Science：宏基因组学测序技术
宏基因组学技术(Metagenomic approaches)正快速拓宽我们对微生物代谢能力(microbial metabolic potential)的认识。 长期以来，对微生物(microorganism)功能开展的研究主要依赖的都是以在实验室里培养的单一物种(individual specie)为对象获得的研究成果。大约在10年前，科研人员们开始获得自然环境中存在的、非人工培养的细菌或古细菌(archaea)的基因组草图，这些基因组数据为科研人员们了解这些微生物在自然环境中的作用打开了一条新的渠道。这就是所谓的宏基因组学(metagenomics)技术，该技术的发展现在已经可以做到从多个不同的环境样本中快速、准确地获得环境微生物的基因组序列。这些成果有可能会彻底颠覆我们对生命之树结构，以及各个物种代谢能力的理解和认识。生物信息学的飞速发展也提供了另外一种便利，由于能够全面了解遗传信息和数据，所以能够快速......阅读全文
蔬菜中心：绘成世界首张西瓜基因组序列图谱
我国是世界第一西瓜生产与消费大国，但是人们却始终未能从外到内了解它，直到2013年1月，国际学术顶级刊物《自然·遗传学》发表了世界首张西瓜基因组序列图谱（影响因子35.532），标志着人类成功破译了西瓜遗传“密码”。这项由蔬菜中心主任许勇的研究团队牵头进行的科研创新，为高效培育兼具优质、高产、抗
基因组学突破性成果：斑马鱼序列解析
人类发育，生理功能及疾病发生的过程涉及到成千上万的基因和其变异体，但是大部分的基因和其变异体的功能依然是未知的。过去的20年里，斑马鱼逐渐成为研究人类基因功能的重要模式动物。在《自然》杂志网站发表的两篇文章里1,2，报道了斑马鱼参考基因组序列和完成超过10,000个蛋白编码基因的断裂性突变体的鉴
PCR技术（十七）：用PCR扩增cDNA库中的特异序列
最常用的基因分离方法需要建立组织或细胞RNA的cDNA库，然后用抗体或 DNA探针筛选出感兴趣的基因。虽然这个方法已成功地克隆了大量基因，但建立和筛 选CDNA库是一项非常耗时．费力的工作，而且用寡聚核苷酸作探针进行筛选需大量蛋 白质序列结构的资料。聚合酶链的反应（PCR）方法可使一种特异DNA扩增
直接检测着丝粒DNA序列的PCR技术问世了！
X形的染色体中心是有着“DNA的最后边界”之称的“着丝粒”，在维持日常细胞分裂中起重要作用，同时它也与出生缺陷、癌症等涉及细胞分裂的疾病息息相关。 如今，一种新技术终于可以帮助人类一窥着丝粒的秘密。密歇根大学医学院的研究人员已经用它找到了着丝粒在唐氏综合征（多了1条21号染色体）中所扮演的角色
Nature：CRISPRa截然不同的非编码调控序列分析技术
来自加州大学旧金山分校的一组研究人员修改了现有的基因编辑CRISPR技术，用以来寻找增强子，他们的方法并不是编辑增强子，令其发挥作用，而是利用一种称为CRISPRa（CRISPR activation）的工具，搜寻影响T细胞免疫细胞发育的一种基因的增强子。这项研究发现将有助于解析自身免疫疾病，如
基因敲除技术
一．概述：基因敲除是自80年代末以来发展起来的一种新型分子生物学技术，是通过一定的途径使机体特定的基因失活或缺失的技术。通常意义上的基因敲除主要是应用DNA 同源重组原理，用设计的同源片段替代靶基因片段，从而达到基因敲除的目的。随着基因敲除技术的发展，除了同源重组外，新的原理和技术也逐渐被应用，比较
基因转移技术
基因转移技术分为两类：第一类是将目的基因转导入体外培养的细胞或导入从体内取出的细胞，观察目的基因在细胞中的表达，这项技术称基因转染（gene transfection）技术。通常情况下，该技术转入的目的基因不与细胞染色体发生整合，而是在细胞质呈现暂时性表达，随时间推移而逐渐减弱或消失。第二类是将
基因敲除技术
一．概述：基因敲除是自80年代末以来发展起来的一种新型分子生物学技术，是通过一定的途径使机体特定的基因失活或缺失的技术。通常意义上的基因敲除主要是应用DNA 同源重组原理，用设计的同源片段替代靶基因片段，从而达到基因敲除的目的。随着基因敲除技术的发展，除了同源重组外，新的原理和技术也逐渐被应用，比较
