上海药物所发展出基于知识图谱的计算模型

9月19日,中国科学院上海药物研究所郑明月课题组在《细胞-基因组学》(Cell Genomics)上,发表了题为Identifying compound-protein interactions with knowledge graph embedding of perturbation transcriptomics的研究论文。该研究提出了基于知识图谱的计算模型PertKGE。这一模型以数据驱动的形式在微扰转录组数据中解耦出化合物-蛋白质相互作用。化合物和蛋白质是药物发现中两个基本实体,而关于二者相互作用的建模是药物发现的基础。目前,尚无通用的计算方法来预测和解释所有的化合物-蛋白质相互作用,但科研人员可以利用不同的生物数据并从多种研究视角构建化合物-蛋白质相互作图谱。在药物发现领域,微扰转录组学连接了药物发现中最重要的实体(化合物)和组学数据,提供了化合物微扰受试体后产生的直观微扰结果,为解耦化合物-蛋白质相互作用(CPI)......阅读全文

上海药物所发展出基于知识图谱的计算模型

9月19日,中国科学院上海药物研究所郑明月课题组在《细胞-基因组学》(Cell Genomics)上,发表了题为Identifying compound-protein interactions with knowledge graph embedding of perturbation trans

上海药物所发展出基于知识图谱的计算模型

9月19日,中国科学院上海药物研究所郑明月课题组在《细胞-基因组学》(Cell Genomics)上,发表了题为Identifying compound-protein interactions with knowledge graph embedding of perturbation trans

错流超滤的计算模型

错流超滤的计算模型错流超滤的自由空间内流体对膜表面有剪切力的作用,其渗透率在管道长度方向是变化的。针对错流超滤的特点,在膜的上层部分引入了流体自由流动空间,用方程来描述。在自由空间和膜的界面处,用流体的连续性将自由空间和膜介质的流场进行了耦合。膜的污染描述,基于死端超滤建立起来的污染模型。在错流超滤

红外图谱的峰面积怎么计算

现在基本上都是计算机工作站自动计算了,起码也得用积算仪吧,手工计算的年代不再了。

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全球首个知识增强千亿大模型亮相

  12月8日,鹏城实验室与百度联合发布全球首个知识增强千亿大模型——鹏城—百度·文心。  为什么大模型在产学界持续走热,越来越多的技术公司入场?  如中国工程院院士、鹏城实验室主任高文所言,预训练模型赋能人工智能衍生更多的应用,而不局限于某个领域,是人工智能自身发展并作用于社会及科学创新的重要工具

液相色谱系统图谱相关知识问答

  液相色谱系统的许多问题都能在谱图上反映出来。其中有一些问题可以通过改变设备参数得到解决;而其他的问题必须通过修改操作程序来解决。对于色谱柱和流动相的正确选择是得到好的色谱图的关键。   1峰拖尾   原因和解决方法   1、筛板阻塞   a、反冲色谱柱   b、更换进口筛板

大模型加速改变云计算行业规则

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498365.shtm

静态摩擦性能计算模型领域取得突破

  近日,中国科学院兰州化学物理研究所润滑材料全国重点实验室的计算摩擦学课题组在静态摩擦性能计算模型方面取得了重要进展。这项研究不仅加深了我们对摩擦现象的理解,还为未来摩擦学的发展奠定了坚实的基础。相关论文发表于Physical Review B。  摩擦,这个在我们日常生活中无处不在的现象,其实蕴

颜色基础知识——白度值计算

白度是颜色具有的高反射率和低饱和度(纯度)的属性。白色是一个颜色群体,处于主波长大约在470~570nm的狭长范围内,一般情况下其亮度y>70,兴奋纯度Pe0,表示样品带绿,而且值越大,表示越偏绿色;Tw

计算机模型解开塑料的“基因密码”

  人们的生活离不开塑料。但迄今为止,工业上还是先开发出一种塑料,然后才去发现它的用途,或试验几百种不同的“配置”看看哪种管用,既费时又费钱。据美国物理学家组织网9月30日(北京时间)报道,最近,英国利兹大学和杜伦大学解决了这一难题,他们开发出一种计算机模型,能在化学水平预测各种高分子成型时的形状,

计算机模型高估全球安全捕鱼量

近些年来,针对过度捕捞问题,科学家和资源管理者绞尽了脑汁,通过估算鱼类种群数量,制定各种政策措施,以在商业利益与生态健康和可持续性之间取得平衡。近日,一项发表于《科学》的研究对全球230个海洋渔场1980年至2018年的实际捕鱼数据及计算机模型预测值进行分析后发现,计算机模型往往高估了鱼类种群规模,

DNA计算机模型检测神秘面纱揭开

   DNA计算机的研制是各国竞争的一个科技制高点。17日,记者从郑州大学信息工程学院获悉,该校朱维军副教授、周清雷教授开发出一系列算法,初步解决“DNA模型检测”这一困扰国际DNA计算机学界多年的核心技术难题。 与其他计算工具相比,计算机的本质优点在于通用性,而通用性归根结底在于千变万化的具体

玻璃固化配方设计及性能计算模型初步建成

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495080.shtm 滚烫的玻璃熔融体从熔炉中缓缓浇注进容器 冷却凝固后的玻璃体整齐地放入库房…… 莫非我们正身处某个玻璃生产厂之中吗? 这些玻璃怎么不像平时见到的那样晶莹透亮呢?

