中科院团队单细胞分泌组分析新方法研究取得新进展

单细胞基因组测序测的是什么dna还是rna

深度测序的read指的是高通量中双端测序得到的一条条序列，如测序前将dna打成小的片段，测序是从这个片段的两端测的，即会产生两条reads。至于是mapping到基因组还是dna基因组，这要看你做什么了，一般基因组是指生物个体的全基因组。并不是所有测序都要rna反转，这其实要看你想做什么分析，如做转

Nature论述：单细胞基因组学揭开“免疫新世界”

　　人类对生命的好奇，从来没有减退。一个多世纪以来，科学家们一直试图解析构成我们机体的成千上万亿个细胞，从一米长的神经元到8微米宽的红细胞。他们希望从中找到解析重要生理、病理过程，挖掘重要的细胞类型和信号通路。　　但是，过去几十年，包括荧光抗体标记技术、DNA和RNA测序技术等在内的研究工具却不能解

科学家开发单细胞全转录组测序新技术

　　北京大学生物动态光学成像中心黄岩谊、汤富酬课题组在《美国科学院院刊》（PNAS）上发表题为“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的论文。该研究利用微流控芯片技术实现了高质量单细胞的全转录组测序样品准备，全面提高了单细胞全

IsoPlexis单细胞蛋白质组学检测服务即将启动啦！

　　重磅消息来袭　　你想要的单细胞　　蛋白质组学检测服务即将启动啦！　　单细胞蛋白质检测技术　　传统的细胞分析通常包含数千个或更多的细胞，提供了一个总体平均值，掩盖了重要的细胞异质性，尤其是一些发挥重要作用的稀有细胞群体的意义，比如免疫细胞、肿瘤细胞、干细胞等均展现出广泛的异质性。　　当前，随着单细

新型微流控芯片可提高单细胞转录组测序效率

近日，中国科学院深圳先进技术研究院医工所微纳系统与仿生医学研究中心研究员陈艳和南加州大学教授钟江帆合作，在针对稀有细胞样本的单细胞测序技术方面取得新进展。相关研究成果以Improving single-cell tranome sequencing efficiency with a microfl

新型CUT＆RUN技术实现单细胞全基因组定位

　　在一项新的突破性研究中，来自美国匹兹堡大学和马萨诸塞大学医学院的研究人员对一种称为CUT&RUN（cleavage under targets and release using nuclease）的方法进行改进，使得在使用少量细胞（包括单细胞和单个植入前胚胎）的情形下，它适合用来研究转录因子和

研究成果：灵长类海马衰老的单细胞转录组图谱绘制

　　海马体作为脑的重要组成部分，在学习和记忆中发挥重要作用。随着年龄增长，海马功能逐渐退化，导致认知功能的减退以及多种人类神经退行性疾病发生。由于海马结构复杂，细胞组成具有高度异质性，传统研究技术难以精确揭示海马衰老过程中不同细胞类型的衰老规律及分子调控网络。此外，由于伦理及样本来源的限制，不同年龄

单细胞转录组揭秘玉米根系对热胁迫的响应机制

近日，中国农业科学院生物技术研究所玉米功能基因组创新团队首次在单细胞水平解析了玉米根系细胞对热胁迫的特异性响应机制，揭示了热胁迫下植物根系的细胞异质性、根系类型的差异和分化轨迹，鉴定了单双子叶植物响应热胁迫的关键核心基因，相关研究成果发表于《自然—通讯》（Nature Communications）

首个棉花纤维起始发育单细胞时空组学图谱发布

近日，中国农业科学院棉花研究所乡村振兴科技创新团队牵头构建了首个结合单细胞转录组、空间转录组及空间代谢组的棉花纤维起始发育图谱。利用该图谱可以识别关键基因的表达模式及其与代谢途径的关系，深入剖析纤维发育过程中的核心调控机制。相关研究成果发表在《自然通讯（Nature Communications）》

单细胞基因组学：通往个体化医疗之门

　　随着第二代测序技术的普及，单细胞测序迎来了迅猛发展。　　近日，南方科技大学生物学系副教授贺建奎在美国冷泉港参加了单细胞分析会议后，在科学网博客里写道：“这是一个非常令人激动的前沿学术会议，我深深地体会到了单细胞基因组学时代的来临。”　　他对《中国科学报》表示：“单细胞基因测序技术的突破，只是开了

