“寄生虫”DNA片段会破坏癌症基因组稳定性
27日的《科学》杂志发表了一项研究,揭示了人类基因组中一类可“跳跃”的DNA片段——被称为遗传“寄生虫”的LINE-1(L1)元件,如何成为破坏癌症基因组稳定性的主要力量。基因组的不稳定正是癌症演化的温床,为恶性细胞提供了更多生长、适应和逃避治疗的机会。该研究挑战了传统观点,发现了对癌症基因组有全面影响的一个关键因素。西班牙巴塞罗那基因组调控中心联合多国团队此次聚焦于肿瘤中异常活跃的L1元件,并采用长读长测序新技术,首次完整描绘了这类“跳跃基因”对癌症基因组结构的全面影响。他们发现,L1不仅能通过插入突变破坏单个基因,更能驱动大规模且具有破坏性的基因组结构重排,例如缺失、易位等。在分析的10个L1高活性肿瘤中,共观察到6418次跳跃事件,其中大约每40次跳跃就会引发一次大规模结构改造,这种重排有3/4是传统短读长测序技术难以检测的。尤为重要的是,约65%的L1事件发生在肿瘤演化的早期阶段,且大多出现在“全基因组倍增”(癌细胞复制......阅读全文
发现新基因与3/4癌症有关
据国外媒体报道,意大利科学家最近发现了一种基因,近四分之三的癌症与它有关。这一重大发现增加了找到治愈癌症新方法的希望。 研究人员在西班牙巴塞罗纳召开的欧洲癌症大会上公开了这一发现。他们说,一种叫Trop-2的基因在很多常见的肿瘤上扮演着重要角色,其中包括乳腺癌、结肠癌、胃癌、肺癌、前列腺癌、子房
北京迈基诺:检测你的癌症基因
最常见的两个用药检测是罗氏的赫赛汀和阿斯利康的易瑞沙。前者对HER2阳性的乳腺癌患者有效;后者对EGFR突变的非小细胞肺癌患者有效。赫赛汀 1998年就已上市,相应的检测在医院已经很成熟。易瑞沙2008年在国内上市,相应的检测还没能在医院全部推行。今年6月,又一款新药获批在中国上市,用药之前
Nat-Commun:癌症——基因突变的起源
DNA的复制是细胞分裂的前提。但是,在存在某些破坏性成分的情况下,细胞将无法很好地执行相关操作,复制过程将变得更加缓慢且效率较低,这种现象称为“复制压力”。虽然已知“复制压力”与遗传突变的增加有关,但至今仍不清楚起作用的确切机制。 最近,日内瓦大学(UNIGE)的研究人员阐明了在“复制压力”下
基因检测可提高癌症治愈率?
据报道,三年前,弗雷德-巴克(Fred Barker)被诊断出患有一种罕见的肾上腺恶性癌症,多数患上此病的人寿命将少于半年。而高度复杂的基因测试改变了癌症的治疗方式,也使得弗雷德的生命延续了将近三年。 这项测试的目的是寻找特定的肿瘤基因,之后便可以对病人进行针对性的药物治疗。这个月初,美国临床
基因突变检测指导癌症靶向治疗
肺癌和结直肠癌近年来已成为大多数国家癌症死亡的主要原因。由于个体遗传基因存在差异性,不同类型的癌症患者选择适合的靶向治疗药物或能取得预期的疗效,基因突变检测为医生提供了重要参考信息。中国国家食品药品监督管理局日前批准由瑞士罗氏诊断研发的cobas EGFR/KRAS基因突变检测技术用于临床基因突
Nature子刊揭示新型癌症驱动基因
研究人员发现了一种基因驱动了1%癌症患者的肿瘤形成。这是首次证实CUX1基因与癌症形成存在广泛的联系。 研究小组发现,当CUX1失活时激活了一种促进肿瘤生长的生物信号通路。当前有一些抑制这一信号通路的药物正在临床使用或进入研发阶段,因此为携带这种致癌突变的患者提供了一种潜在的靶向新疗法。
《科学》重点文章:癌症与基因突变
生物通报道:来自霍德华休斯医学院,Ludwig癌症遗传与治疗中心(the Ludwig Center for Cancer Genetics and Therapeutics)以及约翰霍普金斯凯门综合癌症中心(Johns Hopkins Kimmel Comprehensive Cancer Cen
Science:癌症基因数据提出技术质疑
据美国国立癌症研究所的一位病理学家David Levens称,在PubMed数据目录上有超过25,000篇关于Myc基因的论文,这种基因与转移性癌症有关,但是现在由于一项最新研究成果,因此都需要重新再评估,这项研究指出了Myc的致癌作用比大多数人认为的都要更广泛,而目前的实验方法具有缺陷,也
基因检测能否延长癌症患者的生命?
