NatureMethods|单细胞多模态测序的未来:UDAseq如何引领新革命?
近年来,单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)在揭示复杂生物系统和探索遗传学及临床研究中取得了突破性进展。然而,仅依赖单一的转录组信息往往难以区分分子相似但功能差异显著的细胞类别。因此,融合多种模态信息的单细胞测序技术逐渐成为研究热点,通过同时获取单个细胞的多维数据,研究人员能够更全面地解析细胞状态及其功能互作。然而,目前大多数多模态单细胞测序技术成本高昂、通量有限,难以大规模应用,尤其在临床样本分析和自动化处理方面存在诸多限制。为了解决上述难题,1月20日Nature Methods的研究报道“UDA-seq: universal droplet microfluidics-based combinatorial indexing for massive-scale multimodal single-cell sequencing”,研究人员开发了一种基于微液滴技术的组合标记方法——UDA-seq(Universal D......阅读全文
单细胞培养技术的概念
单细胞培养(single cell culture)是指从植物器官、愈伤组织或悬浮培养物中游离出单个细胞,在无菌条件下,进行体外生长、发育的技术。人们分离和培养植物单细胞的设想和实践都比较早,但成功地进行单细胞培养是随着更有效的培养基的发展以及从愈伤组织悬浮培养物分离单细胞的专门技术的建立才实现的。
简述单细胞蛋白的相关物质
单细胞蛋白所含的营养物质极为丰富。其中,蛋白质含量高达40%~80%,比大豆高10%~20%,比肉、鱼、奶酪高20%以上;氨基酸的组成较为齐全,含有人体必需的8种氨基酸,尤其是谷物中含量较少的赖氨酸。一般成年人每天食用10~15 g干酵母,就能满足对氨基酸的需要量。单细胞蛋白中还含有多种维生素、
关于不同单细胞蛋白的介绍
1、单细胞蛋白—酵母蛋白 真菌中的酵母在食品加工中应用较早,包括酿造、烘烤等食品。酵母中蛋白质的含量超过了干重的一半,但相对缺乏含硫氨基酸。另外,由于酵母中含有较高量的核酸,若摄入过量的酵母蛋白则会造成血液的尿酸水平升高,引起机体的代谢紊乱。 2、单细胞蛋白—细菌蛋白 细菌蛋白的生产一般是
单细胞技术分类及应用(一)
2019年10月22日,Biogen与日本Eisai宣布,经与FDA协商,计划于2020年初向FDA提交Aducanumab治疗阿尔兹海默症(AD)的上市申请。如果获批,Aducanumab将成为首个逆转疾病进展的AD药物。从技术角度看,Aducanumab也将有可能成为首个单B细胞测序来源的抗体药
Namocell单细胞铺板基本工作原理
单细胞铺板新选择传统的细胞铺板一般采用手动的有限稀释法来进行,这种方法在需要的操作简单,只需要普通的排枪就能实现,但是效果却很不理想。主要体现在:一致性差,有效孔比例低下,耗费时间等。近年来,单抗药物的开发领域又被推上了一个新的高度,越来越多的公司都纷纷投入到这个热潮当中,随之而来的相关法规的要求也
单细胞蛋白的优点有哪些?
单细胞蛋白具有以下优点: 第一、生产效率高,比动植物高成千上万倍,这主要是因为微生物的生长繁殖速率快。 第二、生产原料来源广,一般有以下几类:①农业废物、废水,如秸秆、蔗渣、甜菜渣、木屑等含纤维素的废料及农林产品的加工废水;②工业废物、废水,如食品、发酵工业中排出的含糖有机废水、亚硫酸纸浆废
单细胞分析技术的应用前景
单细胞分析技术具有广阔而令人振奋的应用前景:在医学领域:疾病的早期诊断:能够在疾病症状出现之前检测到细胞层面的细微变化,实现超早期诊断。例如,在癌症的萌芽阶段,识别出具有恶变倾向的单个细胞,大幅提高患者的生存率。精准医疗:根据患者肿瘤细胞的单细胞特征,为其定制个性化的治疗方案,包括选择最有效的药物和
单细胞蛋白质的优点
从单细胞微生物中提取出的蛋白。由于微生物繁殖速度快,原料要求低(包括农林副产物及废料,食品加工后的废物、副产品,石油衍生原料,厌氧废物处理过程中产生的生物质副产品等),营养价值高(含有碳水化合物、脂肪、维生素和矿物质等多种营养成分),是人类和动物获得蛋白质的手段之一。可制取蛋白质的微生物,包括含
