首个家鸡泛三维基因组图谱构建成功
鸡是如何从野生原鸡演化为如今的高产肉鸡或蛋鸡的？其背后的基因“开关”在哪里？近日，华南农业大学动物科学学院家禽遗传育种研究团队联合国内多家单位，成功构建了首个高分辨率家鸡泛三维基因组图谱。相关成果发表于《先进科学》（Advanced Science）。“该研究成果就像是一张高精度的‘立体导航图’，将家鸡泛基因组研究拓展到三维基因组水平，系统解析了结构变异（SV）在染色质三维结构中的调控作用，揭示了其在家鸡驯化及重要生产性状中的分子机制，为家鸡功能基因组学的研究提供了新的见解。”论文责任通讯作者、华南农业大学教授聂庆华对《中国科学报》表示。作为最早完成全基因组测序的家养动物之一，鸡的遗传密码一直备受关注，其自驯化以来一直是人们获取高质量蛋白质的重要来源。然而，关于SV如何通过三维基因组调控家鸡驯化及重要生产性状的系统性解析仍然缺乏。在国家重点研发计划、国家自然科学基金等项目资助下，研究团队整合了全球28个染色体水平的家鸡基因组和1......阅读全文
致榆树枯萎病真菌基因组图谱绘制完成
据《每日科学》网站近日报道，加拿大多伦多大学研究人员宣布，他们已成功绘制出可引起榆树枯萎病的真菌的基因图谱，该图谱包含有3000万个DNA(脱氧核糖核酸)字符。此项研究成果发表在本周《BMC基因组学》网络版上。 研究报告作者之一、多伦多大学细胞和系统生物学助理教授艾伦·摩西称，从本质上说，
云南怒江草果全基因组精细图谱绘制成功
从20世纪70年代开始，云南省怒江州就开始种植草果，到2020年，种植面积已达111万亩，不仅是全国草果的核心产区，也是当地群众脱贫致富的重要经济作物。 为了加快提高草果遗传改良效率，培育高产、抗病、优质、安全新品种，对从源头创新保障草果产业健康可持续发展，2019年9月，怒江州联合华南农业
Nature里程碑成果：扩展人类表观基因组图谱
10年前，科学家们宣布人类基因组计划(Human Genome Project)完工。通过这一国际项目人们旨在了解人类独特的四种核苷酸——腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶和鸟嘌呤的组合。这一生物学字母表帮助研究人员确定了人类基因组中大约2.5万个编码基因，然而随着时间的推移，他们开始提出一些关于这些
研究绘制迄今最大规模个人表观基因组图谱
日前，复旦大学类脑智能科学与技术研究院杨禹丞等DNA元件百科全书计划国际合作团队，首次绘制迄今全球最大规模个人表观基因组图谱。作为人类基因组计划以来最大的基因组学协作计划，“DNA元件百科全书计划”（Encyclopedia of DNA Elements）从2003年启动至今整整20周年；本研
中科院昆明动物所家鸡矮小化研究获得系列进展
中科院昆明动物所在家鸡矮小化研究中获得系列进展，相关研究成果发表在《分子生物学与进化》杂志上。 人类的驯化和选育使得家鸡成为表型多样性最为丰富的动物之一。在体型大小方面，大型肉鸡或斗鸡（>5 kg）和小型观赏鸡（约0.5 kg）可达到10倍以上的悬殊差异。其中，家鸡的矮小化在蛋鸡和观赏鸡选育
家鸽(或家鸡)的外形及解剖实验（一）
实验方法原理 1. 通过对家鸽（或家鸡）外形、骨骼及解剖结构的观察，认识鸟类各系统的基本结构及其适应于飞翔生活的主要特征； 2. 学习解剖鸟类的方法。实验材料 标本活家鸽仪器、耗材 钟形罩乙醚解剖盘骨剪剪刀镊子实验步骤 一、家鸽（或家鸡）骨骼系统的观察 1. 脊柱区分颈椎、胸椎、腰椎、荐椎
家鸽(或家鸡)的外形及解剖实验（二）
二、家鸽(或家鸡)的内部解剖 在实验前20～30 min，将家鸽（或家鸡）放入装有乙醚的钟形罩中，使其麻醉致死。或紧捏实验动物的胁部，令其窒息而死。 解剖标本之前，先进行外形观察。家鸽（或家鸡）具有纺锤形的躯体。全身分头、颈、躯干、尾和附肢5部分。除喙及跗跖部具角质覆盖物以外，全身被覆羽毛。头前端有
Genome－Biology：构建猪体细胞染色质三维结构图谱
猪不仅是重要的经济家畜，在生物医学领域也有重要应用。生猪的育种中广泛应用了辅助生殖技术，包括体外受精技术、孤雌和孤雄生殖技术等。但与体外受精胚胎相比，孤雌和孤雄胚胎的存活率级低。这一存活率差异产生的机制目前还不清楚。深入理解这一机制不仅有助于增加商业化猪育种的产仔数，也将有利于生物医学研究中转基
