中国科学家绘制全球首张维管植物整合细胞图谱
中国科学院分子植物科学卓越创新中心研究员王佳伟团队,绘制了世界上首张维管植物整合细胞图谱,并通过系统鉴定维管植物各类细胞的底层基因,突破了基因高效挖掘的瓶颈,为植物发育生物学研究提供了一个全新的研究范式。相关研究8月18日发表于《细胞》。 得益于双子叶模式植物拟南芥和单子叶模式植物水稻的遗传学研究,植物发育生物学在过去40年取得了长足的发展。然而,随着正向遗传学筛选的日趋饱和,基因功能的冗余性逐渐成为植物新基因挖掘的巨大障碍。许多植物高质量单细胞制备难度大,同时相当一部分植物的基因组庞大且相关测序尚未完成,为植物单细胞图谱的绘制带来了巨大挑战。 研究团队开发了高效的原生质体制备技术,并建立了一套无需参考基因组即可进行单细胞转录组数据分析的流程。在此基础上,研究团队成功绘制了来自石松类植物(石松和银边卷柏)、蕨类植物(肾蕨)及裸子植物(油松)的四张全新单细胞图谱,并在此基础上实现了维管植物的整合单细胞图谱的构建。维管植物的......阅读全文
中国科学家绘制全球首张维管植物整合细胞图谱
中国科学院分子植物科学卓越创新中心研究员王佳伟团队,绘制了世界上首张维管植物整合细胞图谱,并通过系统鉴定维管植物各类细胞的底层基因,突破了基因高效挖掘的瓶颈,为植物发育生物学研究提供了一个全新的研究范式。相关研究8月18日发表于《细胞》。 得益于双子叶模式植物拟南芥和单子叶模式植物水稻的遗传学
植物所揭示维管植物迄今最早的异源多倍化事件
杂交是植物界中普遍存在的现象,也是物种多样化的重要驱动因素。通常,研究人员利用不同基因树之间系统发生关系的冲突来推测杂交事件。杂交、基因渐渗、基因复制和丢失、不完全谱系分选以及进化率变异等因素可能导致系统发生关系冲突。随着时间的积累,基因突变和重组等事件会稀释和改变杂交后代中来自亲本的遗传印记。因此
向维管植物请教,如何制备高性能多孔膜
高渗透选择性和耐久性的膜适合大规模分离应用。然而,目前大多数使用非溶剂诱导相分离(NIPS)制备的膜,都存在低渗透性和高污染倾向,这是因为在膜的合理设计和实用优化方法方面仍存在巨大挑战。近日,东华大学化学化工与生物工程学院教授武培怡、副教授吴慧青团队受维管植物网络结构的启发,通过一种简单而稳健的策略
我国学者首次估出中国维管植物数量
中国地大物博,是世界上生物多样性最丰富的5个国家之一。“中国植物志”记载了分布于我国的31362种维管植物(包括蕨类和种子植物),但到底还有多少种维管植物有待发现一直是一个谜。最近,中山大学何芳良教授和硕士生吕牧羊的一项研究首次估算出中国总共约有36500种维管植物(最多不超过39200种),该
武汉植物园完成东非火山埃尔贡山的维管植物编目
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498460.shtm 埃尔贡山是东非最古老的火山之一,位于肯尼亚和乌干达的交界处,最高点海拔4321米。埃尔贡山具有独特的生态系统,其植物多样性高,并拥有非洲大陆植物区系中的稀有和特有物种,长期以来
《世界维管植物新分类群2022年度报告》发表
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514851.shtm
迄今最完整植物单细胞图谱问世,揭开叶片衰老“密码”
植物的衰老往往伴随着新生,在衰老的过程中,叶片并非简单地枯萎掉落,而是悄悄进行一场资源大转移,将自己积累的碳、氮等营养物质分解,转运给花朵、果实,甚至根部,用“牺牲”自己,换来果实的茁壮成长。 在叶片衰老的过程中,植物细胞如何进行时空协调?哪些关键基因参与了调控?4月11日,一项发表于《细胞》
首个豆科植物根尖单细胞表达图谱绘制成功
百脉根单细胞图谱细胞类型。中国农科院供图 近日,中国农业科学院生物技术研究所作物生物技术育种创新团队与国内其他科研单位合作,共同绘制完成首个豆科植物百脉根的根尖单细胞表达图谱,鉴定出根尖的主要细胞类型,发现了新的细胞类型特异基因,并分析了各个细胞类型的潜在功能,对研究豆科植物根系发育、结瘤固氮
科学家开发出基因挖掘新策略
