链霉菌天然产物沉默基因簇激活方法开发获进展
近日，中国科学院南海海洋研究所研究员张长生团队在国家重点研发计划、国家自然科学基金等项目的资助下，在链霉菌天然产物沉默基因簇的激活方法开发中取得新进展。相关成果发表于《代谢工程》（Metabolic Engineering）。采用kasOp*-KCl协同策略激活海洋链霉菌中沉默天然产物生物合成基因簇。研究团队供图链霉菌天然产物是药物研发的重要资源。近年来，随着测序成本的降低和生物信息学工具的普及，大量未知天然产物的生物合成基因簇序列被解析公布，亟待深入挖掘。然而，当前基因组挖掘面临两大核心挑战：一是链霉菌生物合成基因簇在实验室条件下大多数呈沉默或低表达状态，其产物丰度极低；二是部分野生型链霉菌无法进行遗传操作，导致其天然产物生物合成途径挖掘受限。针对链霉菌基因组挖掘中的上述瓶颈问题，研究人员开发了一种基于盐响应启动子的新型挖掘策略。该策略可有效激活链霉菌天然产物沉默基因簇，并成功应用于三种活性天然产物的激活与高产。他们在对南海来......阅读全文
细胞化学词汇基因簇
中文名称：基因簇外文名称：gene cluster定 义：基因簇（gene cluster）指基因家族中的各成员紧密成簇排列成大串的重复单位，位于染色体的特殊区域。位 于：染色体的特殊区域含 义：基因家族中的各成员的重复单位
嗜热吸水链霉菌抗体检测的临床意义
自1932年Campbell首次报告5例“农民肺”以来，国内外学者对嗜热放线菌与呼吸道感染的关系进行了广泛的研究。我校于1982年在洪湖县1例农民肺死亡者家的铺草中分离出嗜热吸水链霉菌H9-4(Streptomyces thermohydroscopicus H9-4)，并以分离的感染菌和其代谢
加拿大建议继续使用链霉菌菌株K61
加拿大卫生部正在就链霉菌菌株K61（Streptomyces strain K61）的所有用途进行公众咨询。链霉菌属菌株K61是生物杀菌剂Mycostop中的主要成分，用于防治温室植物猝倒，根冠腐病以及枯萎。 在加拿大卫生部有害生物管理监管机构重新评估之后，没有对产品标签提出额外的风险缓解措施
通过串联删除吸水链霉菌5008的γ丁内脂受体基因...（三）
通过串联删除吸水链霉菌5008的γ丁内脂受体基因提高井冈霉素产量以上结果表明同时删除shbR1/shbR3能够完全抑制adpA-H转录，增加井冈霉素产量。5. 同时突变后转录分析为了研究shbR1/shbR3缺失对细胞代谢的影响，本研究采用RNA测序对野生型以及shbR1/shbR3同时突变菌株进行
链霉菌产的酶在食品工业中的应用介绍
目前在多种链霉菌中都发现了( transgulaminase, EC 2. 3. 2. 13 简称 TGase)，如轮枝链霉菌产的谷氨酰胺转胺酶能够促使蛋白质分子内交联，蛋白质分子间交联以及蛋白质和氨基酸之间交联，可以在食品加工中应用。木聚糖酶是生产低聚木糖的关键酶。几丁质酶在制备几丁寡糖、处理海洋
通过串联删除吸水链霉菌5008的γ丁内脂受体基因...（一）
通过串联删除吸水链霉菌5008的γ丁内脂受体基因提高井冈霉素产量摘要 γ丁内脂（γ-butyrolactone简称GBL）生物合成基因afsA和GBL受体基因arpA的两对同系物位于吸水链霉菌基因组的不同位置。井冈霉素是一种重要的抗菌抗生素，同时也是抗糖尿病药物合成的关键底物。抑制afsA能够使急剧
通过串联删除吸水链霉菌5008的γ丁内脂受体基因...（二）
通过串联删除吸水链霉菌5008的γ丁内脂受体基因提高井冈霉素产量2. afsA及arpA同系物参与井冈霉素生物合成分别删除afsA以及arpA同系物。shbA1失活导致井冈霉素产量下降超过90%；ShbA2和shbA3失活分别导致产量下降77%和61%（Fig 3A）。ΔshbR1和Δshb
基因簇的组成和结构
