中科院动物所携手华大等机构构建全球首份多器官衰老时空图谱
11月5日凌晨,中国科学院动物研究所携手华大生命科学研究院、北京基因组研究所(国家生物信息中心),在全球顶尖学术期刊 《细胞》(Cell)上发表了最新研究成果,利用华大自主研发的“超广角百亿像素生命照相机”——时空组学技术,构建了全球首份多器官衰老时空图谱,增强了对衰老生物学机制的理解,找到了可用于衰老预警和评估的新型生物学标志物,并为进一步探索衰老的干预策略奠定了理论基础。 研究中,研究团队利用时空组学技术Stereo-seq对不同年龄小鼠的心脏、肝脏、脾脏、肺、小肠等9个器官进行了分析,最终形成了一张包含72个细胞类型的多器官衰老时空图谱。这些图谱不仅能“看到”不同细胞内基因的表达情况,还能精确定位每个细胞的位置,如同一部生命衰老的纪录片,展现了不同器官在不同年龄段的“模样”。 研究团队表示,通过多器官衰老时空图谱,研究人员可以如同“拍电影”般,清晰地记录下身体各个器官衰老的微观过程。 通过深入研究,研究团队提出了......阅读全文
科学家绘制脊髓损伤的分子时空图谱并发现新治疗靶点
由于成年哺乳动物的中枢神经系统再生能力非常有限,脊髓损伤 (SCI) 造成的伤害大多不可逆,往往导致永久性的运动、感觉和自主神经功能障碍。尽管SCI的病程发展可以持续数月至数年,但最主要、最剧烈的改变则发生在损伤后的数小时至数天内。因此,系统性地解析SCI在不同时间、不同损伤距离、不同解剖区域和
我国科学家发布大黄鱼全基因组图谱
由浙江海洋学院、上海交通大学、复旦大学等高校研究机构联合破译的大黄鱼全基因组图谱,日前在世界权威期刊——《自然》周刊发表。这是继半滑舌鳎之后,我国公布的第二个海水鱼类的基因组图谱,也是世界上第一个石首科鱼类基因组图谱,标志着我国海洋生物学的研究真正进入基因组时代。 自1985年大黄鱼人工养殖
蔬菜中心:绘成世界首张西瓜基因组序列图谱
我国是世界第一西瓜生产与消费大国,但是人们却始终未能从外到内了解它,直到2013年1月,国际学术顶级刊物《自然·遗传学》发表了世界首张西瓜基因组序列图谱(影响因子35.532),标志着人类成功破译了西瓜遗传“密码”。这项由蔬菜中心主任许勇的研究团队牵头进行的科研创新,为高效培育兼具优质、高产、抗
我国完成首部高原濒危物种全基因组序列图谱
12月25日,由青海大学和深圳华大基因研究院共同发起并承担的藏羚羊基因组序列图谱在青海大学医学院宣告绘制完成,这是世界上第一部绘制完成的高原濒危物种全基因组序列图谱,也是中国科学家对全球基因组科学的又一重大贡献。 藏羚羊是我国青藏高原特有的物种,其生存环境高寒、缺氧,自然条件极为严酷。在喜
最广泛的人类基因组相互作用图谱
最近,英国剑桥Babraham研究所和伦敦Francis Crick研究所的研究人员,开发并使用了一种新的技术,将基因组拼图中的点连接起来。就像连接点拼图,需要完成才能看到整幅图片,研究者的这项分析把称为启动子和增强子的调控因子连接起来,并指出了它们在小鼠和人类基因组中长距离内的物理相互作用。确
荷兰科研人员首次绘出女性个人基因组图谱
荷兰科研人员5月26日说,他们首次绘出女性的个人基因组图谱,这将有助于深入研究人的遗传多样性。 荷兰莱顿大学医学中心发表的一份声明说,科研人员已测定该中心一位女性临床遗传学家的基因组序列,她是基因组被完整测序的首位女性和首位欧洲人。 基因组是指包含在生物DNA(脱氧核糖核酸)中的全部遗传信息。此前科
多国科学家破解硬粒小麦全基因组图谱
近日,来自意大利、加拿大、德国等多国科研机构的科学家共同在Nature Genetics上发表了题为“Durum wheat genome highlights past domestication signatures and future improvement targets”的文章,绘制
中国首份个人基因组图谱将在1年内出炉
每个人的基因都能刻成盘? 采访人:记者 余建斌 点评人:浙江大学遗传与基因组医学中心主任 祁 鸣 来源:人民网-《人民日报》 事件 人民网综合消息诺贝尔奖获得者、被人称为“DNA之父”的吉姆·沃森得到了一份特殊奖品:一张含有组成他基因的30亿个DNA单位详细信息的光盘,颁奖仪式31
《自然—生物技术》:美教授“自绘”个人基因组图谱
