两个菠菜野生种高质量基因组序列发布
近日，国际期刊《新植物学家》（New Phytologist）在线发表了两个高质量的菠菜野生种基因组序列。这项研究由中国农业科学院蔬菜花卉研究所菠菜遗传育种课题组钱伟团队完成，揭示了菠菜的染色体结构，并解析其重要的驯化性状。该研究为进一步利用菠菜野生资源、培育优质菠菜品种具有重要意义。两个菠菜野生种。a为Spinacia tetrandra。b为Spinacia turkestanica。白色框内表示菠菜雄蕊。中国农科院蔬菜所供图菠菜起源于波斯（今伊朗），又名波斯草，赤根菜，于唐代作为尼泊尔的贡品传入我国。菠菜有两种不同类型的野生种，S. turkestanica和S. tetrandra。野生材料往往具有较强的适应性和抗逆境能力，因此是作物遗传改良的重要资源。而菠菜的两种野生型基因组信息尚不清楚，阻碍了菠菜野生种的进一步利用。因此，解析菠菜野生种基因组序列，挖掘重要的驯化性状相关基因，对培育优质菠菜品种奠定基础。该研究从头组装......阅读全文
两个菠菜野生种高质量基因组序列发布
近日，国际期刊《新植物学家》（New Phytologist）在线发表了两个高质量的菠菜野生种基因组序列。这项研究由中国农业科学院蔬菜花卉研究所菠菜遗传育种课题组钱伟团队完成，揭示了菠菜的染色体结构，并解析其重要的驯化性状。该研究为进一步利用菠菜野生资源、培育优质菠菜品种具有重要意义。两个菠菜野生种
两个菠菜野生种高质量基因组序列发布
近日，国际期刊《新植物学家》（New Phytologist）在线发表了两个高质量的菠菜野生种基因组序列。这项研究由中国农业科学院蔬菜花卉研究所菠菜遗传育种课题组钱伟团队完成，揭示了菠菜的染色体结构，并解析其重要的驯化性状。该研究为进一步利用菠菜野生资源、培育优质菠菜品种具有重要意义。两个菠菜野生种
首个野生大豆高质量参考基因组被解析
近日，香港中文大学林汉明教授团队及华大基因等多家国内外机构合作完成了全球首个野生大豆高质量参考基因组解析，该成果为挖掘野生大豆遗传资源和改良、优化栽培大豆品种提供了重要工具。相关研究成果近日在线发表于《自然-通讯》。图片来源于网络 基因组信息是当前作物改良计划的重要基础。过往大豆基因组研究主要
小麦野生近缘种基因组“密码”被破解
记者宋喜群、冯帆从山东农业大学获悉，该校农学院教授孔令让研究团队首次组装了小麦远缘杂交常用物种中间偃麦草和鹅观草染色体水平的高质量基因组序列，解析了二者基因组结构差异与独立多倍化演化路径，对两者携带的抗小麦赤霉病基因Fhb7同源序列的功能与抗性效应进行了研究，为小麦抗性遗传改良及牧草育种提供了重
野生种基因组支招桃产业“上山下滩”
桃子是一种人见人爱的水果。为了促进桃产业绿色发展，让桃树适应更多生存环境，科学家将目光投向了分布更广泛、抗性更高、适应能力更强的桃野生近缘种。 近日，中国农业科学院郑州果树研究所（以下简称郑果所）桃资源与育种创新团队与国内外研究团队合作，发布了桃的4个野生近缘种的高质量泛基因组，发掘了桃野生近
PacBio构建目前最高质量的植物基因组参考序列
来自中科院遗传与发育生物学研究所，四川农业大学的研究人员发表了题为“Sequencing and de novo assembly of a near complete indica rice genome”的文章，对一个籼稻基因组蜀恢498（R498）进行PacBio单分子测序，结合遗传图谱和
科学家破译甘蔗细茎野生种基因组
6月3日，福建农林大学海峡联合研究院基因组中心教授张积森团队以《同源多倍体甘蔗细茎野生种的近期基因组演化》为题，相关研究发表在《自然—遗传学》上。 该研究解析了细茎野生种天然同源四倍体Np-X基因组，并利用基因组学手段系统阐明了甘蔗细茎野生种（又称割手密）的起源、染色体基数、基因组倍体、关键性状
《自然》：2种疟疾寄生虫基因组序列测定
疟疾裂殖子 一个由美英等国科学家组成的国际研究小组近日测定了两种致命疟疾寄生虫的基因组序列。这两种疟疾寄生虫分别名为Plasmodium knowlesi和Plasmodium vivax，其中P. knowlesi最近被认为是感染人类的一个主要疟疾病原体，而P. vivax则会致人极度虚弱，