在决定治疗方案时,先进行基因检测,这在肺癌治疗领域已成为共识。不过,肿瘤基因检测的产品获批、商业化,还需国内公司通过长期随访、病例积累,自证临床价值。 (在决定治疗方案时,先进行基因检测,这在肺癌治疗领域已成为共识,美国、欧洲、中国等的医生组织均制定了相应的共识文件。图/视觉中国)
国外癌症基因液体检测技术进展
通过技术手段从病人体液中检测出相关的癌症信号,让病人提前获知癌症信号、及时治疗;Freenome公司获得555万美元种子轮投资。 前不久,美国Freenome公司获得种子轮融资555万美元。本轮融资由Andreessen Horowitz领投,跟投方Founders Fund、Data Col
基因研究揭示:癌症和衰老存在“制衡”
本报讯 《自然-通讯》发表的一项研究显示,衰老相关的基因表达变化与退行性慢性病相关基因表达变化轨迹一致,但与癌症的相反。这一发现有助于解释研究人员观察到的一种现象:在人类衰老后期,人类的主要死因从癌症变成了退行性慢性病。 在该研究中,德国基尔大学研究者生成了一个大型衰老相关基因表达谱数据集,
Nature公布800个癌症基因组
来自癌症基因组计划的科学家们近期报告了他们最新的癌症基因组研究成果,他们公布了800个乳腺癌的遗传特征,包括发现了导致乳腺癌最常见的形式的遗传原因,为新的治疗靶点提供线索,并确定乳腺癌和卵巢癌一种亚型之间的分子遗传相似性。 这项研究结果有助于更全面的了解每种乳腺癌亚型背后的分子机制,相关成
Science专题:癌症基因组学
在2001年完成人类基因组测序后,许多的研究人员立即将目光放到了利用这些信息来更好地了解遗传学上。最近,越来越多的研究确定了表观遗传学在癌症的发生、形成及发展过程中起效应。从鉴别与遗传性癌症相关的单基因变异的前基因组时代转向,测序技术的进步使得研究人员能够利用全基因组方法来检测基因组间的差异,以
鉴定出癌症免疫疗法的必需基因
在一项新的研究中,来自美国国家卫生研究院(NIH)、乔治城大学医学院、纽约大学、纽约基因组中心、宾夕法尼亚大学、布罗德研究所和麻省理工学院的研究人员鉴定出癌症免疫疗法发挥作用所必需的基因,这解决了为何一些肿瘤不对免疫疗法作出反应,或者初始时作出反应但随着肿瘤细胞对免疫疗法产生抵抗力后不再作出反应的问
《Nature》:癌基因“地震扩增”,驱动多种癌症!
染色体外DNA(ecDNA)是一类特殊的从正常基因组上脱落下来的游离于染色体外的环状DNA。早在1964年,人们就在神经母细胞瘤细胞中观察到了ecDNA的存在 ,但由于技术受限,人们对于ecDNA在肿瘤发生发展中发挥的具体作用未能有更进一步认识。 2017年Paul Mischel团队在《自然
Cell年度综述:癌症基因组入选
Cell杂志创刊于1976年,现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一,并陆续发行了十几种姊妹刊,在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。近期Cell杂志盘点了2013年度最佳综述及最佳论文,其中热门技术CRISPR也登上了榜单,相关论文描述了利用基因调控系统 CRISPR/Cas,一步
基因组DNA的快速纯化
第 1 天1. 大约 1.5 cm 长的尾部活检样品放在一个 1.5 ml 盛有 0.7 ml 尾部缓冲液的小离心管中,加 35 μl 10 mg/ml蛋白酶 K,在 55℃ 振摇温育过夜。尾部缓冲液(配 25 ml)50 mmol/L Tris,pH 8
DNA修饰QKI基因信号通路介绍
该基因编码的蛋白质是一种RNA结合蛋白,可调节mRNA的前剪接,从细胞核输出mRNA,蛋白质翻译和mRNA稳定性。 编码的蛋白质参与髓鞘化和少突胶质细胞分化,并且可能在精神分裂症中起作用。 已经为该基因发现了编码不同同工型的多个转录物变体。
植物基因组DNA的RFLP