中科院团队单细胞分泌组分析新方法研究取得新进展

近日，中科院大连化物所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组（1810组）张丽华研究员和袁辉明研究员团队在单细胞分泌组分析新方法研究中取得新进展，通过结合非天然氨基酸代谢标记、基于点击化学的选择性富集、nanoLC-MS/MS等技术，实现了单细胞分泌组的全景式分析，为在单细胞水平深入研究细胞分泌

欢迎加入“微流控技术助推单细胞组学研究”网络讲座

基于拉曼组的单细胞快检技术可同时定量检测

　　通过光合作用固定的二氧化碳与太阳能在生物体内有三种主要的存储形式：多糖、油脂和蛋白质，共同构成了生物碳存储与生物能源产业的物质基础。目前，对细胞中这三类高含能储碳分子的识别、表征和定量极为繁琐，通常难以在单个细胞精度测量，这限制了光合固碳细胞工厂的筛选与改造效率。中国科学院青岛生物能源与过程研究

实用技巧二——单细胞转录组高级分析之细胞谱系分析

　　基于单细胞转录组数据的细胞轨迹分析常见形式有细胞变化轨迹分析和细胞谱系分析，在上一篇中，我们详细介绍了常规拟时间序列分析的相关内容（具体内容查看链接）。在这里，我们主要就细胞谱系分析进行介绍和解读。 　　细胞谱系分析，最简明的理解就是细胞领域的进化树，通常指的是某类祖源细胞，在特定条件下，有多

拉曼介导靶向单细胞基因组原创技术研发成功

 　单细胞精度的海洋微生物组功能靶向性拉曼分选与测序技术（scRACS-Seq）  刘阳供图　　海洋是地球上最大的活跃碳库，海洋微生物在全球碳循环中起着至关重要的作用，然而由于大部分海洋微生物尚难以培养、原位代谢功能难以测量等技术瓶颈，业界对于海洋微生物光合固碳的原位功能机制等重要问题，仍然存在争议

实用技巧二——单细胞转录组高级分析之细胞谱系分析

　　基于单细胞转录组数据的细胞轨迹分析常见形式有细胞变化轨迹分析和细胞谱系分析，在上一篇中，我们详细介绍了常规拟时间序列分析的相关内容（具体内容查看链接）。在这里，我们主要就细胞谱系分析进行介绍和解读。 　　细胞谱系分析，最简明的理解就是细胞领域的进化树，通常指的是某类祖源细胞，在特定条件下，有多

流形学习在单细胞组学数据分析中的运用

　　以10x Genomics为代表的单细胞组学检测技术的发展，为我们从细胞层面去理解生命体的发育过程，疾病发生和发展过程提供了重要的手段。以单细胞转录组(scRNA-Seq)为例，我们可以发现，单细胞组学数据具有横向细胞数量巨大，纵向数据分布稀疏的特点。因此，针对单细胞数据，从分析的角度提出了巨大

流形学习在单细胞组学数据分析中的运用

以10x Genomics为代表的单细胞组学检测技术的发展，为我们从细胞层面去理解生命体的发育过程，疾病发生和发展过程提供了重要的手段。以单细胞转录组(scRNA-Seq)为例，我们可以发现，单细胞组学数据具有横向细胞数量巨大，纵向数据分布稀疏的特点。因此，针对单细胞数据，从分析的角度提出了巨大

流形学习在单细胞组学数据分析中的运用

　　以10x Genomics为代表的单细胞组学检测技术的发展，为我们从细胞层面去理解生命体的发育过程，疾病发生和发展过程提供了重要的手段。以单细胞转录组(scRNA-Seq)为例，我们可以发现，单细胞组学数据具有横向细胞数量巨大，纵向数据分布稀疏的特点。因此，针对单细胞数据，从分析的角度提出了巨大

第二届单细胞技术及组学应用发展大会

议程揭晓，亮点荟萃 | 第二届单细胞技术及组学应用发展大会聚势来袭！（文末领取限量免费入场券）2023年5月 19-20日，第二届单细胞技术及组学应用发展大会将在上海虹桥绿地铂瑞酒店盛大召开，大会以“聚焦技术前沿，加速科研转化”为主题，邀请众多单细胞及组学领域的科学家、代表性企业展示单细胞及多组学技

