NatStructMolBiol:冷冻电镜技术揭示RNA降解新通路
2013年12月15日,清华大学生命科学学院王宏伟教授课题组在《Nature》子刊《Nature Structural and Molecular Biology》在线发表题为“Visualization of Distinct Substrate Recruitment Pathways in the Yeast Exosome by EM”的研究论文,报道了不同RNA底物在蛋白复合物Exosome中的不同降解通路及结构调节机制。 在中心法则中,RNA由DNA转录而成,并经过复杂的转录后加工,成为成熟的多种RNA。细胞中的RNA质量控制,在细胞基因表达及调控的多个过程中发挥着不可缺少的作用,对细胞的发生、生长、分裂、分化、死亡等过程都具有重要意义。目前对细胞中的RNA质量控制,尤其是对RNA分子被降解的决定因素知之甚少。真核生物细胞中有多种识别及调控RNA降解的蛋白质大分子及其复合物,其中, Exosom......阅读全文
使用荧光底物的直接-ELISA-实验方案
实验概要使用荧光偶联一抗的直接 ELISA 测定的程序。实验步骤第 1 天:1. 在滤过的 PBS 中稀释包被抗体后,在每孔中加入 100 μl 进行包被。用封板膜覆盖酶标板,将酶标板在 4℃下孵育过夜。 第 2 天:2. 将 4 g Block ACE 粉末稀释于 100 ml 去离子水中,使用其
底物浓度对酶反应速度的影响
底物浓度的改变,对酶反应速度的影响比较复杂。在一定的酶浓度下当底物浓度较低时(底物浓度从0逐渐增高),反应速度与底物浓度的关系呈正比关系。随着底物浓度的增加,反应速度不再按正比升高;如果再继续加大底物浓度,反应速度却不再上升,趋向一个极限。
酶免疫技术中酶和酶作用底物
酶和酶作用底物(一)酶的要求: 一个酶蛋白分子每分钟可催化10 3 ~10 4 个底物分子转变成有色产物。用于标记的酶应符合:1.酶的活性要强,催化反应的转化率高,纯度高。2.酶催化底物后产生的产物易于判断或测量,方法简单易行、敏感和重复性好。3.作用专一性强 ,酶活性不受样品中其他成分的影响,受检
免疫酶技术中常用的酶底物系统
各种免疫酶技术,最终都是以某种显色反应而揭示待测物质来进行定性和定量分析。不同酶要选择相应的底物,见下表。免疫酶技术中常用的酶-底物系统酶底物显色反应测定波长/nm辣根过氧化物酶二氨基联苯胺深褐色沉淀5-氨基水杨酸棕色449邻苯二胺橘红色492/460邻联甲苯胺蓝色4254-硝基酚磷酸黄色400碱性
酶的特性实验—底物专一性
实验原理 酶的专一性是指一种酶只能对一种底物或一类底物(此类底物在结构上通常具有相同的化学键)起催化作用,对其他底物无催化反应。如淀粉酶只能催化淀粉水解,对蔗糖的水解并无催化作用。淀粉水解产物为葡萄糖,蔗糖水解产物为果糖及葡萄糖,这两种己糖的半缩醛基可与 Benedict试剂反应,生成氧化亚
胰岛素受体底物的结构功能特点
胰岛素受体底物(insulin receptor substrate,IRS) 是指能够被激活的胰岛素受体酪氨酸激酶作用的底物, 其上具有十几个酪氨酸残基,可被磷酸化,磷酸化的IRS能够结合并激活下游效应物。
大肠杆菌的呼吸酶和底物汇总
大肠杆菌的呼吸酶和底物呼吸酶氧化还原对中点电位(伏)甲酸脱氢酶碳酸氢盐/甲酸盐−0.43氢化酶质子/氢−0.42NADH脱氢酶NAD/NADH−0.32甘油-3-磷酸脱氢酶DHAP/Gly-3-P−0.19丙酮酸氧化酶醋酸盐+二氧化碳/丙酮酸盐?乳酸脱氢酶丙酮酸盐/乳酸盐−0.19D-氨基酸脱氢酶2
底物浓度对酶反应速度的影响
底物浓度的改变,对酶反应速度的影响比较复杂。在一定的酶浓度下当底物浓度较低时(底物浓度从0逐渐增高),反应速度与底物浓度的关系呈正比关系。随着底物浓度的增加,反应速度不再按正比升高;如果再继续加大底物浓度,反应速度却不再上升,趋向一个极限 。
大肠杆菌的检测方法酶底物法
酶底物法已被列为国家标准(GB/T4789.32-2002),用酶底物法来检测大肠杆菌的主要原理是:大肠杆菌细菌能够产生 β-半乳糖苷酶(β-D-galactosidase),它能够分解 ONPG(Ortho-nitro phenyl-β-D-galactopyr-anoside),从而使得培养
酶测定中底物浓度的影响有哪些?
