科学家提出蛋白质—配体复合物柔性结构预测方法PackDock
作为细胞的“主力军”，蛋白质往往通过与小分子配体或其他蛋白质发生特异性结合来发挥功能。然而，蛋白质结构具有天然的动态性，配体结合也常伴随构象变化。因此，获得准确的结合构象是基于结构药物设计的重要前提。近日，中国科学院上海药物研究所研究团队提出了蛋白—配体复合物柔性结构建模新方法PackDock。该方法将生成式AI与物理算法相结合，用于预测柔性蛋白—配体复合物构象。研究显示，该方法在多种应用场景中展现出良好的精度与效率，并兼具较强的泛化能力。PackDock通过整合物理建模与深度学习方法，来表征蛋白质—配体相互作用，并通过考虑蛋白质在无配体（自由态）与配体结合态下的构象分布，可更精准地建模柔性蛋白—配体复合物的结合构象。同时，其核心模块PackPocket结合等变图神经网络与生成式建模策略，学习侧链构象空间的能量景观，并在不同状态分布中采样口袋侧链构象，以描述结合过程中可能发生的构象变化。研究表明，PackDock框架可兼容多种刚......阅读全文
Nature：从结构上揭示线粒体呼吸链超级复合物的组装机制
真核生物通过线粒体中的细胞呼吸产生生存所需的能量，这一过程被称为氧化磷酸化。在这个过程中，营养物质和氧气被转化为一种化学形式的能量：三磷酸腺苷（ATP）。这是由线粒体内的电子传递链建立的质子梯度实现的。这种质子梯度由线粒体内膜上的四种呼吸链复合物驱动。一项新的研究将断层扫描和分子模拟结合起来，揭示了
植物所等－绿藻光系统I超级复合物结构解析方面取得进展
光合生物的光系统I（PSI）是一个极高效率的光能吸收和转化系统，几乎每一个吸收的光子都能产生一个电子，其量子转化效率超过90%。因此PSI高效吸能、传能和转能的结构基础受到科学家的广泛关注。目前，原核生物蓝藻、真核生物红藻和高等植物PSI超级复合物结构都已被解析，然而绿藻PSI的高分辨率结构长期
Cell：新型CRISPRCas系统C2c2RNA复合物结构
2017年1月12日，Cell 杂志发表了中科院生物物理研究所王艳丽课题组关于Ⅵ型CRISPR-Cas系统的效应蛋白C2c2的结构研究。标题为“Two Distant Catalytic Sites Are Responsible for C2c2 RNase Activities”。该研究解析
2012诺奖得主最新PNAS文章
2012年荣获诺贝尔化学奖的是两位美国科学家：罗伯特・莱夫科维茨(Robert J. Lefkowitz)和布莱恩・科比尔卡(Brian K. Kobilka)，他们因“G蛋白偶联受体”研究领域的杰出贡献而获奖。 其中Brian K. Kobilka现任斯坦福大学医学院教授，美国科
中国科大揭示钙敏感受体CaSR非对称激活的分子机制
近日，中国科学技术大学生命科学与医学部教授田长麟课题组首次解析了人源钙敏感受体（Ca2+Sensing Receptor，CaSR）与下游信号传导蛋白Gq的高分辨三维复合物结构，结合细胞信号转导和核磁共振（NMR）揭示了CaSR蛋白受激动剂、正向别构调节剂等分子非对称激活的分子机制，相关研究成果
可刚可柔－新光控聚合物能转换特性
美国麻省理工学院研究人员18日在《自然》杂志上发表研究论文称，他们开发出一种新型聚合物，能够在不同波长光线照射下改变其结构，在刚性和柔性两种状态间转换。 聚合物的许多特性，如硬度和膨胀能力，都受其拓扑结构，即材料组成部分的排列方式的控制。通常，材料一旦形成，其拓扑结构就不能可逆地改变。而此次麻
肿瘤坏死因子超家族的介绍
目前，研究人员已经证实肿瘤坏死因子蛋白同系物超家族存在着29个不同的受体（图1）。这些受体可以被分为三个主要群体： 第一类受体是在胞质尾区包含死亡结构域（DD）。通过配体与相应的包含死亡结构域的受体结合可以招募胞内含有死亡结构域的受体，例如Fas相关死亡结构域蛋白（FADD/MORT1）和TN
肿瘤坏死因子的受体超家族的相关介绍
目前，研究人员已经证实肿瘤坏死因子蛋白同系物超家族存在着29个不同的受体（图1）。这些受体可以被分为三个主要群体： 第一类受体是在胞质尾区包含死亡结构域（DD）。通过配体与相应的包含死亡结构域的受体结合可以招募胞内含有死亡结构域的受体，例如Fas相关死亡结构域蛋白（FADD/MORT1）和TN
微流控芯片上基于核酸适配体的蛋白质检测方法研究
