生命科学不容错过的几款App
最近,Biotechniques杂志介绍了一些简单实用的App和网站,现在各位学霸可以随时随地进行科研了。从分子克隆到qPCR,从线虫到质粒,都在你的掌握之中。 1. Cloning Bench 这款多功能软件是分子克隆的好帮手,提供了实验设计和进行所需的基本工具,可以帮你摸索实验条件,选择合适的限制性内切酶和感受态细胞等等。软件由Life Technologies公司提供,适用于iPhone/iPad。 2. Handbook of Biological Statistics 这是一本在线教材,可以帮助用户为特定研究选择合适的统计学工具。此外该教材还提供了详细的指引,以便用户能够正确使用统计学工具,并正确解读统计学结果。 3. OpenWorm Browser 该软件展示了线虫C. elegans的3D模型,该模型包含各细胞的详细信息,支持放大、旋转和翻转等功能,适用于iPhone/......阅读全文
MassARRAY®-分析软件
MassARRAY® 分析软件是一套模块化应用程序,用于基因分型、甲基化、基因表达、拷贝数变异等多种应用的数据分析。以MassARRAY® Typer4软件为例,该软件用于MassARRAY系统的iPLEX SNP基因分型。用户可利用它进行分析结果的评估和管理,通过表格和图形格式进行数据的可视化,
熔点测定软件
提升实验台性能熔点测定软件具有什么功能? 如今,分析仪器不仅会提供准确的结果: 还应确保数据安全性并优化工作流程。 使用LabX实验室软件符合FDA 21 CFR Part 11等法规要求。 轻松管理用户、方法、结果和调整。 平滑无缝地执行复杂的工作流程。 提供多种曲线和视频,报告可以个性化
ASP感官分析软件汽配行业专用感官分析软件
1.ASP-汽配行业专用感官分析软件简介ASP-汽配行业专用感官分析软件是一款为开展规范的汽车气味感官评价活动开发的计算机管理软件。软件的主体功能是感官检验模块,可实现感官检验试验设计、结果录入、结果分析、报告输出的在线自动化。采用全球及全国范围内普遍认可、协调一致的感官分析标准化方法,按照VW50
细胞化学词汇匹配序列
中文名称:匹配序列英文名称:matched sequence定 义:在序列排比中,两条多核苷酸链或两条多肽链上彼此相同的核苷酸或氨基酸序列。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
标准核酸序列的分类
标准核酸序列可分为植物来源、动物来源、微生物来源及重组生物制品的鉴别或鉴定用标准核酸序列等。 1.植物来源 植物来源的标准核酸序列系指用种属来源明确的植物样本按DNA测序技术指导原则测定得到的标准序列,可用于植物来源的物种如中药材、中药饮片或提取物等的原植物鉴别或鉴定。 2.动物来源 动
间插序列的定义
中文名称间插序列英文名称intervening sequence;IVS定 义基因间或基因内的非编码序列。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
DNA序列家族的概念
中文名称DNA序列家族英文名称DNA sequence family;sequence family定 义DNA分子变性后可复性形成稳定的碱基配对双链分子的一组序列。序列之间有很高的同源性。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
多序列比的概念
把两个以上字符序列对齐,逐列比较其字符的异同,使得每一列的字符尽可能一致,以发现其共同的结构特征的方法称为多序列比对。多序列比对问题是双序列比对问题的推广。
获取时间序列图像
获取时间序列图像 共聚焦显微镜的"Time-Series"功能,可以自动在实验者规定的时间内按照设定的时间间隔获取图像。只需设定所需的时间间隔以及所需图像数量,开启“Start T”功能键,即可进行实验。“Time-Series"功能大大减轻了实验者的劳动强度,对于荧光漂白恢复和钙离子成像等实验非
间插序列的定义
中文名称间插序列英文名称intervening sequence;IVS定 义基因间或基因内的非编码序列。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
重复[DNA]序列的概念
中文名称重复[DNA]序列英文名称repetitive [DNA] sequence定 义DNA分子中重复出现的核苷酸序列。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
表达序列标签的作用
⑴ 用于构建基因组的遗传图谱与物理图谱;⑵ 作为探针用于放射性杂交;⑶ 用于定位克隆;⑷ 借以寻找新的基因;⑸ 作为分子标记;⑹ 用于研究生物群体多态性;⑺ 用于研究基因的功能;⑻ 有助于药物的开发、品种的改良;⑼ 促进基因芯片的发展等方面。正是因为EST 表现出了这些巨大潜能,使其得到了充分的利用
SD序列的形成过程
在原核生物中,起始密码子的选择取决于核糖体的小亚基与mRNA模板之间的相互作用。30S亚基与处于紧靠正确起始密码子上游的富含嘌呤的mRNA模板结合,这个区称为SD序列(Shine—Dalgarno sequence),它与16S rRNA 3'端的一个富含嘧啶区互补。在起始复合物形成过程中,
序列捕获之新品荟萃