单细胞分析技术的应用前景
单细胞分析技术具有广阔而令人振奋的应用前景,主要体现在以下几个重要方面:癌症研究与治疗:肿瘤异质性分析:能够揭示肿瘤内部不同细胞的基因表达、突变和细胞周期状态等的差异,帮助理解肿瘤的发生、发展、转移机制以及耐药性的产生。精准治疗:指导个性化的癌症治疗方案,例如确定对特定药物敏感的肿瘤细胞亚群,从而提
单细胞的概念及研究意义
单细胞是指单个的细胞,它是生物体结构和功能的基本单位。单细胞的研究具有重要意义:在技术层面,单细胞分析技术包括单细胞测序等,能够揭示单个细胞的基因表达、蛋白质组学、代谢组学等信息。在生物学层面:细胞异质性研究:可以帮助了解细胞之间的差异,发现新的细胞类型和细胞状态。发育生物学:追踪细胞在发育过程中的
单细胞蛋白的简介和分类
单细胞蛋白,也叫微生物蛋白,它是用许多工农业废料及石油废料人工培养的微生物菌体。因而,单细胞蛋白不是一种纯蛋白质,而是由蛋白质、脂肪、碳水化合物、核酸及不是蛋白质的含氮化合物、维生素和无机化合物等混合物组成的细胞质团。单细胞蛋白中重要的是酵母蛋白、细菌蛋白和藻类蛋白,它们的化学组成中一般以蛋白质
单细胞生物的大智慧
地球上绝大多数物种是单细胞生物。它们大多隐居在这个星球不为人知的角落里,籍籍无名。但生命是如此的奇妙,总会有一些看似简单的生物,向我们展示着它们无与伦比的能力,一种生命的力量。有的微生物十分强壮;有的微生物能够一睡万年;有的微生物则可在极端环境中茁壮成长,尽管其他大多数生命在这种环境下会刹那间凋
单细胞测序技术的技术特点
单细胞测序技术是一种在单个细胞水平上对基因组、转录组、表观遗传组等进行高通量测序分析的技术。 它具有以下几个重要特点和优势: 1. 揭示细胞异质性:能够发现细胞群体中不同细胞之间的细微差异,识别罕见细胞类型和细胞的不同状态。 2. 深入了解细胞发育和分化:追踪细胞从干细胞到成熟细胞的发育轨迹,揭
单细胞技术分类及应用(二)
什么是OEP呢?OEP的前身是2018年诺贝尔物理学奖获得者之一的Ashkin发明的Optical Tweeszer(OET)光镊技术,其原理是利用单个激光束通过高倍的显微物镜聚焦形成光阱,微观粒子受光压而束缚在光阱处,使用皮牛级别的力操纵和移动陷入光阱的微观粒子。这项技术在生物学上为单细胞
单细胞在医学领域的应用
单细胞在医学领域有着广泛而重要的应用,包括但不限于以下几个方面: 1. 疾病诊断 - 肿瘤诊断:通过分析肿瘤组织中的单细胞,可以更精确地了解肿瘤细胞的异质性,区分不同亚型的肿瘤细胞,有助于肿瘤的早期诊断、分型和预后评估。例如,在乳腺癌中,单细胞分析可以识别出具有不同转移潜能的肿瘤细胞。
单细胞悬液制备方法介绍
01取样→预处理 取样是原代单细胞悬液制备非常重要的一步,其质量会直接影响到后续处理效果。 操作时,首先根据不同实验需求麻醉或处死动物后进行消毒、固定并切开相应位置皮肤暴露目的组织。 其次操作过程中有以下几点也需要注意: 严格无菌操作,快速处理; 针对不同组织类型控制环境温度; 保证
单细胞分析揭示癌症异质性
2013年度基因组生物学大会(The Biology Of Genomes 2013)于5月7日晚在美国纽约冷泉港实验室召开。这是基因组学领域最大的会议之一,吸引了多个著名研究所的大牛参加。会议主题包括高通量基因组学和遗传学、复杂性状的遗传学、功能和癌症基因组学、计算基因组学、进化基因组学以
Nature-methods发布单细胞测序新技术
来自瑞典Ludwig癌症研究所及Karolinska研究所的研究人员,在最新一期(9月22日)的《自然方法》(Nature Methods)杂志上报告了一项获得重大改良的新技术,可以利用它来分析单细胞中的基因表达——这一性能与从基础研究到未来癌症诊断的一切事物均存在关联。 资深作者Ri
解析古老的单细胞基因组
单细胞的古细菌用肉眼根本看不到,甚至在使用显微镜时,也必须特别用心才能观察到它们。近日由丹麦奥尔胡斯大学地质微生物学中心领导的一个国际研究人员小组,却成功地从海底淤泥中获得了四个古细菌细胞,并绘制出了每个细胞的基因组图谱。这一突破性研究成果发表在著名的《自然》(Nature)杂志上。 “直