2016（第四届）先进体外诊断技术峰会于3月25日在上海顺利召开。此次会议邀请了国内外众多体外诊断方面的专家学者，以及在体外诊断领域取得不俗业绩的企业家代表。会议的第二天来自清华大学化学系的林金明教授做了精彩的演讲。演讲主要围绕着微流控芯片上给予核酸适配体的蛋白质检测方法研究。演讲中林教授提到。微流
缩胆囊素受体识别配体和G蛋白选择性的分子机制被揭示
中国科学院上海药物研究所蒋轶/徐华强团队、赵强团队、吴蓓丽团队、王明伟/杨德华团队和上海科技大学赵素文团队于Nature Chemical Biology背靠背在线发表了题目分别为 ”Ligand recognition and G protein-coupling promiscuity of
酪氨酸激酶的主要类型
酪氨酸激酶可分为三类：①受体酪氨酸激酶，为单次跨膜蛋白，在脊椎动物中已发现50余种；②胞质酪氨酸激酶，如Src家族、Tec家族、ZAP70家族、JAK家族等；③核内酪氨酸激酶如Abl和Wee。根据PTK是否存在于细胞膜受体可将其分成受体型和非受体型。受体型受体酪氨酸激酶（receptor prote
细胞增殖信号通路－FAS基因的临床解释
这个基因编码的蛋白质是肿瘤坏死因子受体超家族的一员。这个受体包含一个死亡结构域。它在细胞程序性死亡的生理调节中起着重要作用，并与多种恶性肿瘤和免疫系统疾病的发病机制有关。这种受体与其配体的相互作用允许形成一种死亡诱导信号复合物，包括fas相关死亡结构域蛋白（fadd）、caspase 8和caspa
FAS基因的结构特点和作用
这个基因编码的蛋白质是肿瘤坏死因子受体超家族的一员。这个受体包含一个死亡结构域。它在细胞程序性死亡的生理调节中起着重要作用，并与多种恶性肿瘤和免疫系统疾病的发病机制有关。这种受体与其配体的相互作用允许形成一种死亡诱导信号复合物，包括fas相关死亡结构域蛋白（fadd）、caspase 8和caspa
DNA损伤修复信号通路FAS基因的临床解释
这个基因编码的蛋白质是肿瘤坏死因子受体超家族的一员。这个受体包含一个死亡结构域。它在细胞程序性死亡的生理调节中起着重要作用，并与多种恶性肿瘤和免疫系统疾病的发病机制有关。这种受体与其配体的相互作用允许形成一种死亡诱导信号复合物，包括fas相关死亡结构域蛋白（fadd）、caspase 8和caspa
PROTAC技术的小分子降解剂类型概况
近年来，PROTAC技术以其可靶向传统“不可成药”蛋白的独特优势而备受医药研发人员的关注。目前对PROTACs技术的突破主要集中在对于E3连接酶类型的改变，使PROTACs由肽类向小分子转变。泛素连接酶E3是一个蛋白家族，泛素化修饰的失调会给生命体带来一系列负面影响,严重者将导致疾病,甚至危及生命，
研究发现胰高血糖素受体结构揭示G蛋白选择调控机制
近日，中国科学院上海药物研究所吴蓓丽研究组、赵强研究组与中国科学院生物物理研究所孙飞研究组和澳大利亚莫纳什大学Denise Wootten研究组合作，在G蛋白偶联受体（G protein-coupled receptor，GPCR）结构与功能研究领域取得又一突破性进展：解析了人源胰高血糖素受体（
兰州化物所采用3D打印柔性水凝胶前驱体制备复杂结构陶瓷
具有复杂几何形状的聚合物衍生陶瓷在环境科学和生物医学等工程领域具有应用价值。然而，固有脆性和刚性的树脂基陶瓷前驱体难以实现结构层次跨越不同尺度的陶瓷构件，限制了复杂陶瓷器件的高精度制造。柔性聚合物陶瓷前驱体的变形能力为实现大跨度结构陶瓷提供了一种理想的选择，但现有的陶瓷前驱体柔韧性和重构性差。因
新兴半导体：一种透明柔性的单晶硅微框架结构
柔性、透明是光电子器件的发展趋势，柔性透明的器件能够不易察觉的与其他器件或物体进行集成，在电子皮肤、物联网、透明柔性显示器和人工视觉等领域有着巨大的应用潜力。然而，发展新型柔性、透明电子器件首先需要克服的就是材料问题。传统光电子器件主要是依靠半导体这一成熟的材料体系，但是目前常用的半导体材料都是
癌症相关的基因突变类型及临床解释－ARNT
该基因编码一个含有一个基本螺旋环螺旋结构域和两个特征性PAS结构域以及一个PAC结构域的蛋白质编码的蛋白质与配体结合的芳香烃受体结合，并有助于该复合物向细胞核移动，在细胞核中促进参与外源代谢的基因的表达该蛋白也是缺氧诱导因子1转录调控的共因子。该位点与12号染色体上的etv6（ets变异体6）基因的
ARNT基因的结构特点及作用
