上海药物所发展出基于知识图谱的计算模型
9月19日，中国科学院上海药物研究所郑明月课题组在《细胞-基因组学》（Cell Genomics）上，发表了题为Identifying compound-protein interactions with knowledge graph embedding of perturbation transcriptomics的研究论文。该研究提出了基于知识图谱的计算模型PertKGE。这一模型以数据驱动的形式在微扰转录组数据中解耦出化合物-蛋白质相互作用。化合物和蛋白质是药物发现中两个基本实体，而关于二者相互作用的建模是药物发现的基础。目前，尚无通用的计算方法来预测和解释所有的化合物-蛋白质相互作用，但科研人员可以利用不同的生物数据并从多种研究视角构建化合物-蛋白质相互作图谱。在药物发现领域，微扰转录组学连接了药物发现中最重要的实体（化合物）和组学数据，提供了化合物微扰受试体后产生的直观微扰结果，为解耦化合物-蛋白质相互作用（CPI）......阅读全文
液相色谱系统图谱相关知识问答
液相色谱系统的许多问题都能在谱图上反映出来。其中有一些问题可以通过改变设备参数得到解决;而其他的问题必须通过修改操作程序来解决。对于色谱柱和流动相的正确选择是得到好的色谱图的关键。 1峰拖尾 原因和解决方法 1、筛板阻塞 a、反冲色谱柱 b、更换进口筛板
国家林草局：林草领域知识图谱应用系统正式运行
国家林草局今天发布，日前，由中国林科院科信所林草大数据与知识服务团队研发的“林草领域知识图谱应用系统”正式运行。 该系统历经3年多研发，覆盖了从数据采集、图谱自动构建及动态更新、可视化关联分析、智能问答、语义检索等知识图谱技术链。开展了林草专家、机构、造林树种、国家林木良种名录、授权植物新品种
科学家正构建堪称AI“巴别塔”的知识图谱
如果说波士顿动力的翻跟头是在帮机器人锻炼筋骨，那么知识图谱的“绘制”则是在试图“创造”一个能运转的机器人大脑。 “目前，还不能做到让机器理解人的语言。”中国科学院软件所研究员、中国中文信息学会副理事长孙乐说。无论是能逗你一乐的Siri，还是会做诗的小冰，亦或是会“悬丝诊脉”的沃森，它们并不真
泥沙龙笔记：知识图谱是烧钱但靠谱的战略项目
在隔壁侃了一通人人平等和社会主义的理念，接着谈大数据。 最近遇到几个有来头的企业，中国的美国的都有，谈到大数据的话题。说如果往后看五年到十年，什么项目值得去做。 我说，如果有胆识有资源有平台，与其花那么多钱东一榔头西一棒头的遍地开花，上那么多项目，摸石头过河，把个大企业个个都整得像风投和暴发
转录图谱的转录图谱的意义
在于它能有效地反应在正常或受控条件中表达的全基因的时空图。通过这张图可以了解某一基因在不同时间不同组织、不同水平的表达；也可以了解一种组织中不同时间、不同基因中不同水平的表达，还可以了解某一特定时间、不同组织中的不同基因不同水平的表达。人类基因组是一个国际合作项目：表征人类基因组，选择的模式生物的D
3篇论文被国际会议收录－—腾讯医疗知识图谱研究近况分享
近日，腾讯在医疗AI领域的学术研究获得实质性进展，旗下医疗AI实验室共有3篇论文分别被KDD 2018、SIGIR 2018 、COLING 2018三个国际顶尖学术会议收录，论文的主要研究方向为医疗知识图谱中实体关系的发现和应用。在医疗领域，专业知识和病人信息均存储在复杂多样的文本中，如医疗文献、
XPS图谱解释
（1）谱线识别X射线入射在样品上，样品原子中各轨道电子被激发出来成为光电子。光电子的能量统计分布（X射线光电子能谱）代表了原子的能级分布情况。不同元素原子的能级分布不同，X射线光电子能谱就不同，能谱的特征峰不同，从而可以鉴别不同的元素。电子能量用E = Enlj 表示。光电子则用被激发前原来所处的能
阅读质粒图谱
载体主要有病毒和非病毒两大类,其中质粒DNA是一种新的非病毒转基因载体。一、一个合格质粒的组成要素 复制起始位点Ori 即控制复制起始的位点。原核生物DNA分子中只有一个复制起始点。而真核生物DNA分子有多个复制起始位点。 抗生素抗性基因 可以便于加以检测，如Amp+ ,Kan+ 多克隆