得益于双子叶模式植物拟南芥和单子叶模式植物水稻的遗传学研究,植物发育生物学在过去40年取得了长足发展。植物分生组织(干细胞)的建立与维持机制、重要组织和器官的分化轨迹及其核心调控网络已初步建立。这些基础知识为作物农艺性状的分子调控解析与设计改造奠定了基础。然而,随着正向遗传学筛选的日趋饱和,基因
《自然》发布重要单细胞RNA图谱:首张小肠细胞图谱
我们肠道上皮是人体内多样性最高,最具活力的组织之一, 作为机体与外界的主要界面之一,组成了一个细胞的生态系统。为了更好地理解这些复杂的组织及其功能,还有影响它的疾病,麻省理工学院、哈佛大学和麻省总医院研究人员领导的一个研究团队通过分析从小鼠肠道或肠道类器官中取样的5.3万多个单独的细胞,完成了一
Genome-Biology:构建猪体细胞染色质三维结构图谱
猪不仅是重要的经济家畜,在生物医学领域也有重要应用。生猪的育种中广泛应用了辅助生殖技术,包括体外受精技术、孤雌和孤雄生殖技术等。但与体外受精胚胎相比,孤雌和孤雄胚胎的存活率级低。这一存活率差异产生的机制目前还不清楚。深入理解这一机制不仅有助于增加商业化猪育种的产仔数,也将有利于生物医学研究中转基
我国揭示植物调控花粉管细胞完整性与精细胞释放机制
人们发现在被子植物的有性生殖过程中,花粉管质膜上的受体ANX1/2参与了对花粉管完整性的调控,因为缺失这两个受体之后花粉管一萌发就提前发生爆炸,精细胞无法正常送至胚囊(雌方组织),双受精无法完成。但是,ANX1/2是如何维持花粉管细胞的完整性的?他们识别的信号分子是什么?花粉管又是如何在适当的地
人体细胞图谱问世
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505110.shtm
肠道细胞综合图谱面世
肠道是人体重要的消化器官,肠道由不同的解剖区域组成,这些区域发育速度不同,在消化、营养吸收、代谢和免疫调节中也发挥着不同的作用。正确认识肠道细胞的分化过程对于肠道疾病的研究至关重要。 近期,英国桑格研究所的研究团队发布了人体肠道细胞综合图谱。相关研究在《Nature》发表,题为:Cells o
《细胞》:单细胞测序助力基因重组图谱
来自斯坦福大学医学院等处的研究人员发表了题为“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章,首次公布了来自一个成人男子91个
Nature:三维计算机方法成功构建基因活性三维图谱
一种三维计算机模型(或者说算法)使得科学家们能够快速地确定哪些基因在哪些细胞中有活性,以及它们在器官中的精确位置。在一项新的研究中,德国亥姆霍兹协会马克斯-德尔布吕克分子医学中心的Nikolaus Rajewsky教授、以色列希伯来大学的Nir Friedman教授及其团队近期在Nature期刊
Science绘制细胞药物反应图谱
为什么对于同一种药物人们会有不同的反应?研究人员第一次解开了与药物反应相关的遗传和环境因素,使得我们朝着预测出药物将会对我们造成的影响又近了一步。 来自英属哥伦比亚大学的研究人员将6,000种酵母菌株暴露于3,000种药物之中。他们对酵母菌株进行了改造使得能够测量这些酵母的反应。研究人员发
首个果蝇细胞衰老图谱公布
了解身体如何衰老是一个重要的研究领域。美国贝勒医学院、斯坦福大学等机构研究人员在《科学》杂志上发表了首个果蝇细胞衰老图谱(AFCA),详细描述了果蝇中163种不同细胞类型的衰老过程。 分析表明,体内不同细胞的年龄不同,每种细胞类型的衰老过程都遵循特定的模式。AFCA为衰老研究提供了宝贵的资源,
首个肺癌全息细胞图谱问世
肺癌是发病率和死亡率增长最快、对人群健康和生命威胁最大的恶性肿瘤之一。近年来,肺癌患者有更加年轻化的趋势,治愈较为困难。虽然目前科学家在肺癌治疗方面已取得了巨大进展,但对其细胞层面上的科学认识仍难尽如人意。近日,著名学术期刊《自然—医学》推出史上最完整的肺癌细胞图谱,这将是科学家们在细胞层面深入
PNAS:单细胞测序绘制大脑的细胞图谱
斯坦福大学的著名学者Stephen Quake及其同事本周在《美国科学院院刊》(PNAS)上发表文章,介绍了人类脑细胞的单细胞转录组测序研究成果。 研究小组对近500个成人或胎儿脑细胞进行了单细胞RNA测序。利用这种方法,他们能够鉴定出大脑中所有主要的细胞类型,并确定神经元的亚型。他们还观察了