基因重组应用——转基因技术
基因重组中转基因技术的理论基础来源于进化论衍生来的分子生物学。基因片段的来源可以是提取特定生物体基因组中所需要的目的基因，也可以是人工合成指定序列的DNA片段。基因重组DNA片段被转入特定生物中，与其本身的基因组进行重组，再从重组体中进行数代的人工选育，从而获得具有稳定表现特定的遗传性状的个体。该技
宠物到强大入侵生物－小龙虾基因组序列揭秘缘由
一个新物种如何在短时间内崛起，基因组测序可以提供线索。英国《自然·生态与进化》杂志5日在线发表的一篇论文，首次报告了美洲龙纹螯虾的基因组序列，有助于揭示这种单性繁殖的动物，如何在短短20年间就从德国宠物贸易的宠儿，变为马达加斯加的强大入侵生物。 美洲龙纹螯虾在上世纪90年代首次被发现。据资料称
吉林疫情病毒基因序列为奥密克戎进化分支
吉林市今天下午召开了疫情防控新闻发布会，通报疫情防控的最新情况。截至3月8日，吉林市本次疫情累计报告本土确诊病例161例（其中，普通型1例，轻型160例），无症状感染者142例。303例感染者全部在定点救治医院隔离治疗，患者病情平稳。 目前，吉林市已完成此次新冠肺炎疫情的基因测序，本次疫情病毒基
基因序列仪在遗传性疾病诊断上的应用
由于基因突变而导致的疾病具有遗传性和终身性的特点，一旦患上这种病，会给自身和整个家族带来痛苦。通过对被检人员进行基因测序，查看基因突变情况，判断是否存在基因遗传病，或者推断后代患病的概率为婚育提供指导，减少遗传性疾病的发病率。
我国首例输入性裂谷热病毒全基因组序列测定完成
记者从国家质量监督检验检疫总局获悉：7月24日凌晨，该局和军事医学科学院微生物流行病研究所联合攻关，获得了我国首例输入性裂谷热病例的病毒全基因组序列。 “测序结果确认了该输入性病例为非洲流行的裂谷热病毒感染所致。”军事医学科学院微生物流行病研究所研究员童贻刚告诉科技日报记者，经测定，该病毒基因
基因序列能被快速测定和配对生产高亲和纳米抗体
抗体是一种由免疫系统释放的防御性蛋白质，用来识别和抵御入侵者，此外，它们也是生物学和医学中最有用的工具，比如用于分子标记研究或破坏病变细胞等。 纳米抗体也能完成相同的任务，其瘦小身躯更易到达大分子禁区，因而显出更诱人的前景，但科学家们缺少有效方法去识别它们。这一难题被美国洛克菲勒大学的研究人员
新冠病毒全基因组大小和序列的研究进展
2月3日，《自然》在线发表论文介绍了上海公共卫生临床中心和复旦大学公共卫生学院教授张永振等人对2019-nCov的基因组序列的分析。该病毒基因组从就职于出现首批患者的海鲜市场的一名病人身上获得。基因组分析显示，该病毒与此前在中国蝙蝠体内找到的一组SARS样冠状病毒密切相关。 通过对从患者收集的
PacBio构建目前最高质量的植物基因组参考序列
来自中科院遗传与发育生物学研究所，四川农业大学的研究人员发表了题为“Sequencing and de novo assembly of a near complete indica rice genome”的文章，对一个籼稻基因组蜀恢498（R498）进行PacBio单分子测序，结合遗传图谱和
世卫组织——中国已分享新型冠状病毒基因序列信息
世界卫生组织12日宣布，已收到中国分享的从武汉不明原因病毒性肺炎病例中检测到的新型冠状病毒基因序列信息。世卫组织还表示，不建议对中国实施任何旅行或贸易限制。 世卫组织在一份声明中说，12日已从中国国家卫生健康委员会获得更多有关武汉不明原因病毒性肺炎的详细信息，包括从病例中检测到的新型冠状病毒基
我国科学家绘制出毛白杨基因组序列框架图
我国林木基因组学研究取得突破。北京林业大学的科学家们选用百年古树作为测序的样本，利用最新的全基因组鸟枪法测序和拼接策略，绘制完成了毛白杨的基因组序列图谱，标志着毛白杨分子育种进入基因组时代。 在“985”平台建设资金支持下，北林大林木育种国家工程实验室的专家们用短短的6个月完成了这一
我国首次完成益生乳酸菌全基因组序列测定