基因簇少则可以是由重复产生的两个相邻相关基因所组成，多则可以是几百个相同基因串联排列而成。它们属于同一个祖先的基因扩增产物，也有一些基因家族的成员在染色体上排列并不紧密，中间还含有一些无关序列，但总体是分布在染色体上相对集中的区域。
上海生科院在放线菌天然产物的合成生物学方面取得进展
1月11日，国际学术期刊《代谢工程》（Metabolic Engineering）在线发表了中国科学院上海生命科学研究院上海植物生理生态研究所姜卫红研究组题为Multiplexed site-specific genome engineering for overproducing bioact
串联删除吸水链霉菌5008的γ丁内脂受体基因提高井冈霉素
γ丁内脂（γ-butyrolactone简称GBL）生物合成基因afsA和GBL受体基因arpA的两对同系物位于吸水链霉菌基因组的不同位置。井冈霉素是一种重要的抗菌抗生素，同时也是抗糖尿病药物合成的关键底物。抑制afsA能够使急剧降低井冈霉素的生物合成，删除arp同系物能够分别增加井冈霉素的产率
科学家发现链霉菌、草莓和传粉蜜蜂的互惠互作
近日，韩国庆尚国立大学等科研机构的研究人员在Nature Communications上发表了题为“A mutualistic interaction between Streptomyces bacteria, strawberry plants and pollinating bees”的文
科学家开发出利用CRISPRCas9系统一步克隆大基因簇技术
大片段基因簇（尤其是高附加值生物分子的基因簇）的克隆是微生物功能基因组研究中最为基础和关键的步骤。传统基于PCR的克隆方法或者通过构建基因组文库筛选等方法存在着克隆片段长度的限制、易产生突变、步骤复杂、效率低下等缺点。因此开发一种快速简单的方法来获得大尺度的基因簇片段至关重要。 近
基因簇的概念和组成介绍
基因簇少则可以是由重复产生的两个相邻相关基因所组成，多则可以是几百个相同基因串联排列而成。它们属于同一个祖先的基因扩增产物，也有一些基因家族的成员在染色体上排列并不紧密，中间还含有一些无关序列，但总体是分布在染色体上相对集中的区域。基因簇中也常常包括一些没有生物功能的假基因。一组紧密连锁的且功能上密
分子遗传学词汇基因簇
中文名称：基因簇外文名称：gene cluster定义：基因簇（gene cluster）指基因家族中的各成员紧密成簇排列成大串的重复单位，位于染色体的特殊区域。
RNA沉默的分类
植物中的RNA沉默根据作用靶标可以分为两类:以RNA为靶标, 使其降解或抑制蛋白翻译, 称为转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing, PTGS);以染色质为靶标, 使其基因启动子或组蛋白甲基化从而抑制 RNA 转录的起始, 称为转录基因沉默(trans
RNA沉默的作用
植物可利用 PTGS 和 TGS 来抵抗病毒侵染, 病毒侵染植物后会产生大量病毒来源的小 RNA (virus-derived small interfering RNAs, vsiRNA), 介导对病毒 RNA 的降解或抑制病毒基因的转录; 而在与植物长期共进化过程中, 病毒编码一个或多个RNA沉
RNA沉默的作用
植物可利用 PTGS 和 TGS 来抵抗病毒侵染, 病毒侵染植物后会产生大量病毒来源的小 RNA (virus-derived small interfering RNAs, vsiRNA), 介导对病毒 RNA 的降解或抑制病毒基因的转录; 而在与植物长期共进化过程中, 病毒编码一个或多个RNA沉
RNA－沉默的概念
RNA 沉默(RNA silencing)或基因沉默(gene silencing)是广泛存在于植物、动物、线虫和真菌等真核生中的一种高度保守的、序列特异的 RNA 降解机制. RNA 沉默对于调控发育、维持基因组的稳定性以响应生物和非生物胁迫等具有重要作用.
