用“全景地图”破解肿瘤“混乱社区”

肿瘤组织具有高度异质性,细胞类型多样、基因表达杂乱无章,区域界限模糊,传统的空间转录组技术难以全面揭示肿瘤的特性。传统方法通常将采样点视为独立的“房子”,统计每个点的细胞类型和基因表达信息,容易产生误差。 为了解决这一难点问题,西安交通大学叶凯教授团队提出以基因表达的空间分布来构建整体计算框架,相关研究成果以“STMiner:以基因为中心的空间转录组学解析肿瘤组织”为题,于近日发表在《细胞·基因组学》(Cell Genomics)杂志上。 叶凯教授团队长期致力于生物信息学方法研究,并将开发的方法运用于遗传病和肿瘤的早诊和精准治疗。由于肿瘤组织的高异质性和空间转录组数据的高稀疏性,传统侧重局部临近特征的策略往往在肿瘤空间转录组数据分析中出现遗漏和偏差。因此,叶凯教授团队开发了STMiner方法,利用二维高斯混合模型和最优传输理论,将离散的采样点转化为连续的基因分布地图,就像从零散的“房屋信息”中绘制出一张完整的“居民分布图......阅读全文

比利时研制千万像素360度全景飞行模拟器

Barco公司研发负责人格尔特-马蒂斯演示360度全视角飞行模拟器 这是世界上第一款360度全视角飞行模拟器,赋予受训飞行员前所未有的训练体验多个飞行模拟器可以连接在一起,允许多名飞行员相互配合,进行空中加油等更为复杂的训练科目多个飞行模拟器可以连接在一起,允许多名飞行员相互配合,进

Cell重要论文:绘制前列腺癌的遗传全景图

  人们通常认为,癌症是在基因随时间逐步突变,最终压倒细胞的生长控制能力之后形成的。然而,近日一个国际研究小组在对前列腺癌基因组进行更深入的研究之后,揭示出实际上遗传突变呈突然地周期性地爆发,引起复杂的、大规模的DNA重组,驱动了前列腺癌的形成。这项研究工作发表在4月25日的《细胞》(Cell)杂志

Cell重要论文:绘制前列腺癌的遗传全景图

  人们通常认为,癌症是在基因随时间逐步突变,最终压倒细胞的生长控制能力之后形成的。然而,近日一个国际研究小组在对前列腺癌基因组进行更深入的研究之后,揭示出实际上遗传突变呈突然地周期性地爆发,引起复杂的、大规模的DNA重组,驱动了前列腺癌的形成。这项研究工作发表在4月25日的《细胞》(Cell)杂志

2022年全球气相色谱仪行业技术全景图谱

  1、全球气相色谱仪行业ZL申请概况  (1)技术周期:处于成长期  2010-2020年,全球气相色谱仪行业ZL申请人数量及ZL申请量整体上呈现增长态势,虽然2021年行业ZL申请量和申请人数量有所下降,但整体来看,全球气相色谱仪技术处于成长期。    注:当前技术领域生命周期所处阶段通过ZL申

SCIEX开启微流SWATH全景蛋白组学交流之旅

  由武汉国家生物产业基地主办,武汉金开瑞生物工程有限公司承办的第一届表观遗传组与蛋白质组学技术研讨会将于2019年8月12日-14日在湖北武汉举行。  此次会议针对蛋白质组学、三维基因组、表观遗传学等热点议题展开深入研讨,邀请了来自中科院、上海交大、同济大学、华中科技大学、华中农业大学等全国知名高

美宇航员国际空间站拍摄台风“浣熊”全景

   美国宇航员国际空间站拍摄到的台风“浣熊”全景  据日本《读卖新闻》7月8日报道,正在国际空间站工作的美国宇航员乔治•里德•怀斯曼,日前在社交网站上展示了一张他在空间站拍摄到第8号超强台风“浣熊”台风的照片。  据报道,乔治•里德•怀斯曼在日本时间7日夜里观测到巨大白色云漩涡,“浣熊”台风中心于

因美纳扩展全景变异分析应用,赋能NovaSeq-X用户

  通过在旗舰型测序仪上提供标志性肿瘤学产品应用,因美纳致力于为客户提供覆盖更大规模、总成本更低的全景变异分析  美国加利福尼亚州圣迭戈——近日,全球基因测序和芯片技术的领导者因美纳(纳斯达克股票代码:ILMN)宣布,已在 NovaSeq™ X 系列测序仪上扩展了肿瘤学产品应用。近几个月以来,因美纳

2015年我国医疗器械对外贸易全景分析

  根据中国海关数据统计,2015年我国医疗器械贸易总额达到384.89亿美元,同比增长7.53%,增速同比提升了3.21个百分点。其中,出口额为211.70亿美元,同比增长5.73%,增速同比上升2.17%;进口额为173.19亿美元,同比增长9.81%,增速同比上升4.49个百分点。  进口概况