红外图谱口诀
红外识谱图看似复杂，其实也有规律可循，试试这个口诀，说不定 也是一种方法。 红外可分远中近，中红特征指纹区， 1300来分界，注意横轴划分异。 看图要知红外仪，弄清物态液固气。 样品来源制样法，物化性能多联系。 识图先学饱和烃，三千以下看峰形。 2960、2870是甲基
将领域知识引入神经网络，MIT团队用光谱Transformer研究非靶向代谢组学图谱
代谢组学研究已经确定了介导细胞信号传导、竞争和疾病病理学的小分子，部分原因是大规模社区努力测量数千种代谢物标准品的串联质谱。然而，在临床样品中观察到的大多数光谱不能与已知结构明确匹配。令人惊讶的是，用于阐明小分子结构的深度学习方法无法与经典统计方法相媲美，科学家认为这可能是由于缺乏纳入当前神经网络架
如何查找质粒图谱
方法一：使用Vector NT 软件 做分子实验，经常和不同的质粒打交道，了解各种质粒的图谱信息是必需的，invitrogen公司的这款软件绝对是分子生物学虫子们的福音，要想对质粒图谱了解更直观，安装这款软件是非常必要的。这款软件的软件包里面会包括invitrogen公司的所有质粒图谱信息和
质粒图谱的阅读
载体主要有病毒和非病毒两大类,其中质粒DNA是一种新的非病毒转基因载体。一、一个合格质粒的组成要素 复制起始位点Ori 即控制复制起始的位点。原核生物DNA分子中只有一个复制起始点。而真核生物DNA分子有多个复制起始位点。 抗生素抗性基因 可以便于加以检测，如Amp+ ,Kan+ 多克隆
怎么分析XRD图谱
1、XRD图中有很多信息，如组成（物相）和结构、粒度、应力、结晶度等，其分析方法各不相同。2、比如，若是做物相分析，样品是已知物质的，你只要将XRD图谱与标准图进行比对就可以大致判断，一般设备中都会提供已知物数据库，供调用比对。3、当然杂相分析就需要一定的经验了，不是一两句话就能说清楚的。4、若是做
新灵长类大脑图谱
长期以来，科学家们一直难以找到全面绘制灵长类大脑神经元之间连接结构的工具。来自冷泉港实验室的神经科学家在日本进行的新研究重建了狨猴大脑三维立体图像，以及整个大脑的神经连接，这是迄今为止最详细的灵长类大脑图谱，文章发表在《eLife》杂志。 该研究引入了结合实验和计算的新方法，有助于解释个体大脑
怎么分析XRD图谱
1、XRD图中有很多信息，如组成（物相）和结构、粒度、应力、结晶度等，其分析方法各不相同。2、比如，若是做物相分析，样品是已知物质的，你只要将XRD图谱与标准图进行比对就可以大致判断，一般设备中都会提供已知物数据库，供调用比对。3、当然杂相分析就需要一定的经验了，不是一两句话就能说清楚的。4、若是做
怎么分析XRD图谱
1、XRD图中有很多信息，如组成（物相）和结构、粒度、应力、结晶度等，其分析方法各不相同。2、比如，若是做物相分析，样品是已知物质的，你只要将XRD图谱与标准图进行比对就可以大致判断，一般设备中都会提供已知物数据库，供调用比对。3、当然杂相分析就需要一定的经验了，不是一两句话就能说清楚的。4、若是做
怎么分析XRD图谱
1、XRD图中有很多信息，如组成（物相）和结构、粒度、应力、结晶度等，其分析方法各不相同。2、比如，若是做物相分析，样品是已知物质的，你只要将XRD图谱与标准图进行比对就可以大致判断，一般设备中都会提供已知物数据库，供调用比对。3、当然杂相分析就需要一定的经验了，不是一两句话就能说清楚的。4、若是做
怎么分析XRD图谱
1、XRD图中有很多信息，如组成（物相）和结构、粒度、应力、结晶度等，其分析方法各不相同。2、比如，若是做物相分析，样品是已知物质的，你只要将XRD图谱与标准图进行比对就可以大致判断，一般设备中都会提供已知物数据库，供调用比对。3、当然杂相分析就需要一定的经验了，不是一两句话就能说清楚的。4、若是做
EDS图谱是什么
色散谱英文全称:Energy Dispersive Spectroscopy原理:利用不同元素的X射线光子特征能量不同进行成分分析。
连锁图谱的定义