国家超级计算天津中心发布“天河天元”大模型

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/501029.shtm5月20日,在第七届世界智能大会上,国家超级计算天津中心正式发布“天河E级智能计算开放创新平台”和“天河天元大模型”。近期,ChatGPT的爆火引发了信息技术领域的“大模型热”,国内多

Nature:计算机模型预测学术成功

电脑模型预测论文数量、任职机构及性别关乎学术成就  在发表同等数量文章的情况下,和男性生物学家相比,女性生物学家成为学术带头人的可能性更低。  最近,研究者用电脑模型证明:对事业起步期的科学家来说,“不发表就发臭”是一条黄金准则。根据计算公式,对于年轻科学家来说,以第一作者身份在知名期刊上发表的论文

国家林草局:林草领域知识图谱应用系统正式运行

  国家林草局今天发布,日前,由中国林科院科信所林草大数据与知识服务团队研发的“林草领域知识图谱应用系统”正式运行。  该系统历经3年多研发,覆盖了从数据采集、图谱自动构建及动态更新、可视化关联分析、智能问答、语义检索等知识图谱技术链。开展了林草专家、机构、造林树种、国家林木良种名录、授权植物新品种

神经元新计算模型或产生更强大AI

模型或产生更强大AI 数字手与人手相互绘制图画(艺术图)。图片来源:西蒙斯基金会科技日报北京6月30日电 (记者张梦然)几乎所有支持现代人工智能(AI)工具的神经网络都是基于20世纪60年代的活体神经元计算模型。但美国西蒙斯基金会熨斗研究所计算神经科学中心(CCN)开发的新模型表明,这种已有数十年历

港中大研发精准计算模型预测病毒基因演变

香港中文大学(港中大)2日公布,港中大医学院研究团队建立了一套精准计算模型“beth-1”,能准确预测病毒基因演变,有助在设计流感疫苗时选择最具代表性的病毒株。港中大医学院表示,流感病毒会持续出现基因进化演变,导致免疫逃脱,令已经感染过病毒或打过疫苗的人可能再次感染突变后的病毒,造成新的季节性流感高

详解可信计算、OS和RAID卡知识(二)

第2章、服务器操作系统基础知识

详解可信计算、OS和RAID卡知识(一)

本文主要介绍可信计算(TPM、TCM)知识和工作原理、常见的操作系统、RAID卡、RAID的Cache保护、RAID卡连接磁盘等原理相关知识。第1章、可信计算和TPM基础知识说到可信计算,就不能不提TPM安全芯片。所谓TPM安全芯片,是指符合TPM标准的安全芯片,它能有效地保护PC,防止非法用户访问

3D计算机模型揭开舌头的奥秘

新3D模型展示出舌头上复杂交织的肌肉。   无论何时说话或者吞咽,我们都会用到舌头。然而,关于舌头如何活动的很多问题仍然是个谜。现在,研究人员创造了一个人类舌头的3D计算机模型,并可以通过它来揭开舌头的秘密。   这个模型的创建是基于“人体可视化计划”的数据,该计划于20世纪90年代用大块明胶对

科学家建立中国人群“免疫年龄”计算模型

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/504754.shtm

美国新计算模型可捕捉化学反应过渡态

  美国麻省理工学院科研团队开发出一种基于机器学习的方法,可以更快的计算化学反应过程中的过渡态,帮助化学家设计新的化学反应和催化剂。  新计算方法使用“扩散模型”来表示两种相对于彼此任意方向的反应物,该模型可以了解哪种类型的过程最有可能产生特定的结果。科研人员在大约1,000个以前从未见过的反应上测

计算电磁学基础知识及数值方法汇总

一. 计算电磁学的重要性在现代科学研究中,“科学试验,理论分析,高性能计算”已经成为三种重要的研究手段。在电磁学领域中,经典电磁理论只能在11 种可分离变量坐标系中求解麦克斯韦方程组或者其退化形式,最后得到解析解。解析解的优点在于:①可将解答表示为己知函数的显式,从而可计算出精确的数值结果;②可以作

泥沙龙笔记:知识图谱是烧钱但靠谱的战略项目

  在隔壁侃了一通人人平等和社会主义的理念,接着谈大数据。  最近遇到几个有来头的企业,中国的美国的都有,谈到大数据的话题。说如果往后看五年到十年,什么项目值得去做。  我说,如果有胆识有资源有平台,与其花那么多钱东一榔头西一棒头的遍地开花,上那么多项目,摸石头过河,把个大企业个个都整得像风投和暴发

科学家正构建堪称AI“巴别塔”的知识图谱

   如果说波士顿动力的翻跟头是在帮机器人锻炼筋骨,那么知识图谱的“绘制”则是在试图“创造”一个能运转的机器人大脑。  “目前,还不能做到让机器理解人的语言。”中国科学院软件所研究员、中国中文信息学会副理事长孙乐说。无论是能逗你一乐的Siri,还是会做诗的小冰,亦或是会“悬丝诊脉”的沃森,它们并不真

新AI模型可大幅提高化合物蛋白质相互作用预测可靠性

中国科学院上海药物研究所研究员郑明月,副研究员张素林、李叙潼,提出了基于知识图谱的人工智能计算模型PertKGE,并以数据驱动的形式从微扰转录组数据中解耦出化合物-蛋白质相互作用(CPI)。9月19日,相关研究发表于《细胞基因组学》。对化合物和蛋白质之间的相互作用进行建模,是药物发现的基础。目前,研

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