我国学者与海外合作者在利用人工智能识别潜在RNA病毒研究方面取得进展

图 使用人工智能对全球病毒圈的深度挖掘 在国家自然科学基金项目(批准号:82341118、32270160)等资助下,中山大学医学院施莽教授团队、阿里云李兆融团队,联合悉尼大学Edward Holmes教授团队,在人工智能(artificial intelligence,AI)算法识别潜在的RNA病毒种(species)及RNA病毒超群(supergroups)研究方面取得进展。相关成果以“利用人工智能揭示隐藏的RNA病毒圈(Using Artificial Intelligence to Document the Hidden RNA Virosphere)”为题,于2024年10月9日在《细胞》(Cell)杂志在线发表。论文链接:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(24)01085-7。 病毒是地球生态系统的重要组成部分,与人类健康关系密切。目前人类对病毒多样性的认......阅读全文

RNA的提取

【实验原理】Trizol 试剂是直接从细胞或组织中提取总RNA 的试剂。它在破碎和溶解细胞时能保持RNA 的完整性。加入氯仿后离心,样品分成水样层和有机层。RNA存在于水样层中。收集上面的的水样层后,RNA 可以通过异丙醇沉淀获得。【实验仪器】1. 匀浆机2. 低温离心机3. 涡旋器【试剂及配制】1

RNA点线杂交

RNA点线杂交(Dot and Slot blotting)·         RNA dot blot and slot blot (Beverly Faulkner-Jones)This methods allows the rapid analysis of numerous small sa

纯化RNA实验

从培养的细胞中纯化总RNA 从组织中纯化总RNA             实验材料 细胞

RNA提取原理

RNA抽取一般使用Trizol法抽提:Trizol是一种总RNA抽提试剂,内含异硫氰酸胍等物质,能迅速裂解细胞,抑制细胞释放出的核酸酶活性。目前常用Trizol法进行提取组织或细胞中的RNA。Trizol作用原理:在匀质化或溶解样品中,Trizol试剂可保持RNA的完整性,同时能破坏细胞及溶解细胞成

RNA-Immunoprecipita...

实验概要Interest in RNA-protein interactions is booming as we begin to appreciate the role of RNA, not just in well-established processes such as tran

前信使RNA

中文名称前信使RNA英文名称pre-messenger RNA;pre-mRNA;precursor mRNA定  义未经剪接加工的基因转录产物。即初级转录物。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

水生动物病毒基因组DNA/RNA提取试剂盒使用说明

水生动物病毒基因组DNA/RNA提取试剂盒一、简介水生动物病毒基因组DNA/RNA提取试剂盒适合于快速从水生动物组织匀浆液中提取高纯度的病毒基因组核酸。试剂盒基于硅胶柱纯化技术,提取过程中无需使用有毒的酚氯仿抽提,也无需进行耗时的醇类沉淀,获得的核酸可直接用于PCR/RT-PCR、Sorthern杂

我国科学家发现1445种新RNA病毒:极大丰富其多样性

  《自然》杂志在线发表了中国疾病控制中心传染病所研究员张永振团队的学术论文《无脊椎动物RNA病毒圈的重新界定》。这项始于2011年的研究发现了1445种新的RNA病毒,极大丰富了RNA病毒多样性,并从遗传进化的角度揭示了RNA病毒发生和进化上的基本规律。其中一些病毒与现有已知病毒的差异性之大,以至

在RNA病毒聚合酶中发现一种独特的保真度调控机制

  RNA病毒包括多种人类和动物致病病原,对人类健康构成严重威胁。这类病毒的基因组复制过程不涉及DNA形式,因此需要由病毒自身编码的依赖RNA的RNA聚合酶(RdRP)来主导完成。病毒RdRP可准确而高效地实现多达数万个核苷酸的合成,并将合成的出错率水平维持在万分之一上下。在其他生命形式中,长链核酸

