首个家鸡泛三维基因组图谱构建成功
鸡是如何从野生原鸡演化为如今的高产肉鸡或蛋鸡的?其背后的基因“开关”在哪里?近日,华南农业大学动物科学学院家禽遗传育种研究团队联合国内多家单位,成功构建了首个高分辨率家鸡泛三维基因组图谱。相关成果发表于《先进科学》(Advanced Science)。“该研究成果就像是一张高精度的‘立体导航图’,将家鸡泛基因组研究拓展到三维基因组水平,系统解析了结构变异(SV)在染色质三维结构中的调控作用,揭示了其在家鸡驯化及重要生产性状中的分子机制,为家鸡功能基因组学的研究提供了新的见解。”论文责任通讯作者、华南农业大学教授聂庆华对《中国科学报》表示。作为最早完成全基因组测序的家养动物之一,鸡的遗传密码一直备受关注,其自驯化以来一直是人们获取高质量蛋白质的重要来源。然而,关于SV如何通过三维基因组调控家鸡驯化及重要生产性状的系统性解析仍然缺乏。在国家重点研发计划、国家自然科学基金等项目资助下,研究团队整合了全球28个染色体水平的家鸡基因组和1......阅读全文
破译对虾基因组-获国际首个高质量对虾基因组参考图谱
由中国科学院海洋研究所相建海和李富花研究组主导的研究团队,与国内外多家单位共同合作,历时十年成功破译凡纳滨对虾基因组,获得国际首个高质量对虾基因组参考图谱,研究成果于1月21日在《自然-通讯》(Nature communications)在线发表,为甲壳动物研究及对虾基因组育种和分子改良提供了重
中国启动十万人基因组计划:绘制国人精细基因组图谱
科学家们希望通过绘制中国人精细基因组图谱,来研究疾病健康和基因遗传的关系。 此次启动的“中国十万人基因组计划”覆盖地域包含我国主要地区,涉及人群除汉族外,还将选择人口数量在500万以上的壮族、回族等9个少数民族。 基因是DNA上有遗传效应的片断,人类的生、老、病、死等都与基因有关。而基因组和
海洋所成功破译对虾基因组并获得国际首个基因组图谱
由中国科学院海洋研究所相建海和李富花研究组主导的研究团队,与国内外多家单位共同合作,历时十年成功破译凡纳滨对虾基因组,获得国际首个高质量对虾基因组参考图谱,研究成果于1月21日在《自然-通讯》(Nature communications)在线发表,为甲壳动物研究及对虾基因组育种和分子改良提供了重
家鸽(或家鸡)的外形及解剖实验
实验方法原理1. 通过对家鸽(或家鸡)外形、骨骼及解剖结构的观察,认识鸟类各系统的基本结构及其适应于飞翔生活的主要特征; 2. 学习解剖鸟类的方法。实验材料标本活家鸽仪器、耗材钟形罩乙醚解剖盘骨剪剪刀镊子实验步骤一、家鸽(或家鸡)骨骼系统的观察 1. 脊柱区分颈椎、胸椎、腰椎、荐椎和尾椎。
Science:新的人类早期胚胎三维图谱或改写医学教科书
最近,荷兰阿姆斯特丹学术医疗中心的一组研究人员,绘制了一副最新的互动式3D图谱,描绘了人类胚胎发育的各个阶段――从怀孕开始到两个月,他们将这一研究结果发表在11月25日的《Science》杂志上。这项研究列举了医学课本正在过时的原因、他们该如何解决这个问题、这副新图谱的特点,以及它可能对未来的医学研
全球首例微米级脑机接口三维图谱在武汉亮相
“精度达到头发丝的二十分之一,为脑疾病治疗、人机交互等临床应用提供全新解决方案。”3月26日,全球首例微米级脑机接口多模态三维图谱在武汉发布。与传统毫米级医学影像相比,新技术将分辨率提升1000倍至微米级。这项突破让医生做脑部手术时,能像用手机导航一样看清每条神经的位置。华中科技大学同济医学院附属协
Cell-Res封面文章:新型三维基因组成像系统
来自中科院生物物理研究所,中科院动物研究所等处的研究人员发展了一种新型三维基因组活细胞成像工具TTALE,并利用该系统实现了对端粒缩短和着丝粒构象变化等衰老伴随的染色质结构改变的精准成像。此外,该研究发现了核仁区核糖体DNA拷贝数减少可以作为人类衰老的新型分子标志物。上述成果为在遗传和表观遗传水
研究发展出新型三维基因组成像系统
4月7日,《细胞研究》发表了中国科学院生物物理研究所刘光慧课题组和徐涛课题组,以及中科院动物研究所曲静课题组合作的题为Visualization of Aging-Associated Chromatin Alterations with an Engineered TALE System的研究
研究发展出新型三维基因组成像系统
