我国学者与海外合作者在利用人工智能识别潜在RNA病毒研究方面取得进展
图 使用人工智能对全球病毒圈的深度挖掘 在国家自然科学基金项目（批准号：82341118、32270160）等资助下，中山大学医学院施莽教授团队、阿里云李兆融团队，联合悉尼大学Edward Holmes教授团队，在人工智能（artificial intelligence，AI）算法识别潜在的RNA病毒种（species）及RNA病毒超群（supergroups）研究方面取得进展。相关成果以“利用人工智能揭示隐藏的RNA病毒圈（Using Artificial Intelligence to Document the Hidden RNA Virosphere）”为题，于2024年10月9日在《细胞》（Cell）杂志在线发表。论文链接：https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(24)01085-7。 病毒是地球生态系统的重要组成部分，与人类健康关系密切。目前人类对病毒多样性的认......阅读全文
卫星RNA的重组
在一些动物病毒中，存在着基因组之间的重组现象。发生重组的RNA可能具有同源性，也可能没有同源性。前一种情况下，交换重组的RNA发生在两者之中的相同位置而不会改变通读框架ORF；后一种情况下，交换重组的位置不确定，因而会影响到ORF。在植物病毒中，仅证明雀麦花叶病毒BMV存在着RNA基因组重组现象。T
RNA干扰功能特点
1.高效性：Elbashir等在研究中发现分别为25 nmol/L与100 nmol/L的起始双链RNA产生的结果是一样的，只是高浓度起始的更有效些。将双链RNA浓度降低到1.5 nmol/L时产生的基因沉默效果变化不大，只有当浓度降低到0.05 nmol/L时，沉默的效果才消失。Holen等也证实
转运RNA的定义
大多数tRNA由七十几至九十几个核苷酸折叠形成的三叶草形短链组成，相对分子质量为25000〜30000，沉降常数约为4S。旧称联接RNA、可溶性RNA等。主要作用是携带氨基酸进入核糖体，在mRNA指导下合成蛋白质，即以mRNA为模板，将其中具有密码意义的核苷酸顺序翻译成蛋白质中的氨基酸顺序。tRNA
RNA干扰的概念
RNA干扰（RNA interference，RNAi）是指在进化过程中高度保守的、由双链RNA（double-stranded RNA，dsRNA）诱发的、同源mRNA高效特异性降解的现象。基因沉默，主要有转录前水平的基因沉默(TGS)和转录后水平的基因沉默(PTGS)两类：TGS是指由于DNA修
重组RNA的定义
中文名称重组RNA英文名称recombinant RNA定 义用人工手段进行了改造和重新组合的RNA。重组RNA可以经重组DNA转录获得，也可以使用专门作用于RNA的酶类(如T4 RNA连接酶、Qβ-RNA复制酶、RNA酶Ⅲ)等工具和技术获得。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），方法与技术（
总RNA的提取
完整RNA的提取和纯化,是进行RNA方面的研究工作,如Nothern杂交、mRNA分离、RT-PCR、定量PCR、cDNA合成及体外翻译等的前提。所有ＲＮＡ的提取过程中都有五个关键点，即１）：样品细胞或组织的有效破碎；２），有效地使核蛋白复合体变性；３），对内源ＲＮＡ酶的有效抑制；４）有效地将ＲＮ
转运RNA的功能
主要是携带氨基酸进入核糖体，在mRNA指导下合成蛋白质。即以mRNA为模板，将其中具有密码意义的核苷酸顺序翻译成蛋白质中的氨基酸顺序（见蛋白质的生物合成、核糖体）。tRNA与mRNA是通过反密码子与密码子相互作用而发生关系的。在肽链生成过程中，第一个进入核糖体与mRNA起始密码子结合的tRNA叫
什么是信使RNA？
信使RNA，中文译名“信使核糖核酸”，是由DNA的一条链作为模板转录而来的、携带遗传信息能指导蛋白质合成的一类单链核糖核酸。