临床前研究表明口服4氟尿苷可强效抑制SARSCoV2RNA病毒

  在一项新的研究中,来自美国佐治亚州立大学、埃默里大学和得克萨斯生物医学研究所的研究人员报道,在细胞培养、人体类器官和不同的动物模型中,一种新的候选核糖核苷类似物---4'-氟尿苷(4'-fluorouridine, 4'-FlU,也称为EIDD-2749)---每天口服一

科学家首次阐述了环形RNA在细胞受病毒感染时的降解机制

  4月25日,国际学术期刊《细胞》(Cell)在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于环形RNA的最新研究进展:Structure and degradation of circular RNAs regulate PKR activation in innate immun

从果蝇胚胎中提取总-RNA-或-poIy(A)-+RNA

试剂、试剂盒 0.lmol LNaOH 乙醇 3mol L 乙酸钠 苯酚 无 SDS 的结合缓冲液 含 SDS 的结合缓冲液 TE 缓冲液 SEVAG 漂白剂(Bleach) 含 MgCl2 的 PBS(pH7.2) 果蝇勻浆缓冲液实验步骤 一 材料与设备1)0.lmol/LNaOH2)70%(V/

从果蝇胚胎中提取总-RNA-或-poIy(A)-+RNA

            试剂、试剂盒 0.lmol LNaOH  乙醇  3mol L 乙酸钠   苯酚  无 SDS 的结合缓冲液 含 SDS 的结合缓冲

真核细胞总RNA的制备(Total-RNA-Isolation)2

Total RNA Isolation Guanidine-based isolation Objective:  To obtain total RNA from zebrafish embryos. Required Materials  Denaturing Solution

真核细胞总RNA的制备(Total-RNA-Isolation)1

从细胞中分离RNA的纯度于完整性对于许多分子生物学实验至关重要。如Northern印迹与杂交分析、寡聚(dT)纤维素选择分离 mRNA,cDNA合成及体外翻译等实验的成败,在很大程度上决定于RNA的质量。RNA分离的最关键因素是尽量减少RNA酶的污染。快速一步法提取总RNA组织及有核细胞在匀浆过程中

中国校企联手发表科研成果,借AI发现超16万种RNA病毒

记者10日了解到,国际顶级学术期刊《Cell》在北京时间9日11时发表了中山大学与阿里云合作的科研成果,研究团队利用云计算与AI技术发现了180个超群、16万余种全新RNA病毒,是已知病毒种类的近30倍,大幅提升了业界对RNA病毒多样性和病毒演化历史的认知。《Cell》是国际公认的享有最高学术声誉的

Science子刊:一种检测新冠病毒RNA的双色RTLAMP检测方法

  新型冠状病毒SARS-CoV-2导致2019年冠状病毒病(COVID-19),如今正在全球肆虐。基于此,人类面临着一项重大的公共卫生挑战。快速检测现有的SARS-CoV-2感染和评估病毒传播至关重要。  基于逆转录环介导等温扩增(reverse transcription loop-mediat

诺如病毒GI型RNA核酸检测试剂盒(恒温荧光法)使用说明

◆ 产品说明致病菌检测系列基于独特的恒温荧光检测技术,可针对食品、饲料等样品中的致病微生物的特异核酸片段进行扩增,仪器实时监测扩增过程中的荧光信号变化,自动判读结果。本产品用于诺如病毒GI型RNA的检测。检出限为103 CFU/ml。◆ 产品组成(96测试)012111L试剂含量A-GI-I1200

葛兰素史克两款创新反义RNA疗法-阻断乙肝病毒蛋白产生

  Ionis公司是反义RNA疗法方面的行业领导者,已利用其专有的反义RNA技术,创建了一个庞大的首创或同类最佳的药物管线,已有4款反义RNA药物获批上市,分别为Kynamro(治疗纯合子家族性高胆固醇血症[HoFH])、Spinraza(治疗脊髓性肌萎缩症[SMA])、Tegsedi(治疗遗传性转

