源部正寻求多种途径力图实现自己的目标。能源部的努力包括探寻自然界中潜在的新型燃料资源,它们包括从陆地上可作为纤维质原料的植物(如快速生长的树木和多年生牧草)到水中及其他生长环境中的产油生物(如海藻和细菌),极具多样性。
解码“基因组学之父”桑格:测序,测序,测序
“桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’,他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础,彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、 有一天,65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验,转身走出实验室,宣布自己正式退休。那一年是1983
美国农业部发现转基因小麦
近日,美国农业部说,华盛顿州一块未耕作农地检出的转基因小麦品种并没有流入市场,不会带来食品安全问题。美国农业部动植物卫生检验局周五(12日)发布公告说,此次发现的小麦都是孟山都公司的抗草甘膦除草剂转基因小麦品种,品种名为MON 71300和MON 71800。 农业部表明,经过一个多月调查,“目
认识泛基因组测序
什么是泛基因组?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念(pangenome,pan源自希腊语‘παν’,全部的意思),泛基因组即某一物种全部基因的总称。2009 年,Li等人首次采用新全基因组组装方法对多个人类个体基因组进行拼接,发现了个体独有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“
基因组测序仪简介
基因组测序仪是一种用于生物学领域的分析仪器,于2012年12月19日启用。 技术指标 个体化基因组测序仪主机/ION TORRENT主机。 主要功能 样品处理、快速的运行时间以分析单个或多个样品 支持多重文库,从而实现最大的效率和经济性 可在必要时禁用个别测序通道,以节约试剂用量。
PNAS:甜瓜基因组测序
甜瓜在世界范围具有很高的经济价值,日前西班牙的九个研究中心通力合作,利用罗氏454平台完成了甜瓜基因组的测序。除了甜瓜的全基因组,科学家还得到了 7个特定甜瓜品种的基因组,文章发表在Proceedings of the National Academy杂志上。 联合国粮农组织2009年
关于全基因组测序的测序指标介绍
一、全基因组测序的测序指标— 深度 测序深度(Sequencing depth)是指测序得到的碱基总量(bp)与基因组大小的比值,它是评价测序量的指标之一。测序深度与基因组覆盖度之间是一个正相关的关系,测序带来的错误率或假阳性结果会随着测序深度的提升而下降。测序的个体,如果采用的是双末端或Ma
-美国农业部修订种植植物进口法规
美国农业部动植物卫生检验局(APHIS)近日发布一份最终通知,向“待有害生物风险分析后批准的植物列表”(NAPPRA)中添加来自所有国家的 31种检疫性有害生物和几乎来自所有国家的107种宿主的13种检疫性害虫。该法规将于2013年5月20日生效。这是APHIS首次向NAPPRA添加新的类别
美国农业部“土地休耕计划”再次扩容
美国农业部部长Tom Vilsack近日宣布将43次“土地休耕计划”(CRP)的常规签约土地再次扩增390万英亩。在四个星期的签约时间内,农业部收到了近4.8万份的申请,共涉及450万英亩的土地。这突显出农业部在美实施自愿保护土地、水、空气和野生生物资源行动中所占据的重要地位。从200
美国农业部修订胴体牛肉分级标准
据美国联邦公报消息,2017年12月6日,美国农业部农产品市场服务局发布通告,修订胴体牛肉分级标准。 按照新修订的标准,美国农业部在进行胴体牛肉官方质量分级时,可采用牛的牙列和年龄资料判断牛肉的成熟度。新规定自2017年12月18日实施。
454测序用于美洲奶牛种牛基因组测序项目
一只名为Pawnee Farm Arlinda Chief的种牛和它的儿子Walkway Chief Mark大约有60000个后代,其后代是牛奶生产的主力。最近一项研究中1,科学家通过454全基因组测序,掌握了他们的基因组中控制重要性状的基因,包括抗病能力、牛奶产量,这些性状已通过北美的当
支持还是反对?美国公司在华开启新生儿全基因组测序!