什么是转运RNA？
转运RNA（Transfer RNA），又称传送核糖核酸、转移核糖核酸，通常简称为tRNA，是一种由76-90个核苷酸所组成的RNA，其3'端可以在氨酰-tRNA合成酶催化之下，接附特定种类的氨基酸。转译的过程中，tRNA可借由自身的反密码子识别mRNA上的密码子，将该密码子对应的氨基酸转运
什么是RNA作图？
中文名称RNA作图英文名称RNA mapping定 义对RNA分子在基因上的定位分析。将RNA与相应的DNA杂交后，用单链特异性核酸酶(常用的如S1核酸酶)切去不发生杂交的单链部分，用以分析RNA与相应DNA的关系，包括确定RNA的5′和3′端、外显子和内含子在DNA上的相应位置等。应用学科生物化
反义RNA的功能
在原核生物中反义RNA具有多种功能，例如调控质粒的复制及其接合转移，抑制某些转位因子的转位，对某些噬菌体溶菌-溶源状态的控制等。下文仅举数例。调控细菌基因的表达反义RNA对编码CAP的基因的调控作用已如前述。这里再介绍一下micF RNA对ompF基因的表达的调控。ompF蛋白质是大肠杆菌的外膜蛋白
RNA干扰的简介
RNAi研究取得了突破性进展，被《Science》杂志评为2001年的十大科学进展之一，并名列2002年十大科学进展之首。由于使用RNAi技术可以特异性剔除或关闭特定基因的表达，所以该技术已被广泛用于探索基因功能和传染性疾病及恶性肿瘤的基因治疗领域。
3.5－RNA－反转录
利用 RNA 模板通过反转录获得 DNA,进而复制和感染细胞实验材料poly(A)+RNA反转录酶鼠源反转酶 或禽源反转录酶试剂、试剂盒oligo(dT)12-18lmol LTris-Cl1mol LTris-Cllmol LKC125 mmol LMgCl2dNTP 混合物0.lmol LDTT
RNA提取与纯化
实验概要掌握RNA提取的基本技术，了解RNA提取过程中的各种注意事项。实验原理RNA提取是分子生物学实验中难度较大的实验技术。 RNA提取和DNA提取有类似的地方，因为它们都是核酸，都具有较好的水溶性。提取RNA首先破碎细胞，然后用提取液将RNA溶出，反复抽提去除蛋白质，加入乙醇沉淀RNA，将RNA
RNA沉默的作用
植物可利用 PTGS 和 TGS 来抵抗病毒侵染, 病毒侵染植物后会产生大量病毒来源的小 RNA (virus-derived small interfering RNAs, vsiRNA), 介导对病毒 RNA 的降解或抑制病毒基因的转录; 而在与植物长期共进化过程中, 病毒编码一个或多个RNA沉
反义RNA稳定方法
[1]反义RNA3'端带有茎环结构或类似ρ-不依赖性终止子结构时，可以稳定RNA分子；[2]Gorski等还发现在T4噬菌体的基因32mRNA的5'端上游的茎环结构及其附近的序列亦可稳定RNA分子。所以在设计反义RNA基因时，最好将产生3'及5'端这种二级结构的序列克
RNA－标准转录反应
实验材料 模板 DNA 或质粒试剂、试剂盒 TE 异丙醇 3mol LNaAc 无水乙醇 5×转录缓冲液 l00 mmol L DTT RNasin rATPrGTPrUTP 各 2.5 mmol L [α42P] rCTP SPGT3 或 T7RNA 聚合酶 TE-饱和的酚氯仿异戊醇 DN
RNA假结的定义
RNA中的一种常见的三级结构元件。RNA的茎环结构中的环上序列与其他部位(通常是邻近部位)的序列碱基配对，形成类似“打结”形状。
TRIzol－RNA提取方法
（一）试剂准备1．TRIzol试剂。2．氯仿3．异丙醇4．75%乙醇（DEPC H2O配制）5．DEPC H2O（二）操作步骤1． 样品处理：（1）培养细胞：收获细胞1-5×107，移入1.5ml离心管中，加入1ml Trizol，混匀，室温静置5min。（2）组织：取50-100mg组织（新鲜或-
转运RNA的结构