4月7日,《细胞研究》发表了中国科学院生物物理研究所刘光慧课题组和徐涛课题组,以及中科院动物研究所曲静课题组合作的题为Visualization of Aging-Associated Chromatin Alterations with an Engineered TALE System的研究
Cell:基因组三维结构存在细胞异质性
美国国家癌症研究所、哈佛大学、马萨诸塞大学和麻省理工学院联合开展的一项研究发现,不同细胞和不同等位基因之间的基因组组织结构存在很大差异。这项研究成果于本周发表在《Cell》杂志上。 研究人员利用高通量的染色质构象捕获(Hi-C)和高通量的荧光原位杂交(hiFISH)光学图谱绘制来分析人包皮成纤
我国学者揭示麒麟鸡卷羽性状的遗传机制
家鸡的羽毛具有丰富的表型多样性,其遗传基础一直是家鸡遗传学研究中热点。相关研究在生产中具有重要的应用价值。例如,隐性白羽性状已成为肉鸡配套系中常用的标记之一。除了羽色,羽毛在结构上也表现出多种表型。相比于正常的片羽,卷羽(frizzle)表现为羽毛翻卷(图1),在观赏鸡育种中颇受青睐。此外,卷羽
家鸡卷羽性状的遗传机制研究获进展
家鸡的羽毛具有丰富的表型多样性,其遗传基础一直是家鸡遗传学研究中的热点。相关研究在生产中具有重要的应用价值。例如,隐性白羽性状已成为肉鸡配套系中常用的标记之一。除了羽色,羽毛在结构上也表现出多种表型。相比于正常的片羽,卷羽(frizzle)表现为羽毛翻卷(图1),在观赏鸡育种中颇受青睐。此外,卷
香港中大破解鼻咽癌全基因组图谱
香港中文大学7日宣布,该校医学院研究人员成功破解鼻咽癌的全基因组图谱,这一突破性发现有助评估鼻咽癌病人的预后情况,并向鼻咽癌的个人化治疗迈出一大步。 鼻咽癌是华南地区常见的癌症,也是一种极具侵略性的头颈癌。据介绍,鼻咽癌大多与感染EB病毒相关。由于缺乏早期病征,60%至70%患者于确诊时已届晚
Nature里程碑成果:扩展人类表观基因组图谱
10年前,科学家们宣布人类基因组计划(Human Genome Project)完工。通过这一国际项目人们旨在了解人类独特的四种核苷酸——腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶和鸟嘌呤的组合。这一生物学字母表帮助研究人员确定了人类基因组中大约2.5万个编码基因,然而随着时间的推移,他们开始提出一些关于这些
Science:绘制一张复杂疾病基因组图谱
尽管研究人员已经利用全基因组关联研究(GWAS)确定了与人类疾病相关的遗传因素,但是要解释这些数据,还需要清楚的了解这些新的风险基因是如何被调控的。 近期Science杂志发布了最新研究成果,解析了人类天然免疫系统中的遗传调控网络,并且也指出了这些信息如何能直接用于理解自身免疫疾病的遗传学
科学家绘制出首幅小麦基因组物理图谱
《科学》:有助于培育出更高产和抗旱的小麦新品种 一个由法国、美国、澳大利亚等国科学家组成的研究小组日前为小麦的一个基因组绘制出了首幅物理图谱,这一成果将有助于科学家培育出更高产和抗旱的小麦新品种。 基因组物理图谱是指有关构成基因组的全部基因的排列和间距的信息,它是通过对构成基因组的DNA分子进行
我国公布世界首个辣木基因组图谱
记者从云南农业大学获悉:由云南农业大学、云南省高原特色农业产业研究院等6家单位联合组成的科研团队,经过一年多的努力,破译了辣木的三亿一千六百万对碱基排序,完成了世界上首个辣木基因组精细图谱绘制工作。该基因组的解析,为辣木的育种、药理研究、病虫害防治、推广等提供了重要的依据,将辣木研究带入到分子育
我国完成世界首张-西瓜基因组序列图谱
由北京市农林科学院蔬菜平台牵头,联合了中国农业科学院、深圳华大基因科技有限公司、美国康奈尔大学、荷兰瑞克斯旺等优势单位,共同完成了世界首张西瓜基因组序列图谱绘制与破译,获得了高质量的西瓜基因组序列图谱,成为由中国主导完成的世界第一张西瓜基因组序列
高精度亚洲猪参考基因组图谱绘制成功
近日,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所动物基因工程与种质创新科技创新团队联合北京相关生物企业等单位成功绘制了梅山猪高质量基因组图谱。该图谱是迄今为止精度最高的亚洲猪基因组图谱,为我国地方猪种质资源保护和开发利用奠定了基础。相关成果发表于《分子生态资源(Molecular Ecology Reso