该基因编码一个含有一个基本螺旋环螺旋结构域和两个特征性PAS结构域以及一个PAC结构域的蛋白质编码的蛋白质与配体结合的芳香烃受体结合，并有助于该复合物向细胞核移动，在细胞核中促进参与外源代谢的基因的表达该蛋白也是缺氧诱导因子1转录调控的共因子。该位点与12号染色体上的etv6（ets变异体6）基因的
核酸适配体应用于细胞成像
荧光标记适配体或适配体复合物是适配体应用于细胞成像的基础。流式细胞仪、荧光分光光度计常被用于测定荧光标记适配体与靶细胞结合力的大小，荧光显微镜能够呈现复合物的直观图像。Wang 等基于FISH技术和荧光标记的特异性DNA 适配体构建了绿脓假单胞菌的成像检测系统。荧光适配体探针还可以用于细胞内部的显微
揭示血清素5HT6受体高组成性活性的分子机制
3月30日，《美国国家科学院刊》（PNAS）在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）汪胜研究组和丛尧研究组完成的研究成果（Structural insights into constitutive activity of 5-HT6 receptor）。该研究通
研究揭示血清素5HT6受体高组成性活性的分子机制
《美国国家科学院刊》（PNAS）在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）汪胜研究组和丛尧研究组完成的研究成果（Structural insights into constitutive activity of 5-HT6 receptor）。该研究通过解析血清素
科学家揭示基因表达调控核心复合物LDB1/SSBP2的分子机制
近期，《美国国家科学院院刊》（PNAS）在线发表了题为Crystal structure of human LDB1 in complex with SSBP2 的论文，该项工作由中国科学院生物物理研究所许文青/梁栋材课题组和美国国立卫生研究院Ann Dean课题组合作完成。 增强子是一种控制
科学家发现基因表达调控核心复合物LDB1/SSBP2的分子机制
12月31日，《美国国家科学院院刊》（PNAS）在线发表了题为Crystal structure of human LDB1 in complex with SSBP2 的论文，该项工作由中国科学院生物物理研究所许文青/梁栋材课题组和美国国立卫生研究院Ann Dean课题组合作完成。 增强子是
什么是柔性直流输电
柔性直流输电是一种基于电压源变换器、自开关器件和脉宽调制（PWM）的新型传输技术。该技术具有向无源网络供电、无换相故障、换相站间无通信、易于构建多终端直流系统等优点。柔性直流输电系统两端换流站由换流站和换流变压器设备、换流电抗设备等组成。变结构控制是变结构控制的核心部分，由电流桥和直流电容组成。柔性
Fluidity－OneW在分析复杂背景中蛋白质的相互作用的应用
Fluidic Analytics公司总部位于英国剑桥，致力于为实验室、诊所和其他用户提供蛋白质研究的创新仪器、软件和服务。目前Fluidic Analytics在欧洲、北美和亚洲有分公司和合作伙伴，并积极寻找新的合作伙伴。Fluidity One-W是Fluidic Analytics公司
上海药物所G蛋白偶联受体结构与功能研究取得突破性进展
3月21日，美国《科学》杂志(Science)同期发表两篇在线文章，介绍了中科院上海药物研究所徐华强课题组、蒋华良课题组、美国Scripps研究所Ray Stevens课题组、北卡罗那大学(UNC -Chapel Hill)Bryan Roth课题组的联合研究成果。该项研究成功解析了五羟
溶菌酶一般是由什么细胞产生的
由细胞核糖体合成的，再由内质网包裹为溶菌酶体。利用蛋白质和酶的生物学特异性，即蛋白质或酶与其配体之间所具有的专一性亲和力而设计的色谱技术。酶一底物复合物形成之后，在一定的条件下分离复合物便得到纯净的酶。溶菌酶化学性质非常稳定，当pH值在一定范围内剧烈变化时，其结构几乎不变。溶菌酶不可逆变性的临界点是
中科院发表最新Nature文章
来自中国科学院上海药物研究所、美国国立卫生研究院、南加州大学等机构的研究人员，在G蛋白偶联受体（GPCR）研究领域取得重大研究突破，揭示出了人类P2Y1受体的三维结构，发现了这一受体具有两个完全不同的配体结构位点。这些重要的研究成果发表在3月30日的《自然》（Nature）杂志上。 中国科学院