转运RNA分子由一条长70~90个核苷酸并折叠成三叶草形的短链组成的。上图中有两种不同的分子，苯丙氨酸tRNA(4tna)和天冬氨酸tRNA(2tra)。tRNA链的两个末端在图上方指出的L形结构的末端互相接近。氨基酸在箭头示意的位置被连接。在这条链的中央形成了L形臂，如图下方所示，露出了形成反
RNA组的定义
中文名称RNA组英文名称RNome定 义生物体在特定条件下所拥有的全套非信使RNA(nmRNA)，即非编码RNA(ncRNA)或基因组编码的除信使RNA及其前体(hnRNA)外的全部RNA。主要是非信使小RNA(snmRNA)，包括核仁小RNA、核小RNA、微RNA和干扰小RNA等，广义地说，也包
微RNA的简介
MicroRNA（miRNA）是一类内生的、长度约20-24个核苷酸的小RNA，其在细胞内具有多种重要的调节作用。每个miRNA可以有多个靶基因，而几个miRNAs也可以调节同一个基因。这种复杂的调节网络既可以通过一个miRNA来调控多个基因的表达，也可以通过几个miRNAs的组合来精细调控某个基因
RNA干扰回复实验
RNA干扰回复实验，主要是为了说明Off-target效应。Off-target效应Off-target effects（脱靶效应）最早由Dharmacon科学家Jackson和他的同事们提出（Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can Induce
RNA靶向的定义
中文名称RNA靶向英文名称RNA targeting定 义(1)针对RNA分子设计的一种定向作用技术。包括一些小分子化合物(如抗生素)、反义核酸、反式作用核酶、适配体、干扰小RNA等的应用。(2)由于RNA分子本身具有较大的柔性，能专一地与RNA、DNA和蛋白质相互作用，而成为一种特异的靶向试剂。
RNA干扰主体实验
siRNA表达载体构建好后，即可进行RNA干扰主体实验。RNA干扰主体实验的重点在于：成功将siRNA表达载体导入目的细胞如果目的细胞的质粒转染效率较低（低于70%），则应采用腺病毒或慢病毒载体，利用病毒载体的高感染率、高表达特性，更好地开展RNA干扰主体实验。设置好分组和对照按照nature的标准
反义RNA的来源
细胞中反义RNA的来源有两种途径：第一是反向转录的产物，在多数情况下, 反义RNA是特定靶基因互补链反向转录产物, 即产生mRNA和反义RNA的DNA是同一区段的互补链。第二种来源是不同基因产物，如OMPF基因是大肠杆菌的膜蛋白基因，与透性有关，其反义基因MICFZE则为另一基因。
TRIzol－RNA提取方法
实验方法原理 Trizol是一种新型总RNA抽提试剂，采用变性剂即内含异硫氰酸胍酚和β-巯基乙醇等变性物质，能迅速破碎细胞，抑制细胞释放出的核酸酶。异硫氰酸胍属于解偶剂，是一类强力的蛋白质变性剂，可溶解蛋白质，并使蛋白质二级结构消失，细胞结构
分离植物总RNA
实验概要认识真核生物RNA的组成及分离的原理；学习RNA提取过程中抑制RNA酶活性的方法。实验原理真核生物的RNA包括rRNA、tRNA和mRNA。一个典型的真核细胞约含有10-5~10-6mg的RNA，其中80-85%为rRNA，其余15-20%主要由各种低分子量RNA组成（如tRNA、核内小分子
反义RNA的定义
反义RNA是指与mRNA互补的RNA分子，也包括与其它RNA互补的RNA分子。由于核糖体不能翻译双链的RNA，所以反义RNA与mRNA特异性的互补结合, 即抑制了该mRNA的翻译。通过反义RNA控制mRNA的翻译是原核生物基因表达调控的一种方式，最早是在E.coli 的产肠杆菌素的Col E1质粒中
转运RNA的功能
主要是携带氨基酸进入核糖体，在mRNA指导下合成蛋白质。即以mRNA为模板，将其中具有密码意义的核苷酸顺序翻译成蛋白质中的氨基酸顺序（见蛋白质的生物合成、核糖体）。tRNA与mRNA是通过反密码子与密码子相互作用而发生关系的。在肽链生成过程中，第一个进入核糖体与mRNA起始密码子结合的tRNA叫起始