利用分子标尺技术对长链RNA的结构和构象动态开展研究或成可能

近日,中国科学院生物物理研究所方显杨课题组在《结构生物学的当前观点》发表综述,全面总结了利用非天然碱基对系统赋能分子标尺技术及其应用。 随着全球对由RNA病毒引起的病毒性疾病的关注度增加,如何通过深入理解这些病毒RNA的结构来调控其功能,发展基于或靶向RNA的新疗法,成为了当前研究的热点。相关分子标尺技术的应用不仅可更准确地理解黄病毒RNA的构象动态变化,为病毒性疾病的治疗提供新的靶点和策略,也有望推动RNA纳米技术的发展,为未来的生物医学研究提供更多可能性。 RNA分子因其固有的柔性和构象动态,一直以来都是结构生物学研究中的难点。传统的结构解析技术,如X射线晶体学、核磁共振(NMR)和冷冻电镜,虽然在解析蛋白质结构方面取得了显著进展,但在解析RNA结构和捕捉RNA动态变化方面仍面临巨大挑战。近年来,人们日益认识到,多方法联用、实验数据与计算模拟结合可拓展结构生物学的研究方法和研究思路。 该综述介绍了3种互补的分子标尺......阅读全文

碱基的定义

碱基,在生物化学中又称核碱基、含氮碱基,是形成核苷的含氮化合物,核苷又是核苷酸的组分。碱基、核苷和核苷酸等单体构成了核酸的基本构件。核碱基间可以形成碱基对,且彼此堆叠,所以,它们是长链螺旋结构,例如核糖核酸(RNA)和脱氧核糖核酸(DNA)的重要组成部分。

蛋白质芯片技术生物分子反应

使用时将待检的含有蛋白质的标本如尿液、血清、精液、组织提取物等,按一定程序做好层析、电泳、色谱等前处理,然后在每个芯池里点入需要的种类。一般样品量只要2-10μL即可。根据测定目的不同可选用不同探针结合或与其中含有的生物制剂相互作用一段时间,然后洗去未结合的或多余的物质,将样品固定一下等待检测即可。

质谱法鉴定蛋白质分子量

质谱法鉴定蛋白质分子量对样品的消耗很少,且具有更高的灵敏度、分辨率和准确度,有利于对复杂混合物样品的分析。目前广泛使用的用干蛋白质鉴定的质谱分析主要使用两种类型质谱:一种是MALDI-TOF直接对分子量进行测量,MALIDI离子源产生的离子多带单电荷,质谱图中的峰与样品各组分质量数是一-对应的,不用

蛋白质与生物小分子结合

生物大分子,首先先说一下什么是生物大疯子,生物大分子指的是作为生物体内主要活性成分的各种分子量达到上万或更多的有机分子.高相对分子量的生物有机化合物(生物大分子)主要是指蛋白质、核酸以及高相对分子量的碳氢化合物.常见的生物大分子包括蛋白质、核酸、多糖.但是,这只是相对的说法,这个定义只是概念性的,与

蛋白质分子稳定性测量

      采用标准       测量类型:温度中点Tm测量类型:焓∆H测量类型:热容变化∆CpSample capacity:576(六个96-孔板)样品量:370µL样品池容积:130µL样品展示选件:96-孔板Sample capacity:50个样品 / 24小时(自动系统

分子遗传学词汇非转录间隔区

中文名称:非转录间隔区定义:非转录间隔区是DNA分子中,不同基因(操纵子)之间的非转录序列。

非蛋白质新标签可追踪细胞过程

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/504716.shtm 图片来源:俄罗斯卫星通讯社科技日报莫斯科7月13日电 (记者董映璧)俄罗斯研究人员使用一种新开发的非蛋白质光学标签,可在不改变基因组的情况下标记单个细胞。使用该项技术能在任何

互补碱基的DNA和RNA的主要碱基的差别

胸腺嘧啶是DNA的主要嘧啶碱,在RNA中极少见;相反,尿嘧啶是RNA的主要嘧啶碱,在DNA中则是稀有的。在DNA分子结构中,由于碱基之间的氢键具有固定的数目和DNA两条链之间的距离保持不变,使得碱基配对必须遵循一定的规律,这就是Adenine(A,腺嘌呤)一定与Thymine(T,胸腺嘧啶)配对,G

哪些是天然高分子化合物?

