用“全景地图”破解肿瘤“混乱社区”
肿瘤组织具有高度异质性,细胞类型多样、基因表达杂乱无章,区域界限模糊,传统的空间转录组技术难以全面揭示肿瘤的特性。传统方法通常将采样点视为独立的“房子”,统计每个点的细胞类型和基因表达信息,容易产生误差。 为了解决这一难点问题,西安交通大学叶凯教授团队提出以基因表达的空间分布来构建整体计算框架,相关研究成果以“STMiner:以基因为中心的空间转录组学解析肿瘤组织”为题,于近日发表在《细胞·基因组学》(Cell Genomics)杂志上。 叶凯教授团队长期致力于生物信息学方法研究,并将开发的方法运用于遗传病和肿瘤的早诊和精准治疗。由于肿瘤组织的高异质性和空间转录组数据的高稀疏性,传统侧重局部临近特征的策略往往在肿瘤空间转录组数据分析中出现遗漏和偏差。因此,叶凯教授团队开发了STMiner方法,利用二维高斯混合模型和最优传输理论,将离散的采样点转化为连续的基因分布地图,就像从零散的“房屋信息”中绘制出一张完整的“居民分布图......阅读全文
Phenom-飞纳颗粒统计分析测量系统在中国计量院的应用
在使用颗粒统计分析测量系统之前,先借助扫描电镜观察 PS 聚苯乙烯小球的微观形貌。这个过程类似于搜集样本,借助 Phenom 飞纳电镜的光学导航,自动马达样品台,找样的过程非常简单。光学导航相当于有了地图,从而有了找到zui佳位置的方向,自动马达样品台可以在瞬间将视野移动到需要观察位置,只需点击该位
PD1/L1国内外研发全景扫描
在肿瘤免疫治疗领域,PD-1抑制剂自首次露面以来就一直带着光环,临床试验、审批阶段都受到相关机构的加速批准待遇。自2014年全球首个该类药物获得批准以来,国外各企业高度聚焦,临床试验也是加紧进行。让人欣慰的是,国内企业也毫不示弱,截至2016年2月底,已经有4家本土企业积极投入到这场激烈战斗中。
Cell:组学“全景”分析推动前列腺癌精准治疗
最近来自美国UCLA的癌症研究人员开发了一组复杂的分析工具对患有转移性前列腺癌的病例进行分析,绘制了帮助前列腺癌细胞增殖和抵抗治疗的复杂基因和蛋白质网络的详细图谱。研究人员还开发了一种计算方法来分析病人个体化数据帮助每位病人选择最有效的治疗药物。 相关研究结果发表在国际学术期刊Cell上。
Cell:组学“全景”分析推动前列腺癌精准治疗
最近来自美国UCLA的癌症研究人员开发了一组复杂的分析工具对患有转移性前列腺癌的病例进行分析,绘制了帮助前列腺癌细胞增殖和抵抗治疗的复杂基因和蛋白质网络的详细图谱。研究人员还开发了一种计算方法来分析病人个体化数据帮助每位病人选择最有效的治疗药物。 相关研究结果发表在国际学术期刊Cell上。
火星长这样?“好奇”号火星车拍摄火星全景(图)
中新网2月12日电 据外媒报道,美国国家航空航天局(NASA)官网消息称,美国国家航空航天局公布了一段美国“好奇”号火星车拍摄的火星全景视频。 据悉,这段视频拍摄于2018年12月19日,由各种静态图片拼接而成。 这段视频是由火星车在12月19日拍摄的全景照片合成的。(图片来源:NASA)
2019年中国基因测序产业全景图谱
近年来,基因测序行业得到迅速发展,吸引了大量资本和企业的进入。目前,在行业上游仪器设备环节,国外企业竞争优势显著,而在国内的基因测序与应用终端领域华大基因竞争力强劲。但是,基因测序技术在终端应用领域还未实现完全推广,未来发展仍具有巨大的想象空间。全景图:下游应用领域广泛,但尚未完全推广 从基因
杨靖等发表半胱氨酸氧化还原修饰全景分析
Nat Comm | 半胱氨酸残基(Cys)的氧化还原作为重要的翻译后修饰机制,能够可逆地调节蛋白质功能、互作与定位,进而实现对诸多生物学进程与氧化信号(如过氧化氢H2O2)转导的精准调控【1】。半胱氨酸的氧化还原修饰广泛存在于各种真核生物中。线虫作为常用的模式生物,可用于从网络水平上研究半
1000多家重点污染企业入选大气污染地图
究竟谁在污染中国 北京灰霾,上海灰霾,广州灰霾……PM2.5进入国标,也难扫污染天气带给公众的心理“灰霾”。人们不禁要问,污染从何处来? 目前的现实情况是,对于身边有哪些污染源、哪些工业企业是重点污染源,普通民众无从得知,公众监督更无从谈起。 近日,民间环保组织公众环境研究中心的《
