营养所揭示SRSF10调控mRNA选择性剪接的新机制
1月18日，Nucleic Acids Research在线发表了中科院上海生命科学研究院营养科学研究所研究员冯英组的最新研究进展：Transcriptome analysis of alternative splicing events regulated by SRSF10 reveals position-dependent splicing modulation，该研究基于高通量转录组测序(RNA-seq)技术结合生物信息分析，首次揭示了选择性剪接蛋白SRSF10在细胞内调节的靶底物以及其调控mRNA选择性剪接的机制。 近年来，随着二代测序技术的飞速发展，测序已成为研究基因组和转录组的重要手段之一。高通量转录组测序技术(RNA-seq)可用于检测基因表达差异、融合基因、未知或稀有转录本、以及mRNA选择性剪接等研究领域。 SRSF10是经典的SR蛋白家族成员之一，已有研究表明，SRSF10......阅读全文
选择性剪接
中文名选择性剪接外文名alternative splicing别 名可变剪接作 用mRNA前体加工特 点表达水平的不同而导致不同的表型定义选择性剪接（也叫可变剪接）是指从一个mRNA前体中通过不同的剪接方式（选择不同的剪接位点组合）产生不同的mRNA剪接异构体的过程，使得最终的蛋白
致癌新机制：“选择性剪接”
由于正常细胞周期基本机制（如复制、DNA修复和细胞死亡）遭到破坏，在世界范围内，癌症已成为死亡的主要原因之一。 在基因组测序技术的帮助下，如今的生物医学研究人员已经可以鉴定不同肿瘤患者体内的常见遗传突变。 通常情况，人们认为只有DNA突变会导致癌症。9月21日《Cell Reports》杂志
中科院Cell子刊发布选择性剪接研究新发现
来自中科院上海生命科学研究院营养科学研究所的研究人员证实，SRSF10通过调控选择性剪接在成肌细胞分化及葡萄糖生成中起重要作用。这一研究发现发布在11月11日的《Cell Reports》杂志上。 领导这一研究的是中科院上海生命科学研究院营养科学研究所代谢性疾病的基因表达调控研究组组长冯英（Y
营养所揭示SRSF10调控mRNA选择性剪接的新机制
1月18日，Nucleic Acids Research在线发表了中科院上海生命科学研究院营养科学研究所研究员冯英组的最新研究进展：Transcriptome analysis of alternative splicing events regulated by SRSF10 reve
Nature子刊:深度学习预测传统RNASeq无法检测的选择性剪接
项目负责人Yi Xing博士是CHOP计算和基因组医学中心主任，本周他与博士生Zijun Zhang和Zhicheng Pan在《Nature Methods》报道了这款DARTS的框架。DARTS，又称为深度学习加强的RNA-seq转录剪接分析（Deep-learning Augmented
自剪接
自剪接(self-splicing)出现在稀少的内含子组成核酸酶，核酸酶在只有RNA的情况下代替了剪接体的功能。自剪接的内含子有两种，称为I型及Ⅱ型。I型及Ⅱ型内含子以与剪接体类似的方式进行剪接，但不需要任何蛋白质。这种相似性使人相信这些内含子与剪接体在演化过程上有着关连。自剪接亦可能是非常古老，且
RNA－剪接
中文名称RNA 剪接英文名称RNA splicing定 义在真核细胞核中从RNA初始转录物切除内含子，连接外显子形成成熟的mRNA的过程。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞遗传（二级学科）
异常剪接
中文名异常剪接定 义指对序列库中异常剪接mRNA的鉴定和分析隶属领域生物领域主要功能处理多顺反子性转录单元，调控转录效率和mRNA的稳定性，同时可以增加产物蛋白的多样性
剪接位点
中文名称剪接位点英文名称splicing site;splice site定 义剪接体可识别的RNA前体中内含子和外显子连接边界的序列和接头位点。根据位置不同可以分为供体和接纳体剪接位点。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
剪接体
剪接体（英文：spliceosome）定义：由核小RNA(snRNA，U1、U2、U4、U5、U6等)和蛋白质因子(约100多种)动态组成、识别RNA前体的剪接位点并催化剪接反应的核糖核蛋白复合体。只与SMT蛋白理解与糖性一致。
简述第Ⅳ类内含子的剪接tRNA的剪接
酵母基因组共有约400个tRNA基因,含有内含子的基因仅占十分之一。内含子的长度从14到46个碱基对不等,它们之间并无保守序列,切除内含子的酶识别仅是共同的二级结构,而不是共同的序列。通常内含子插入到靠近反密码子处,与反密码子碱基配对,未成熟tRNA的反密码子环不存在,而是以插入的内含子所构成的
调控NMD因子UPF3A的选择性剪接在结直肠癌中的重要功能
4月11日，国际学术期刊International Journal of Cancer 在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所冯英组的最新研究进展“U2-related proteins CHERP and SR140 contribute to colorectal tumorigenesi
蓝光和环境温度通过CRY2CIS1调控RNA选择性剪接及开花时间
