NatureMethods：单细胞RNAseq方法的比较
随着大家对单细胞转录组分析的兴趣日益增加，开展单细胞RNA-seq的方法也在不断涌现。近日，斯坦福大学的研究人员比较了市场上各种单细胞RNA扩增方法，以系统评估单细胞RNA-seq方法的灵敏度和准确性。他们的研究结果发表在《Nature Methods》在线版上。 目前，整个转录组的高通量测序(RNA-seq)已广泛用于各种组织的基因表达分析。然而，人们开展单细胞转录组分析的愿望也越来越强烈，这是因为有些细胞量少珍贵，不足以开展传统的RNA-seq，也有人希望对异质群体中的细胞亚群开展分析。过去的基因表达“平均值”已不再能满足人们的需求。 近年来，开展单细胞RNA-seq的各种方法时有报道，但关于这些方法的通量和性能还存在一些问题。比如说，性能主要是通过灵敏度和精确性来评估的。然而，为了评估测定方法的有效性，还应当评估准确性，即测量值与真实值之间有多接近。 为此，斯坦福大学生物工程系的Stephen R......阅读全文
基因表达的系列分析
中文名称基因表达的系列分析英文名称serial analysis of gene expression;SAGE定 义通过构建较短的表达序列标签规模化地检测基因表达种类及其丰度的实验技术。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
siRNA表达载体的构建
实验方法原理 多数的siRNA表达载体依赖三种RNA聚合酶III 启动子(pol III)中的一种，操纵一段小的发夹RNA(short hairpin RNA, shRNA)在哺乳动物细胞中的表达。这三类启动子包括大家熟悉的人源和鼠源的U6启动子和人H1启动子。之所以采用RNA pol
蛋白的表达与纯化
蛋白表达纯化已经是非常经典简单的实验了，没有LSS说的那么吓人。说说我的蛋白表达纯化以及下面的单抗制作工作总体设计概要吧:1首先要知道你要纯化蛋白的编码DNA序列，查阅相关文献，看目的基因在那些细胞或者组织中高表达，进而设计该基因的引物，扩增出目的DNA片段的ARF。这一布叫目的基因片段的获取2构建
表达序列标签的应用
EST作为表达基因所在区域的分子标签因编码DNA序列高度保守而具有自身的特殊性质，与来自非表达序列的标记（如AFLP、RAPD、SSR 等）相比更可能穿越家系与种的限制，因此EST标记在亲缘关系较远的物种间比较基因组连锁图和比较质量性状信息是特别有用。同样，对于一个DNA序列缺乏的目标物种，来源于其
融合基因的表达物
融合基因的表达产物为融合蛋白。
基因表达调控的概念
基因表达调控是生物体内基因表达的调节控制，使细胞中基因表达的过程在时间、空间上处于有序状态，并对环境条件的变化作出反应的复杂过程。基因表达的调控可在多个层次上进行，包括基因水平、转录水平、转录后水平、翻译水平和翻译后水平的调控。基因表达调控是生物体内细胞分化、形态发生和个体发育的分子基础。
RNAi表达载体构建（一）
近年来的研究表明,一些短片断的双链RNA可以通过促使特定基因的mRNA降解来高效、特异的阻断体内特定基因表达,诱使细胞表现出特定基因缺失的表型, 称为RNA干扰（RNA interference,RNAi）.siRNA（small interfering RNAs）就是这种短片断双链RNA分
什么是中止表达组件？
中文名称中止表达组件英文名称cessation cassette定 义由若干基因元件组成可以阻止某些基因表达的一类组件。如用含有此种组件的载体转入宿主形成转基因植物后，用某种激活物(如四环素)激活，就能够抑制种子发芽。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），方法与技术（二级学科）
siRNA表达载体的构建
siRNA表达载体构建可应用于：（1）作为后基因组时代基因功能分析的有力工具；（2）基因组学、细胞信号传导通路分析；（3）药物靶点筛选、疾病治疗。实验方法原理多数的siRNA表达载体依赖三种RNA聚合酶III 启动子(pol III)中的一种，操纵一段小的发夹RNA(short hairpin RN
基因共表达的定义
共表达质粒就是指那些可以同核DNA一起表达的质粒DNA。
组成型表达的定义
组成型表达的定义是基因表达不受时期、部位、环境影响,没有时空特异性。
基因超表达的概念
超表达是指目的基因的全长序列与高活性组成型启动子或组织特异性启动子融合，通过转化，获得该基因产物大量积累的植株。
什么是基因表达调控
分为转录水平上的基因表达调控和翻译水平上的基因表达调控。1.转录水平的调控：包括DNA转录成RNA时的是否转录及转录频率的调控，DNA的序列决定了DNA的空间构型，DNA的空间构型决定了转录因子是否可以顺利的结合到DNA的调控序列上，比如结合到TATA等序列上。2.翻译水平的调控：翻译水平的调控又可
表达序列标签的作用
⑴ 用于构建基因组的遗传图谱与物理图谱；⑵ 作为探针用于放射性杂交；⑶ 用于定位克隆；⑷ 借以寻找新的基因；⑸ 作为分子标记；⑹ 用于研究生物群体多态性；⑺ 用于研究基因的功能；⑻ 有助于药物的开发、品种的改良；⑼ 促进基因芯片的发展等方面。正是因为EST 表现出了这些巨大潜能，使其得到了充分的利用
原核表达操作流程