在检测试剂中底物浓度、辅因子、活化剂、复构剂的种类和浓度均对酶的测定至关重要。其中以底物的种类和浓度最为重要。底物浓度影响遵循米氏方程:ν=V[S]/Km+[S]当底物浓度远远小于Km,增加底物浓度,反应速度增加。当底物[S]>>Km时,公式近似为ν=V,反应速度不再增加,故此时反应速度为最大反应V
血栓/止血成份检测方法—底物显色法简介
底物显色法通过测定产色底物的吸光度变化来推测所测物质的含量和活性的,该方法又可称为生物化学法。检测通道由一个卤素灯为检测光源,波长一般为405nm。探测器与光源呈直线,与比色计相仿。 凝血仪使用产色底物检测血栓与止血指标的原理是:通过人工合成与天然凝血因子有相似的一段氨基酸排列顺序并还有特
关于胰岛素受体底物的种类介绍
已知有三种胰岛素受体酪氨酸激酶作用的底物(IRS)。 第一种是胰岛素受体底物1(IRS1)。这是一种蛋白质,其上有多个(至少8个)可被受体激酶磷酸化的位点,磷酸化后可同多种效应物结合,包括PI3K(磷脂酰肌醇-3-激酶)、Syp(一种磷酸酪氨酸磷酸酶)、Nck(一种连接蛋白)、GRB2(gro
关于酶标记抗体的酶制剂及其底物
凡无毒性又能呈现有色化学反应的酶,原则上均可作为标记用。但作为标记抗体用的酶应满足下列要求:(1)来源方便,易于纯化;(2)比活性高,性质稳定;(3)酶活性和量能用简单方法测定。在免疫酶技术中常用的酶为辣根过氧化物酶(HRP)和碱性磷酸酶(AP),其次还有葡萄糖氧化酶,β-半乳糖苷酶、溶菌酶和苹
酪蛋白激酶分析实验_用多肽底物
实验方法原理酪蛋白激酶 I 可用多肽 AspAspAspGluGluSerIleThrArgArg 进行分析,最近酿蛋白激酶 II 也已被特异性的多肽底物分析,如 ArgArgArgGluGluGluThrGluGluGlu(下划线残基是磷酸受体)。两个多肽均可通过精氨酸残基结合到 P81 磷酸纤维
常用的酶和常用的底物有哪些?
常用的酶1.辣根过氧化物酶(HRP):目前酶联免疫吸附试验中应用最广泛的标记用酶。由无色的糖蛋白(主酶)和亚铁血红蛋白(辅基)结合而成的复合物。辅基是酶活性基团,而主酶则与酶活性无关,HRP的纯度用RZ(HRP分别在403nm和275nm处的吸光度比值)表示,RZ值应大于3.0。RZ值仅说明血红素基
关于mRNA降解途径介绍
涉及到许多细胞内因子和复合物, 如Dcp1p、Pat1p、Rap55和staufen等.同时, 也有报导认为, 细胞质处理小体是体内mRNA 降解的主要位点 .因此, 明确细胞质处理小体(P-body)在mRNA 降解过程的功能以及各种酶和复合物调节mRNA 降解所经历的途径是本领域研究的主要内容.
