NatureMethods：单细胞RNAseq方法的比较
随着大家对单细胞转录组分析的兴趣日益增加，开展单细胞RNA-seq的方法也在不断涌现。近日，斯坦福大学的研究人员比较了市场上各种单细胞RNA扩增方法，以系统评估单细胞RNA-seq方法的灵敏度和准确性。他们的研究结果发表在《Nature Methods》在线版上。 目前，整个转录组的高通量测序(RNA-seq)已广泛用于各种组织的基因表达分析。然而，人们开展单细胞转录组分析的愿望也越来越强烈，这是因为有些细胞量少珍贵，不足以开展传统的RNA-seq，也有人希望对异质群体中的细胞亚群开展分析。过去的基因表达“平均值”已不再能满足人们的需求。 近年来，开展单细胞RNA-seq的各种方法时有报道，但关于这些方法的通量和性能还存在一些问题。比如说，性能主要是通过灵敏度和精确性来评估的。然而，为了评估测定方法的有效性，还应当评估准确性，即测量值与真实值之间有多接近。 为此，斯坦福大学生物工程系的Stephen R......阅读全文
重组蛋白表达系统
选择合适的蛋白表达系统是重组蛋白成功表达的关键。需要考虑以下方面的因素，包括：目标蛋白性质、用途、蛋白质产量和成本。此外，许多蛋白质表达项目也存在着风险，尤其是大蛋白、膜蛋白、核蛋白和具有大量翻译后修饰的蛋白质。目前卡梅德生物可以提供几种表达系统可供客户选择，不同的系统有不同的特性和应用。在这里，我
甲醇酵母基因表达系统
1 甲醇酵母表达系统的特点 1.1 宿主 七十年代巴斯德毕赤酵母曾被用于生产单细胞蛋白（SCP），有很好的发酵基础，菌体密度可达100g/L干重。其生长培养液的组分包括无机盐、微量元素、生物素、氮源和碳源，廉价而无毒。它能在以甲醇为唯一碳源的培养基中快速生长，其中醇氧化酶AOX——甲醇代谢途径
原核表达操作流程
实验概要本实验介绍了原核表达的具体操作流程，包括：外源基因的诱导表达，大肠杆菌包涵体的分离与蛋白质纯化。实验原理1. E. coli 表达系统E. coli 是重要的原核表达体系。在重组基因转化入E. coli 菌株以后，通过温度的控制，诱导其在宿主菌内表达目的蛋白质，将表达样品进行SDS-PAGE
iRNA干扰GFP表达实验
实验概要本文介绍了iRNA干扰GFP表达实验的原理及方法步骤。实验原理RNA沉默是发生在植物（转录后基因沉默或共抑制）、动物（RNA干扰，RNAi）和真菌（消除作用）等真核生物细胞中的的特异性和高效率的mRNA降解机制。在哺乳动物细胞中，RNAi通常用于阻断特定基因的表达从而研究基因的功能。将靶向特
RNAi表达载体构建（一）
近年来的研究表明,一些短片断的双链RNA可以通过促使特定基因的mRNA降解来高效、特异的阻断体内特定基因表达,诱使细胞表现出特定基因缺失的表型, 称为RNA干扰（RNA interference,RNAi）.siRNA（small interfering RNAs）就是这种短片断双链RNA分
基因异位表达的概念
自然状态下细胞内大多数基因表达都有组织特异性和诱导表达性,人为操纵外源基因的导入和表达称之为异位表达( ectopic expression) 。功能性外源基因的异位表达势必对细胞造成一定的影响,这种影响可以是多方面的,随基因的功能和细胞类型的不同而不同。
真核细胞表达系统2
在病毒感染晚期，由于大量外源蛋白的表达引起昆虫细胞的裂解，胞质内的物质释放出来，与 目的蛋白混在一起，从而使蛋白的纯化工作变得很困难，另外水解酶的释放会降解重组蛋白。为了克服以上这些困难，科学工作者先后尝试用丝蛾肌动蛋白基因启动子或杆状病毒ie-1基因启动子表达外源蛋白，但效果都不明显。Farr
组成型表达的定义
组成型表达的定义是基因表达不受时期、部位、环境影响,没有时空特异性。
什么是基因表达调控
分为转录水平上的基因表达调控和翻译水平上的基因表达调控。1.转录水平的调控：包括DNA转录成RNA时的是否转录及转录频率的调控，DNA的序列决定了DNA的空间构型，DNA的空间构型决定了转录因子是否可以顺利的结合到DNA的调控序列上，比如结合到TATA等序列上。2.翻译水平的调控：翻译水平的调控又可