天然高分子化合物,常用俗名,如,淀粉、蛋白质、橡胶、纤维素,等等。

mBio:天然免疫蛋白抑制HIV复制的分子机制

  根据乔治华盛顿大学研究人员发表在《mBio》杂志上的一项新研究,人蛋白质载脂蛋白A-1结合蛋白(AIBP)通过靶向脂质筏并减少病毒细胞融合来抑制HIV复制。这些结果提供了第一个证据,表明AIBP是一种先天免疫因子,该因子可通过修饰HIV靶细胞上的脂质筏来限制HIV复制。  “先前的研究表明,AI

分子植物卓越中心揭示天然反义转录本调控机制

  近期,中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所研究员何玉科研究组在Nature Communications上,发表题为Natural antisense transcripts of MIR398 genes suppress microR398 processing and a

分子蒸馏新技术在天然香料分离中的应用

摘要:利用分子蒸馏新技术从天然香料肉桂油和山苍子油中分离提纯肉桂醛和柠檬醛,用GC–MS 联用仪对分离物中肉桂醛和柠檬醛的质量分数进行分析,重点研究了压力和温度等主要影响因素。结果表明:在其他条件一定时,从山苍子油中分离柠檬醛较优的蒸馏压力和蒸馏温度分别为0.15 kPa 和45 ℃,此

天然气分子筛干燥剂更换要求

1、打开吸附式干燥机设备底部法兰,把吸附罐内吸附剂卸出干净,再用吸尘器把底部粉尘和碎渣清理干净。2、检查吸附罐底部筛板下面丝网是否破损,破损就需要更换不锈钢40目或者60目丝网,最好采用双层不锈钢丝网。3、底部法兰安装好,测试密封情况是否漏气。4、打开顶部法兰,把分子筛从顶部法兰倒入吸附罐内,装填到

理化所团队发现分子靶向天然冰晶成核剂

  水结冰是自然界中普遍存在的现象,在相对较高的过冷度下,能够促进水相变的物质被称为冰晶成核剂。冰晶成核剂在气候调节(如人工降雪)、农业发展(促冻杀虫)、制冷(提高相变点以促进节能)、生物医学(强化杀伤作用)等领域均有广阔的应用前景。目前常用的冰晶成核剂通常包括两类,一类以无机材料为主,如碘化银(常

研究揭示天然免疫中caspase活化分子机理

  2月27日,中国科学院生物物理研究所王大成/丁璟珒研究组和北京生命科学研究所邵峰研究组合作,在国际学术期刊《细胞》在线发表题为Structural Mechanism for GSDMD Targeting by Autoprocessed Caspases in Pyroptosis 的研究论

《Cell》子刊:逆转蛋白质聚集的天然细胞机制

  你在平底锅里打一颗鸡蛋,只需几分钟蛋清就会从透明的粘液状态变成富有弹性的白色固体,蛋黄也慢慢变硬,一系列生理和化学变化导致鸡蛋内化学键断裂、蛋白质发生聚集和重塑,你得到了一颗不可逆的固态煎蛋。  从生鸡蛋到熟煎蛋容易,但是,从熟煎蛋到生鸡蛋却不可逆。特拉维夫大学(Tel Aviv Univers

质谱仪的质量标尺无法校准怎么解决

1.故障现象:调谐时, 高质量峰m/z 502、614不显示  产生故障的可能原因及排除方法:预四级杆短路,排除方法是将预四级杆拆下, 用氦气或氮气吹干。  校准和灵敏度的故障排除2.故障现象:质谱仪的质量标尺无法校准  产生故障的可能原因及排除方法:  a. 质谱仪调谐未达到佳状态,排除方法是重新

质谱仪的质量标尺无法校准问题分析

产生故障的可能原因及排除方法:a. 质谱仪调谐未达到最佳状态,排除方法是重新调谐质谱仪;b. 离子源温度过高或过低,排除方法是将离子源温度设在180~220℃;c. 空气泄漏,排除方法是检查空气峰m/z 28的高度, 若大于10%氦气峰m/z 4的高度,表明有空气泄漏,用注射器将丙酮滴在各接口处,通

研究为量子计算提供“标尺”和“量杯”

  中国科学技术大学郭光灿院士团队李传锋、陈耕等与复旦大学周游、意大利那不勒斯费德里克二世大学Alioscia Hamma等合作,首次提出了“注入魔术资源”和“潜在魔术资源”两个核心概念,如同为量子计算过程配备了精确的“标尺”和标准的“量杯”,揭示了量子计算优势的积累过程。相关成果日前发表于《物理评

土壤污染修复的“标尺”在哪里

  “怎么定义土壤污染?污染一定是和相应标准相比较得出的结论。反过来,既然污染了,治理、修复,或者风险管控到什么地步才是安全或者可接受的?”近日,在江苏南京召开的第二届污染场地(地块)治理修复紫金论坛上,中国科学院生态环境研究中心副研究员、易修复生态平台创始人黄锦楼发问。黄锦楼抛出的上述问题也引发了