由内蒙古农业大学“乳品生物技术与工程”教育部重点实验室主持进行的益生乳酸菌L.casei Zhang的全基因组序列测定分析历时15个月，近日全部完成。这是我国第一个独立完成、具有完全自主知识产权的乳酸菌基因全序列测定，标志着我国在乳酸菌基因组学方面的研究达到国际水平。 L.casei Zhang是
我国学者在合成生物基因调控序列智能设计领域取得进展
图1 跨物种基因调控序列的逆向设计图2 基于TFBU的增强子模块化建模与智能设计 在国家自然科学基金项目（批准号：62250007、62225307）等资助下，清华大学自动化系汪小我教授团队在合成生物基因调控序列智能设计取得进展，系列研究成果连续发表两篇论文：（1）以“系统表示与优化实现细菌跨物种
我国科学家绘制完成鲤鱼全基因组序列图谱
鲤科鱼类是我国最重要的水产养殖种类，年产量占我国淡水养殖总产量的70%以上，其中鲤鱼不仅是我国也是世界性的重要养殖鱼类。5月6日，中国“鲤鱼基因组计划”学术报告会暨新闻发布会在京举行。由中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心、黑龙江水产研究所和中科院北京基因组研究所共同实施
我国绘制完成世界首个鹅全基因组序列图谱
6月3日，深圳华大基因研究院和浙江省农业科学院、象山县浙东白鹅研究所联合召开新闻发布会，宣布“鹅全基因组序列图谱绘制完成”。这是我国独立研究完成的全世界首个鹅全基因组序列图谱，这一研究成果对于揭示家鹅繁殖、抗逆、生长、肉质、羽色等性状的遗传基础，鹅的驯化、不同鹅种的生物学分类、中国家鹅
揭秘口腔细菌Fretibacterium－fastidiosum的完整基因组序列－助力牙周病研究
人类口腔微生物组由多种细菌组成。由于体外培养存在挑战，并非所有口腔细菌都被充分研究。在这项研究中，研究人员报告了一种最近发现的口腔细菌 —— 苛求弗雷特杆菌（Fretibacterium fastidiosum）的完整基因组序列。口腔微生物组包含 700 多种细菌，其中超过三分之一尚未被培养出来。苛
两个菠菜野生种高质量基因组序列发布
近日，国际期刊《新植物学家》（New Phytologist）在线发表了两个高质量的菠菜野生种基因组序列。这项研究由中国农业科学院蔬菜花卉研究所菠菜遗传育种课题组钱伟团队完成，揭示了菠菜的染色体结构，并解析其重要的驯化性状。该研究为进一步利用菠菜野生资源、培育优质菠菜品种具有重要意义。两个菠菜野生种
两个菠菜野生种高质量基因组序列发布
近日，国际期刊《新植物学家》（New Phytologist）在线发表了两个高质量的菠菜野生种基因组序列。这项研究由中国农业科学院蔬菜花卉研究所菠菜遗传育种课题组钱伟团队完成，揭示了菠菜的染色体结构，并解析其重要的驯化性状。该研究为进一步利用菠菜野生资源、培育优质菠菜品种具有重要意义。两个菠菜野生种
我国科学家完成鲤鱼全基因组序列图谱绘制
近日，由中国水产科学研究院首席科学家孙效文牵头，中国水产科学研究院联合黑龙江水产研究所、中科院基因组研究所、哈佛大学、奥本大学等单位组建的国际合作研究团队，完成了鲤鱼全基因组序列图谱绘制，在国际上首个完成全面解析的异源四倍体硬骨鱼类基因组图谱。该研究成果于9月21日在国际生物学权威期刊《自然—
转化序列的概念
中文名称转化序列英文名称transforming sequence定 义起变化作用的基因或序列。应用学科遗传学（一级学科），发育遗传学（二级学科）
序列排比额概念
中文名称序列排比英文名称sequence alignment定 义核酸或蛋白质序列的比较分析法。将序列之间的相同和不同部分排列出来，由此显示序列间的相关性或同源性程度。常借助计算机软件进行分析。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），方法与技术（二级学科）
信号序列的概念
信号序列是引导蛋白质定向转移的线性序列，通常有16-26个氨基酸残基，对所引导的蛋白质没有特异性要求。
SD序列的作用
SD序列的作用是与16S rRNA的3'端上一段富含嘧啶的序列结合，小亚基16S rRNA的3'端的这个小片段就被称为反SD序列。当mRNA中的SD序列于16S rRNA上的反SD序列结合后，就指示了下游的AUG，即是蛋白质合成的起始密码子。