《细胞》:单细胞测序助力基因重组图谱
来自斯坦福大学医学院等处的研究人员发表了题为“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章,首次公布了来自一个成人男子91个
Science:新型单细胞基因表达检测技术
发表在最新一期《科学》(Science)杂志上的一篇研究论文,证实了一种新型的大规模平行测序技术可借助于新一代测序(NGS)在单细胞水平上检测基因表达。 论文作者、来自Cellular Research, Inc公司的Christina Fan博士、Glenn Fu博士以及Stephen Fo
Science:单细胞分析?并行测序技术可以
近日,一项发表于国际杂志Science上的研究论文中,来自美国的研究者描述了一种新型的大规模并行技术,通过利用新一代测序技术来在单细胞水平上实现对基因表达的监测;研究者表示,单细胞分析对于理解人类造血系统的必要性及重要性不断凸显,如果没有这种分析的话,来自少许细胞的大量表达改变就和来自许多细胞的
微藻:单细胞植物的大学问
微藻是一类古老的低等植物,在陆地、淡水湖泊、海洋分布广泛。微藻种类繁多,截至21世纪初已发现的藻类有三万余种,其中微小类群就占了70%,即两万余种。 中科院水生生物研究所(以下简称水生所)研究员、国家开发投资公司微藻生物科技中心主任、“千人计划”专家胡强主要从事藻类生物学、生物技术与生物能源
单细胞技术让这些研究成为现实
生物通报道 如今,细胞群体的平均值数据已不再能够满足研究的需求。研究人员开始转向单细胞来探索基本的生物学。在这一期的《BioTechniques》上,Jeffrey Perkel博士介绍了让单细胞实验成为现实的技术。 2015年底,巴西卫生部门和世界卫生组织报告,新生儿中小头症的发病率急剧增加
单细胞技术让这些研究成为现实
如今,细胞群体的平均值数据已不再能够满足研究的需求。研究人员开始转向单细胞来探索基本的生物学。在这一期的《BioTechniques》上,Jeffrey Perkel博士介绍了让单细胞实验成为现实的技术。 2015年底,巴西卫生部门和世界卫生组织报告,新生儿中小头症的发病率急剧增加。没过多久,
Nature重建单细胞的生命史
研究人员开发出了一些新方法来追溯单个细胞的生命史,揭示它们在受精卵中的起源。通过检测健康细胞中人类基因组拷贝,他们构建出了从早期胚胎一路发育成为成体器官的组成部分每个细胞的图像。这项研究发表在6月29日的《自然》(Nature)杂志上。 在个体的生命过程中,机体内所有的细胞都会产生体细胞突变,
-GEN报告重磅解析单细胞分析技术
本期GEN Market & Tech Analysis报告的重点是单细胞分析(Single Cell Analysis ,SCA)市场。 SCA的应用涉及多个的领域,包括癌症、神经科学等。目前,SCA主要应用于生命科学的研究领域,但报告认为,在未来的5-7年,SCA将对诊
Nature子刊报道单细胞技术突破
人类肠道是一件了不起的事情。每周,肠道都会再生一层新的内皮细胞,脱落的表面面积相当于一个小型公寓,并用新的细胞进行修复。几十年来,研究人员已经知道,负责这一改头换面行为的是肠道干细胞,但是直到今年,美国北卡大学教堂山分校(UNC)医学、细胞生物学和生理学、生物医学工程副教授Scott Magne
高通量单细胞技术获得新突破
人类肠道是一件了不起的事情。每周,肠道都会再生一层新的内皮细胞,脱落的表面面积相当于一个小型公寓,并用新的细胞进行修复。几十年来,研究人员已经知道,负责这一改头换面行为的是肠道干细胞,但是直到今年,美国北卡大学教堂山分校(UNC)医学、细胞生物学和生理学、生物医学工程副教授Scott Magne
单细胞分析之全攻略(上)
均值虽然有用,但无法准确反映单个细胞的表型,它们有时差异甚大。而这些表达上的差异也许包含了重要的信息,有助于我们了解癌症、确定治疗是否有效、鉴定免疫反应等。近两年,单细胞分析发展迅速,文章数以每年40%的速度增长。单细胞方法让微生物学家能够着手研究无法培养且数量有限的微生物,同时也让干细胞研究人员能