用“全景地图”破解肿瘤“混乱社区”

肿瘤组织具有高度异质性,细胞类型多样、基因表达杂乱无章,区域界限模糊,传统的空间转录组技术难以全面揭示肿瘤的特性。传统方法通常将采样点视为独立的“房子”,统计每个点的细胞类型和基因表达信息,容易产生误差。 为了解决这一难点问题,西安交通大学叶凯教授团队提出以基因表达的空间分布来构建整体计算框架,相关研究成果以“STMiner:以基因为中心的空间转录组学解析肿瘤组织”为题,于近日发表在《细胞·基因组学》(Cell Genomics)杂志上。 叶凯教授团队长期致力于生物信息学方法研究,并将开发的方法运用于遗传病和肿瘤的早诊和精准治疗。由于肿瘤组织的高异质性和空间转录组数据的高稀疏性,传统侧重局部临近特征的策略往往在肿瘤空间转录组数据分析中出现遗漏和偏差。因此,叶凯教授团队开发了STMiner方法,利用二维高斯混合模型和最优传输理论,将离散的采样点转化为连续的基因分布地图,就像从零散的“房屋信息”中绘制出一张完整的“居民分布图......阅读全文

中国大豆有了精准分布地图

记者1月9日从中国农业科学院获悉,该院作物科学研究所大豆育种技术创新与新品种选育团队,通过对大豆生产田进行多年多点网格化取样和多种成分的系统分析,全面揭示了我国大豆营养成分的地理分布规律,提出了中国大豆品质区划方案,为指导我国优质大豆生产基地建设提供了科学依据。相关研究成果近日在线发表于《国际食品研

全国10城市启动雾化治疗地图项目

  随着全球气候变化,以及空气污染日趋严重,儿童喘息性疾病的发病率逐年上升并且频繁发作。为进一步普及雾化吸入治疗知识,方便患儿就诊,近日由中华医学会国家级医学继续教育教材委员主办的全国10个城市雾化治疗地图项目全面启动,其中,广州市包括中山大学附属第三医院、广州市第一人民医院、广州市儿童医院等在内的

国家重点实验室区域地图

导读    国家重点实验室的布局基本反映了我国基础研究力量的地域分布。其中,京沪苏是全国科研资源最集中的地区,尤其北京,拥有国家实验室数量比上海两倍还多。    国家实验室代表了一个国家相关领域的最高科技水平,在科学前沿探索和解决国家重大需求方面发挥着重要的作用。    近日,科技部发布了《2016

中国大豆有了精准分布地图

1月9日从中国农业科学院获悉,该院作物科学研究所大豆育种技术创新与新品种选育团队,通过对大豆生产田进行多年多点网格化取样和多种成分的系统分析,全面揭示了我国大豆营养成分的地理分布规律,提出了中国大豆品质区划方案,为指导我国优质大豆生产基地建设提供了科学依据。相关研究成果近日在线发表于《国际食品

绘就类器官研究全景画卷:回溯、探析与革新

在过去的十年中,类器官(Organoid)研究进入了一个黄金时代,这也标志着生物医学领域发生的关键转变。2023年可以称为类器官研究的一个里程碑,在这一年里发表了数千篇类器官研究论文,反映了类器官研究热度的指数级增长。然而,与这种蓬勃发展的快速扩张相比,仍缺少对类器官全面且准确的概述。近日,复旦大学

首个大豆全景定量蛋白质组图谱发布

近日,中国农业科学院生物技术研究所联合多家单位,绘制出大豆全景定量蛋白质组图谱,揭示了RNA甲基化在调控大豆蛋白表达量中的作用,并利用蛋白质组数据挖掘出调控大豆发育的新表观因子MTBa。相关研究成果发表在《细胞—基因组学》(Cell Genomics)上大豆基因组数据尽管可以提供大量信息,但不足以阐

中国制造全景图:谁在成长,谁在成熟,谁在衰退

任何行业都会经历萌芽、成长、成熟、衰退四个阶段,一家企业可以在不同的行业之间跃迁,但一个行业很难逆生长。不同阶段的行业有不同的投资机会,萌芽期行业投资要注重风险管理,成长期行业投资看重研发投入和商业模式及目标,成熟期行业投资在于龙头,衰退期行业投资在于提高产能利用率和运营效率的行业。企业的价值不是一

NASA毅力号拍全景照-360度展现火星样貌

中新网2月25日电 据“中央社”报道,在登陆火星不到一周的时间里,美国“毅力”号火星车已经发回了许多影像。当地时间24日,美国宇航局(NASA)公布了“毅力”号火星车在登陆地点拍摄的壮观全景照。 当地时间2月24日,美国宇航局发布了一张Jezero陨石坑的边缘影像,这是“毅力号”火星车拍摄的36