实验概要本实验介绍了植物基因组DNA的RFLP多态性分析的原理及操作步骤。通过本实验可了解不同植物或同一植物不同个体之间基因组DNA顺序的差异性,掌握DNA限制性酶切片段长度多态性研究的基本方法。实验原理DNA多态性是指DNA碱基顺序的差异性。这种差异性不仅存在于不同的植物之间,也存在于同一种植物的
细胞化学词汇基因组DNA
中文名称:基因组DNA英文名称:genomic DNA定 义:组成生物基因组的所有DNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
细菌基因组DNA提取实验
细菌基因组DNA提取可应用于:(1)获得细菌基因组DNA;(2)作为PCR模板;(3)用于测序、遗传信息分析等。实验方法原理本试剂盒采用独特的细胞裂解和相分离技术,结合DNA 制备膜选择性地吸附DNA 的方法达到纯化基因组DNA 的目的。适合于从1.0x109 细菌中获得多至20 ug 的基因组DN
血基因组DNA提取实验
实验方法原理 本试剂盒采用特殊的细胞裂解和蛋白去除液(包括蛋白酶K 裂解)从抗凝全血中得到基因组DNA。适用于从冻全血、血浆、血清、骨髓、其他体液、淋巴细胞、培养细胞、病毒和线粒体中提取DNA。实验材料 抗凝全血试剂、试剂盒 血基因组DNA 试剂盒仪器、耗材 96孔深孔板96圆孔板96孔DNA制备板
细菌基因组DNA提取实验
实验方法原理 本试剂盒采用独特的细胞裂解和相分离技术,结合DNA 制备膜选择性地吸附DNA 的方法达到纯化基因组DNA 的目的。适合于从1.0×109 细菌中获得多至20 μg 的基因组DNA。用于PCR、Southern 印迹分析、RAPD、RFLD 等分子生物学实验。实验材料 细菌培养物
拟南芥基因组DNA的提取
实验概要本实验介绍了用CTAB法提取拟南芥基因组DNA。主要试剂CTAB提取液(2%CTAB,50mMEDTA,50mM Tris-HCl,PH 8.0,0.84M NaCI,0.05%巯基乙醇),氯仿,无水酒精,70%的酒精主要设备1.5 mL离心管,65℃水浴锅,高速离心机,研钵实验材料拟南芥叶
血基因组DNA提取实验
实验方法原理 采用特殊的细胞裂解和蛋白去除液(包括蛋白酶K 裂解)从抗凝全血中得到基因组DNA。 实验材料 抗凝全血
小鼠肝基因组DNA制备
原理DNA 以核蛋白形式存在于细胞核中,制备 DNA 的原则是既要将 DNA 与蛋白质、脂类和糖类等分离,又要保持 DNA 分子的完整。蛋白酶K 及链霉蛋白酶 E 的应用使这两个原则得到了保证。蛋白酶K 或链霉蛋白酶 E 均为广谱蛋白酶,其重要特性是能在 SDS 和 EDTA 存在下保持很高的活性。
细菌基因组DNA提取实验
实验方法原理 本试剂盒采用独特的细胞裂解和相分离技术,结合DNA 制备膜选择性地吸附DNA 的方法达到纯化基因组DNA 的目的。适合于从1.0x109 细菌中获得多至20 ug 的基因组DNA。用于PCR、Southern 印迹分析、RAPD
分子遗传学词汇dna基因
中文名称:dna基因英文名称:dna gene定 义:与细菌DNA复制直接相关的基因。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
DNA基因探针的克隆方法介绍
对于基因探针的克隆尚有更快捷的途径。这也是许多重要蛋白质的编码基因的克隆方法。该方法的第一步是分离纯化蛋白质,然后测定该蛋白的氨基或羟基末端的部分氨基酸序列,然后根据这一序列合成一套寡核苷酸探针。用此探针在DNA文库中筛选,阳性克隆即是目标蛋白的编码基因。值得一提的是真核细胞和原核细胞DNA组织有所
小鼠肝基因组DNA制备
原理DNA 以核蛋白形式存在于细胞核中,制备 DNA 的原则是既要将 DNA 与蛋白质、脂类和糖类等分离,又要保持 DNA 分子的完整。蛋白酶K 及链霉蛋白酶 E 的应用使这两个原则得到了保证。蛋白酶K 或链霉蛋白酶 E 均为广谱蛋白酶,其重要特性是能在 SDS 和 EDTA 存在下保持很高的活性。