洛氏硬度试验硬度标尺相关介绍

  洛氏硬度试验采用三种试验力,三种压头,它们共有9种组合,对应于洛氏硬度的9个标尺:HRA、HRB、HRC、HRD、HRE、HRF、HRG、HRH和HRK。这9个标尺的应用涵盖了几乎所有常用的金属材料。HRA 60kg载荷金刚石锥压入器;HRB 100kg载荷1/16"直径钢球压头;HRC 150

科技造就质量强国建设新标尺

  走进福建辅布司产业园生产车间,只见织机旁的高清摄像头格外醒目,它们连接着由该公司与华为联合推出的人工智能(AI)质检系统。该系统基于昇腾AI平台,每秒可处理60帧图像,能够清晰记录蕾丝花边的每一处细微纹理,并实时定位故障点位。  凭借这一能力,车间从过去的人工抽检升级为自动化100%全检,有效解

应用Chu美学标尺的牙冠延长术

美观的微笑是美和健康的重要标志,很多因素共同决定了微笑的整体美观性,其中与龈.牙复合体相关的“红白美学”是影响微笑的最主要因素之一。然而,在其所决定的美学范畴内有一类患者表现为牙冠短小及露龈笑,对微笑美观具有不同程度的影响。 牙冠延长术主要用于解决涉及前牙区的美学问题,例如:被动萌出延迟导致的临床牙

“最”榜单:2017年,这些创新技术让人印象深刻!

  CRISPR“大升级”  自诞生之际,“魔剪”CRISPR就一直深受实验室“热衷”。2017年,围绕它的研究除了优化器精准编辑技能之外,还大大拓宽了其应用范围,被赋予新的功能:  编辑RNA  由Broad研究所的张锋带领的研究团队将一种编辑RNA的酶融合到靶向RNA的Cas蛋白上,实现了对细胞

大连化物所团队研制出非天然辅酶的合成酶

  烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(Nicotinamide Adenine Dinucleotide, NAD)是生物体不可或缺的辅酶。调控NAD水平被广泛应用于设计细胞的性能,但由于NAD关联大量代谢反应,导致其调控策略的可预见性低。  近期,中国科学院大连化学物理研究所研究团队在非天然辅酶研究领域取得新

中科院大化所非天然辅酶研究取得新进展

   近日,中科院大连化物所生物技术部赵宗保研究员团队和薛松研究员团队合作,在非天然辅酶研究方面取得新进展,获得了系列偏好非天然辅酶的亚磷酸脱氢酶突变体,解析了它们与非天然辅酶复合物的结构,揭示了辅酶偏好性改变的分子机制。相关研究成果发表在ACS Catalysis上。  天然辅酶,例如吡啶核苷酸辅

Science:新方法让蛋白在非天然环境中保持活性

蛋白存在的问题是它们是非常挑剔的。将它们从它们的天然环境中移除,它们可能会降解。 为了正常地发挥功能,蛋白必须折叠成特定的结构,而且这种折叠通常需要其他蛋白的帮助。 为了克服这一挑战,来自美国加州大学伯克利分校 的Ting Xu教授及其团队分析了蛋白序列和表面的趋势,以便观察他们是否能够开发一种合

蛋白质截短试验_非放射性蛋白质截短试验

实验材料患者和正常人的保存于乙醇中的 RNA 或 DNA 样品试剂、试剂盒乙酸钠随机引物反转录试剂盒二硫苏糖醇4dNTP 混合液RNase 抑制剂特异性的 PCR 引物RNase H10 X PCR 缓冲液Taq 酶丙烯酰胺 双丙烯酰胺SDSTris • Cl过硫酸铵运行缓冲液电转缓冲液(冰预冷)甲

蛋白质氨基酸和非蛋白质氨基酸的区别

蛋白质氨基酸:即标准氨基酸,在蛋白质生物合成中,由专门的tRNA携带,直接参入到蛋白质分子之中,包括20种常见氨基酸以及2种不常见氨基酸。常见的20种氨基酸有:甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、甲硫氨酸(蛋氨酸)、脯氨酸、色氨酸、丝氨酸、酪氨酸、半胱氨酸、苯丙氨酸、天门冬酰胺、谷氨酰胺、苏氨

兆碱基的定义

兆碱基megabase (Mb)定义:DNA片段长度单位,相当于1百万个核苷,大约等于1M。