又称连锁图谱（linkage map），它是以具有遗传多态性（在一个遗传位点上具有一个以上的等位基因，在群体中的出现频率皆高于1%）的遗传标记为“路标”，以遗传学距离（在减数分裂事件中两个位点之间进行交换、重组的百分率，1%的重组率称为1cM）为图距的基因组图。遗传图谱的建立为基因识别和完成基因定位
物理图谱的定义
物理图谱是指有关构成基因组的全部基因的排列和间距的信息，它是通过对构成基因组的DNA分子进行测定而绘制的。绘制物理图谱的目的是把有关基因的遗传信息及其在每条染色体上的相对位置线性而系统地排列出来。DNA物理图谱是指DNA链的限制性酶切片段的排列顺序，即酶切片段在DNA链上的定位。因限制性内切酶在DN
转录图谱的原理
所有生物性状和疾病都是由结构或功能蛋白质决定的，而已知的所有蛋白质都是由mRNA编码的，这样可以把mRNA通过反转录酶合成cDNA或称作EST的部分的cDNA片段，也可根据mRNA的信息人工合成cDNA或cDNA片段，然后，再用这种稳定的cDNA或EST作为“探针”进行分子杂交，鉴别出与转录有关的基
怎么分析XRD图谱
1、XRD图中有很多信息，如组成（物相）和结构、粒度、应力、结晶度等，其分析方法各不相同。2、比如，若是做物相分析，样品是已知物质的，你只要将XRD图谱与标准图进行比对就可以大致判断，一般设备中都会提供已知物数据库，供调用比对。3、当然杂相分析就需要一定的经验了，不是一两句话就能说清楚的。4、若是做
如何看懂XRD图谱
XRD图谱峰的面积表示晶体含量，面积越大，晶相含量越高。峰窄说明晶粒大，可以用谢乐公式算晶粒尺寸。XRD图谱峰高如果是相对背地强度高，表示晶相含量高，跟面积表示晶相含量一致。XRD图谱峰高如果是A峰相对B峰高很多，两峰的高度比“A/C”相对标准粉末衍射图对应峰的高度比要大很多，那么这个材料是A方向择
转录图谱的定义
转录图谱是在识别基因组所包含的蛋白质编码序列的基础上绘制的结合有关基因序列、位置及表达模式等信息的图谱。在人类基因组中鉴别出占具2%~5%长度的全部基因的位置、结构与功能，最主要的方法是通过基因的表达产物mRNA反追到染色体的位置。
如何看懂XRD图谱
XRD图谱峰的面积表示晶体含量，面积越大，晶相含量越高。峰窄说明晶粒大，可以用谢乐公式算晶粒尺寸。XRD图谱峰高如果是相对背地强度高，表示晶相含量高，跟面积表示晶相含量一致。XRD图谱峰高如果是A峰相对B峰高很多，两峰的高度比“A/C”相对标准粉末衍射图对应峰的高度比要大很多，那么这个材料是A方向择
如何看懂XRD图谱
XRD图谱峰的面积表示晶体含量，面积越大，晶相含量越高。峰窄说明晶粒大，可以用谢乐公式算晶粒尺寸。XRD图谱峰高如果是相对背地强度高，表示晶相含量高，跟面积表示晶相含量一致。XRD图谱峰高如果是A峰相对B峰高很多，两峰的高度比“A/C”相对标准粉末衍射图对应峰的高度比要大很多，那么这个材料是A方向择
EBSD－样品制备知识小知识
EBSD，即电子背散射衍射（Electron Backscattered Diffraction ）。EBSD的主要特点是在保留扫描电子显微镜的常规特点的同时进行空间分辨率亚微米级的衍射。目前EBSD技术的应用领域集中于多种多晶体材料，例如金属、合金、陶瓷、半导体、超导体、矿石，用以研究各种现象
知识讲堂COD（化学需氧量）知识
（1）COD超标，城市污水、各种各样化工废水、水里石灰质等是水里耗氧的来源于。 身心健康威协：这种有机化合物中，非常部分是自然环境工资基数，别称内分泌失调干挠物。自然环境生长激素会令人免疫能力减少、危害人的精子质量、造成癌证、对中枢神经系统造成干挠。消化系统疾病等与耗氧呈明显的有关。
《自然》发布重要单细胞RNA图谱：首张小肠细胞图谱
我们肠道上皮是人体内多样性最高，最具活力的组织之一, 作为机体与外界的主要界面之一，组成了一个细胞的生态系统。为了更好地理解这些复杂的组织及其功能，还有影响它的疾病，麻省理工学院、哈佛大学和麻省总医院研究人员领导的一个研究团队通过分析从小鼠肠道或肠道类器官中取样的5.3万多个单独的细胞，完成了一