中科院动物所携手华大等机构构建全球首份多器官衰老时空图谱
11月5日凌晨，中国科学院动物研究所携手华大生命科学研究院、北京基因组研究所（国家生物信息中心），在全球顶尖学术期刊 《细胞》（Cell）上发表了最新研究成果，利用华大自主研发的“超广角百亿像素生命照相机”——时空组学技术，构建了全球首份多器官衰老时空图谱，增强了对衰老生物学机制的理解，找到了可用于衰老预警和评估的新型生物学标志物，并为进一步探索衰老的干预策略奠定了理论基础。 研究中，研究团队利用时空组学技术Stereo-seq对不同年龄小鼠的心脏、肝脏、脾脏、肺、小肠等9个器官进行了分析，最终形成了一张包含72个细胞类型的多器官衰老时空图谱。这些图谱不仅能“看到”不同细胞内基因的表达情况，还能精确定位每个细胞的位置，如同一部生命衰老的纪录片，展现了不同器官在不同年龄段的“模样”。 研究团队表示，通过多器官衰老时空图谱，研究人员可以如同“拍电影”般，清晰地记录下身体各个器官衰老的微观过程。 通过深入研究，研究团队提出了......阅读全文
小鼠肺发育时空分子图谱绘制成功
近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员彭广敦团队同合作者运用高通量空间转录组技术，绘制出小鼠胚胎期主要阶段到出生后P0天的时空分子图谱，从而揭示了肺发育过程中的复杂调控机制。相关成果发表于《科学通报》（Science Bulletin）。哺乳动物肺的功能发育是一个复杂的过程，它依赖于多种细胞
最大动物基因组图谱——南极磷虾基因组图谱破译
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495141.shtm ? Cell官网截图。黄海水产研究所供图 日前，由中国水产科学研究院黄海水产研究所联合青岛华大基因研究院、德国阿尔弗雷德?魏格纳研究所、澳大利亚联邦科学
人脑多区域时空发育转录组图谱获解析
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514996.shtm
人脑多区域时空发育转录组图谱获解析
科学家通过单细胞和时空转录组研究，首次解析迄今为止跨时间点最广（GW6-GW23）、面积最大（最大4cm x 3cm）的人脑多区域时空发育转录组图谱，为解码人脑发育及区域特化研究提供了新见解。日前，相关研究成果发表在《细胞》上。 脑是人类最复杂和神秘的器官。解剖学上，脑可以被划分为不同的区域，
科学家解析人脑发育时空图谱及规律
作为人类最复杂的器官，脑在解剖学上被划分为不同的区域，包括端脑【主要由新皮层（Cor）构成】、间脑（Dien）、中脑（Mid）和小脑（Cere）等。这些不同脑区具有特殊的输入输出连接，发挥不同的功能。在人脑发育过程中，通过内在基因程序产生了复杂的细胞类型。在这些细胞类型中，有些已有明确的特征，但
Nature公布大麦基因组图谱
大麦是世界上最重要的粮食作物之一，17日Nature公布了目前为止最完善的大麦基因组测序图谱。这项由美国农业部主导的大工程，在德国、日本、芬兰、澳大利亚、英国、美国和中国科学家们的共同努力下，历经六年终于取得了重大进展。大麦基因组图谱将成为人们提高大麦产量、增强大麦抗虫抗病能力、增加大麦营养价值
我国科学家绘制出脊髓损伤时空动态图谱
7月18日，《发育细胞》（Developmental Cell）在线发表了中国科学院上海有机化学研究所研究员方燕姗团队、中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员彭广敦团队和暨南大学副研究员李昂团队合作最新成果。他们成功绘制出脊髓损伤后原位基因表达和细胞互作的时空动态图谱，为脊髓损伤的治疗提供了新视角
科学家成功绘制鼠脑出血后时空分子图谱
脑出血，指非外伤引起的大脑血管破裂造成血液流出，是病死率最高的脑血管疾病，大多数患者无法完全恢复功能独立。由于脑出血的病理机制复杂且缺乏精准干预靶点，至今尚无特异性治疗手段。记者从华大生命科学研究院了解到，近日，该院联合郑州大学、瑞典卡罗林斯卡学院及哥德堡大学，利用时空组学技术Stereo-seq，
