我国学者与海外合作者在利用人工智能识别潜在RNA病毒研究方面取得进展

图 使用人工智能对全球病毒圈的深度挖掘 在国家自然科学基金项目(批准号:82341118、32270160)等资助下,中山大学医学院施莽教授团队、阿里云李兆融团队,联合悉尼大学Edward Holmes教授团队,在人工智能(artificial intelligence,AI)算法识别潜在的RNA病毒种(species)及RNA病毒超群(supergroups)研究方面取得进展。相关成果以“利用人工智能揭示隐藏的RNA病毒圈(Using Artificial Intelligence to Document the Hidden RNA Virosphere)”为题,于2024年10月9日在《细胞》(Cell)杂志在线发表。论文链接:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(24)01085-7。 病毒是地球生态系统的重要组成部分,与人类健康关系密切。目前人类对病毒多样性的认......阅读全文

RNA-标准转录反应

            实验材料 模板 DNA 或质粒 试剂、试剂盒 TE 异丙醇 3mol LNaAc

微RNA的概念

微RNA(microRNAs;miRNA,又译小分子RNA)是真核生物中广泛存在的一种长约21到23个核苷酸的RNA分子,可调节其他基因的表达。miRNA来自一些从DNA转录而来,但无法进一步转译成蛋白质的RNA(属于非编码RNA)。miRNA通过与靶信使核糖核酸(mRNA)特异结合,从而抑制转录后

细胞RNA含量检测

实验步骤展开

互补RNA的功能

中文名称互补RNA英文名称complementary RNA定  义能与另一条核酸(DNA或RNA)链互补的RNA分子。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞RNA含量检测

实验步骤             展开

RNA抽提经验

对大部分实验人员来说,RNA 抽提比基因组 DNA 抽提要困难得多。事实上,现有的 RNA 抽提方法/试剂,如果用于从培养细胞中抽提 RNA,比抽提基因组 DNA 更方便,成功率也更高。那为什么同样的方法用于组织 RNA 的抽提,总会碰到问题呢?   组织 RNA 抽提失败的两大现象是: RNA 降

植物RNA提取实验

实验方法原理 独特的裂解液/β-巯基乙醇迅速裂解细胞和灭活细胞RNA酶,植物RNA助提剂PLANTaid帮助结合多糖多酚并通过离心去除,然后用乙醇调节结合条件后,RNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,去蛋白液和漂洗液将细胞代谢物,蛋白等杂质去除,

概述反义RNA技术

  随着分子生物学和遗传工程的发展,基因治疗应运而生,反义技术是其中一种,它的基础是根据核酸杂交原理设计针对特定靶序列的反义核酸,从而抑制特定基因的表达,包括反义RNA、反义DNA及核酶(Ribozyme),它们通过人工合成和生物合成获得。  反义DNA是指一段能与特定的DNA或RNA以碱基互补配对

动物RNA提取实验

实验方法原理 SV Total RNA Isolation System (SV 总RNA 纯化系统)可在1小时内从组织、培养细胞和白细胞中提取纯化完整总RNA,方法简单、快速。该系统以膜为基础,根据组织类型的不同,每次最多可纯化60 mg 组织。系统包含DNase 处理步骤,直接在小离

信使RNA的应用

2020年12月,美国食品和药物管理局(FDA)授权一款运用mRNA(信使核糖核酸)技术研制的新冠疫苗的紧急使用许可。2022年2月,南非一公司3日对当地媒体表示,该公司利用已公开的新冠疫苗核酸序列,开发出非洲大陆首款mRNA(信使核糖核酸)新冠疫苗,计划今年底前开展临床试验。 南非当地时间2022

提取植物rna方法

  提到RNA的提取,是不是充满了心酸和无奈呀,抽提过程中已十分小心谨慎了,但是有时候还是会出现RNA污染、降解的悲剧。别怕,今天小编给您介绍一种新的RNA提取方法,比以前的方法更快、更有效和更可靠,让您从此不用再担心的RNA的抽提了。  众所周知:获得纯净、完整的RNA样品,是对一种植物的活性基因

总RNA的提取

完整RNA 的提取和纯化,是进行RNA 方面的研究工作,如Nothern杂交、mRNA 分离、RT-PCR、定量PCR、cDNA合成及体外翻译等的前提。所有RNA的提取过程中都有五个关键点,即1):样品细胞或组织的有效破碎;2),有效地使核蛋白复合体变性;3),对内源RNA酶的有效抑制;4)

动物RNA提取实验

SV总RNA试剂盒提取法 Trizol试剂提取法             实验方法原理 SV Total RNA Isolation System (SV 总RNA

反义RNA的定义

反义RNA是指与mRNA互补的RNA分子,也包括与其它RNA互补的RNA分子。由于核糖体不能翻译双链的RNA,所以反义RNA与mRNA特异性的互补结合, 即抑制了该mRNA的翻译。通过反义RNA控制mRNA的翻译是原核生物基因表达调控的一种方式,最早是在E.coli 的产肠杆菌素的Col E1质粒中

信使RNA的构成

  大肠杆菌的全酶有5个亚基(α2ββ’ωσ),含2个锌。β催化形成磷酸二酯键,β’结合模板,σ亚基称为起始因子,可使RNA聚合酶稳定地结合到启动子上。ββ’ωσ称为核心酶。σ亚基在不同菌种间变动较大,而核心酶比较恒定。酶与不同启动子的结合能力不同,不同启动因子可识别不同的启动子。σ70识别启动子共

什么是反义RNA?

