NatureMethods：单细胞RNAseq方法的比较
随着大家对单细胞转录组分析的兴趣日益增加，开展单细胞RNA-seq的方法也在不断涌现。近日，斯坦福大学的研究人员比较了市场上各种单细胞RNA扩增方法，以系统评估单细胞RNA-seq方法的灵敏度和准确性。他们的研究结果发表在《Nature Methods》在线版上。 目前，整个转录组的高通量测序(RNA-seq)已广泛用于各种组织的基因表达分析。然而，人们开展单细胞转录组分析的愿望也越来越强烈，这是因为有些细胞量少珍贵，不足以开展传统的RNA-seq，也有人希望对异质群体中的细胞亚群开展分析。过去的基因表达“平均值”已不再能满足人们的需求。 近年来，开展单细胞RNA-seq的各种方法时有报道，但关于这些方法的通量和性能还存在一些问题。比如说，性能主要是通过灵敏度和精确性来评估的。然而，为了评估测定方法的有效性，还应当评估准确性，即测量值与真实值之间有多接近。 为此，斯坦福大学生物工程系的Stephen R......阅读全文
蛋白的表达与纯化
蛋白表达纯化已经是非常经典简单的实验了，没有LSS说的那么吓人。说说我的蛋白表达纯化以及下面的单抗制作工作总体设计概要吧:1首先要知道你要纯化蛋白的编码DNA序列，查阅相关文献，看目的基因在那些细胞或者组织中高表达，进而设计该基因的引物，扩增出目的DNA片段的ARF。这一布叫目的基因片段的获取2构建
什么是基因表达调控
意义：1.适应环境、维持生长和增殖：生物体赖以生存的外环境是在不断变化的，为了生存，所有活细胞都必须对外环境变化作出适当反应，调节代谢，以适应环境变化。生物体适应环境、调节代谢的能力与蛋白质分子的生物学功能有关。而蛋白质的水平又受基因表达的调控。2.维持个体发育与分化：多细胞生物调节基因的表达除为适
共表达质粒的定义
共表达质粒就是指那些可以同核DNA一起表达的质粒DNA。
基因的翻译表达2
方法 1：重组载体构建同前面实验 2：诱导表达：提取带重组片断的质粒DNA转化BL21（DE3）受体菌37℃活化过夜，转入新鲜培养基摇菌至对数生长期（约2－3小时），加入IPTG至终浓度0.4mM，继续培养6小时 3：表达产物提取及鉴定见实验十九
甲醇酵母基因表达系统
1 甲醇酵母表达系统的特点 1.1 宿主 七十年代巴斯德毕赤酵母曾被用于生产单细胞蛋白（SCP），有很好的发酵基础，菌体密度可达100g/L干重。其生长培养液的组分包括无机盐、微量元素、生物素、氮源和碳源，廉价而无毒。它能在以甲醇为唯一碳源的培养基中快速生长，其中醇氧化酶AOX——甲醇代谢途径
重组蛋白表达系统
选择合适的蛋白表达系统是重组蛋白成功表达的关键。需要考虑以下方面的因素，包括：目标蛋白性质、用途、蛋白质产量和成本。此外，许多蛋白质表达项目也存在着风险，尤其是大蛋白、膜蛋白、核蛋白和具有大量翻译后修饰的蛋白质。 目前卡梅德生物可以提供几种表达系统可供客户选择，不同的系统有不同的特性和应用
表达序列标签的方法
首先从样品组织中提取mRNA，在逆转录酶的作用下用oligo（dT）作为引物进行RT-PCR合成cDNA，再选择合适的载体构建cDNA 文库，对各菌株加以整理，将每一个菌株的插入片段根据载体多克隆位点设计引物进行两端一次性自动化测序，这就是EST序列的产生过程。
siRNA表达载体的构建
实验方法原理 多数的siRNA表达载体依赖三种RNA聚合酶III 启动子(pol III)中的一种，操纵一段小的发夹RNA(short hairpin RNA, shRNA)在哺乳动物细胞中的表达。这三类启动子包括大家熟悉的人源和鼠源的U
真核细胞表达系统2
在病毒感染晚期，由于大量外源蛋白的表达引起昆虫细胞的裂解，胞质内的物质释放出来，与 目的蛋白混在一起，从而使蛋白的纯化工作变得很困难，另外水解酶的释放会降解重组蛋白。为了克服以上这些困难，科学工作者先后尝试用丝蛾肌动蛋白基因启动子或杆状病毒ie-1基因启动子表达外源蛋白，但效果都不明显。Farr