第二届单细胞技术及组学应用发展大会

专场早知道！单细胞分析迈入多组学时代，掀起单细胞多组学研究新革命！       大量的多组学分析，如基因组、转录组和蛋白质基因组学分析，已被证明有利于加强对细胞事件的全面了解。这一优势促进了单细胞多组学分析的发展。近年来出现了一些前沿的单细胞多组学技术，并掀起了一场新的研究革命！       今天，

科学家发表跨物种小脑皮层单细胞空间转录组图谱

9月27日，《科学》（Science）在线发表了题为Cross-species single-cell spatial transcriptomic atlases of the cerebellar cortex的研究论文。该成果由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心联合杭州华大生命科学研究院、

Nature子刊发布单细胞转录组开创性研究成果

　　来自苏黎世大学的生物学家们开发出了一种可在单细胞中显像基因活性的新方法。这种方法如此的高效，从而使得研究人员第一次在1万个人类单细胞中平行研究了 1000种基因，揭示出基因的活性和生成的转录分子的空间结构在单细胞之间存在显著差异。这一新方法可广泛应用于基础研究和医学诊断等领域。 　　当细胞

单细胞蛋白质组学：让细胞个体研究更加精细

    细胞是生命活动的基本单元。对细胞的精确认知是理解细胞在生理和病理过程中功能的先决条件。    在组织、器官或个体中，细胞具有非常大的异质性，而传统的研究手段针对大量细胞进行分析，得到的是大量细胞的平均结果，无法区分不同细胞个体对于大量样品结果的具体贡献值，从而忽视或掩盖了单细胞的个体差异，不

拉曼介导靶向单细胞基因组原创技术研发成功

  　单细胞精度的海洋微生物组功能靶向性拉曼分选与测序技术（scRACS-Seq）  刘阳供图 　　海洋是地球上最大的活跃碳库，海洋微生物在全球碳循环中起着至关重要的作用，然而由于大部分海洋微生物尚难以培养、原位代谢功能难以测量等技术瓶颈，业界对于海洋微生物光合固碳的原位功能机制等重要

单细胞转录组测序（scRNAseq）的十个问答解惑

　　高通量组学研究已经发展了快20年，从最开始的基因芯片到二代测序，从编码基因到lncRNA，circRNA，从三代测序的出现到单细胞组学研究的火热，相信在这个领域中共事的小伙伴们都深有感触。大家都知道高通量单细胞测序现在很火，但是不是所有的研究都适用，是不是所有的样本都能进行单细胞测序呢？本期小编

安诺开年力作：单细胞转录组测序登陆Nature子刊

　　X染色体失活（XCI）是指雌性哺乳类细胞中，两条X染色体的其中之一失去活性的现象，过程中X染色体会被包装成异染色质，进而因功能受抑制而沉默化。Xist RNA是能引发X染色体沉默的长片段ncRNA，尽管Xist对XCI是必要的，但其对胚胎植入前的印记XCI的精确作用尚存争议。近日，安诺优达与法国

单细胞基因组测序如何实现：从实验到分析，步步解析

　　随着生命科学研究的微观化，基于细胞群体的研究方法已不适用于某些研究领域（如肿瘤异质性、早期胚胎发育等）。单细胞基因组测序通过在单个细胞水平上进行测序，解决了用组织样本无法获得不同细胞间的异质性信息或样本量太少无法进行常规测序的难题，为科学家研究单个细胞的行为、机制等提供了新的方向。　　【应用概览

单细胞组学解码泛癌肿瘤微环境中的T细胞

T细胞是最关键的抗肿瘤免疫细胞。肿瘤微环境中存在“肿瘤浸润T细胞”亚群，能够对肿瘤抗原产生反应，肩负着清除肿瘤细胞的重任，也是摧毁癌细胞的“主力军”。然而，随着肿瘤发展，这些英勇的“战士”常常陷入功能失调状态，“战斗力”大幅下降，被科学家称为“T细胞耗竭”。越来越多的证据表明，不同癌症的肿瘤微环境对

利用单细胞空间转录组揭示猕猴大脑皮层的细胞类型

　　阐明大脑皮层的细胞类型组成对于理解大脑结构和功能至关重要。中国科学院脑智卓越中心利用单细胞空间转录组揭示猕猴皮层的细胞类型。该研究成果于近日发表在《Cell》杂志上，题为：Single-cell spatial transcriptome reveals cell-type organizati