2.3.1-从果蝇胚胎中提取总-RNA-或-poIy(A)-+RNA

试剂、试剂盒0.lmol LNaOH乙醇3mol L 乙酸钠苯酚无 SDS 的结合缓冲液含 SDS 的结合缓冲液TE 缓冲液SEVAG漂白剂(Bleach)含 MgCl2 的 PBS(pH7.2)果蝇勻浆缓冲液实验步骤一 材料与设备1)0.lmol/LNaOH2)70%(V/V) 乙醇3)3mol/

纯化RNA实验——从培养的细胞中纯化总RNA

实验材料细胞试剂、试剂盒RNA 提取缓冲液变性液水饱和酚仪器、耗材培养皿Falcon 2063 管实验步骤1. 取 1 个细胞已长满的 100 ml 培养皿,吸出培养液,加 2 ml RNA 提取缓冲液,用橡胶刮棒刮下细胞。RNA 提取缓冲液:变性液,20 mlβ-巯基乙醇,0.144 ml2 mo

利用-Marligen-总-RNA-快速纯化系统纯化总-RNA-实验

由 Marligen Biosciences 提供的 Rapid Total RNA System 可从各种样品中提取 RNA,且产量和质量非常稳定。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒乙醇β-巯基乙醇仪器、耗材转子-定子均化器或类似设备Marligen Rap

用T4-RNA-连接酶连接-RNA-分子

            实验材料 T4RNA连接酶 供体RNA 受体RNA 试剂、试剂盒 10XT4RNA连接酶缓冲液

利用-Marligen-总-RNA-快速纯化系统纯化总-RNA-实验

试剂、试剂盒 乙醇β-巯基乙醇仪器、耗材 转子-定子均化器或类似设备 Marligen Rapid Total RNA System实验步骤 一、材料1.缓冲液、溶液和试剂乙醇,70%和100%β-巯基乙醇2.特殊设备转子-定子均化器或类似设备3.其他Marligen Rapid Total RNA

提质粒后有RNA污染,可以加点RNA酶处理吗

实验室一直都是用日常型质粒抽提试剂盒,转染细胞没问题。我觉得只要是注意以下2点就可以了:1,注意大肠杆菌(Escherichia coli)本身的污染,收集菌体沉淀时防止菌液散落,经常用75%的乙醇擦拭手套。2,最后洗脱时最好使用无内毒素的水,我们是用注射用水的。无论是小提还是大提我们都是用的日常型

用T4-RNA-连接酶连接-RNA-分子

实验材料 T4RNA连接酶供体RNA受体RNA试剂、试剂盒 10XT4RNA连接酶缓冲液无核酸酶的水FEGRNA酶抑制剂实验步骤 一材料与设备1)10XT4RNA 连接酶缓冲液:50 mmol/LTris (pH7,8),l0 mmol/L MgCl2,5 mmol/LDTT,1 mmol/L AT

利用-Marligen-总-RNA-快速纯化系统纯化总-RNA-实验

            试剂、试剂盒 乙醇 β-巯基乙醇 仪器、耗材 转子-定子均化器或类似设备 Marligen Ra

提取质粒还没加Rna酶为何电泳中不见Rna

一般来说,提取质粒所用的试剂盒已经加入了RNase,所以电泳跑胶不会出现RNA条带。即使是采用的人工方法提取,也不可避免的空气中,汗液,唾液等中丰富的RNase的降解。此外,按照你的问题来看,你应该是再提取质粒,提取质粒然后电泳渴望观察到RNA的条带,殊不知质粒分子一般较大,其所用的琼脂糖胶浓度一般

RNA-polymerase-III-transcription

Unlike the RNA polymerase II that transcribes a large variety of genes that encode proteins, RNA polymerase III transcribes only a limited number of g

RNA-大量转录合成

实验材料 模板 DNA 或质粒试剂、试剂盒 TE TE 饱和酚 氯仿异内醇 3mol LNaAc 无水乙醇 5X 转录缓冲液 lOOmmoL LDTT RNasin rATPrGTPrUTPrCTP SF6T3 或 T7RNA 聚合酶 异戊醇 DNase 7.5mol L 乙酸铵 无水乙醇 乙醇实验