基因表达组件的概念
中文名称表达组件英文名称expression cassette定 义与基因表达有关的一系列序列元件的组合。常包括启动子、编码序列、终止子、增强子等。完整的表达组件是能够表达出目的物的成套基因元件。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），方法与技术（二级学科）
表达载体的应用特点
表达载体（Expression vectors）就是在克隆载体基本骨架的基础上增加表达元件（如启动子、RBS、终止子等），使目的基因能够表达的载体。如表达载体pKK223-3是一个具有典型表达结构的大肠杆菌表达载体。其基本骨架为来自pBR322和pUC的质粒复制起点和氨苄青霉素抗性基因。在表达元件中
基因表达的机制原理
转录转录过程由RNA聚合酶（RNAP）进行，以DNA为模板，产物为RNA。RNA聚合酶沿着一段DNA移动，留下新合成的RNA链。基因组DNA由两条反向平行和反向互补链组成，每条链具有5'和3'末端。这两条链分别称为“模板链”（产生RNA转录物的模板）和“编码链”（含有转录本序列的DN
iRNA干扰GFP表达实验
【原理】RNA沉默是发生在植物（转录后基因沉默或共抑制）、动物（RNA干扰，RNAi）和真菌（消除作用）等真核生物细胞中的的特异性和高效率的mRNA降解机制。在哺乳动物细胞中，RNAi通常用于阻断特定基因的表达从而研究基因的功能。将靶向特定基因的大约21碱基长短的双链siRNAs(smallinte
关于基因表达的介绍
基因的表达过程是将DNA上的遗传信息传递给mRNA,然后再经过翻译将其传递给蛋白质。在翻译过程中tRNA负责与特定氨基酸结合，并将它们运送到核糖体，这些氨基酸在那里相互连接形成蛋白质。这一过程由tRNA合成酶介导，一旦出现问题就会生成错误的蛋白质，进而造成灾难性的后果。值得庆幸的是，tRNA分子
组成型表达的概念
与诱导性表达相对。组成型表达不需要其他因子的诱导即可稳定的表达，而诱导型表达则需要其他因子诱导才能表达。两种表达类型分别被组成型启动子和诱导性启动子启动。
胀泡与基因表达
在个体发育的某个阶段或某些化学物质的诱发下，多线染色体的某些带纹变得疏松膨大而形成胀泡。最大的胀泡叫做巴尔比安尼氏环。胀泡是基因转录和翻译的形态学标志，在这里DNA解旋呈开放环，RNA的合成很活跃；核糖体排列成多聚核糖体长链，多肽链的长度有一个梯度，甚至还可观察到从巴尔比安尼环上新合成的蛋白质分泌颗
RNAi表达载体构建（二）
（2）、序列同源性分析: 将潜在的序列和相应的基因组数据库（人,或者小鼠,大鼠等等）进行比较,排除那些和其他编码序列/EST同源的序列.例如使用BLAST（ www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/）选出合适的目标序列进行合成.并非所有符合条件的siRNA都一样有效,其原因还不清楚
基因差异表达的概念
差异表达不仅有助于阐明生命的奥秘，而且还能为基因诊断与治疗提供重要的理论依据。近几年来，差异表达基因克隆技术不断完善与发展，已成为研究肿瘤和疾病等相关基因的重要手段。
单细胞生物也具有“智慧”
虽然"智慧"是一种十分复杂难以定义的概念，我们却都明白具备一个大脑是生物具有智慧的生理前提。但是对于单细胞生物来讲，它们是否也存在智慧呢？ 如果我们坚信智慧来源于大脑，那么答案就是否定的。不过，最近一项研究表明情况比我们想象的要复杂，研究者们发现"无脑"的单细胞生物也具有学习的能力。 正如科
单细胞蛋白的营养特性