实验概要本实验介绍了原核表达的具体操作流程，包括：外源基因的诱导表达，大肠杆菌包涵体的分离与蛋白质纯化。实验原理1. E. coli 表达系统E. coli 是重要的原核表达体系。在重组基因转化入E. coli 菌株以后，通过温度的控制，诱导其在宿主菌内表达目的蛋白质，将表达样品进行SDS-PAGE
重组蛋白表达系统
选择合适的蛋白表达系统是重组蛋白成功表达的关键。需要考虑以下方面的因素，包括：目标蛋白性质、用途、蛋白质产量和成本。此外，许多蛋白质表达项目也存在着风险，尤其是大蛋白、膜蛋白、核蛋白和具有大量翻译后修饰的蛋白质。 目前卡梅德生物可以提供几种表达系统可供客户选择，不同的系统有不同的特性和应用
基因超表达的定义
超表达是指目的基因的全长序列与高活性组成型启动子或组织特异性启动子融合,通过转化,获得该基因产物大量积累的植株。
植物表达载体的构建
实验概要本实验介绍了一种构建植物表达载体的方法。实验步骤1. 植物正义表达载体的构建 1) 用SmaI和SacI双酶切pTriplEx2-GhMT3a和植物表达载体pBI121： 2) 进行琼脂糖凝胶电泳，回收GhMT3a片段和pBI121载体； 3) 连接：连接体系为：混匀后4-
基因异位表达的概念
自然状态下细胞内大多数基因表达都有组织特异性和诱导表达性,人为操纵外源基因的导入和表达称之为异位表达( ectopic expression) 。功能性外源基因的异位表达势必对细胞造成一定的影响,这种影响可以是多方面的,随基因的功能和细胞类型的不同而不同。
基因的复制与表达
生物的遗传物质基础是核酸（nucleic acid),它也是基因的基本结构，它们的化学组成分子结构符合遗传物质的稳定性、连续性及多样性的要求。 （一)核酸的化学组成 核酸结构的基本单位是核苷酸（nucleic acid)，每个核苷酸由1个磷酸、1个五碳糖和1个碱基3部分组成。核酸有两类：
真核细胞表达系统1
自上世纪70年代基因工程技术诞生以来，基因表达技术已渗透到生命科学研究的各个领域。并随着人类基因组计划实施的进行，在技术方法上得到了很大发展，时至今日已取得令人瞩目的成就 。随着人类基因组计划的完成，越来越多的基因被发现，其中多数基因功能不明。利用表达系统在哺乳动物细胞内表达目的基因是研究基
基因表达调控主要表现
基因表达调控主要表现在以下几个方面:①转录水平上的调控;②mRNA加工、成熟水平上的调控;③翻译水平上的调控;
基因的翻译表达1
1体外TNTRT7 转录/翻译系统表达重组基因体外翻译是研究基因表达、基因调控的一类重要技术，该技术可广泛用于基因表达量、启动序列等调控因子的确立，并结合PTT实验筛选天然突变或人工诱变的基因片段，还可用来进行蛋白和DNA结合方面的研究。早期的体外翻译研究大多是提取mRNA然后通过网织红细胞或麦胚系
iRNA干扰GFP表达实验
实验概要本文介绍了iRNA干扰GFP表达实验的原理及方法步骤。实验原理RNA沉默是发生在植物（转录后基因沉默或共抑制）、动物（RNA干扰，RNAi）和真菌（消除作用）等真核生物细胞中的的特异性和高效率的mRNA降解机制。在哺乳动物细胞中，RNAi通常用于阻断特定基因的表达从而研究基因的功能。将靶向特
体内表达shRNA的设计
1.克隆到shRNA 表达载体中的shRNA 包括两个短反向重复序列，中间由一茎环（loop）序列分隔的，组成发夹结构，由polⅢ启动子控制。随后在连上5-6个T作为RNA 聚合酶Ⅲ的转录终止子。2.两个互补的寡核苷酸两端须带有限制性酶切位点。3.Stratagene发现29个寡核苷酸较之原先推荐的
真核细胞表达系统3
由于腺病毒易于培养、纯化，宿主范围广，故采用该类病毒构建的载体被广泛应用腺病毒载体的构建依赖于腺病毒穿梭质粒和包装载体之间的同源重组。但是哺乳动物细胞内的这种同源重组效率很低，利用细菌内同源重组法构建重组体效率会大大提高，即将外源基因插入到腺病毒穿梭质粒中，形成转移质粒，将其线性化后与腺病毒包装质粒
什么是表达序列标签？
表达序列标签从互补DNA（cDNA）分子所测得部分序列的短段DNA（通常300~500bp）。从cDNA文库所得到的许多表达序列标签集合组成表达序列标签数据库，代表在一定的发育时期或特定的环境条件下，特定的组织细胞基因表达的序列。可用于验证基因在特定组织中的表达，推导全长cDNA序列，或作为标签标志
全表达谱的定义
中文名称全表达谱英文名称global expression profile定 义反映待检样品中所有基因的表达情况的图谱。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
重组蛋白表达系统
选择合适的蛋白表达系统是重组蛋白成功表达的关键。需要考虑以下方面的因素，包括：目标蛋白性质、用途、蛋白质产量和成本。此外，许多蛋白质表达项目也存在着风险，尤其是大蛋白、膜蛋白、核蛋白和具有大量翻译后修饰的蛋白质。目前卡梅德生物可以提供几种表达系统可供客户选择，不同的系统有不同的特性和应用。在这里，我
基因表达系列分析简介
1995年Velculescu等提出了基因表达系列分析(Serial Analysis of Gene Expression,SAGE)技术，能同时对上千个转录本进行研究。 SAGE是一种快速分析基因表达信息的技术,它通过快速和详细分析成千上万个表达序列标签（Expressed Sequenc