中国制造全景图:谁在成长,谁在成熟,谁在衰退

任何行业都会经历萌芽、成长、成熟、衰退四个阶段,一家企业可以在不同的行业之间跃迁,但一个行业很难逆生长。不同阶段的行业有不同的投资机会,萌芽期行业投资要注重风险管理,成长期行业投资看重研发投入和商业模式及目标,成熟期行业投资在于龙头,衰退期行业投资在于提高产能利用率和运营效率的行业。企业的价值不是一

Cell:单细胞测序绘制骨髓基质细胞全景图谱

  最新发布在Cell上的一项研究表明,单细胞测序可以绘制骨髓基质细胞的完整类群,并为白血病研究提供新的视角。这一新研究由美国哈佛大学的David T. Scadden教授和马萨诸塞州综合医院Broad研究所的Aviv Regev团队合作而成。他们创新地使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术

英国发布全球气温上升影响地图

  英国政府近日发布了一款新的谷歌地球地图,该款多平台、交互式地图显示了如果全球气温平均升高4摄氏度,地球将产生怎样的变化。   如果温室气体排放持续升高,在本世纪末,甚至有可能在2060年,全球平均气温将升高4摄氏度。英政府发布的此款地图正阐明了这种情况所产生的潜在影响。通过该地

揭秘中国水污染地图和绿色选择联盟

  中国水污染地图(www.ipe.org.cn)是全国水污染公益数据库,由公众环境研究中心于2006年开发并运行管理。该数据库收录了各省、市政府部门公布的水质信息、污染物排放数据以及污染源信息。目前污染地图数据库已涵盖了空气和固体废弃物污染。截至2010年9月,该数据

新大脑地图揭示我们如何控制身体运动

人类大脑有突出的中央前回,它处于运动皮层的位置。图片来源:Science Photo Library/Getty Images近一个世纪以来,人们一直认为,横跨大脑顶部的薄条状组织——运动皮层,控制着身体运动。但《自然》发布的最新研究表明,身体运动可能受大脑中两个不同网络的控制,而并非仅这一个。20

触摸屏电子地图查询系统优势

触摸屏电子地图查询系统是基于GIS的测土配方施肥智能查询触摸屏一体机,与测土配方施肥信息查询系统有机结合在一起,可以根据提示点击触摸屏就可以查询到目标耕地的土壤类型、理化性状、养分含量及丰缺状况等土壤信息及多种作物的测土配方实施方案,并根据这些信息打印出《推荐施肥卡》进行决策,被广泛应用于基层农技服

全球大型哺乳动物迁徙地图上线

9月4日,一个由8位科学家设计的全球有蹄类动物迁徙图鉴在线发布。该图鉴聚焦瞪羚及其他19种大型哺乳动物,介绍了世界各地动物大迁徙路线,包括阿尔卑斯山中部的马鹿、哈萨克斯坦的高鼻羚羊和中国的羚牛等。图鉴通过展现大规模迁徙的广泛性和重要性鼓励各方对其加以保护。据《科学》报道,有蹄类动物通过迁徙的方式获得

首版全国非公医疗透析地图上线

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/6/481031.shtm 近日,记者从中国非公立医疗协会肾脏病透析专业委员会获悉,首版全国非公立医疗透析地图正式上线。肾透析患者通过上述地图就可以简单快捷地查询到身边的透析中心具体位置和电话。 新冠疫

迄今最完整宇宙三维地图出炉

  据英国《每日邮报》5月25日报道,英国天文学家最近公布了宇宙迄今最完整详尽的三维地图。主持2微米红移巡天(2MRS)科研项目的朴茨茅斯大学的科学家历时十年,将观测视线延伸到宇宙中距离地球3.8亿光年的距离处,从而绘制出这份完整的三维地图。  此次,参与这一巡天项目的科学家将探测触角伸向了银道面。

鳗鱼利用磁地图搭上赴欧“顺风车”

  每年,年轻的鳗鱼都会从位于北大西洋马尾藻海的繁殖区迁徒到斯堪的纳维亚半岛的沿海和淡水区,它们会在这里生活数年,然后回到马尾藻海产卵,之后死去。近日,研究人员在《当代生物学》期刊上报告称,他们揭开了年轻鳗鱼旅行之谜。  鳗鱼能远赴欧洲多亏了探测地球磁场细微变化的能力。这种“地图感”帮它们游入墨西哥

IT等8大行业污染地图首次发布

   苹果、彪马、松下、玛莎百货、西门子、可口可乐、三星……没有一个不是世界级的大品牌。然而,这些企业环境信息公开情况如何?在官方尚未有确切信息公开的时候,环保组织公众环境研究中心(以下简称IPE)以及自然资源保护协会12日却先于官方联合发布了全球首个基于品牌在华供应链环境管理表现而制订的量化评价体