反义RNA是指与mRNA互补后,能抑制与疾病发生直接相关基因的表达的RNA。它封闭基因表达,具有特异性强、操作简单的特点,可用来治疗由基因突变或过度表达导致的疾病和严重感染性疾病。根据反义RNA的作用机制可将其分为3类:Ⅰ类反义RNA直接作用于靶mRNA的S D序列和(或)部分编码区,直接抑制翻译,

细菌RNA制备实验

革兰氏阴性细菌中提取 革兰氏阳性细菌中提取             实验材料 RNA 试

真菌RNA提取实验

实验方法原理 液氮研磨可裂解细胞,促使核蛋白体的解离,使RNA与蛋白质分离,并将RNA释放到溶液中。当加入氯仿时,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA进入水相,离心后可形成水相层和有机层,这样RNA与仍留在有机相中的蛋白质和DNA分离开。 实验材料 菌丝体试剂、试剂盒 NaCl蒸馏水SDSTr

RNA-大量转录合成

            实验材料 模板 DNA 或质粒 试剂、试剂盒 TE   TE 饱和酚   氯仿

RNA编辑主要类型

①简单编辑,单碱基转变的转录后调节;②插入编辑,插入单个核苷酸或少量核苷酸的丢失,其机制是转录链的跳格;③泛编辑,插入或缺失多个尿嘧啶核苷酸或转录后插入多个胞嘧啶,其机制是编辑序列由外源反义引导RNA( gRNA)提供,gRNA在编辑体(editosome)核蛋白颗粒中与前编辑mRNA配对,鉴别作为

双RNA测序技术

在发表于《自然》(Nature)杂志上的一篇研究论文中, 由来自德国、奥地利和美国的研究人员组成的一个研究小组发现,采用一种允许在感染过程中同时研究细菌与宿主小RNA的新技术,可以揭示出两者转录谱的改变。该研究小组描绘了他们的技术、该技术如何更多地帮助了解细菌感染机制,以及在研究中获得的重要发现

RNA沉默的分类

植物中的RNA沉默根据作用靶标可以分为两类:以RNA为靶标, 使其降解或抑制蛋白翻译, 称为转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing, PTGS);以染色质为靶标, 使其基因启动子或组蛋白甲基化从而抑制 RNA 转录的起始, 称为转录基因沉默(trans

什么是RNA编辑?

RNA编辑(RNA editing)是指转录后的RNA在编码区发生碱基的加入、丢失或转换等现象。RNA编辑产生的“基因”可称为隐蔽基因( cryptogene),其产物的结构不能从基因组DNA序列中推导获得。早在1986年发现锥虫线粒体mRNA转录加工后,其mRNA的多个编码位置上加入或丢失尿苷酸。

核RNA的概念

中文名称核RNA英文名称nuclear RNA定  义细胞核内的RNA。如核内不均一RNA、核小RNA、核仁小RNA等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

RNA干扰的定义

RNA干扰(RNA interference,RNAi)是指在进化过程中高度保守的、由双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)诱发的、同源mRNA高效特异性降解的现象。

植物RNA提取实验

直接研磨法 液氮研磨法             实验方法原理 通过裂解液β-巯基乙醇迅速裂解细胞和灭活细胞RNA酶,植物RNA助提剂PLANTaid帮助结合多糖多酚并通过离

RNA干扰的概念

RNA干扰(RNA interference,RNAi)是指在进化过程中高度保守的、由双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)诱发的、同源mRNA高效特异性降解的现象。基因沉默,主要有转录前水平的基因沉默(TGS)和转录后水平的基因沉默(PTGS)两类:TGS是指由于DNA修

间隔RNA的概念

中文名称间隔RNA英文名称spacer RNA定  义初级转录物中由基因间序列编码产生的RNA序列。如哺乳动物核糖体核糖核酸(rRNA)的初级转录物位于18S rRNA和28S rRNA间的一段序列,这些序列不出现在成熟的rRNA中。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

RNA点杂交实验

实验概要了解RNA点杂交实验,包括纯化的RNA的点杂交和狭线杂交,RNA斑点印迹。实验步骤纯化的RNA的点杂交和狭线杂交:1. 安装印迹装置   1) 切一张合适大小的带正电荷尼龙膜。用铅笔标上表示方向的记号。用水把膜简单弄湿,在20×SSC中室温泡1 h。   2) 在膜浸泡期间,先用0.1 mo

反义RNA的来源

细胞中反义RNA的来源有两种途径:第一是反向转录的产物,在多数情况下, 反义RNA是特定靶基因互补链反向转录产物, 即产生mRNA和反义RNA的DNA是同一区段的互补链。第二种来源是不同基因产物,如OMPF基因是大肠杆菌的膜蛋白基因,与透性有关,其反义基因MICFZE则为另一基因。