我国学者与海外合作者在利用人工智能识别潜在RNA病毒研究方面取得进展
图 使用人工智能对全球病毒圈的深度挖掘 在国家自然科学基金项目（批准号：82341118、32270160）等资助下，中山大学医学院施莽教授团队、阿里云李兆融团队，联合悉尼大学Edward Holmes教授团队，在人工智能（artificial intelligence，AI）算法识别潜在的RNA病毒种（species）及RNA病毒超群（supergroups）研究方面取得进展。相关成果以“利用人工智能揭示隐藏的RNA病毒圈（Using Artificial Intelligence to Document the Hidden RNA Virosphere）”为题，于2024年10月9日在《细胞》（Cell）杂志在线发表。论文链接：https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(24)01085-7。 病毒是地球生态系统的重要组成部分，与人类健康关系密切。目前人类对病毒多样性的认......阅读全文
卫星RNA的加工
在具侵染性小分子RNAs的复制机制中，RNA的加工最令学者们兴趣，即是在多聚体形式与相关的线状和环状单体之间的切割与连接过程。1986年有学者发现烟草环斑病毒ToRSV与卫星RNA 正链二聚体在接点处自我切割，产生具有感染性的线状单休。随后，又发现包含有ASBV的正链与负链的二聚体的体外转录休能够在
RNA解旋酶的概念
RNA解旋酶（RNA helicases）是一个包含了与RNA代谢（从翻译起始、核糖体形成、前mRNA拼接和mRNA降解）的许多方面有关的蛋白质家族。
微RNA的作用
人类基因组计划结束后，人们发现编码蛋白质的基因只占总基因组的约2%。而占人类基因组95%的非编码序列竟是产生大量非编码RNA的源泉，这些非编码RNA主要充当调控者的角色，在细胞分化凋亡、生物发育、疾病发生等方面均起重要作用。其实，RNA比DNA更为古老，它组成了地球上最早的生命。生命起源初期，没有由
反义RNA技术要素
[1]长的反义RNA并不一定比短的反义RNA更为有效；[2]在原核生物中针对SD序列及其附近区域的反义RNA可能更有效；[3]在真核生物中，对应于5'端非编码区的反义RNA可能比针对编码区的反义RNA更有效；[4]尽量避免在反义RNA分子中出现自我互补的二级结构；[5]设计的反义RNA分子中
RNA定位的功能
中文名称RNA定位英文名称RNA localization定 义RNA特异定位在细胞不同区域的过程。尤其是信使核糖核酸(mRNA)的定位对生长和发育是重要的。细胞质中RNA定位起始于细胞核，在核中被特异RNA结合蛋白识别，生成核糖核蛋白复合体，然后输出到细胞质。应用学科生物化学与分子生物学（一级学
RNA探针的简介
许多载体如pBluescript, pGEM等均带有来自噬菌体SP6或E.coli噬菌体T7或T3的启动子,它们能特异性地被各自噬菌体编码的依赖于DNA的RNA聚合酶所识别,合成特异性的RNA。在反应体系中若加入经标记的NTP,则可合成RNA探针。RNA探针一般都是单链,它具有单链DNA探针的优
总RNA提取实验
实验方法原理 GTC和N-十二烷基肌氨酸钠的联合使用，将促使核蛋白复合体的解离，使RNA 与蛋白质分离，并将RNA 释放到溶液中。而进一步从复合体中纯化RNA ，则根据Chomc zynski和Sacchi的一步快速抽提法进行，采用酸性酚-氯仿混合液抽提。低pH值的酚将使RNA 进入水相
ISOLATION－OF－RNA－FROM－BACTEROIDS
3 g nodules (fresh or frozen in liquid N2) were ground to a powder in mortar and pestle with liquid N2. To the powder was added ice cold 0.5 M mannito