研究发现大脑靠视觉和身体两幅“地图”定位

  据物理学家组织网12月5日报道,美国加利福尼亚大学圣芭芭拉分校(UCSB)研究人员利用核磁共振成像(MRI)技术研究了18个人的大脑,绘制了400个不同的手臂动作到达目标时的MRI图像。他们发现,大脑在计划动作时,有两种明显不同的定位类型:视觉地图和身体地图。研究发表在《神经元》(Neuron)

科学家绘制出完整药用小分子空间“地图”

  据物理学家组织网4月23日(北京时间)报道,美国杜克大学化学家最近开发出一种新的计算机算法,能模拟出所有的含碳小分子,经过分类编目后形成一份特殊的小分子空间“地图”,帮助化学家在实验室里将这些分子真正制造出来。这一成果有望成为药物开发人员的得力工具,以寻找更有效的药物和新材料。相关论文在线发表于

北京今再迎暴雨考验--网友自制积水地图

  据中国之声《央广新闻》报道,7月21日那次暴雨刚刚过去不久,今天午后到明天白天,北京全市将发生一次明显降雨过程。北京市内有哪些积水点和拥堵点?   7月21日,北京发生了61年以来的最强降水,多地积水成灾,给市民出行造成极大不便。而据天气预报显示,今天起,还将有可能出现新一轮暴雨,北京的城市排

研究人员发布迄今最大3D宇宙地图

迄今最大的三维黑洞和星系地图,精确描述了一百多万个星系的位置和距离,覆盖了约8%的天空。  8月9日,研究人员发布了迄今制作的最庞大的三维黑洞和大型星系地图。  地图精确地描述了超过一百万个星系的位置和距离。大多数的星系都包含了一千亿颗以上的恒星,距离地球10亿到60亿光年。  该研

专家:网传“癌症村”地图确实不同程度存在污染

  本报讯昨日,中国抗癌协会第七届第三次常务理事扩大会议在汉举行。专家介绍,网络热传的中国“癌症村”地图中都不同程度存在污染;肺癌是城市居民发病率最高的癌症,背后与空气污染也有关系。   中国抗癌协会常务理事、湖北省肿瘤医院院长魏少忠教授表示,“癌症村”集中在中东部经济较发达地区,

武大牵头发布导航电子地图国家标准

近日,记者从武汉大学获悉,测绘遥感信息工程国家重点实验室李必军教授牵头起草的国家标准GB/T 35646-2017《导航电子地图增量更新基本要求》,由国家标准出版社出版发行,将于2018年7月1日起正式实施。

《土地覆被地图集》背后:他们,“用脚丈量”

   每一项科研成果背后都凝聚着无数科研人员不舍昼夜忘我的工作,《中华人民共和国土地覆被地图集》成功出版的背后更是凝聚了数百人6年的心血:111356个全国土地覆被地面实测样点数据的校验;13轮大规模交叉自检;3万余个独立地面样点的精度验证;全国31个省(区、市)环保主管部门用户的对接与反馈……辛勤

科学家绘制空中微生物垂直地图

一个特殊的风道将飞机外部的空气引导至飞机内部的12个采样器中。 团队对瑞士森蒂斯峰山顶的空气微生物进行采样和分析。 图片来源均为新加坡环境生命科学工程中心  在近日发表于美国《国家科学院院刊》的一篇论文中,新加坡南洋理工大学的科研人员对从地面到3500米的大气微生物进行了研究,发现细菌和真菌以特定方

我国科学家精确绘制小鼠全脑“导航地图”

  北京时间3月31日晚,《自然-神经科学》期刊以封面文章的形式在线发表了一项中国科学家关于小鼠大脑高分辨率神经联接图谱的研究。这项研究在国际介观图谱领域率先重构了小鼠前额叶皮层6357个单神经元全脑投射图谱,建立了国际上最大的小鼠单神经元投射图谱数据库。  该篇题为《小鼠前额叶单神经元投射图谱》的

关于盘周地图状轮状脉络膜病变的简介

  盘周地图状轮状脉络膜病变(serpiginous choroidal atrophy)又称匐行性脉络膜萎缩(geographic helicoids peripapilltary choroidopathy),是眼底后极部脉络膜毛细血管及视网膜色素上皮(RPE)的一种慢性复发性疾病。盘周地图状轮

新宇宙地图表明暗物质塑造了宇宙

  据《自然》报道,天文学家通过追踪遥远星系团的X射线,重建了近90亿年的宇宙演化历程。该分析支持了宇宙学标准模型。根据该模型,神秘的暗物质的引力作用是宇宙结构形成的主要因素。  “我们没有看到任何偏离宇宙学标准模型的情况。”研究团队成员、德国马克斯·普朗克地外物理研究所(MPE)天体物理学家Esr