斯蒂芬·夸克(Stephen Quake) 一台机器、3个人、5万美元,美国斯坦福大学教授斯蒂芬·夸克(Stephen Quake)最近用“自绘”个人基因组图谱的经历说明,这项“游戏”已不再是谁也玩不起的了。 斯坦福大学8月10日发表声明说,夸克在两名同事的帮助下,利用一台冰箱大
顶级实验室《Nature》发布表观基因组学图谱
基因组中表观遗传变化是能遗传的,近期来自Salk生物学研究所等处的一组研究人员完成了一项野生植物表观基因组学全范围内的研究分析,从中发现了这种修饰与遗传信息相互作用的共同模式。这一成果公布在3月7日Nature杂志在线版上。 文章通讯作者是Salk研究所的著名教授Joseph R. E
海南大学团队定义植物基因组学“终极参考图谱”
近日,记者从海南大学获悉,该校三亚南繁研究院陈飞教授团队首次构建了“分型端粒到端粒超级泛基因组”理论体系,实现了植物基因组从个体单倍型完整到群体遗传多样性全覆盖的技术跨越。相关成果发表在国际期刊《植物科学趋势》。植物基因组研究长期受制于参考基因组的局限——传统组装难以解析着丝粒、端粒等复杂区域,且无
NIH-340万美元资助癌症基因组图谱研究计划
美国国立卫生研究院于当地时间7月2日宣布,决定对八个单位(或个人)进行为期两年、总值340万美元的资助,以支持癌症基因组图谱研究计划(Cancer Genome Atlas pilot program)。 癌症基因组图谱计划是美国国立癌症研究所和美国国家人类基因组研究的合作项目,于2005年晚期,
首个山羊基因组图谱在《自然•生物技术》杂志发表
2012年12月24日,由中国科学院昆明动物研究所、深圳华大基因研究院等单位合作完成的首个山羊全基因组图谱在《自然•生物技术》(Nature Biotechnology)杂志在线发表。本研究采用新一代测序技术(NGS)与全基因组酶切图谱(Whole-genome mapping)技术相结
Cell绘制广泛的人类基因组互作图谱
来自欧洲分子生物学实验室(EMBL)、斯坦福大学的科学家们阐明了,我们的基因表达在DNA中受控的机制。发表在《细胞》(Cell)杂志上的这项新研究,将促成更好地了解某些遗传变异可以开启或关闭控制基因表达的调控元件,最终表现为个体特征和疾病易感性的机制。 这些变异存在于非直接负责编码基因,而是发
首个家鸡泛三维基因组图谱构建成功
鸡是如何从野生原鸡演化为如今的高产肉鸡或蛋鸡的?其背后的基因“开关”在哪里?近日,华南农业大学动物科学学院家禽遗传育种研究团队联合国内多家单位,成功构建了首个高分辨率家鸡泛三维基因组图谱。相关成果发表于《先进科学》(Advanced Science)。“该研究成果就像是一张高精度的‘立体导航图’,将
我国科学家完成甜橙基因组图谱找到甜橙起源
甜美又不上火的甜橙来源于柚作为母本和橘杂交,其后代再与橘杂交而形成的杂种。华中农业大学徐强博士等人26日发表在国际著名学术刊物《自然-遗传学》题为“甜橙基因组图谱”的研究论文,提出了甜橙起源这一新理论。 专家表示,甜橙基因组将在理论上为柑橘基因功能研究提供框架,也将在应用上为果实品质包括色
科学家成功绘制-首幅小麦基因组物理图谱
一个由法国、美国、澳大利亚等国科学家组成的研究小组日前为小麦的一个基因组绘制出了首幅物理图谱,这一成果将有助于科学家培育出更高产和抗旱的小麦新品种。 基因组物理图谱是指有关构成基因组的全部基因的排列和间距的信息,它是通过对构成基因组的DNA分子进行测定而绘制的。绘制物理图谱的目的是把有关基因的遗传
找到“广陈皮”效用线索-破译茶枝柑基因组图谱
茶枝柑,主要分布于广东新会等地,其果皮制干即为中药“广陈皮”,含有多种生物活性成分。多甲氧基黄酮是广陈皮中关键的药用成分,目前尚不清楚其生物合成的遗传基础及调控机制。5月11日,深圳华大生命科学研究院联合华南农业大学、中国药科大学、南京中医药大学,通过多组学技术破译了茶枝柑基因组的遗传图谱,揭示了多
首张拓扑异构酶II全基因组剪切图谱
DNA切割酶对基因结构调节起着关键作用。研究人员发现,它在导致癌症的(如白血病和实体瘤)易位(translocations)异常重排中表现活跃。 II型拓扑异构酶(type II topoisomerase, TOP2)通过断裂DNA双链磷酸二酯键,来更正DNA连环数,使细胞DNA正常转录、复
我国学者首次绘制一串红基因组图谱