RNA转运的概念
中文名称RNA转运英文名称RNA transport定 义RNA分子从一个细胞区室或区域移动到另一个细胞区室或区域的过程。各类不同RNA(如信使RNA、核小RNA、核糖体RNA和转移RNA)的转运遵循不同的机制。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
RNA干扰制备方法
化学合成许多国外公司都可以根据用户要求提供高质量的化学合成siRNA。主要的缺点包括价格高，定制周期长，特别是有特殊需求的。由于价格比其他方法高，为一个基因合成3—4对siRNAs 的成本就更高了，比较常见的做法是用其他方法筛选出最有效的序列再进行化学合成。最适用于：已经找到最有效的siRNA的情况
RNA干扰实验技术
实验概要本文介绍了RNA干扰的原理及基本实验方法，包括了siRNA的设计、siRNA的制备和siRNA的转染等方法，及RNA干扰实验中的注意事项。实验原理近年来的研究表明，将与mRNA对应的正义RNA和反义RNA组成的双链RNA(dsRNA)导入细胞，可以使mRNA发生特异性的降解，导致其相应的基因
真菌RNA提取实验
真菌RNA的提取可以：（1）用于真菌RNA干扰机制研究；（2）用于cDNA文库构建等研究；（3）用于真菌分子生物学相应研究。实验方法原理液氮研磨可裂解细胞，促使核蛋白体的解离，使RNA与蛋白质分离，并将RNA释放到溶液中。当加入氯仿时，它可抽提酸性的苯酚，而酸性苯酚可促使RNA进入水相，离心后可形成
细菌RNA制备实验
实验材料 RNA试剂、试剂盒 STET氯仿乙酸钠氯化铯无水乙醇EDTA仪器、耗材 离心机分光光度计摇床实验步骤 1. 培养100 ml 大肠杆菌或500 ml 蓝细菌至对数生长期，加入1/20体积终止缓冲液，置于冰上。2. 于4℃用JA-10转子17 700 g 离心5 min 收集细胞。3.
分离纯化总RNA
1） 用酸性酚-硫氰酸胍-氯仿提取纯化组织和细胞中的RNA1. 选取从组织细胞或细胞中提取RNA的适宜方法组织a. 分离组织并立即置于液氮中。b. 将约100 mg冰冻组织含液氮的研钵中，用研棒研磨。研磨过程中可加入液氮使组织保持冰冻状态。c.
RNA干扰的特点
1.高效性：Elbashir等在研究中发现分别为25 nmol/L与100 nmol/L的起始双链RNA产生的结果是一样的，只是高浓度起始的更有效些。将双链RNA浓度降低到1.5 nmol/L时产生的基因沉默效果变化不大，只有当浓度降低到0.05 nmol/L时，沉默的效果才消失。Holen等也证实
全血RNA提取
摘要： RNA提取应该说已经成为了一种常见的分子生物学操作步骤了，但是不少科研人员仍然烦恼着如何寻找一种最好的方法，或者找到一种适合于特殊用途方法。比如说传统的血液标本表达谱芯片实验需要先把有核细胞从全血中分离出来，加白细胞分离液、离心等步骤，比较繁琐，如果能进行全血的提取，那就再好不过。RNA提取
RNA提取技术概述
RT-PCR是将RNA的反转录（Reverse Transcription，RT）和cDNA的聚合酶链式扩增（PCR）相结合的技术，近年来得到快速发展和广泛应用。首先，经反转录酶的作用，以RNA为模板，合成互补的DNA链（cDNA），再以cDNA为模板，通过PCR扩增合成目的片段。RT-PC
RNA实验方法
Solublization of RNA in Formamidecontributed by James McCaughern-Carucci, Yale UniversityResuspending RNA in Formamide (as reported by Chomczynski et
反义RNA技术改良