基因沉默的概念
基因沉默是指在真核生物（植物、动物、真菌）中保守的由双链RNA诱导的鉴定和破坏其细胞质中异常变异或过表达的RNA的一种机制。
什么是基因沉默？
基因沉默是指在真核生物（植物、动物、真菌）中保守的由双链RNA诱导的鉴定和破坏其细胞质中异常变异或过表达的RNA的一种机制。
RNAi基因沉默方法
大约在十年前，2006年诺贝尔生理/医学奖得主CraigMello和AndrewFire发现，他们能够将短RNA 分子插入到线虫中并沉默特定基因的表达。今天，研究人员也常常使用这种强大的RNA 干扰方法来研究哺乳动物系统中的特定基因功能。为了进行这种基因沉默实验，研究人员通常需要依赖化学合成的RNA
开发“猫捕”技术助力开发抗癌活性药物
近日，华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室的副研究员谭高翼与合作者在放线菌大型基因簇捕捉和沉默基因簇激活，发掘新颖活性天然产物研究中取得新进展，相关研究近日发表于《核酸研究》。 放线菌是合成天然产物药物的主力，被广泛用于抗肿瘤药物、免疫抑制剂和杀虫剂等多种药物的发酵和规模化工业制造。然而，放
关于基因簇的基本信息介绍
基因簇少则可以是由重复产生的两个相邻相关基因所组成，多则可以是几百个相同基因串联排列而成。它们属于同一个祖先的基因扩增产物，也有一些基因家族的成员在染色体上排列并不紧密，中间还含有一些无关序列，但总体是分布在染色体上相对集中的区域。 基因簇中也常常包括一些没有生物功能的假基因。 一组
删除真菌中基因kmt6有助发现新的抗生素
近日，俄勒冈州立大学研究人员发现，常见真菌的一个基因充当“主调节器”，删除它后有助发现新化合物，寻找潜在新的抗生素。 这一研究发现已经发表在PLOS Genetics杂志上。科学家成功地翻转了一种遗传开关，这一遗传开关沉默真菌中超过2000个基因。在实验室中，许多真菌的基因组大约有三分
RNA沉默的应用特点
RNA 沉默(RNA silencing)或基因沉默(gene silencing)是广泛存在于植物、动物、线虫和真菌等真核生中的一种高度保守的、序列特异的 RNA 降解机制. RNA 沉默对于调控发育、维持基因组的稳定性以响应生物和非生物胁迫等具有重要作用.
简述RNA沉默的作用
植物可利用 PTGS 和 TGS 来抵抗病毒侵染, 病毒侵染植物后会产生大量病毒来源的小 RNA (virus-derived small interfering RNAs, vsiRNA), 介导对病毒 RNA 的降解或抑制病毒基因的转录； 而在与植物长期共进化过程中, 病毒编码一个或多个RN
RNA沉默的作用机制
植物可利用 PTGS 和 TGS 来抵抗病毒侵染, 病毒侵染植物后会产生大量病毒来源的小 RNA (virus-derived small interfering RNAs, vsiRNA), 介导对病毒 RNA 的降解或抑制病毒基因的转录; 而在与植物长期共进化过程中, 病毒编码一个或多个RNA沉
沉默等位基因定义
中文名称沉默等位基因英文名称silent allele定 义通常不表达,但在肿瘤细胞中呈现转录活性的基因。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
基因沉默的主要类型
基因沉默，主要有转录前水平的基因沉默(TGS)和转录后水平的基因沉默(PTGS)两类：TGS是指由于DNA修饰或染色体异染色质化等原因使基因不能正常转录；PTGS是启动了细胞质内靶mRNA序列特异性的降解机制。有时转基因会同时导致TGS和PTGS。
细胞化学词汇RNA沉默
中文名称：基因沉默外文名称：RNA silencing定 义：基因沉默是指在真核生物（植物、动物、真菌）中保守的由双链RNA诱导的鉴定和破坏其细胞质中异常变异或过表达的RNA的一种机制。