中国科学家绘制全球首个高精度完整肝脏三维病理图谱
中国科学院上海药物研究所所副研究员张小川、研究员高召兵，临港实验室研究员殷宪振合作，绘制了全球首个高精度完整肝脏三维病理图谱，为破解肝纤维化等慢性肝病难题提供了革命性研究工具。3月24日，相关研究发表于《先进科学》。据统计，我国脂肪肝患者已超过2亿，构成日益严峻的公共卫生挑战，全球每年因肝硬化死亡人
小而精，科学家绘制大脑皮层神经元三维图谱
研究人员以惊人的细节绘制了人类大脑的一小部分，由此产生的细胞图谱近日发表于《科学》，并可在网上获取。图谱揭示了被称为神经元的脑细胞、围绕自身形成结的细胞，以及几乎互为镜像的成对神经元之间的新连接模式。基于电子显微镜数据的渲染，图片显示了大脑皮层片段中神经元的位置。图片来源：哈佛大学三维图谱覆盖了大约
昆明动物所揭示家鸡视觉退化的无意识选择作用机制
经过长期的驯化和人工选择作用，家鸡与其野生祖先红原鸡除了在行为、体型、生殖周期和生长速度等存在显著差异外，其视觉功能也显著衰退。目前研究理论认为这种视觉退化是由于选择压力放松导致，但是至今这种视觉退化的遗传机制并不清楚。 中国科学院昆明动物研究所张亚平研究团队基于家鸡和红原鸡的群体基因组数据，
研究揭示核纤层蛋白塑造三维基因组空间秩序机制
核纤层是紧贴内核膜内侧的蛋白网状结构，主要由核纤层蛋白（lamins）及其结合蛋白构成。人类的lamins在发育、衰老及疾病过程中扮演关键角色，分为由LMNA基因编码的A型和分别由LMNB1和LMNB2编码的B型。目前，在LMNA基因中已鉴定出超600种致病突变，这些突变可导致儿童早衰症、扩张型心肌
张亚平研究组Cell－Res揭示家鸡视觉退化的遗传机制
经过长期的驯化和人工选择作用，家鸡与其野生祖先红原鸡除了在行为、体型、生殖周期和生长速度等存在显著差异外，其视觉功能也显著衰退。目前研究理论认为这种视觉退化是由于选择压力放松导致，但是至今这种视觉退化的遗传机制并不清楚。 中国科学院昆明动物研究所张亚平研究团队基于家鸡和红原鸡的群体基因组数据，
我国科学家发布大黄鱼全基因组图谱
由浙江海洋学院、上海交通大学、复旦大学等高校研究机构联合破译的大黄鱼全基因组图谱，日前在世界权威期刊——《自然》周刊发表。这是继半滑舌鳎之后，我国公布的第二个海水鱼类的基因组图谱，也是世界上第一个石首科鱼类基因组图谱，标志着我国海洋生物学的研究真正进入基因组时代。 自1985年大黄鱼人工养殖
我国完成首部高原濒危物种全基因组序列图谱
12月25日，由青海大学和深圳华大基因研究院共同发起并承担的藏羚羊基因组序列图谱在青海大学医学院宣告绘制完成，这是世界上第一部绘制完成的高原濒危物种全基因组序列图谱，也是中国科学家对全球基因组科学的又一重大贡献。 藏羚羊是我国青藏高原特有的物种，其生存环境高寒、缺氧，自然条件极为严酷。在喜
蔬菜中心：绘成世界首张西瓜基因组序列图谱
我国是世界第一西瓜生产与消费大国，但是人们却始终未能从外到内了解它，直到2013年1月，国际学术顶级刊物《自然·遗传学》发表了世界首张西瓜基因组序列图谱（影响因子35.532），标志着人类成功破译了西瓜遗传“密码”。这项由蔬菜中心主任许勇的研究团队牵头进行的科研创新，为高效培育兼具优质、高产、抗
中国首份个人基因组图谱将在1年内出炉
每个人的基因都能刻成盘？ 采访人：记者 余建斌 点评人：浙江大学遗传与基因组医学中心主任 祁 鸣 来源：人民网－《人民日报》 事件 人民网综合消息诺贝尔奖获得者、被人称为“ＤＮＡ之父”的吉姆·沃森得到了一份特殊奖品：一张含有组成他基因的３０亿个ＤＮＡ单位详细信息的光盘，颁奖仪式３１
最广泛的人类基因组相互作用图谱
最近，英国剑桥Babraham研究所和伦敦Francis Crick研究所的研究人员，开发并使用了一种新的技术，将基因组拼图中的点连接起来。就像连接点拼图，需要完成才能看到整幅图片，研究者的这项分析把称为启动子和增强子的调控因子连接起来，并指出了它们在小鼠和人类基因组中长距离内的物理相互作用。确
海南大学团队定义植物基因组学“终极参考图谱”
近日，记者从海南大学获悉，该校三亚南繁研究院陈飞教授团队首次构建了“分型端粒到端粒超级泛基因组”理论体系，实现了植物基因组从个体单倍型完整到群体遗传多样性全覆盖的技术跨越。相关成果发表在国际期刊《植物科学趋势》。植物基因组研究长期受制于参考基因组的局限——传统组装难以解析着丝粒、端粒等复杂区域，且无