上海师大团队破解染色体级别基因组密码
中新网上海12月16日电 (记者 许婧)上海师范大学16日发布消息称，该校王全华研究团队在菠菜基因组研究领域又取得一项重大标志性研究成果。团队联合康奈尔大学Boyce Thompson研究所(BTI)费章君教授课题组等多家科研机构完成了新一代菠菜基因组精细图谱绘制、重要农艺性状遗传基础和菠菜驯化
破解染色体级别基因组密码解析栽培菠菜的“前世今生”
上海师范大学16日发布消息称，该校王全华研究团队在菠菜基因组研究领域又取得一项重大标志性研究成果。团队联合康奈尔大学Boyce Thompson研究所(BTI)费章君教授课题组等多家科研机构完成了新一代菠菜基因组精细图谱绘制、重要农艺性状遗传基础和菠菜驯化历史的解析。 该研究成果以“基因组解析
猴痘基因组研究公布：14种序列皆来源这里
对来自正在进行的全球爆发的猴痘病毒 (MPXV) 基因组的分析发现，这些样本聚集在一起，表明它们的来源单一。 根据世界卫生组织的数据，从今年年初到 6 月中旬，已有 2100 多例经实验室确诊的猴痘病例，其中大部分是自 5 月初以来报告的。其中 80% 以上的病例出现在欧洲，12% 出现在美洲
花生二倍体野生种全基因组测序完成
国际花生基因组计划(International Peanut Genome Initiative, IPGI)——由多国作物遗传学家参与的国际团队，于2014年4月2日宣布，历经数年努力后成功完成了世界上首个花生全基因组测序。新测定的花生基因组序列将为世界各地的研究人员和植物育种者使用，来促
科学家构建出目前最高质量的植物基因组参考序列
随着PacBio单分子实时（SMRT）测序技术的发展，利用它已能够独立完成高质量基因组草图的组装。然而，这些草图序列中仍然存在多种错误，比如序列中会包含有很多嵌合体（即不同位置的序列连接到了一起）或是组装质量比较差的区域等，特别是重复序列区域有的没有组装出来，有的组装出来多个序列，而且这些错误通
香港中文大学等解析全球首个野生大豆高质量参考基因组
香港中文大学林汉明团队和华大基因等多家机构合作，完成全球首个野生大豆高质量参考基因组解析。该成果为挖掘野生大豆遗传资源和改良、优化栽培大豆品种提供了重要依据。相关成果近日在线发表于《自然—通讯》。 “大豆的基因组含有大量重复区，组装时困难重重。我们整合了几种最新测序方法产生大量数据，才最终把问
花生基因组宣称花生二倍体野生种全基因组测序完成
国际花生基因组计划4月2日在美国弗吉尼亚州亚历山大市宣布，包括中方合作单位在内的多国科研人员已经成功完成花生基因组测序，将为选育更高产、适应性更广的花生品种提供帮助。 国际花生基因组计划宣称，花生全基因组测序取得的重大进展，分别代表花生属A基因组和B基因组的两个二倍体野生种的全基因组测序已
一种全新的酶可对抗寄生的基因组TE序列
科学家们发现了一种名为 PUCH 的酶，它对于阻止寄生 DNA 序列在我们基因组中的传播至关重要。 这一发现可以让我们深入了解我们的身体如何识别和对抗内部威胁（如基因组寄生虫）和外部威胁（如病毒和细菌）。 德国美因茨分子生物学研究所 (IMB) 的 René Ketting 教授团队与奥地利维
小麦野生远祖基因组测序完成
11月15日出版的《自然》杂志刊登了一篇研究论文称，美国加州大学戴维斯分校科学家领导的国际团队，成功为小麦的一种野生远祖——节节麦（Aegilops tauschii）进行了基因组测序，向破解小麦基因组难题迈进了一步。 作为全球主要粮食作物，小麦为人类提供了超过20%碳水化合物和23%蛋白质等
基因组序列草图的概念
中文名称基因组序列草图英文名称draft genome sequence定 义已测定序列占到90%以上、测序精度在1%的基因组序列图。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
解析现代月季基因组序列
科学家研究现代月季基因。图片来源：monticelloshop.org 近日，法国农业科学研究院、里昂大学、法国国家科学研究中心的研究人员解密了现代月季的基因组序列。现代月季拥有独特的颜色与香味，广受称赞，这项研究帮助人们从分子角度了解这背后的基因和代谢流程。4月30日，相关论文在线刊登于《自然
