NatStructMolBiol:冷冻电镜技术揭示RNA降解新通路

2013年12月15日,清华大学生命科学学院王宏伟教授课题组在《Nature》子刊《Nature Structural and Molecular Biology》在线发表题为“Visualization of Distinct Substrate Recruitment Pathways in the Yeast Exosome by EM”的研究论文,报道了不同RNA底物在蛋白复合物Exosome中的不同降解通路及结构调节机制。 在中心法则中,RNA由DNA转录而成,并经过复杂的转录后加工,成为成熟的多种RNA。细胞中的RNA质量控制,在细胞基因表达及调控的多个过程中发挥着不可缺少的作用,对细胞的发生、生长、分裂、分化、死亡等过程都具有重要意义。目前对细胞中的RNA质量控制,尤其是对RNA分子被降解的决定因素知之甚少。真核生物细胞中有多种识别及调控RNA降解的蛋白质大分子及其复合物,其中, Exosom......阅读全文

酶底物复合物的概念

中文名称酶-底物复合物英文名称enzyme-substrate complex定  义在酶催化的反应中,酶首先与底物结合形成的过渡态中间物。可转化成产物和酶。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),酶(二级学科)

底物化学发光的用途

非放射性发光系统,用于检测固定在膜上的蛋白,其敏感性达1-5pg。用x光片可快速地获得永久的硬拷贝结果。所含独特的底物足以维持12小时以上的发光,便于反复曝光操作,免疫印迹膜经抗体脱卸处理后可供再次抗体探查使用。适用于痕量蛋白或核酸检测。

底物化学发光操作注意

1. 试剂每个批号均独立优化,请不要混用或稀释试剂以免降低敏感性;2. 加入一抗后膜不能再干燥;3. 适当地封闭和洗涤膜片至关重要;4. 使用前配置化学发光试剂,配置足够覆盖膜片即可,弃去使用过的混合试剂;5. 使用干净取样头取用每种试剂;6. 第一张片子建议曝光1分钟,观察结果后判断最佳曝光时间可

胰岛素受体底物的定义

胰岛素受体底物(insulin receptor substrate,IRS),参与胰岛素及其他细胞因子信号转导的磷酸化蛋白。IRS在被胰岛素受体磷酸化以后,如同一块“磁铁”与那些具有SH2结构域的蛋白结合,根据所结合蛋白的具体结构产生不同的效应,如激活SH2蛋白的酶活性、改变蛋白质构型并同另外的蛋

底物量对反应结果的影响

化学反应是化学学习的一个重要内容。物质间发生的化学反应往往错综复杂、变化万千。不少化学反应是需要在一定条件下发生的,缺少了反应条件,有的反应是不能发生的,或进行得很慢。反应物的量的不同对反应结果有影响。1、CO2气体通入NaOH溶液中。当n CO2/n NaOH≤1/2时,反应方程式为CO2+ 2N

试剂盒酶的底物分类

酶的底物 1.3.3.1 HRP的底物 HRP催化过氧化物的氧化反应,最具代表性的过氧化物为H2O2,其反应式如下:DH2+ H2O2 D+ H2O上式中,DH2为供氧体,H2O2为受氢体。2.在ELISA试剂盒中,DH2一般为无色化合物,经酶作用后成为有色的产品,以便作比色测定。常用的供氢体有邻苯

使用荧光底物的直接-ELISA-实验

实验概要使用荧光偶联一抗的直接 ELISA 测定的程序。实验步骤第 1 天:1. 在滤过的 PBS 中稀释包被抗体后,在每孔中加入 100 μl 进行包被。用封板膜覆盖酶标板,将酶标板在 4℃下孵育过夜。 第 2 天:2. 将 4 g Block ACE 粉末稀释于 100 ml 去离子水中,使用其

mRNA降解途径分析

涉及到许多细胞内因子和复合物, 如Dcp1p、Pat1p、Rap55和staufen等.同时, 也有报导认为, 细胞质处理小体是体内mRNA 降解的主要位点 .因此, 明确细胞质处理小体(P-body)在mRNA 降解过程的功能以及各种酶和复合物调节mRNA 降解所经历的途径是本领域研究的主要内容.