真核mRNA的降解
真核细胞的翻译和mRNA衰变之间存在着平衡。正在被翻译的mRNA被核糖体,真核起始因子eIF-4E和eIF-4G以及poly(A)结合蛋白结合,不能接触外泌体复合物,mRNA得到保护。mRNA的poly(A)尾巴被特异性外切核酸酶缩短,该核酸外切酶通过RNA上的顺式调节序列和反式作用RNA结合蛋白的
原核mRNA的降解
原核生物mRNA的降解是不同核糖核酸酶包括核酸内切酶,3'核酸外切酶和5'核酸外切酶的共同作用的结果。在一些情况下,长度为数十至数百个核苷酸的小RNA分子(sRNA)可通过与互补序列碱基配对来促进RNase III对特定mRNA的降解。
Nature揭秘RNA降解机制
就好像我们利用碎纸机来销毁不再有用或包含有潜在破坏性信息的文件一样,细胞利用一些分子机器来降解不必要或有缺陷的大分子。来自马克斯普朗克生物化学研究所(MPIB)的科学家们,现在揭示出了细胞核区室利用一种特异的RNA外来体(exosome)的机制——这一大分子机器负责了核糖核酸(RNAs)的降解和
什么是生物降解
指材料在生物体内通过溶解、酶解、细胞吞噬等作用,在组织长入的过程中不断从体内排出,修复后的组织完全替代植入材料的位置,而材料在体内不存在残留的性质。生物降解金属医用材料是指金属植入物在辅助并完成生物组织修复的过程中。在生物体内逐渐腐蚀直至完全溶解的一类金属材料,同时材料的腐蚀产物对生物体不会产生或产
原核mRNA的降解
原核生物mRNA的降解是不同核糖核酸酶包括核酸内切酶,3'核酸外切酶和5'核酸外切酶的共同作用的结果。在一些情况下,长度为数十至数百个核苷酸的小RNA分子(sRNA)可通过与互补序列碱基配对来促进RNase III对特定mRNA的降解。
COD降解剂工作原理
COD降解剂工作原理产品功能 1. 产品为无色至微黄色晶体或颗粒。 2. 运用化学反响,对污水中高分子进行断链和损坏,到达降解COD的作用。 3. 易溶于水等无机溶剂,运用操作便利。 4.与各种絮凝剂、混凝剂配伍运用,起增效作用。 适用范畴 产品广泛应用于各种印染、化工、酿制、城市日子用水及归纳废水
COD降解剂工作原理
COD降解剂工作原理产品功能 1. 产品为无色至微黄色晶体或颗粒。 2. 运用化学反响,对污水中高分子进行断链和损坏,到达降解COD的作用。 3. 易溶于水等无机溶剂,运用操作便利。 4.与各种絮凝剂、混凝剂配伍运用,起增效作用。 适用范畴 产品广泛应用于各种印染、化工、酿制、城市日子用水及归纳废水
降解的概念和定义
1 有机化合物分子中的碳原子数目减少,分子量降低。2 高分子化合物的大分子分解成较小的分子。3塑料降解:塑料降解一词指高分子聚合物达到生命周期的终结。塑料降解是使聚合物分子量下降、聚合物材料(塑料)物性下降。典型表现是:塑料发脆、破裂、变软、增硬、丧失力学强度等。塑料的老化、劣化就是一种降解现象。但
首次证明:生物降解塑料在深海中也能被降解
日本6家机构共同宣布,生物降解塑料 (聚乳酸除外)即使在深海也能被微生物分解,这一发现是世界第一次。这些研究机构来自东京大学、海洋研究开发机构、群马大学、产品评价技术基础机构、产业技术综合研究所、日本生物塑料协会。他们的试验地点包括神奈川县的三崎冲(水深757m)、静冈县的初岛冲(水深855m) 、
关于芳香族化合物的降解取代苯的降解简介
取代基团的存在使苯环的降解出现两种可能:先降解苯环或先降解侧链 。含 2 ~ 7 个碳原子的单烃基取代苯的一般途径如图1中b)。当 C >7 时,先通过 β,ω氧化降解取代烃基链,最后再降解苯环。长的烃基侧链氧化后足够给微生物提供生长的能量,这样微生物就不会降解苯环 。
农用地膜降解难-“一号文件”或补贴可降解农膜
按照惯例,12月内,一年一度的中央农村工作会议即将召开,业界普遍预计,今年“一号文件”的主题是生态农业。在今年两会期间,“一号提案”是九三学社中央所提的“绿色农业”,其中提出加强对废旧农膜的收购力度,对农民购买可降解农膜实施补贴。政协提案的反馈和落实是政府工作的重要内容。在“一号文件”聚焦生态农
真核生物中典型的呼吸酶及其底物
真核生物中典型的呼吸酶及其底物呼吸酶氧化还原对中点电位(伏)NADH脱氢酶NAD/NADH−0.32琥珀酸脱氢酶FMN或FAD/ FMNH2或FADH2−0.20细胞色素bc1复合体辅酶Q10ox/ 辅酶Q10red+0.06细胞色素bc1复合体细胞色素box/ 细胞色素bred+0.12复合体IV
RNA聚合酶的反应需要哪些底物?
该酶需要四种核糖核苷酸三磷酸(NTP:ATP、GTP、CTP、UTP)作为RNA聚合酶的底物,DNA为模板,二价金属离子Mg2+、Mn2+是该酶的必需辅因子。其催化的反应表示为:(NMP)n+NTP→(NMP)n+1+PPi。RNA链的合成方向也是5’→3',第一个核苷酸带有3个磷酸基。其后
酶与底物反应产生产物的过程
S(底物)→P(产物)这个反应之所以能够进行,是因为有相当部分的S分子已被激活成为活化(过渡态)分子,活化分子越多,反应速度越快。在特定温度时,化学反应的活化能是使1摩尔物质的全部分子成为活化分子所需的能量(千卡)。酶(E)的作用是:与S暂时结合形成一个新化合物ES,ES的活化状态(过渡态)比无催化