我国将编制新版《中国癌症地图集》

   癌症是严重威胁人类健康和社会发展的重大疾病。我国地域广大,自然地理环境和居民生活习惯各有特点,各地区癌症分布情况存在差异,因此,需要针对重点地区、重点人群采取有效的综合防治措施。上世纪70年代,全国肿瘤防治研究办公室首次绘制并出版了《中华人民共和国恶性肿瘤地图集》。三十多年间,由于人口老龄化、

科学家绘制疼痛地图量化慢性疼痛

  据报道,英国研究人员正在构建一份反应身体疼痛的“地图”。他们将通过大脑扫描技术观察大脑对疼痛的反应,确定疼痛信号来自身体哪个部位,并测出所遭受疼痛究竟有多痛,从而能精确获知疼痛的位置和强度。研究人员指出,该研究首次使疼痛定量化成为可能,有望改变对疼痛的诊断方法。这也将终结一项长期的争论:妇女是否

全球大型哺乳动物迁徙地图上线

9月4日,一个由8位科学家设计的全球有蹄类动物迁徙图鉴在线发布。该图鉴聚焦瞪羚及其他19种大型哺乳动物,介绍了世界各地动物大迁徙路线,包括阿尔卑斯山中部的马鹿、哈萨克斯坦的高鼻羚羊和中国的羚牛等。图鉴通过展现大规模迁徙的广泛性和重要性鼓励各方对其加以保护。据《科学》报道,有蹄类动物通过迁徙的方式获得

研究绘制非洲土壤微生物地图

   来自10个国家的1000份土壤样本将成为撒哈拉以南非洲首个大规模土壤微生物调查的基础。牵头该项目的非洲土壤微生物工程,希望这些数据有朝一日能有助于规范该地区的农业操作,以及保护生态系统和农业。  “土壤至关重要,土壤健康与人类和动物生存息息相关。”该项目负责人、南非比勒陀利亚大学微生物生态和基

英4℃地图揭示气候变化失控影响

        英国政府于10月22日公布了一份新的气候地图,主要阐述了如果无法将气候变化控制在2℃以内将产生的全球影响。   该地图由外交大臣David Miliband、能源和气候变化部大臣Ed Miliband与英国政府首席科学家John Beddington在英国科学博物馆共同发布,它是

脑神经“活地图”革新脑疾病诊疗生态

  “这是新发现的颞枕联络纤维束。”4月15日,河北省故城县医院神经影像研究中心主任姜洪新轻点鼠标,对着显示屏上流光溢彩的“多彩大脑”三维成像图进行标注。这些神经纤维束的成像,应用的正是其团队研发的弥散张量成像(DTI)神经纤维束成像技术。  他告诉科技日报记者,这项技术不仅助力团队首次发现并命名8

迄今最大宇宙三维“地图”发布

近日,由全球70多个科研机构共同组建的暗能量光谱巡天(DESI)合作组向全球发布了关于暗能量的最新研究成果,并同步公开了这一项目首年的光谱数据。科研人员利用前3年的收集数据,结合其他巡天信息,发现暗能量对宇宙膨胀的影响或随时间的推移而减弱,这表明可能存在超出现行宇宙标准模型的新物理。其中,中国科学院

新质谱成像技术+?=“谷歌地球”癌症地图

  在英国政府癌症研究重大挑战计划的资助下,英国国家物理研究院(NPL)来自化学、物理、生物等多领域的专家共同研发了一种可复制的标准方法,能够极其精准、全面地为肿瘤制图。这一开拓性项目已取得令人瞩目的进展和成果,将为人们更好地了解、诊断和治疗癌症提供新的更好的方法。世界首个癌症细胞代谢的“罗塞塔石碑

中科院发布抗生素污染地图

  新年的饭桌上少不了鸡鸭鱼肉,然而近期一份抗生素污染地图揭露了隐藏在我们食物体系中的惊人事实——为了供养工业化养殖业,每年有数万吨抗生素经由养殖动物和我们的身体,进入水土环境,致使各种病菌严重抗药。鸡鸭猪牛鱼全部沦陷。  国内首份抗生素污染清单操刀者为中科院广州地化所应光国课题组。应光国博士是国内

《Nature》子刊:完整的肺癌细胞地图

  鲁汶大学和VIB等机构的研究人员采集了数千个健康和癌变肺细胞,创建了第一个完整的肺癌细胞地图。《Nature Medicine》报道了这项研究,结果表明肿瘤比科学家们认为的更复杂,竟然包含52种具有明显差异的不同细胞类型。  尽管抗癌工作已经取得巨大进展,但是,我们对肿瘤的最基本单位——细胞的科

JCB:发布细胞生物学“Google地图”

  通过Google地图我们动动鼠标就可以从地球全景图拉近到自家后院,近日荷兰Leiden大学医学中心的科学家们在Journal of Cell Biology杂志上发布了细胞生物学的“Google地图”,并将其称为虚拟纳米显微镜。现在人们可以通过该成果从整个胚胎的生物组织全景放大到各