欧航局公布最新版世界卫星地图
欧洲航天局12月21日公布了该机构绘制的最新版世界卫星地图,研究机构和普通民众可从GlobCover计划官方网站上下载。 欧航局发表公报说,这幅地图是根据ENVISAT环境观测卫星2009年收集的最新数据绘制而成,具有绘制迅速和精确两个特点。首先,欧航局和比利时卢万天主教大学只
全球空气污染地图:亚欧污染最严重(图)
美国宇航局地球气象台最新绘制了一张地球空气污染地图,呈现了全球各地弥漫悬浮微粒的污染状况。 图中显示深褐色区域是因空气污染过早死亡的居民区;浅褐色区域是空气污染程度较轻,不会导致大量居民死亡的地区;蓝色区域是自1850年污染指数升高的地区,例如美国南部。 这张地图显示,污染最严重的地
Science:人脑单细胞基因表达地图诉说惊人发现
人类大脑被称为世上最复杂的物质,里面有860亿错综复杂的、相互连接的神经元和数量同样庞大的胶质细胞。 有史以来人们对这一神秘器官一直充满好奇:它能生产浪漫的爱情诗歌,也能生产严谨的科学公式。由最初小小的胚胎和一点干细胞出发,成熟的大脑从何而来? 根据今天发表的《Science》,加州大学旧金
高分辨率“资源世界地图”绘成
英国《自然》杂志近日发布一份“资源世界地图”,其由英国牛津大学团队集合多个大型数据源绘制而成,是对全球不同城市中服务、机构和经济资源的可获取性进行的迄今最详尽评估。 医疗、教育、工作、金融机构等资源往往集中在城市地区,而难以获取城市资源成为提高生活水平和总体发展的一个主要障碍。提高全球范围内城
杭州“环保地图”能迅速定位周边可疑污染企业
一旦出现环境污染情况,工作人员可以根据“环保地图”迅速定位周边可疑污染企业,排查污染源。“环保地图”——杭州环境地理信息系统目前在杭州进入前期调试阶段。 据介绍,在这张电子地图上,汇集了所有与杭州环保有关的信息,不论是企业监管,还是水气声尘等环境治理,都能进行非常方便的查询、调取和管理。另外,
北斗“护航”地图升级“红绿灯倒计时”
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495112.shtm 中新网北京3月2日电(李坚 张素)春回大地,各地民众出行需求增多,许多人发现家门口的道路开通了“绿波带”。据知,运用“北斗高精”一体化精准定位导航技术,地图红绿灯倒计时功能已在多
《中国种猪场引种指南电子地图》发行
6月16日,“科创中国”生猪产业高质量发展大型路演之“猪场之旅”2022行:构建产学研融合发展新平台暨创新、创造、创业与高质量发展论坛在长沙开幕。《中国种猪场引种指南电子地图》在开幕式上正式发行。 生猪产业的高质量发展离不开科技的支撑,也需要资源的融合和信息互通。2022年,中国种猪信息网
黑猩猩基因地图助力溯源非法交易
一个国际研究团队近日发表了第一个濒危野生黑猩猩基因组多样性目录。该目录包括来自不同黑猩猩物种的828个样本,重建了黑猩猩群体结构,并提供了物种隔离、迁移和联系的精细模式。相关研究发表于《细胞基因组学》。研究人员利用这些信息设计了一种方法,能将被交易的黑猩猩与其在大约100公里内的原栖息地联系起来,目
新海山地图发现一万九千座海底火山
近日,新海山目录在《地球与空间科学》发表,在新罕布什尔大学海岸与海洋测绘中心主任Larry Mayer看来,这是“向前迈出的一大步”。海底山脉除了对航行构成威胁外,还蕴藏着稀土矿物,使其成为深海采矿者的商业目标。它们是海洋生物的重要绿洲,其大小和分布也为板块构造和岩浆活动提供了线索。“我们对海底的形
新海山地图发现一万九千座海底火山
近日,新海山目录在《地球与空间科学》发表,在新罕布什尔大学海岸与海洋测绘中心主任Larry Mayer看来,这是“向前迈出的一大步”。 海底山脉除了对航行构成威胁外,还蕴藏着稀土矿物,使其成为深海采矿者的商业目标。它们是海洋生物的重要绿洲,其大小和分布也为板块构造和岩浆活动提供了线索。 “我
老挝洞穴化石提示人类迁徙地图有变
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502856.shtm
饶毅小组新成果:绘制神经活动“化学地图”