概述酿酒酵母的基因组序列
1996年6月，在国际互联网的公共数据库中公布了酿酒酵母的完整基因组顺序，它被称为遗传学上的里程碑。因为首先，这是人们第一次获得真核生物基因组的完整核苷酸序列；其次，这是人们第一次获得一种易于操作的实验生物系统的完整基因组。 [10] 在酿酒酵母测序计划开始之前，人们通过传统的遗传学方法已确定
首次测定玉米蛇基因组序列
在现有的5000种哺乳动物中，有超过100种已经进行了基因组测序，但是，只有9种爬行动物（在10000个物种当中）的基因组对科学界来说是可用的。最近，瑞士日内瓦大学（UNIGE）的一个研究小组，构建了一个大的数据库，其中就包括一种爬行动物——玉米蛇的新基因组测序，这种蛇越来越多地被用来了解爬行动
－Nature：一种软骨鱼的第一个基因组序列
象鲨(Callorhinchus milii)是澳大利亚南部和新西兰温带水域的一种本地软骨鱼，生活在200米到500米深处，在春季迁移到浅水中进食。 本期Nature发表了这种鱼的基因组序列。与其他脊椎动物基因组所做比较显示，它是所有已知脊椎动物(包括腔棘鱼)中演化最慢的基因组。
千种野生种质资源汇聚两园
红色的锦带花、白色的冰菊、粉红色的芍药、五颜六色的鲁冰花开得正艳，野苹果、野杏子、野欧洲李挂满枝头，望峰湖、醉心湖、翠月湖、平宁湖流水潺潺…… 盛夏时节，年近70岁的中国科学院新疆生态与地理研究所（以下简称“中科院新疆生地所”）伊犁植物园主任管开云站在伊犁植物园内，脸上满是收获的喜悦。 经过
昆明植物所完成六种木本竹子叶绿体基因组全序列的测定
竹亚科（Bambusoideae）隶属于禾本科（Poaceae），全世界共分布有一千余种。木本竹子因种类数目多，形态性状复杂多变及多年生一次性开花等原因而成为系统发育学研究难点。随着新一代测序技术的兴起，系统发育基因组学为解决这类困难类群的系统发育关系带来了曙光。 中国科学院昆明植物研究所李德
我国率先构建野生大豆泛基因组
中国农业科学院作物科学研究所与诺禾致源等合作，在国际上率先构建和分析了一年生野生大豆的泛基因组，为作物种质资源研究和利用提供了新的方法和启示。该研究成果9月14日在线发表于国际著名学术期刊《自然—生物技术》。 项目牵头人、中国农科院作科所研究员邱丽娟介绍，大豆是重要的油料和高蛋白粮饲兼用作物。
马铃薯基因组序列框架图全球发布
中国科学家的创新性思路助推测序工作提前完成 9月23日，由14国科学家组成的“国际马铃薯基因组测序协作组”分别在北京、阿姆斯特丹、伦敦、纽约、利马等地同时宣布了马铃薯基因组序列框架图的完成。此次公布的马铃薯基因“蓝图”绘制工作的中国参与单位主要来自中国农业科学院蔬菜花卉所和深圳华大基因研究院。
胡萝卜基因组序列草图成功绘出
来自美国的一个研究小组称，他们完成了对30余种胡萝卜样品的测序，绘制出了胡萝卜基因组序列草图。这很可能是迄今最完整的蔬菜基因组序列草图。研究人员称，这一研究阐明了胡萝卜的起源和演化过程，对改善胡萝卜和其他农作物的营养价值提供了可能。相关论文在线发表在《自然·遗传学》杂志网站上。 胡萝卜和生菜
新软件按需组装无缝基因组序列
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494014.shtm 科技日报北京2月16日电 （记者张梦然）美国国立卫生研究院研究人员发布了一种创新的软件工具，用于组装来自各种物种的真正完整（即无缝）的基因组序列。这种名为Verkko的软件在芬兰
白菜甘蓝油菜全基因组序列测定
由中国科学家领衔的白菜、甘蓝和油菜全基因组测序项目取得阶段性重大成果,获得了白菜全基因组的精细图,甘蓝和油菜全基因组的框架图。 研究表明，白菜、甘蓝和油菜的基因组大小分别约为5亿、6.5亿和11亿个碱基对,白菜和甘蓝含有的基因总数目分别约4.2万和4.5万个,油菜基因覆盖度85%以上。该
－震惊！Genbank参考基因组序列多处错误！
震惊！Genbank参考基因组序列多处错误！ 随着基因组测序技术的飞速发展以及测序成本的快速降低，全基因组数据也在急速增加。尽管参考基因组数据是非常有价值的资源，但是由于测序过程中的外源污染或者研究者对数据组装方法的误用，使得基因组数据面临很多问题。 近日，约翰霍