1微米分辨率小鼠三维脑图谱问世
记者2日从海南大学获悉,中国科学院院士、海南大学教授骆清铭等与华中科技大学与美国加州大学洛杉矶分校科研人员合作,绘制出小鼠三维脑区和立体定位图谱(STAM)。这张详细的“空间地图”,以1微米分辨率清晰标注脑区“坐标”和边界,为神经科学研究提供了重要工具。相关成果发表在国际期刊《自然》上。脑图谱是研究
零维碳纳米管首次切割成功-或可用于制人造细胞
据物理学家组织网日前报道,美国匹兹堡大学斯万森工程学院的工程师们研制出了一种新形式的“零维”碳纳米管,科学家们未来或可用此制造出超薄的电子设备和人造细胞,研究发表在著名的《德国应用化学》杂志上。 该研究的主要领导者斯蒂芬·利特尔副教授表示:“自从问世以来,碳纳米管就承载了科学家们变革电子学、材
狼尾草叶片响应热胁迫关键细胞类群获揭示
当前全球气候变暖已成为当前生态系统和农业生产面临的重大挑战之一,温度升高及极端气候事件的频繁发生对作物生长发育、农业生产力及粮食安全构成了严峻威胁。美洲狼尾草作为我国西南地区重要牧草杂交狼尾草亲本之一,以其较高的粗蛋白含量、叶茎比、生物产量以及易消化性,成为我国主要的放牧及青贮饲料之一。 叶片
美研制出新型“4维”晶体管
据物理学家组织网12月6日(北京时间)报道,美国普渡大学和哈佛大学的研究人员推出了一项极为应景的新发明:一种外形如同一颗圣诞树一样的新型晶体管,其重要组件“门”(栅极)的长度缩减到了突破性的20纳米。这个被称为“4维”晶体管的新事物预告了引领半导体工业和未来计算机领域发展的潮流。该研究成果将于1
超越硅极限二维晶体管诞生
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/497868.shtm“在弹道输运晶体管中,电子像子弹一样穿过沟道没有受到碰撞,能量没有被散射损失掉,所以弹道率越高的器件,能量利用效率更高。”近日,北京大学电子学院研究员邱晨光向《中国科学报》解释。随着硅
多学科交互,深度绘制细胞图谱
大多数人类疾病实质上是细胞故障的产物。但要了解细胞的哪些部分出错会导致疾病,科学家首先需要对细胞有完整的了解。美国加州大学圣地亚哥分校医学院的研究人员及其合作者在24日发表于《自然》杂志上的论文中,介绍了尺度集成细胞(MuSIC)技术,这是一种结合了显微镜、生物化学和人工智能的技术,揭示了以前未
脑脊液细胞学分类及图谱
1.免疫活性细胞:均由淋巴细胞(图1)衍生而来,包括小淋巴细胞:为正常人脑脊液中的主要细胞,无特殊的病理意义,占细胞总数75%。①转化型淋巴细胞(图2)和淋巴样细胞:提示局部的体液或细胞介导的免疫反应。临床意义:提示病毒性脑炎、结核性脑膜炎、脑脓肿、多发性硬化等。②浆细胞(图3):亦名抗体细胞,它
武汉植物园莲遗传连锁图谱研究取得进展
遗传连锁图谱是研究植物基因组结构、进化的有力工具,是基因定位、克隆和分子标记辅助育种的重要基础。但作为被子植物中起源最早的植物之一,且素有“活化石”之称的莲,其基因组学研究却明显滞后。因此,构建莲遗传连锁图谱有助于莲基因组学研究的快速发展,为莲重要经济性状的分离和克隆提供依据,从
这种病毒如何诱导水稻产生“肿瘤”
近日,中国农业科学院植物保护研究所作物病毒病害监测与防控创新团队在《植物生物技术》(Plant Biotechnology Journal)上在线发表了研究论文。该研究通过单细胞转录组测序揭示了水稻在感染黑条矮缩病毒(RBSDV)后,维管组织薄壁细胞异常发育形成肿瘤细胞的分化轨迹,解析了RBSDV影
泛癌症T细胞单细胞图谱-相关成果发表
北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)、生命科学学院、北京未来基因诊断高精尖创新中心(ICG)张泽民课题组联合北京大学肿瘤医院季加孚、步召德课题组以及北京大学第三医院,在国际期刊Science上发表了题为“Pan-Cancer Single Cell Landscape of Tumor-