2009年,基因组定向捕获工具的出现,让外显子组的捕获成为可能。科学家们普遍认为外显子组测序比全基因组测序更有优势,特别是对罕见的单基因疾病。不仅仅是费用更低,数据的阐释也更为简单。因此,外显子组测序也在2010年被《Science》杂志评为年度十大突破。 数百篇已发表的文章,也证实了外显
序列图谱的定义
随着遗传图谱和物理图谱的完成,测序就成为重中之重的工作。DNA序列分析技术是一个包括制备DNA片段化及碱基分析、DNA信息翻译的多阶段的过程。通过测序得到基因组的序列图谱。
低度重复序列的概念
低度重复序列在单倍体基因组中只出现一次或数次,因而复性速度很慢。单拷贝顺序在基因组中占50-80%,如人基因组中,大约有60-65%的顺序属于这一类。单拷贝顺序中储存了巨大的遗传信息,编码各种不同功能的蛋白质。尚不清楚单拷贝基因的确切数字,但是是有其在单拷贝顺序中只有一小部份用来编码各种蛋白质,其他
匹配序列的结构特点
中文名称匹配序列英文名称matched sequence定 义在序列排比中,两条多核苷酸链或两条多肽链上彼此相同的核苷酸或氨基酸序列。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
DNA序列分析技术2
3)电泳电极缓冲液 1 倍TBE(pH 值8.0)预电泳 30 分钟至1 小时恒温方式 测序胶板上夹盖铝恒温板电泳温度 50℃左右电泳条件 恒功率 90~110W电泳时间 2.5 小时至5 小时4)干胶制备和压片电泳结束后取下胶板,用工具撬开玻璃板,使胶留在其中一块板上。将裁剪好的新华3 号滤纸在胶
反向重复[序列]的定义
存在于双链核酸分子中排列顺序方向相反的一段核苷酸序列。
核酸序列的检索实验
实验方法原理掌握核酸序列检索的操作方法;熟悉GenBank数据库序列格式及其主要字段的含义;了解EMBL数据库序列格式及其主要字段的含义;熟悉GenBank数据库序列格式的FASTA序列格式显示与保存;实验材料电脑仪器、耗材笔记本笔实验步骤1. 使用Entrez信息查询系统检索核酸序列BC0608
中度重复序列的概念
中度重复序列(moderately repetitive sequence )一般是非编码序列,有十个到几百个拷贝,如 rRNA基因和 tRNA 基因等。这类重复序列的平均长度大约为 300bp ,往往构成序列家族,常以回文序列形式出现在基因组的许多位置上,有些同单一序列间隔排列。大部分中度重复序列
简述回文序列的释义
如果一个(单链)核苷酸的序列和它的反向互补链的序列一样,那么这个核苷酸序列就是回文序列。回文序列结构不仅在DNA中存在,在RNA中也常因碱基的互补而常出现类似的结构,有利于稳定RNA的结构和行使功能。回文序列也经常出现在组成蛋白质的肽序列中,但它们在蛋白质功能中的作用尚不清楚。 短的回文结构可
高度重复序列的概念
高度重复序列是一组基因序列,在基因组中重复频率高,可达百万(10^6)以上,因此复性速度很快。在基因组中所占比例随种属而异,约占10-60%,在人基因组中约占20%。
SD序列的翻译影响
一般来说,mRNA与核糖体的结合程度越强,翻译的起始效率就越大,而这种结合程度主要取决于SD序列与16S rRNA的碱基互补性,其中以GGAG 4个碱基序列尤为重要。其中,大肠杆菌的SD序列为AGGAGGU。对多数基因而言,这4个碱基中任何一个换成C或T,均会导致翻译效率大幅度降低。SD序列与起
端粒DNA-序列的概念
端粒DNA 序列(telomere DNA sequence,TEL)端粒的功能是与端粒酶结合,完成染色体末端复制。端粒酶以其自身的RNA 为模板,在染色体端部添加上端粒的重复序列。作为模板的RNA 比较短,含有1.5 个端粒重复单元。端粒结构还能防止染色体融合及降解。端粒是保护DNA分子中的基因的
SD序列的形成过程
在原核生物中,起始密码子的选择取决于核糖体的小亚基与mRNA模板之间的相互作用。30S亚基与处于紧靠正确起始密码子上游的富含嘌呤的mRNA模板结合,这个区称为SD序列(Shine—Dalgarno sequence),它与16S rRNA 3'端的一个富含嘧啶区互补。在起始复合物形成过程中,
RGD序列的结构特点
RGD序列由精氨酸、甘氨酸和天冬氨酸组成,存在于多种细胞外基质中,可与11种整合素特异性结合,能有效地促进细胞对生物材料的粘附。
质粒维持序列的定义
中文名称质粒维持序列英文名称plasmid maintenance sequence定 义存在于重组质粒中的、与保持其在宿主中稳定复制有关的序列。如乳酸菌质粒pGT232的一段由双链复制起点和编码复制起始蛋白repA的基因所组成的1.7 kb的序列。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与
串联重复[序列]的定义
中文名称串联重复[序列]英文名称tandem repeat定 义首尾相连的重复序列。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
DNA序列分析技术1
物种的遗传多样性在本质上是DNA 一级序列的多样性。近年来,随着DNA 测序技术的迅速发展和日益普及,DNA 测序在遗传多样性的研究中正在起着越来越大的作用。本章将介绍目前在遗传多样性研究中常用的一种手动和一种全自动双链DNA 测序方法。1.DNA 模板的制备在遗传多样性的研究中,由于样本量一般都较