基因表达调控主要表现
基因表达调控主要表现在以下几个方面:①转录水平上的调控;②mRNA加工、成熟水平上的调控;③翻译水平上的调控;
基因表达的机制原理
转录转录过程由RNA聚合酶（RNAP）进行，以DNA为模板，产物为RNA。RNA聚合酶沿着一段DNA移动，留下新合成的RNA链。基因组DNA由两条反向平行和反向互补链组成，每条链具有5'和3'末端。这两条链分别称为“模板链”（产生RNA转录物的模板）和“编码链”（含有转录本序列的DN
组成型表达的概念
与诱导性表达相对。组成型表达不需要其他因子的诱导即可稳定的表达，而诱导型表达则需要其他因子诱导才能表达。两种表达类型分别被组成型启动子和诱导性启动子启动。
iRNA干扰GFP表达实验
【原理】RNA沉默是发生在植物（转录后基因沉默或共抑制）、动物（RNA干扰，RNAi）和真菌（消除作用）等真核生物细胞中的的特异性和高效率的mRNA降解机制。在哺乳动物细胞中，RNAi通常用于阻断特定基因的表达从而研究基因的功能。将靶向特定基因的大约21碱基长短的双链siRNAs(smallinte
siRNA表达载体的构建
实验方法原理 多数的siRNA表达载体依赖三种RNA聚合酶III 启动子(pol III)中的一种，操纵一段小的发夹RNA(short hairpin RNA, shRNA)在哺乳动物细胞中的表达。这三类启动子包括大家熟悉的人源和鼠源的U
基因的复制与表达
生物的遗传物质基础是核酸（nucleic acid),它也是基因的基本结构，它们的化学组成分子结构符合遗传物质的稳定性、连续性及多样性的要求。 （一)核酸的化学组成 核酸结构的基本单位是核苷酸（nucleic acid)，每个核苷酸由1个磷酸、1个五碳糖和1个碱基3部分组成。核酸有两类：
蛋白的表达与纯化
蛋白表达纯化已经是非常经典简单的实验了，没有LSS说的那么吓人。说说我的蛋白表达纯化以及下面的单抗制作工作总体设计概要吧:1首先要知道你要纯化蛋白的编码DNA序列，查阅相关文献，看目的基因在那些细胞或者组织中高表达，进而设计该基因的引物，扩增出目的DNA片段的ARF。这一布叫目的基因片段的获取2构建
什么是表达序列标签？
表达序列标签从互补DNA（cDNA）分子所测得部分序列的短段DNA（通常300~500bp）。从cDNA文库所得到的许多表达序列标签集合组成表达序列标签数据库，代表在一定的发育时期或特定的环境条件下，特定的组织细胞基因表达的序列。可用于验证基因在特定组织中的表达，推导全长cDNA序列，或作为标签标志
植物表达载体的构建
实验概要本实验介绍了一种构建植物表达载体的方法。实验步骤1. 植物正义表达载体的构建 1) 用SmaI和SacI双酶切pTriplEx2-GhMT3a和植物表达载体pBI121： 2) 进行琼脂糖凝胶电泳，回收GhMT3a片段和pBI121载体； 3) 连接：连接体系为：混匀后4-
胀泡与基因表达
在个体发育的某个阶段或某些化学物质的诱发下，多线染色体的某些带纹变得疏松膨大而形成胀泡。最大的胀泡叫做巴尔比安尼氏环。胀泡是基因转录和翻译的形态学标志，在这里DNA解旋呈开放环，RNA的合成很活跃；核糖体排列成多聚核糖体长链，多肽链的长度有一个梯度，甚至还可观察到从巴尔比安尼环上新合成的蛋白质分泌颗
单细胞研究促生肌腱干细胞生物学新见解
近日，Science旗下子刊《Science Advances》在线发表了浙江大学李达三•叶耀珍干细胞与再生医学研究中心欧阳宏伟教授课题组题为“Single-cell analysis reveals a nestin+ tendon stem/progenitor cell populatio
高通量单细胞测序助力寻找新冠肺炎全人源抗体
