酿酒酵母代谢通量动态调控研究获进展
近日,中国科学院天津工业生物技术研究所研究团队在酿酒酵母代谢通量动态调控方面取得进展。团队以酿酒酵母丙酮酸脱羧酶Pdc1为研究对象,开发出蛋白质层面的光遗传学调控工具OptoPdc1,通过蓝光与黑暗切换直接调控糖酵解途径的关键酶丙酮酸脱羧酶的催化活性,实现对酿酒酵母代谢通量快速、可逆、高效调控。团队通过光控蛋白质工程化改造,引入蓝光响应元件结构域,构建多种响应蓝光的突变体OptoPdc1,通过蓝光与黑暗切换,可精准调控丙酮酸脱羧酶的催化活性。基于OptoPdc1团队构建了光控酿酒酵母菌株Opto-S.cerevisia,实现了通过蓝光对细胞生长与乙醇合成的高效调控。在蓝光照射下,光控酿酒酵母菌株对乙醇生物合成动态调控范围达到120倍,且乙醇产量与蓝光强度呈现依赖关系,展现出精准代谢控制潜力。该研究为酿酒酵母代谢通路调控提供了新的蛋白质层面策略,也为乙醇代谢的快速、可逆、高效调控提供了创新工具。团队进一步将Opto-S.cerev......阅读全文
酿酒酵母代谢通量动态调控研究获进展
近日,中国科学院天津工业生物技术研究所研究团队在酿酒酵母代谢通量动态调控方面取得进展。团队以酿酒酵母丙酮酸脱羧酶Pdc1为研究对象,开发出蛋白质层面的光遗传学调控工具OptoPdc1,通过蓝光与黑暗切换直接调控糖酵解途径的关键酶丙酮酸脱羧酶的催化活性,实现对酿酒酵母代谢通量快速、可逆、高效调控。团队
酿酒酵母胞内代谢通量调控机制方面获进展
细胞内的代谢通量受胞内基因表达、转录调控、蛋白修饰、别构效应等调控体系共同作用。然而,目前关于细胞内代谢通量的详细调控机制存在较多未知,例如代谢通量的变化到底在多大程度上依赖基因表达以及有多大程度通过酶活力调控。酿酒酵母的Crabtree效应是重要的代谢调控表型,但该表型下各种调控因子对胞内代谢
高通量光合、呼吸及能量代谢测量技术(一)
随着CO2等传感器技术的创新发展,特别是荧光光纤O2传感器技术的应用,高通量测量微小生物如藻类等浮游植物、浮游动物、鱼类虫卵、土壤微生物、果蝇、斑马鱼等呼吸与能量代谢,对于实验生物学研究、污染生态学与环境毒理学、环境科学与气候变化研究等,都具有越来越重要的意义早在2005年,为了实现个体水平上的海底
高通量光合、呼吸及能量代谢测量技术(二)
不列颠哥伦比亚大学的Bernhardt等(2017),则利用200微升的高通量溶解氧测量技术,对浮游植物细胞光照条件下的放氧量及黑暗条件下的氧气消耗量进行了测量分析,并计算其质量归一化代谢率(氧通量/总细胞体积)和光合作用的活化能。实验中使用了透明的PCR膜密封呼吸室,在3小时内每隔15秒测量一次氧
3min-400种代谢物LCMS/MS分析方法有效提高代谢组研究通量
在精准医学所依赖的大规模队列研究中, 实验通量和数据重现性是最为重要的考量指标。Angelo D'Alessandro教授课题组基于Vanquish-Q Exactive 技术建立了3min方法测定400多种代谢物的方法,覆盖到糖酵解途径、磷酸戊糖途径、三羧酸循环、鸟氨酸循环、氨基酸代谢
封面文章:次级代谢产物导向的放线菌高通量筛选方法
放线菌是重要的天然产物生产菌种,具有颇高的工业应用价值。多数工业放线菌难以进行基因操作,工业放线菌的驯化多依赖传统的随机诱变方法。而此类方法往往产生的随机库突变体数目庞大,正突变率低,传统的基于孔板培养和产量测定的低通量筛选方法难以与其适配,因此开发次级代谢产物导向的放线菌高通量筛选方法对于天然
微生物所等开发出预测精度更高的代谢通量分布算法
基因组规模代谢模型已被广泛应用于细菌进化分析、未知基因功能注释、生理代谢表型分析和代谢工程策略设计等。通量平衡分析(Flux Balance Analysis, FBA)是其中的核心算法,被用来计算稳态时的通量分布。然而,由于FBA的本质是线性规划,在多数情况下不可避免地存在等效解。
基于烟酸生物传感器开发腈代谢相关酶高通量筛选平台
近期,江南大学生物工程学院周哲敏教授团队在基于生物传感器的酶高通量筛选平台开发方面取得重要进展,研究成果“Construction and Application of a High-Throughput In Vivo Screening Platform for the Evolution
许国旺AC发文:nanoESI-DIHRMS实现代谢组高通量高灵敏检测
近日,大连化物所生物分子高分辨分离分析及代谢组学研究组(1808组)许国旺研究员团队在纳升电喷雾质谱直接进样的代谢组学分析新方法研究方面取得新进展,基于纳升电喷雾直接进样的高分辨质谱(nanoESI DI-HRMS),分别结合质谱信息非依赖采集(DIA)、拼接式质谱采集、毛细管微探针取样等技术,
大肠杆菌K12-Keio在高通量筛选赤潮藻类中的细菌代谢产...