高清肝脏时空图谱出炉！揭示肝再生机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/4/521203.shtm在过度熬夜、吸烟喝酒、高糖高盐饮食等不良习惯日渐常态化的现代生活中，肝脏疾病也呈现出日益严峻的态势。作为人体的“化工厂”，肝脏除了解毒功能外，还具备代谢、合成、消化、免疫等多种功能。肝
我研究团队主导构建小鼠肝脏高精度时空图谱
4月16日，深圳华大生命科学研究院研究团队利用自研时空组学技术和单细胞转录组测序技术，构建出小鼠肝脏高精度时空图谱。这一图谱，分别揭示小鼠肝脏稳态的空间分子特征，以及肝部分切除、胆汁淤积损伤与修复过程中的复杂分子机制。两项研究以不同角度解析了肝脏损伤与再生复杂机制，有望为肝脏疾病治疗、肝脏再生与移植
我国科学家绘制出脊髓损伤时空动态图谱
7月18日，《发育细胞》（Developmental Cell）在线发表了中国科学院上海有机化学研究所研究员方燕姗团队、中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员彭广敦团队和暨南大学副研究员李昂团队合作最新成果。他们成功绘制出脊髓损伤后原位基因表达和细胞互作的时空动态图谱，为脊髓损伤的治疗提供了新
基因组图谱的方法和意义
中文名称基因组图谱英文名称genomic map定 义展示一种生物全基因组结构的图谱。按建立图谱的研究目的方法和精细程度，可以有不同的形式，包括以遗传学方法建立的遗传连锁图谱，按距离绘出基因位置分布的物理图谱，经测定核酸序列建立的核苷酸序列图谱，以及标记出可表达序列的转录图谱等。应用学科生物化学与
首个家鸡基因组图谱绘制完成
西南大学教授徐洛浩课题组以中国特有家鸡品系胡须鸡为材料，在国际上率先绘制出首个家鸡全基因组图谱。2月13日，相关研究成果以《家鸡基因组完成图的演化分析》为题，发表在美国《国家科学院院刊》上。这是继去年人类基因组完成图公布以来，首个发表的脊椎动物基因组完成图，也是基因组完成图谱绘制技术首次在经济动物中
揭秘：帝王蟹的基因组图谱
科学家成功获得高质量帝王蟹基因组图谱 帝王蟹 唐伯平供图 帝王蟹基因组染色体图谱 唐伯平供图 帝王蟹和其他泛甲壳动物的系统演化关系 唐伯平供图 近日，《分子生态资源》发表了首个歪尾类螃蟹的高质量基因组图谱，即一种重要经济蟹类蓝帝王蟹（Paralithodes platypus）的基因组
首次绘制小麦表观基因组图谱
最近，英国利物浦大学的科学家们，对小麦中调节基因活性的遗传性分子变化，进行了首次全基因组范围的调查，这可能成为提高作物育种技术的一种新工具。相关研究结果发表在最新一期的《Genome Biology》。延伸阅读：权威期刊发布首个小麦单体型图谱。 表观遗传标记是一种化学标签，将自己附着在DNA上
脑也能再生？《科学》封面现首个脑再生时空图谱
2022年9月2日，华大生命科学研究院主导完成的首个蝾螈脑再生时空图谱以背靠背封面文章的形式发表于国际顶级学术期刊《科学》，这也是全球首个脑再生时空图谱。 研究团队基于华大时空组学Stereo-seq技术，系统解析并比较了蝾螈脑发育和再生过程，找到了蝾螈脑再生过程中的关键神经干细胞亚群，描绘了此
首个棉花纤维起始发育单细胞时空组学图谱发布
近日，中国农业科学院棉花研究所乡村振兴科技创新团队牵头构建了首个结合单细胞转录组、空间转录组及空间代谢组的棉花纤维起始发育图谱。利用该图谱可以识别关键基因的表达模式及其与代谢途径的关系，深入剖析纤维发育过程中的核心调控机制。相关研究成果发表在《自然通讯（Nature Communications）》
“透视”肝脏：中国科学家构建小鼠肝脏高精度时空图谱
·首次成功构建了小鼠肝脏的高精度时空图谱，探索了肝脏的空间分子特征与损伤修复中的分子机制，为未来肝脏疾病的治疗提供了新思路。在所有的器官中，肝脏可能是最“神秘”的一个。它不仅是最大的实体器官，包含最多的血液，具备器官中最强的再生能力，还担负着代谢、合成、消化、免疫等多种功能。古代人曾认为肝代表着欲望
Nature：中科院团队合作获得小鼠胚胎早期时空转录图谱
在小鼠胚胎的植入后发育期间，早期外胚层中的内细胞团的后代从幼稚状态转变为多能状态。同时，形成胚层并指定细胞谱系，从而建立胚胎发生的蓝图。命运映射和谱系分析研究表明，胚胎层不同区域的细胞在原肠胚形成期间获得位置特异性细胞命运。在基本身体计划形成之前，细胞命运的区域化-其机制有助于理解胚胎编程和基于