用反义RNA分子来调节基因表达时，经常会遇到的困难是反应模板的稳定性差。因此，人们正在探索如何改进反义基因的新方法，目前主要有：（1）优化反义RNA的结合。反义RNA链的长度对抑制基因的效果是重要的。双螺旋形成过程中将释放能量，RNA链越长，释放的自由能越多。从这一意义来讲，可以说长RNA作为反义R
细胞RNA含量检测
细胞RNA含量检测 实验步骤
提取悬浮细胞RNA
提取RNA器械：离心管2支，吸管4个，酒精灯，打火机，记号笔，200ul,1000UL枪，DEPC泡过的枪头EP管，紫外照过的手套。滤纸，DEPC纯水（750ml无水乙醇＋150mlDEPC水,剧烈振荡，使劲的摇晃，直至混匀），氯仿，75％酒精，异丙醇，Trizol，预冷的离心机（两种），EP管架（
常见RNA碱基介绍
四个常见RNA碱基---腺嘌呤，尿嘧啶，鸟嘌呤和胞嘧啶显然不能提供足够的空间以形成一个坚固的结构，因为这些碱基大部分被修饰过以延长它们的结构。有两个奇特的例子，看37号反密码子相邻的碱基，位于甲硫氨酸tRNA（1yfg）或苯丙氨酸tRNA(4tna和6tna)的起始部位。
TRIzol－RNA提取方法
研究基因的表达和调控时常常要从组织和细胞中分离和纯化RNA。TRIzol RNA提取方法：（1）操作简单的，提取方便，回收率高； （2）提取的RNA的质量高，对cDNA库，RT-PCR和Northern Blot等分子生物学实验起着很重要的影响。实验方法原理Trizol是一种新型总RNA抽提试剂，采
总RNA提取实验
实验方法原理 一些公司推出的总RNA 提取试剂盒，可以用来制备高质量的可用于建库的RNA 。该总RNA 纯化系统采用两种著名的RNA 酶抑制剂，异硫氰酸弧(GTC)和β-巯基乙醇，加上整个操作都在冰浴下进行，这样就能显著降低RNA 的
RNA干扰回复实验
RNA干扰回复实验，主要是为了说明Off-target效应。Off-target效应Off-target effects（脱靶效应）最早由Dharmacon科学家Jackson和他的同事们提出（Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can Induce
RNA探针的概念
RNA探针是一类很有前途的核酸探针，由于RNA是单链分子，所以它与靶序列的杂交反应效率极高。早期采用的RNA探针是细胞mRNA探针和病毒RNA探针，这些RNA是在细胞基因转录或病毒复制过程中得到标记的，标记效率往往不高，且受到多种因素的制约。
RNA干扰回复实验
RNA干扰回复实验，主要是为了说明Off-target效应。Off-target效应Off-target effects（脱靶效应）最早由Dharmacon科学家Jackson和他的同事们提出（Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can Induce
RNA探针技术简介
许多载体如pBluescript, pGEM等均带有来自噬菌体SP6或E.coli噬菌体T7或T3的启动子,它们能特异性地被各自噬菌体编码的依赖于DNA的RNA聚合酶所识别,合成特异性的RNA。在反应体系中若加入经标记的NTP，则可合成RNA探针。RNA探针一般都是单链,它具有单链DNA探针的优点,
RNA时代：初级读物
自从二十世纪五十年代核酸研究出现在科学领域之后，DNA一直是其中的重点。除了核糖体RNA（rRNA）和转移RNA（tRNA）等之外，RNA在很大程度上被认为仅是非常重要的DNA和它的蛋白产物之间的信使。确实，它被赋予了这个名字！ 美国斯坦福大学生化学家Julia Salzman说，“DNA被认
转运RNA的定义
大多数tRNA由七十几至九十几个核苷酸组成，参与蛋白质的合成。分子量为25000～30000，沉降常数约为4S（个别tRNA的沉降常数为3S，含63个核苷酸）。曾用名有联接RNA、可溶性RNA、pH5RNA等。一种tRNA只能携带一种氨基酸，如丙氨酸tRNA只携带丙氨酸，但一种氨基酸可被不止一种