大肠杆菌K-12 Keio在高通量筛选赤潮藻类中的细菌代谢产物的应用水生生物是大型生态网络的一部分,许多生物在整个生命周期中都通过这种网络相互影响。近几十年来,对藻类和细菌之间不同类型的生态相互作用(包括共生和共生)进行了大量研究,试图阐明这些相互作用的潜在工业应用。这些研究表明,特定细菌可以改变藻
高通量测序
高通量测序技术又称“下一代”测序技术,以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。高通量测序包括:大规模平行签名测序、聚合酶克隆、454焦磷酸测序、离子半导体测序和DNA 纳米球测序等技术。 高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条DN
代谢组学的最新进展:快速、高灵敏度和高通量分析
分析测试百科网译 代谢组学致力于研究生物系统中存在的小分子或代谢物。通过分析生物体或细胞内存在的代谢物来得到其生理状态的化合物指纹谱。 从营养、食品科学到了解人类疾病,代谢组学表征在许多领域中具有广泛的应用。随着分析技术的不断发展和功能的增强,这个应用领域将会越来越广。 为了进一步了解代谢组
高通量测序原理
高通量测序原理是将基因组 DNA 片断化,然后克隆到质粒载体上,再转化大肠杆菌。对于每个测序反应,挑出单克隆,并纯化质粒 DNA。高通量是相对于第一代测序的,第一代测序只能一次测1个样品的1段序列,产生的数据量相对来说很小,而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G,可以一次测很多的样本。高通量
高通量测序原理
高通量测序原理是将基因组 DNA 片断化,然后克隆到质粒载体上,再转化大肠杆菌。对于每个测序反应,挑出单克隆,并纯化质粒 DNA。高通量是相对于第一代测序的,第一代测序只能一次测1个样品的1段序列,产生的数据量相对来说很小,而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G,可以一次测很多的样本。高通量
高通量测序原理
高通量测序原理是将基因组 DNA 片断化,然后克隆到质粒载体上,再转化大肠杆菌。对于每个测序反应,挑出单克隆,并纯化质粒 DNA。高通量是相对于第一代测序的,第一代测序只能一次测1个样品的1段序列,产生的数据量相对来说很小,而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G,可以一次测很多的样本。高通量
高通量测序技术
没有测序的癌症诊断是不完整的,完整的癌症诊断应该包括一系列基于细胞遗传学技术、荧光原位杂交技术、标准分子技术以及NGS的预后与预测性分析。对于早期癌症患者来说,NGS序列分析在多种癌症的筛查技术中具有不容忽视的代表性;而对于晚期癌症患者,大量的侵入性测试往往只能筛查出少数几个药物靶点。 随
光量子通量密度
光量子通量密度通常用μmol/m2·s或者μE/m2·s表示,它们间的换算为1μE=1μmol/m2·s。其中1μmol/m2·s=6.022*1023*10-6个光子每秒钟穿过1平方米的面积。下面我们就针对西洋参叶片蒸腾速率与气孔导度在不同光量子通量密度下的变化趋势来进行一次分析。由表1可知,晴天
高通量测序技术-中的“高通量”-是什么意思
高通量是相对于第一代测序的,第一代测序只能一次测1个样品的1段序列,产生的数据量相对来说很小,而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G,可以一次测很多的样本。在2000年的时候,3700、MegaBace等仪器上的测序也是高通量测序,是相对手工测序或者跑平板胶来说的。不过到2005年以后,高通
高通量组织研磨机低温以及高通量研磨工艺
高通量组织研磨机是一种特殊的、快速的、率的、多试管的一致系统。在水平方向上进行振动的,研磨球的惯性带动它们以高能量撞击位于弧形内表面的样品材料,从而达到粉碎研磨的效果。它能将任何来源(包括土壤、植物和动物的组织/器官、细菌、酵母、真菌、孢子、古生物标本等)的原始DNA、RNA和蛋白质进行提取和纯化
铁代谢是如何代谢的?