科学家破译茶枝柑基因组遗传图谱
茶枝柑属于芸香科柑橘属宽皮橘物种,是历经700多年驯化栽培的柑橘变种,其果皮制干即为中药“广陈皮”,含有多种生物活性成分。多甲氧基黄酮是“广陈皮”中关键的药用成分,但目前对其生物合成的遗传基础及调控机制知之甚少。近日,我国科学家在“广陈皮”活性成分合成调控机制研究方面取得重要进展,他们通过多组学技术
科学家绘制高精度类人猿基因组图谱
一个国际科研团队宣布,他们新近绘制出红毛猩猩和黑猩猩这两种类人猿的高精度基因组图谱。与过去类似研究不同的是,这次没有参照人类基因组图谱,因此更准确地揭示了人类与类人猿的基因差异。 利用第三代基因测序技术和先进的拼接方法,美国华盛顿大学等机构研究人员绘制出的这个高精度基因组图谱,对人与类人猿基因组
我国自主完成首个果树作物基因组序列图谱
华中农业大学今天透露,该校科研人员经过一年多努力,已绘制完成甜橙的全基因组序列图谱。这是我国自主完成的第一个果树作物基因组序列图谱。这一农业科技基础研究成果,将对加快我国柑橘品种改良,改变柑橘品种大量依赖进口的状况,提升我国柑橘产业的核心竞争力起到重要作用。 据悉,柑橘是世界栽培面积
科学家绘制褐牙鲆全基因组精细图谱
近日,中国水产研究院黄海水产研究所研究员陈松林领导的研究组与上海海洋大学、德国维尔茨堡大学、葡萄牙阿尔加夫大学、深圳华大基因研究院等单位合作,破译了褐牙鲆全基因组序列,通过与半滑舌鳎全基因组比较分析,初步揭示了比目鱼变态发育的分子机制。该研究成果发表于《自然—遗传学》。 通过与半滑舌鳎全基因组
科学家绘制褐牙鲆全基因组精细图谱
近日,中国水产研究院黄海水产研究所研究员陈松林领导的研究组与上海海洋大学、德国维尔茨堡大学、葡萄牙阿尔加夫大学、深圳华大基因研究院等单位合作,破译了褐牙鲆全基因组序列,通过与半滑舌鳎全基因组比较分析,初步揭示了比目鱼变态发育的分子机制。该研究成果发表于《自然—遗传学》。 通过与半滑舌鳎全基因组
云南怒江草果全基因组精细图谱绘制成功
从20世纪70年代开始,云南省怒江州就开始种植草果,到2020年,种植面积已达111万亩,不仅是全国草果的核心产区,也是当地群众脱贫致富的重要经济作物。 为了加快提高草果遗传改良效率,培育高产、抗病、优质、安全新品种,对从源头创新保障草果产业健康可持续发展,2019年9月,怒江州联合华南农业
研究绘制迄今最大规模个人表观基因组图谱
日前,复旦大学类脑智能科学与技术研究院杨禹丞等DNA元件百科全书计划国际合作团队,首次绘制迄今全球最大规模个人表观基因组图谱。作为人类基因组计划以来最大的基因组学协作计划,“DNA元件百科全书计划”(Encyclopedia of DNA Elements)从2003年启动至今整整20周年;本研
研究绘制迄今最大规模个人表观基因组图谱
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/497746.shtm 日前,复旦大学类脑智能科学与技术研究院杨禹丞等DNA元件百科全书计划国际合作团队,首次绘制迄今全球最大规模个人表观基因组图谱。作为人类基因组计划以来最大的基因组学协作计划,“DN
全球首张榨菜高质量基因组图谱问世
9月6日,《自然-遗传》(Nature Genetics)杂志在线发表了浙江大学农业与生物技术学院园艺系教授张明方团队的最新研究成果,课题组通过高通量测序技术,绘制了世界上第一张榨菜全基因组图谱,并从基因组选择与进化层面解答了榨菜“家乡味”的成因,这一进展将对芥菜类蔬菜作物的改良产生重要意义。
我国科学家完成扇贝基因组精细图谱绘制
日前,中国海洋大学教授包振民团队完成了扇贝基因组精细图谱绘制,探究原始动物祖先染色体核型进化、躯体结构多样性产生、眼睛起源及其调控机制等,在动物宏观进化研究领域取得重要进展。相关成果日前发布于《自然.生态学与进化》。 动物界99%的物种隶属于双侧对称动物,进化学家推测这些双侧对称动物可能起
致榆树枯萎病真菌基因组图谱绘制完成
据《每日科学》网站近日报道,加拿大多伦多大学研究人员宣布,他们已成功绘制出可引起榆树枯萎病的真菌的基因图谱,该图谱包含有3000万个DNA(脱氧核糖核酸)字符。此项研究成果发表在本周《BMC基因组学》网络版上。 研究报告作者之一、多伦多大学细胞和系统生物学助理教授艾伦·摩西称,从本质上说,