多国科学家破解硬粒小麦全基因组图谱
近日，来自意大利、加拿大、德国等多国科研机构的科学家共同在Nature Genetics上发表了题为“Durum wheat genome highlights past domestication signatures and future improvement targets”的文章，绘制
我国学者首次绘制一串红基因组图谱
北京市园林科学研究院21日对外称，由该研究院和北京林业大学合作共同完成了一串红高质量的基因组图谱绘制项目工作，这使我国成为世界上首个绘制出一串红基因组图谱的国家。图片来源于网络 唇形科是开花植物中的第六大科，包括约236个属，6900—7200个种类。而一串红则隶属唇形科鼠尾草属，其花色艳丽
荷兰科研人员首次绘出女性个人基因组图谱
荷兰科研人员5月26日说，他们首次绘出女性的个人基因组图谱，这将有助于深入研究人的遗传多样性。 荷兰莱顿大学医学中心发表的一份声明说，科研人员已测定该中心一位女性临床遗传学家的基因组序列，她是基因组被完整测序的首位女性和首位欧洲人。 基因组是指包含在生物DNA（脱氧核糖核酸）中的全部遗传信息。此前科
找到“广陈皮”效用线索－破译茶枝柑基因组图谱
茶枝柑，主要分布于广东新会等地，其果皮制干即为中药“广陈皮”，含有多种生物活性成分。多甲氧基黄酮是广陈皮中关键的药用成分，目前尚不清楚其生物合成的遗传基础及调控机制。5月11日，深圳华大生命科学研究院联合华南农业大学、中国药科大学、南京中医药大学，通过多组学技术破译了茶枝柑基因组的遗传图谱，揭示了多
顶级实验室《Nature》发布表观基因组学图谱
基因组中表观遗传变化是能遗传的，近期来自Salk生物学研究所等处的一组研究人员完成了一项野生植物表观基因组学全范围内的研究分析，从中发现了这种修饰与遗传信息相互作用的共同模式。这一成果公布在3月7日Nature杂志在线版上。 文章通讯作者是Salk研究所的著名教授Joseph R. E
《自然—生物技术》：美教授“自绘”个人基因组图谱
斯蒂芬·夸克(Stephen Quake) 一台机器、3个人、5万美元，美国斯坦福大学教授斯蒂芬·夸克(Stephen Quake)最近用“自绘”个人基因组图谱的经历说明，这项“游戏”已不再是谁也玩不起的了。 斯坦福大学8月10日发表声明说，夸克在两名同事的帮助下，利用一台冰箱大
NIH－340万美元资助癌症基因组图谱研究计划
美国国立卫生研究院于当地时间7月2日宣布，决定对八个单位（或个人）进行为期两年、总值340万美元的资助，以支持癌症基因组图谱研究计划（Cancer Genome Atlas pilot program）。 癌症基因组图谱计划是美国国立癌症研究所和美国国家人类基因组研究的合作项目，于2005年晚期，
首个山羊基因组图谱在《自然•生物技术》杂志发表
2012年12月24日，由中国科学院昆明动物研究所、深圳华大基因研究院等单位合作完成的首个山羊全基因组图谱在《自然•生物技术》(Nature Biotechnology)杂志在线发表。本研究采用新一代测序技术(NGS)与全基因组酶切图谱(Whole-genome mapping)技术相结
Cell绘制广泛的人类基因组互作图谱
来自欧洲分子生物学实验室(EMBL)、斯坦福大学的科学家们阐明了，我们的基因表达在DNA中受控的机制。发表在《细胞》(Cell)杂志上的这项新研究，将促成更好地了解某些遗传变异可以开启或关闭控制基因表达的调控元件，最终表现为个体特征和疾病易感性的机制。 这些变异存在于非直接负责编码基因，而是发
我国科学家完成甜橙基因组图谱找到甜橙起源
甜美又不上火的甜橙来源于柚作为母本和橘杂交，其后代再与橘杂交而形成的杂种。华中农业大学徐强博士等人26日发表在国际著名学术刊物《自然-遗传学》题为“甜橙基因组图谱”的研究论文，提出了甜橙起源这一新理论。 专家表示，甜橙基因组将在理论上为柑橘基因功能研究提供框架，也将在应用上为果实品质包括色
首张拓扑异构酶II全基因组剪切图谱
DNA切割酶对基因结构调节起着关键作用。研究人员发现，它在导致癌症的（如白血病和实体瘤）易位（translocations）异常重排中表现活跃。 II型拓扑异构酶（type II topoisomerase， TOP2）通过断裂DNA双链磷酸二酯键，来更正DNA连环数，使细胞DNA正常转录、复