(一)铁的来源1.来自食物,正常人每天从食物中吸收的铁量1.0~1.5mg、孕妇2~4mg.2.内源性铁主要来自衰老和破坏的红细胞,每天制造红细胞所需铁20~25mg.(二)铁的吸收动物食品铁吸收率高(可达20%),植物食品铁吸收率低(1%~7%)。食物中铁以三价铁为主,必须在酸性环境中或有还原剂如
胆红素的代谢:肝内代谢
肝内代谢:肝脏对胆红素有摄取、转化、排泄的功能。1)摄取:胆红素随血运输到肝后,在膜上与白蛋白解离,并被肝细胞摄取。肝细胞内有Y蛋白和Z蛋白的两种色素受体蛋白。Y蛋白是肝细胞主要的胆红素转运蛋白,Z蛋白对长链脂肪酸具有很强的亲和力。Y、Z蛋白与进入胞质的胆红素结合,并将它运至内质网。2)转化:肝细胞
高通量基因点样仪
高通量基因点样仪是一种用于基础医学领域的医学科研仪器,于2016年11月17日启用。 技术指标 1.X 轴移动速度:50-250mm/s;Y 轴移动速度:100mm/s;Z 轴移动速度:100mm/s;X,Y,Z轴移动精度:± 0.2mm;划线头定位精度:± 0.2mm。2.划头最小间距:
光通量的定义
光通量(luminous flux)指人眼所能感觉到的辐射功率,它等于单位时间内某一波段的辐射能量和该波段的相对视见率的乘积。由于人眼对不同波长光的相对视见率不同,所以不同波长光的辐射功率相等时,其光通量并不相等。
转录组高通量测序
(第二代高通量测序技术-454) 转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu
高通量平行合成仪
产品描述:这是专为精细化工等行业研发设计的组合化学和多产品合成设备。该产品按反应板温度区域数量不同分为单区反应和多区反应;按多区反应板功能不同可分为加热型、加热/冷却型、回流型;按试管容量不同及试管的装载数量不同又可分成多个品种规格。 产品特点: ●模块化设计理念 1、一个反应
恒温核酸扩增技术通量
在实际的产业化中,分子诊断仪器的通量往往至关重要。对于qPCR而言,由于引物设计的成熟和荧光通道的多样性,往往可以比较好的实现高通量检测。由于恒温核酸扩增技术引物设计较为困难,单一的反应温度会造成引物和模板,引物与引物之间的非特异性链接和扩增,使得恒温扩增的检测通量受到限制。但同时也得益于反应温
高通量组织研磨器
高通量组织研磨器可以在3分钟内最多对2×96个样本同时进行快速、有效的研磨。可以干磨、湿磨和混合以及均质化处理。样本的种类包括:植物组织、动物组织、细胞、细菌和酵母等等。对于提取大通量样本中的核酸,大大提高研磨效率和质量。
高通量测序技术包括
高通量测序技术及原理介绍如下:高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术(“Next-generation” sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。测序技术推进科学研
高通量细胞迁移筛选
细胞迁移是一个活的生物生长和维持生命过程中不可缺少的的关键过程。为了完成相应的功能,体内的细胞经常会以特定的方向迁移到特定的位置。迁移是一个循环的过程,细胞向前端伸出突触,缩回其尾端。动物组织中的细胞发生迁移主要是为了响应特定的外部信号。细胞迁移对于胚胎发育、伤口愈合、分化以及免疫应答等都是非常重要
土壤碳通量系统相关
土壤碳通量系统是一种用于农学领域的分析仪器,于2012年03月15日启用。 技术指标 CH4量程:0.1-25 ppmv;CO2量程:200-4000 ppmv;H2O量程:7000-70000 ppmv 精度(5sec/5min)平均测量精度:CH4:1/0.3 ppb;CO2:150/5