日前，在北京市科委协调推进下，北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）发挥所长，联合首都医科大学附属北京佑安医院、北京义翘神州科技有限公司等单位，用高通量单细胞测序找到了新冠肺炎多种全人源抗体，有望为大规模疫情防控提供解决方案。 新冠肺炎（COVID-19）亟需特效治疗药物。日前利用康复期
包涵体表达的蛋白的复性包涵体表达的蛋白的复性
蛋白的复性是一个世界性的难题，没有通用的方法，甚至没有靠得住的规律，只能试。可以参考以下文章。该文出处已经忘了，如果有人知道原创作者或网上出处，请补充。包涵体表达的蛋白的复性包涵体表达的蛋白的复性包涵体：包涵体是指细菌表达的蛋白在细胞内凝集，形成无活性的固体颗粒。包涵体的组成与特性：一般含有50%以
杆状病毒表达系统用于表达多个非融合蛋白的转染载体
这种载体的主要特征是含有2个或2个以上相同的启动子，可表达2条或2条以上多肽链的蛋白。 如Emery和Bishop[8]等构建的pAcVC2转染质粒，含有两个方向相反的多角体基因启动子。重组病毒可同时表达多角体蛋白和淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒（LCMV） N蛋白。Takehara[9]等构
包涵体表达的蛋白的复性包涵体表达的蛋白的复性
蛋白的复性是一个世界性的难题，没有通用的方法，甚至没有靠得住的规律，只能试。可以参考以下文章。该文出处已经忘了，如果有人知道原创作者或网上出处，请补充。包涵体表达的蛋白的复性包涵体表达的蛋白的复性包涵体：包涵体是指细菌表达的蛋白在细胞内凝集，形成无活性的固体颗粒。包涵体的组成与特性：一般含有50%以
重组蛋白真核表达系统与原核表达系统的区别
重组蛋白真核表达采用原核表达系统进行研究，主要方法是将已克隆到目的基因DNA的片段的载体转化到细菌中，通过IPTG诱导和终纯化获得所需的目的蛋白。其优点是可以在短时间内获得基因表达产物，所需成本相对较低。 目前的表达系统各有利弊，但一般理想的表达系统满足以下几点：一是特异性，不受其他内源性因素
【干货】流式细胞术原理与应用详解
研究实验中，我们常常用到一个高大上的仪器――流式细胞仪，而与之相对应的就是流式细胞术，可是大家对它们都了解多少呢？今天小编就带着大家好好地认识一下~ 流式细胞术 流式细胞术（flow cytometry，FCM）是利用流式细胞仪对于处在快速直线流动状态中的细胞或生物颗粒同时进行多参数
基于液质联用的单细胞蛋白质组学研究进展
摘要 蛋白质是细胞功能的主要执行者，由于其无法在体外进行扩增，单细胞蛋白质组学技术相较单细胞基因组学和转录组学技术而言发展相对滞后。传统的蛋白质组学技术可获得大量细胞蛋白表达的平均值，但忽略了细胞亚型及细胞异质性等信息。单细胞水平的蛋白质分析有助于阐明细胞不同表型与异质性的分子基础。随着质谱仪
杨树次生木质部单细胞转录组图谱建立
近日，北京林业大学教授张德强团队在《植物生物技术杂志》发表研究论文。该研究以杨树为研究模式，利用单细胞测序技术、基因组分析、RNA原位杂交、愈伤组织遗传转化等技术建立了杨树次生木质部的单细胞转录组图谱，重构了完整的杨树次生木质部细胞类群，鉴定了调控木质部发育过程的关键转录因子，系统解答了次生木质
布鲁克与景杰生物联合－推动前沿单细胞蛋白质组学研究
分析测试百科网讯 2021年10月14日，在第十一届中国蛋白质组学大会召开期间，为推动单细胞蛋白质组学的发展，拓展单细胞研究的视野，布鲁克和景杰生物联合举办了“单细胞蛋白质组学专题卫星会”，并在线上进行了直播。卫星会现场布鲁克.道尔顿中国区经理何磊先生布鲁克.道尔顿中国区经理何磊先生首先致欢迎辞，他
DNMT3A突变相关白血病发病的分子机制及治疗靶点新发现
来自上海交通大学医学院附属瑞金医院、上海血液学研究所的研究人员证实，在小鼠造血系统中条件性敲入DNA甲基转移酶3A（Dnmt3a）R878H突变基因，可诱发急性髓系白血病（Acute myeloid leukemia，AML），mTOR通路异常活化可能是潜在的治疗靶点。《美国科学院院刊》（PNA