“哇!”凌晨4点半,原本睡得香甜的小婴儿突然醒来开始哭闹。从出生到快两岁,每天固定的夜哭和别人家“天使宝宝”的故事,让她的父母百思不得其解:究竟是什么影响甚至决定了人的睡眠? 神经科学家也希望获得这个问题的答案。近日,细胞出版社旗下的学术期刊《神经元》发表了北京大学生命科学学院教授饶毅课题组的
共建“地图云与环保云”-生态中心落户天津
中科宇图科技股份有限公司(以下简称“中科宇图”)日前与天津市东丽区举行签约仪式,双方将围绕地图大数据平台、智慧环保平台、智慧水务平台、水体环境综合治理等内容,充分发挥各自优势,共建“地图云与环保云”新型云生态中心,实现更深层次的合作共赢。 据了解,运营中心将立足东丽,辐射天津市及环渤海地区,为
利用小鼠“脑地图”定位动物大脑中的意识
有人认为,大脑网络中支持意识区域的部分应该是双向连接的,因为前馈和反馈过程对意识体验都是必要的。例如,以前研究视觉感知的研究表明,当只有前馈处理时,有意识的感知不会产生,而当有反馈和前馈处理时,有意识的感知会产生。 科学可能会进一步了解意识在大脑中的位置。一项新的研究显示了某些类型的神经连接在
美国绘制全球空气污染地图-亚欧最严重
美国最新绘制的全球空气污染地图,深褐色区域是因空气污染导致居民早逝的地区,蓝色区域是自1850年以来空气污染持续升高的地区 据英国每日邮报报道,目前,美国宇航局地球气象台最新绘制了一张地球空气污染地图,呈现了全球各地弥漫悬浮微粒的污染状况。 图中显示深褐色区域是因空气污染过早死亡的居民区
立夏被冷哭?全国秋裤“返岗”地图来了!
今年5月初,我国中东部经历了一轮升温浪潮,华北、黄淮等地体验了一回“超前版夏天”,但进入立夏节气后,不少地区又感受到了历史同期少见的“五月寒”。不少网友吐槽:“差点热死在春天,冻死在夏天。” 眼下正有一股较强冷空气横扫中东部,降温直达华南,多地秋裤将再上岗。中国天气网推出全国秋裤返岗地图,看看未
看美国信息专家如何绘制“全球健康地图”
听到埃博拉这一熟悉的字眼,我们大都会感到几分恐慌与不安。那场离我们并不遥远、肆虐西非的病毒疫情,让地球上的每一个人,都倍感揪心与沉痛。还有扫荡亚洲的H5N1禽流感、一度谣传为民族灭顶之灾的SARS,这一场场生死浩劫的大规模流行病,都严重威胁了全人类的健康和生存。 如果能动态追踪疫情发展、提前预
绘制海草地图,海龟比卫星更靠谱
海草是海底郁郁葱葱的避风港,为鱼类和甲壳类动物提供庇护,改善水质,并加固海床。然而,寻找这些重要且相对罕见的水下绿地可能非常困难。但是,一个海洋生态学家团队发现,以海草为食的海龟像水下血猎犬一样,可以比卫星图像更可靠地引导研究人员找到海草。相关研究成果近日发表于《英国皇家学会学报B》。绿海龟以海草为
世界上最古老的三维地图
研究人员发现了世界上最古老的三维地图,它位于法国巴黎盆地的一块石英砂岩粗碎屑上。自20世纪80年代以来,这个名为塞戈诺3的岩石庇护所以旧石器时代晚期风格的艺术雕刻而闻名——在女性公共形象两侧刻有两匹马,现在被发现包含周围景观的微缩图。相关论文近日发表于《牛津考古学杂志》。塞戈诺3岩石庇护所里的三维地
第十九届上海教育博览会开幕
9月24日,2022第十九届上海教育博览会在上海科学会堂开幕,开启为期一个月线上展示交流体验。 本届展会将从“立德树人”“兴教赋能”“惠民智治”“创新策源”四个维度切入,通过集线上展示、虚拟体验、直播论坛、实践活动于一体的展会形式,多视角地呈现上海教育数字化转型带来的新变化、新成果。同时,展会还
首次展示上海多类型“教育应用场景
9月24日,2022第十九届上海教育博览会在上海科学会堂开幕,开启为期一个月线上展示交流体验。 本届展会将从“立德树人”“兴教赋能”“惠民智治”“创新策源”四个维度切入,通过集线上展示、虚拟体验、直播论坛、实践活动于一体的展会形式,多视角地呈现上海教育数字化转型带来的新变化、新成果。同时,展会
《PLoS综合》:流感病毒家族谱系研究获突破
可为抗击新的甲型H1N1流感提供重要技术支持 近来,从墨西哥暴发的人感染新的甲型H1N1流感病毒疫情,已经传播到多个国家,引起国际社会和公众的高度关注。其病原一开始被称为猪流感病毒。很多人对猪流感病毒、人流感病毒和近年来一直没有消停的禽流感病毒感到很困惑,它们之间到底存在哪些关系呢?近日,