北京市园林科学研究院21日对外称,由该研究院和北京林业大学合作共同完成了一串红高质量的基因组图谱绘制项目工作,这使我国成为世界上首个绘制出一串红基因组图谱的国家。图片来源于网络 唇形科是开花植物中的第六大科,包括约236个属,6900—7200个种类。而一串红则隶属唇形科鼠尾草属,其花色艳丽
中科院动物所携手华大等机构构建全球首份多器官衰老时空图谱
11月5日凌晨,中国科学院动物研究所携手华大生命科学研究院、北京基因组研究所(国家生物信息中心),在全球顶尖学术期刊 《细胞》(Cell)上发表了最新研究成果,利用华大自主研发的“超广角百亿像素生命照相机”——时空组学技术,构建了全球首份多器官衰老时空图谱,增强了对衰老生物学机制的理解,找到了可
武汉植物园等完成中国莲基因组框架图谱绘制
中科院武汉植物园与美国、澳大利亚科学家合作完成了对中国古代莲的基因组测序和分析,相关研究成果已于5月10日刊登在《基因组生物学》杂志上。 研究人员利用全基因组鸟枪测序法完成了对中国莲(Nelumbo nucifera)基因组的测序。结果显示,莲基因组大约有2.7万个基因,全长9.3亿个
人类基因组“primiRNA”剪切位点图谱绘制
人体的基因表达是一个复杂的过程,那么多的基因不可能都总是持续表达。指挥基因表达的功臣之中就包括几种RNA分子。MicroRNA(miRNA)是一类真核生物内源性的小分子单链RNA,它是一种古老的、生死攸关的基因调节因素,30-60%的哺乳动物蛋白质编码基因都受miRNA的调控(主要是基因沉默调控
日本研究人员首次成功绘制日本人基因组图谱
据日本共同社报道,日本理化学研究所基因组医科学研究中心日前通过新一代DNA测序仪成功绘制出首份日本人基因组图谱。该成果10月24日发表在美国《自然—遗传学》杂志网络版上。 DNA一共有4种碱基排列组合,人类大约有30亿对碱基对。新一代测序仪可将DNA进行极其精细的切片,对大量切片同时
科学家首次绘制小鼠全基因组沉默子图谱
近日,中国农业科学院农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队构建了小鼠全基因组沉默子图谱,阐明了其基本特征,并发现了影响细胞重编程效率的重要沉默子。相关研究成果发表在《先进科学》(Advanced Science)上。转录调控在生物体发育和细胞分化中至关重要,而沉默子作为关键的顺式调控元件,通过结合
罗氏454测序用于野生双峰驼基因组图谱绘制
中国及中亚细亚温带荒漠地区的骆驼均为双峰骆驼(Bactrian camel),中国的双峰驼集中分布于内蒙古西部、宁夏、新疆、甘肃的温带荒漠和荒漠草原区,占全国总驼数的95%。且中国尚有数量比大熊猫还少的世界珍稀濒危动物―野生双峰驼存在。内蒙古阿拉善盟是中国骆驼最多的地区,拥有双峰驼10万峰以
人类首张黄种人基因组图谱有望在深面世
人类第一张“黄种人基因组图谱”有望在深面世,并计划在今年高交会期间向全世界发布。目前,深圳华大基因研究院近百位科学家已进驻盐田。市区两级政府正着手将沙头角海山街道辖区的恩上村整体搬迁改造成“生物研发加速器”,作为该项目基地。 人们对基因工程技术应用于制药和医学治疗的信心在不断增强。2006年底,
我国绘制完成世界首个鹅全基因组序列图谱
6月3日,深圳华大基因研究院和浙江省农业科学院、象山县浙东白鹅研究所联合召开新闻发布会,宣布“鹅全基因组序列图谱绘制完成”。这是我国独立研究完成的全世界首个鹅全基因组序列图谱,这一研究成果对于揭示家鹅繁殖、抗逆、生长、肉质、羽色等性状的遗传基础,鹅的驯化、不同鹅种的生物学分类、中国家鹅
多样性增加281%,人类肠道菌群基因组图谱公布!
近两年来,以免疫检查点为药物靶点的免疫检查点抑制剂治疗癌症受到越来越多科研工作者的青睐。但是临床研究结果表明,许多癌症患者因接受免疫药物治疗而出现不同程度的免疫相关不良反应,最终出现不得不提前终止治疗的情况。 而寄居在人体内的肠道菌群可以影响免疫检查点抑制剂治疗癌症,能够极大地改善患者对该疗法
Lal-Teer畜牧公司联合华大基因成功绘制水牛基因组图谱
2014年1月24日,孟加拉Lal Teer畜牧科技公司(孟加拉Lal Teer种业科技公司的联营公司,以下简称"Lal Teer")与华大基因联合宣布水牛基因组图谱绘制完成。该项科研成果将为深入了解水牛这一物种的起源、驯化过程及其品种选育等奠定重要的遗传学基础。 水牛,也叫印度水牛,