韩国推行“食物中毒风险信息预测地图”示范服务

  据韩媒报道,韩国KFDA与气象厅、国立环境科学院、国民健康保险公团共同开发了“食物中毒预测地图”,将从2日开始通过KFDA的网站等进行示范服务。   “食物中毒预测地图”融合了食物中毒产生的相关信息、气象、环境、诊疗信息以及社交网络(SNS)大数据,以人人都能易于理解的形式,将各地区发生的危险信

Science:首次揭示蛋白组亚细胞结构定位地图

  对于人细胞中的蛋白是如何在细胞中定位的首次分析于5月11日在线发表在Science上,这项研究,揭示了在给定的一个细胞中,大部分的人类蛋白被发现存在一个以上的定位位置。  基于瑞典的Cell Atlas计划,研究人员检查了对应大部分蛋白编码基因的人类蛋白组的空间分布,空前地详细描述了蛋白在多个细

简述盘周地图状轮状脉络膜病变的病理

  盘周地图状轮状脉络膜病变的发病时间多在20~50岁,男多于女。一般累及双眼,但亦可单眼发病。反复发作,病程缓慢,脉络膜呈进行性萎缩。盘周地图状轮状脉络膜病变一般没有家族史,但可能有显性或隐性遗传,不伴有炎症和毒性反应。其病变主要发生在脉络膜毛细血管层。  盘周地图状轮状脉络膜病变的病因尚未阐明。

英发布首张宽带网络交互式地图

  近日,英国政府发布了该国第一张固线宽带网络交互式地图,该地图表明,英国的宽带网络建设发展极不均衡,城乡差别巨大,宽带网络建设需要进行更大规模投资。   应英国文化、传媒和体育部的要求,英国通信管理局每三年要向其提交一份关于英国通信设施发展情况的报告,该宽带交互式地图即是此项任务

谁“内卷”,谁“躺平”?请看高校青年教师压力地图

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/518001.shtm 图片来源:视觉中国■本报记者 温才妃18年前,某高校青年教师在媒体上以“青椒”自嘲,感慨工作、生活压力之大。18年后,又一代高校青年教师在“双一流”建设、“破五唯”改革、“非升即走”

5G联创中心开放实验室落户江苏

   记者6月27日在上海举行的2018世界移动大会上获悉,中国移动在江苏打造了以5G联创为“主体”,以苏州、南京为“两翼”的5G联创中心开放实验室。该实验室可向合作伙伴提供5G网络环境、终端测试、开发支撑、商业模式孵化等能力。目前已引入10多家合作伙伴,开展了5G开源无线网络、车联网、工业互联网等

“人体哈勃望远镜”落户上海仁济医院

  近日,全景动态PET-CT成像系统uEXPLORER 探索者在上海交通大学医学院附属仁济医院核医学科完成装机。这台2米长的全景动态PET-CT成像系统可一次实现整个人体的全景采集,并完成所有组织和器官同时成像。该设备的问世曾被英国Physics world杂志评为“2018年全球十大科学突破”。

喜马拉雅山脉高山树线高清全景图发布

近日,中国科学院青藏高原研究所生态系统功能与全球变化团队研究员汪涛与合作者综合野外监测数据、70万个亚米—米级目视解译样点、30米分辨率卫星遥感数据,研发了大尺度遥感自动提取高山树线方法,全景展现了绵延2400千米的喜马拉雅山脉高山树线分布图。相关研究成果于6月3日在线发表于《自然—生态与演化》。高

世界首个人类早期胚胎DNA甲基化全景观图谱

  记者25日从北京大学第三医院获悉,该院生殖医学中心乔杰研究组与北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬研究组合作,绘就了世界首个人类早期胚胎DNA甲基化全景观图谱。这一成果日前已在线发表于《自然》,影响因子达38.597。  据介绍,哺乳动物的胚胎发育起始于单个受精卵细胞,父母的表观遗传记

科学家在单细胞水平解析拟南芥根发育全景图

  正如没有相同的指纹、完全一样的叶片,构成生命体基本单元的细胞同样存在高度的异质性。近年来随着单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)的发明与应用,使得研究人员能够在单细胞水平研究单细胞属性、细胞间异质性和细胞类型,深入解析生命活动的内在基本机理。  4月18日,国际学术期刊Molecular

我国学者在单细胞水平解析拟南芥根发育全景图

  正如没有相同的指纹、完全一样的叶片,构成生命体基本单元的细胞同样存在高度的异质性。近年来随着单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)的发明与应用,使得研究人员能够在单细胞水平研究单细胞属性、细胞间异质性和细胞类型,深入解析生命活动的内在基本机理。  4月18日,国际学术期刊Molecular