玉米基因组更详细图谱出炉
美国研究人员12日在《自然》杂志网络版上发表论文称，他们利用新一代测序技术对玉米自交系B73进行测序，得到了新的、更详细的基因组图谱。研究显示，玉米具有良好的表型可塑性，不同品系玉米的基因组差异明显。这意味着在全球气候环境变化不断加剧的情况下，玉米仍有巨大的发展空间。 玉米是生物学研究中的重要
玉米基因组更详细图谱出炉
美国研究人员12日在《自然》杂志网络版上发表论文称，他们利用新一代测序技术对玉米自交系B73进行测序，得到了新的、更详细的基因组图谱。研究显示，玉米具有良好的表型可塑性，不同品系玉米的基因组差异明显。这意味着在全球气候环境变化不断加剧的情况下，玉米仍有巨大的发展空间。 玉米是生物学研究中的重要
基因组物理图谱的主要构架途径
基因组物理图谱的构建不需要经过减数分裂的世代群体，可直接利用DNA分子分析，主要有以下三种构建途径：限制性酶图谱。利用限制性内切酶构建图谱，对于DNA分子长度在50kb以下的片段，一般没有什么困难。而对于大于50kb的DNA分子，可选用稀有切点的内切酶酶切DNA。（1）用识别较多核苷酸的内切酶，如N
铁树“开花”：苏铁喜获完整基因组图谱
苏铁基因组图谱研究由来自22个科研机构的65位科学家联合完成。 苏铁目系统发育树支持现存苏铁是在经历大量灭绝以后，几次辐射演化的后代。如今苏铁有2科10属。（刘阳供图） 也许你不熟悉苏铁类植物，但你一定听说过“铁树开花”这个成语，比喻事情很难实现。相传因受苏东坡青睐，铁树得名“苏铁”。作为现存最
小须鲸全基因组图谱获破译
11月25日，韩国海洋科学技术研究所、深圳华大基因研究院等宣布成功破译了小须鲸全基因组图谱，并对鲸类独特生理习性的遗传学机制进行了分析。相关成果在线发表于《自然—遗传学》杂志。 人们一直痴迷于海洋生物是如何演化为陆生生物的。鲸类的进化却反其道而行之，由陆生向水生演化，和陆生偶蹄动物如牛、猪等
老鼠基因组单体型图谱出炉
美国的研究人员希望通过对15只常用于生物医药研究的小鼠的DNA进行研究来帮助科研人员确定出与环境疾病敏感性相关的基因。目前这些数据被存放在了基因变异数据目录之下，即小鼠基因组单体型图谱（将染色体分隔成许多小的片段），从而帮助研究人员找出小鼠中影响健康和疾病的基因和遗传变异。这个单体型图谱公布在7月2
Scientific－Reports：创建首个全面基因组图谱
近日，澳大利亚加文医学研究所的研究人揭示身体不同部位脂肪积聚所造成的伤害的驱动因素。他们的一项新研究比较了皮肤下的脂肪细胞和腹部内的有害脂肪，创建了第一个全面的基因组图谱。该图谱揭示了在细胞发育早期独特的特征，不同类型的脂肪似乎“硬捆绑”（hard-wire）在一起。该研究发表于Scientif
OPGEN全基因组图谱应用系列——鞭虫全基因组测序
鞭虫是一种常见的土壤传播寄生虫，地理分布广，感染率高，寄生于人体盲肠，导致人体慢性感染，对人类危害巨大。鞭虫的全基因组测序研究由著名的桑格研究院（Wellcome Trust Sanger Institute）完成，发表在世界顶级期刊《Nature Genetics》上。该研究通过对2种不同
全球首份！中科院携手华大构建多器官衰老时空图谱
中国科学院动物研究所携手华大生命科学研究院、北京基因组研究所(国家生物信息中心)，于11月5日在全球顶尖学术期刊《细胞》(Cell)上发表了最新研究成果，该研究利用华大自主研发的“超广角百亿像素生命照相机”——时空组学技术，构建了全球首份多器官衰老时空图谱。 研究中，研究团队利用时空组学技术S
科学家建立首个人类肢体发育的单细胞时空图谱
中山大学中山医学院教授张宏波团队与英国Sanger 研究所教授Sarah Teichmann团队合作，研究建立了首个人类肢体发育的单细胞时空图谱并解析关键调控机制。12月6日，相关成果在线发表于Nature。 “我们基于单细胞转录组学和空间转录组学技术建立的首个人类肢体发育单细胞图谱，解析了从
首个棉花泛基因组图谱助力分子育种
近日，华中农业大学棉花遗传改良团队发表了题为“Cotton pan-genome retrieves the lost sequences and genes during domestication and selection”的研究论文，公布了目前为止变异类型最丰富的棉花遗传变异数据集。文章