单细胞蛋白质饲料由于原料及生产工艺不同，其营养成分组成变化较大，一般风干制品含粗蛋白质在50%以上。因为这类蛋白质是由多个独立生存的单细胞构成，所以富含多种酶系。动物对其消化率高。例如，猪对啤酒酵母的消化率可达92%，对木糖酵母的消化率可达88%。必需氨基酸组成和利用率与优质豆饼相似。单细胞生物
单细胞分析重大突破
生物学家对单个细胞的行为而不是对整个细胞群体的行为越来越感兴趣。在一项新的研究中，来自瑞士联邦理工学院（ETH）的研究人员开发出一种新方法可能引发单细胞分析变革。这一技术利用世界上zui小的注射器来对单个细胞的内含物进行取样以便进行分子分析。相关研究结果发表在2016年7月14日那期Cell期刊上，
单细胞蛋白的生产特性
单细胞蛋白质生产周期短。单细胞生物繁殖特别快，世代周转迅速。如酵母菌在良好条件下每接种100千克，1天即可获得2500千克酵母，其生长繁殖速度约为大豆的1300倍，为动物生长的2000倍。所以，这类饲料生长速度快，世代周转迅速。 生产单细胞蛋白质饲料产品的原料多为烃类及其衍生物、天然气、石油加
单细胞研究指南：细胞分离
多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过，近年来蓬勃发展的单细胞研究告诉我们，每一个细胞都是独一无二的。不同类型的细胞激活特定组合的机制，即使是同类型细胞，基因表达也会出现差异。 那么，细胞之间的哪些差异有生物学意义，哪些差异来自于技术偏好呢？要获得可靠的结果又需要研究多少细胞呢？这
单细胞生物的主要影响
单细胞生物虽然个体微小，但是与人类的生活有着密切的关系。多数单细胞生物是浮游生物的组成部分，是鱼类的天然饵料。草履虫对污水净化有一定的作用，据统计，一只草履虫每小时大约能形成60个食物泡，每个食物泡中大约含有30个细菌，因此，一只草履虫每天大约能吞食43000个细菌。但是单细胞生物也有对人类有害
单细胞mRNA差异显示实验
目前有几种方法可以显示生理刺激下组织样本中未知基因的表达水平变化。然而, 很多组织内的细胞又存在形态和功能上的异质性，因此常常需要从单个细胞水平研究基因表达的差异。现在，我们介绍一种新方法，它常规用来在单细胞水平考察未知基因的差异性表达。现代神经科学研究技术作者：U.Windhorst & H. J
单细胞生物的生产特性
单细胞蛋白质生产周期短。单细胞生物繁殖特别快，世代周转迅速。如酵母菌在良好条件下每接种100千克，1天即可获得2500千克酵母，其生长繁殖速度约为大豆的1300倍，为动物生长的2000倍。所以，这类饲料生长速度快，世代周转迅速。 生产单细胞蛋白质饲料产品的原料多为烃类及其衍生物、天然气、石油加
单细胞动物的进化过程
当生命进化到真核细胞以后，便有了动物和植物之分。最早的动物叫原生动物，是最低等的一类动物，它的个体是由一个细胞构成的。仅管如此，“麻雀虽小却五脏俱全”，这是一个完整的生命活动体，拥有作为一个动物应具备的主要生活机能，如新陈代谢、刺激感应、运动和繁殖等，它的体内有了原始的分化，各具一定功能，形成了
单细胞mRNA差异显示实验
实验方法原理 ##流程图 试剂、试剂盒 溶液和缓冲液 仪器、耗材
单细胞凝胶电泳介绍
单细胞凝胶电泳（single-cell gel eiectrophoresis，SCGE）又称慧星试验（comet assay）是一项较新的电泳方法。自1978年被Rydcbert B.等人成功地用于检验DNA单链断裂以来，经过不断的改进，已成为一种快速、灵敏、简便的检测DNA损伤的方法，广泛地应用
单细胞分选效率的分析
引言在单克隆细胞培养时，手动有限稀释法是最经典的分离单细胞手段之一。这种方式分离单细胞，每个孔中落进去的细胞数目符合泊松分布。依靠单细胞分选仪器分离单细胞的效率，无论从分选能力还是重复性都要明显优于手动的有限稀释方法。测定一款设备分选效率的标准方法，是用荧光校准微球来分选检验。实验方法Namocel