环鸟苷酸的降解途径

和大多数环化核苷酸一样,环磷酸鸟苷可以被磷酸二酯酶(phosphodiesterases, PDE)水解为5'-磷酸鸟苷。

泛素依赖降解途径

大多数蛋白酶(包括溶酶体酶体系)降解底物时不需要三磷酸腺苷(ATP)提供能量,如胃蛋白酶、胰蛋白酶等。20世纪50年代初,Simpson在肝脏组织培养的切片中检测到了氨基酸的产生,揭示出细胞内大部分蛋白质的降解需要能量。真核生物如何识别和选择性降解蛋白质是细胞生命过程中的重要环节,对于维持蛋白质在细

信使RNA的降解

同一细胞内的不同mRNA具有不同的寿命(稳定性)。在细菌细胞中,单个mRNA可以存活数秒至超过一小时,但平均寿命为1至3分钟,因此,细菌mRNA的稳定性远低于真核mRNA。哺乳动物细胞mRNA的寿命从几分钟到几天不等。mRNA的稳定性越高,从该mRNA产生的蛋白质越多。 mRNA的有限寿命使细胞能够

印染废水降解方法

印染行业是用水大户,也是排污大户。印染企业一般都建有完善的污水处理系统,污水处理后出水达一级或二级排放标准,但由于水资源的日渐短缺和严重污染,无论从企业成本角度还是社会环保的发展要求,印染废水进行深度处理后回用已十分必要。本公司对印染企业做了大量的研究及试验工作,开发了整套HS印染废水回用解决方案,

酶催化的特点和底物类型

特点一、酶促反应具有极高的效率二、酶促反应具有高度的特异性酶的特异性是指酶对底物的选择性,有以下三种类型:1.绝对特异性 酶只作用于特定结构的底物,生成一种特定结构的产物。如淀粉酶只作用淀粉。2.相对特异性 酶可作用于一类化合物或一种化学键。例如磷酸酶可作用于所有含磷酸酯键的化合物。3.立体异构特异

底物存放时间对酶活的影响

大量实验表明,长时间存放的底物,会造成较高的本底值,影响测定精度。我们分析了植酸钠溶液存放在4 ℃条件下,底物存放时间对酶活的影响,结果见表3。

胰岛素受体底物的功能介绍

胰岛素受体底物(insulin receptor substrate,IRSs)是一种能够被激活的胰岛受体酪氨酸激酶的底物, 其上具有十几个酪氨酸残基可被磷酸化,磷 酸化的IRSs能够结合并激活下游效应物。

底物用量对转化率的影响

恒温恒压时:如反应mA(g)+nB(g)≒pC(g)+qD(g)(1)当不改变反应物用量,平衡受温度或压强改变的影响向正向移动时,各反应物的转化率增大;(2)若反应达平衡后,增加一种气态反应物的用量,则另一种反应物的转化率增大,而本身的转化率反而减小;(3)投料比等于气态反应物化学计量数之比,各反应

血凝分析仪底物显色法简述

  底物显色法(生物化学法)  底物显色法是通过测定产色底物的吸光度变化来推测所测物质的含量和活性的,该方法又可称为生物化学法。其原理是通过人工合成与天然凝血因子有相似的一段氨基酸排列顺序、并含有特定作用位点的小肽,并将可水解产色的化学基因与作用位点的氨基酸相连。测定时由于凝血因子具有蛋白水解酶的活

关于胰岛素受体底物的简介

  胰岛素受体底物(insulin receptor substrate,IRS) 是指能够被激活的胰岛素受体酪氨酸激酶作用的底物, 其上具有十几个酪氨酸残基,可被磷酸化,磷酸化的IRS能够结合并激活下游效应物。  IRS在被胰岛素受体磷酸化以后,如同一块“磁铁”与那些具有SH2结构域的蛋白结合,根

胰岛素受体底物种类介绍

第一种是胰岛素受体底物1(IRS1),是一种蛋白质,其上有多个(至少8个)可被受体激酶磷酸化的位点,磷酸化后可同多种效应物结合,包括:PI(3)K、Syp(一种磷酸酪氨酸磷酸酶)、Nck(一种连接蛋白)、GRB2(growthfactor receptor-bound protein2,一种通过SH

化学发光底物(化学发光剂)

在化学发光反应中参与能量转移并最终以发射光子的形式释放能量的化合物称为化学发光剂或发光底物。在发光免疫技术中常用的化学发光底物有以下几类。 1、氨基苯二酰肼类主要是鲁米诺及异鲁米诺衍生物,是最常用的一类化学发光剂。鲁米诺(luminol,5'-氨基-2,3-二氢-1,