一家波士顿的DNA测序公司正在为中国新生儿提供全基因组测序,这引发了人们的争议:关于新生儿的遗传信息,父母到底应该了解多少? Veritas Genetics解释说该测试将由医生开处方进行,将对新生儿950种严重幼年或者晚年疾病风险、200个与药物反应相关的基因以及超过100个身体特征的遗传
我国完成小麦A基因组测序
本报讯(记者丁佳)5月10日,《自然》杂志刊发了中国科学院的一项最新成果,该项研究完成了小麦A基因组的测序和染色体精细图谱的绘制。 这项由中科院遗传与发育生物学研究所植物细胞与染色体工程国家重点实验室、中科院种子创新研究院和遗传发育所基因组分析平台等合作完成的研究,全面揭示了小麦A基因组的结构和
基因组测序拯救鸮鹦鹉
为了保护极度濒危的新西兰鸮鹦鹉kakapo,几乎所有剩余个体的基因组都已被测序,这为其保护管理提供了重要信息。 新西兰鸮鹦鹉kakapo(Strigops habroptila)有几个特性。它是世界上最重的鹦鹉,有的雄性甚至超过3公斤,被认为有达90年的最长寿命。它是唯一一种不会飞的鹦鹉,通过
我国完成小麦A基因组测序
5月10日,《自然》杂志刊发了中国科学院的一项最新成果,该项研究完成了小麦A基因组的测序和染色体精细图谱的绘制。这项由中科院遗传与发育生物学研究所植物细胞与染色体工程国家重点实验室、中科院种子创新研究院和遗传发育所基因组分析平台等合作完成的研究,全面揭示了小麦A基因组的结构和表达特征,对深入和
什么是基因组测序技术
自1998年美国塞莱拉遗传公司组建以来,人类基因组研究开始由两部分科学家同时展开,分别是由公共经费支持的人类基因组工程和美国塞莱拉遗传公司。在研究过程中,他们也分别采用了两种不同的测序和分析的方法。塞莱拉公司的核心分析方法被称为"霰弹法",人类基因组工程则采用了"克隆法"。所谓"霰弹法",其实是一种
盘点最新基因组测序成果
the scientist杂志发表文章盘点了几项最新的基因组测序成果以飨读者: 种属:非洲腔棘鱼(Latimeria chalumnae) 基因组:~2.86 billion bp 人们曾经认为腔棘鱼早在七千万年前就已灭绝,直到1938年一只腔棘鱼在南非海岸被渔民捕获。这种鱼看上去跟三亿年
基因组测序的具体过程
讲起来很复杂哈,简单来说,就是边合成边测序,把所要测序的序列通过各种手段来建库,然后加上5‘和3’都加上接头,放在一个小玻璃片一样的芯片上,上面一般是8个lane,把样品加入到lane上之后和上面长好的接头序列相结合(之前的建库时加的接头与之反向互补),然后再经过PCR扩增的过程形成一个DNA簇,然
简化基因组测序好做吗
简化基因组方法是一种利用酶切技术、序列捕获芯片技术或其他实验手段降低物种基因组复杂程度,进而研究基因组各类遗传结构性变异的技术手段。目前常见的简化基因组技术包括RAD(Restriction site Associated DNA)和GBS(Genotyping By Sequencing)。这些技
白肉灵芝完成基因组测序
在韶关产业园种植的白肉灵芝。吴清平团队 供图 近日,中国工程院院士、广东省科学院微生物研究所名誉所长吴清平团队完成了第一个白肉灵芝全基因组测序。据悉,这是世界上首次对白肉灵芝的基因组进行组装和注释。相关研究发表于《G3:基因,基因组,遗传学》(G3-Genes Genomes Genet
Nature突破:香蕉基因组测序
由法国的研究人员领导的一个国际小组近日完成了对香蕉品种小果野蕉(Musa acuminata)的基因组测序,并开始分析这一基因组草图。相关研究成果发布在了7月11日的《自然》(Nature)杂志上。 研究人员采用Roche 454、Sanger和Illumina的测序方法绘制出了双单倍
人类全基因组测序计划
全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。 1986年, Renato Dulbecco是Z早提出人类基因组测序的科学家之一。他认为如果能够知道所有人类基因的序列,对癌症的研究将会很有帮助。美国能源部(DOE)与美国国家卫生研究院(NIH),分别在1986年与1987年加入人类基
中国莲基因组测序完成
继中国科学家成功完成水稻、玉米基因组测序工作后,近日,中国科学院武汉植物园研究人员与国外多家科研机构合作,顺利完成中国莲的基因组测序,构建了首张中国莲全基因组图谱,相关论文在线发表于《基因组生物学》杂志。 “该项目为将来的莲分子育种提供了坚实的基础,也标志着我国相关研究将对生物进
让基因组测序绕过PCR
在基因组测序中,PCR扩增似乎是绕不过去的一步。然而,PCR也带来一些问题,包括不均匀扩增,导致某些序列的比例过高。对目前的新一代测序(NGS)平台而言,测序某些碱基组成上存在严重偏向的基因组区域仍是一大挑战。在GEN杂志上,Patricia Fitzpatrick Dimond博士介绍了PCR-