底物用量对转化率的影响

恒温恒压时:如反应mA(g)+nB(g)≒pC(g)+qD(g)(1)当不改变反应物用量,平衡受温度或压强改变的影响向正向移动时,各反应物的转化率增大;(2)若反应达平衡后,增加一种气态反应物的用量,则另一种反应物的转化率增大,而本身的转化率反而减小;(3)投料比等于气态反应物化学计量数之比,各反应

底物种类对酶活的影响

实验结果表明,用Sigma植酸钠做底物,其酶活检测值相当于国产植酸钠的82.49%左右,经过反复多次的对比,两种底物的检测值都有相似的对应关系。国产植酸钠完全可以替代Sigma植酸钠用于中性植酸酶酶活的检测,同时,其价格只有Sigma植酸钠的0.5%,用国产植酸钠可以大大降低检测成本。

新型ECL底物为Western带来漂亮结果

  Bio-Rad公司近日推出了新的化学发光检测试剂 C Clarity western ECL底物。这种新底物既适合胶片检测,也适合数码检测,能为高表达和低表达蛋白带来出色的结果,满足研究人员的各种需求。   选择western blotting检测底物看似很简单,其实也有不少学问。一般

大肠杆菌的呼吸酶和底物

大肠杆菌的呼吸酶和底物呼吸酶氧化还原对中点电位(伏)甲酸脱氢酶碳酸氢盐/甲酸盐−0.43氢化酶质子/氢−0.42NADH脱氢酶NAD/NADH−0.32甘油-3-磷酸脱氢酶DHAP/Gly-3-P−0.19丙酮酸氧化酶醋酸盐+二氧化碳/丙酮酸盐?乳酸脱氢酶丙酮酸盐/乳酸盐−0.19D-氨基酸脱氢酶2

胰岛素受体底物的主要种类

已知有三种胰岛素受体酪氨酸激酶作用的底物(IRS)。第一种是胰岛素受体底物1(IRS1)。这是一种蛋白质,其上有多个(至少8个)可被受体激酶磷酸化的位点,磷酸化后可同多种效应物结合,包括PI3K(磷脂酰肌醇-3-激酶)、Syp(一种磷酸酪氨酸磷酸酶)、Nck(一种连接蛋白)、GRB2(growthf

底物化学发光使用方法

1. 印迹膜制备 按常规方法完成SDS-PAGE和电转膜操作,适当的封闭非常重要。可以通过标记一抗或二抗的手段引入HRP,一般采用市售的HRP二抗交联物。仔细地淋洗对于降低背景非常重要,在与HRP交联物温育后,膜片更需仔细洗涤,所有步骤均在室温下完成。2. 化学发光试剂的配置 在使用前等量混合a液和

发光底物吖啶酯和鲁米诺哪个更好

吖啶酯类的直接化学发光剂不需酶的催化作用,只需改变溶液的pH等条件就能发光。吖啶酯的化学发光量子产率比鲁米诺高,而且吖啶酯标记条件温和,标记率高,标记后不影响分离。吖啶酯和鲁米诺两者价格也相差很大。

ELISA中的试剂(3)-酶的底物

3.3  酶的底物 3.3.1  HRP的底物 HRP催化过氧化物的氧化反应,最具代表性的过氧化物为H2O2,其反应式如下:DH2+ H2O2 D+ H2O上式中,DH2为供氧体,H2O2为受氢体。在ELISA中,DH2一般为无色化合物,经酶作用后成为有色的产物,以便作比色测定。常用的供氢体有邻苯二

芳香族化合物的降解苯的降解介绍

  苯的降解在 30 年前的研究已经非常成功 。苯降解时有二个分支途径,途径如图1中a。苯环最初被苯双加氧酶攻击而形成邻苯二酚,邻苯二酚进一步通过间位或邻位双加氧酶的作用而产生粘康酸半醛或粘康酸。

蛋白降解靶向嵌合体降解剂研究取得新进展

近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员许永团队报道了一种新型的、高效的靶向环磷酸腺苷反应元件结合蛋白(CREB)结合蛋白CBP/腺病毒EA1结合蛋白p300(CBP/p300)的蛋白降解靶向嵌合体(PROteolysis TArgeting Chimeras,PROTAC)降解剂,可用于治疗