11月18日，《自然-通讯》（Nature Communications）在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心刘宏涛研究组撰写的题为CRY2 interacts with CIS1 to regulate thermosensory flowering via FLM alternati
关于RNA剪接第Ⅱ类内含子的自我剪接介绍
第Ⅱ类内含子,其5’剪接点和3’剪接点的序列多为…外显子…↓GUGCG…内含子…嘧啶碱AU↓…外显子…,除了剪接点序列特征之外,在离3’剪接点上游6-12bp有一段比较保守的序列,一致序列为CUCAC,在这一保守序列A的两侧各有一段3~5核苷酸的短序列能与上游方向的核苷酸互补,而A总是不包含在这
前剪接体和剪接体的分离及分析实验
剪接体是由 RNA 和蛋白质构成的核糖核蛋白体（RNP)，它在前体 mRNA 的剪接过程中可去除前体 mRNA 的内含子。snRNP 是由 snRNA 及其结合蛋白组成，在前体 mRNA 的剪接过程起着重要作用。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。实验方法原理剪接体是由 RNA 和蛋白质
关于第Ⅲ类内含子的剪接hnRNA的剪接的介绍
核基因hnRNA内含子的剪接点序列为…外显子…↓GU…内含子…AG↓…外显子…,这就是普遍适用的所谓Breathnach-Chambon规则（GU-AG规则）(GU-AG rule),此规律不适合于线粒体和叶绿体的内含子,也不适合于tRNA和某些编码rRNA的核结构基因,酵母的分支位点序列是高度
前剪接体和剪接体的分离及分析实验
实验方法原理 剪接体是由 RNA 和蛋白质构成的核糖核蛋白体（RNP)，它在前体 mRNA 的剪接过程中可去除前体 mRNA 的内含子。snRNP 是由 snRNA 及其结合蛋白组成，在前体 mRNA 的剪接过程起着重要作用。
第1类内含子自我剪接rRNA的自我剪接介绍
第1类内含子,其5’剪接点和3’剪接点的序列绝大部分为…外显子…U↓…内含子…G↓…外显子…,除了剪接点序列特征之外,第1类内含子还具有比较保守的4种10一12核苷酸的序列,分别以5’-P-Q-R-S-3’表示,P、Q、R、S的一致序列。序列能与Q序列互补,R序列能与S序列互补,形成一个所谓中部
前剪接体和剪接体的分离及分析实验
实验方法原理 剪接体是由 RNA 和蛋白质构成的核糖核蛋白体（RNP)，它在前体 mRNA 的剪接过程中可去除前体 mRNA 的内含子。snRNP 是由 snRNA 及其结合蛋白组成，在前体 mRNA 的剪接过程起着重要作用。实验材料 PIP 10 载体核苷酸焦磷酸酶RNasinT7 RNA 聚合酶
关于RNA剪接的简介
大多数脊椎动物基因的编码序列,无论是编码多肽的基因还是编码除mRNA以外的RNA分子的基因,都是由非编码的间隔序列(内含子)分隔为各个外显子部分。这些基因的外显子和内含子都转录在一条初级RNA转录分子中,接下来,此初级RNA转录分子要经过RNA剪接,此过程包括一系列的加工反应：RNA的内含子部分
概述RNA剪接的类型
RNA剪接及其机制的研究,不仅解决了不连续基因“连续”转录产物的问题,而且对于了解不连续基因的起源乃至整个生命起源与进化等问题,均产生极大的推动作用,另外,由此发现了核酸分子的催化功能,进一步拓宽了对于酶的认识。不连续基因中的介入序列称为内含子；被内含子隔开的基因序列称为外显子(exon)。一个
关于基因剪接的简介
基因组中或基因组间发生遗传信息的重新组合，被称为DNA重组（DNA recombination），其中发生在基因组中的DNA重组又称DNA重排。包括同源重组、特异位点重组和转座重组等类型，广泛存在于各类生物。体外通过人工DNA重组可获得重组体DNA，是基因工程中的关键步骤。
环形RNA可变反向剪接和可变剪接表达图谱被系统绘制
6月30日，国际学术期刊Genome Research 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所杨力研究组和生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于环形RNA研究的最新进展：Diverse alternative back-splicing and alternative spl
什么是蛋白质剪接？
蛋白质剪接是特定蛋白质的分子内反应，其中从前体蛋白质中去除内部蛋白质片段（称为内含肽），并在两侧连接C端和N端外部蛋白质（称为内含肽）。前体蛋白的剪接点主要是半胱氨酸或丝氨酸，它们是含有亲核侧链的氨基酸。现在已知的蛋白质剪接反应不需要外源性辅助因子或能源，如三磷酸腺苷(ATP)或三磷酸鸟苷(GTP)
关于RNA剪接的基本介绍
RNA剪接 （RNA splicing）是指从DNA模板链转录出的最初转录产物中除去内含子,并将外显子连接起来形成一个连续的RNA分子的过程。RNA剪接机制的研究,是80年代生物化学和分子生物学领域中最有生机的研究课题之一,它不仅解决不连续基因转录产物的剪接问题,而且对于了解不连续基因的起源乃至
关于RNA剪接的定义介绍
RNA剪接是真核细胞基因表达中非常重要的一个生物过程,通过RNA剪接,可以产生许多具有功能的,带有编码信息的mRNA,它对生物的发育及进化至关重要。所以RNA剪接识别是正确理解基因表达过程的重要一步,而剪接的识别的关键是依赖于剪接位点的判定。真核细胞pre-mRNA的剪接位点处存在一定的序列保守
蛋白质剪接的历史
xxx个内含肽是在1988年通过粗糙脉孢菌和胡萝卜液泡ATP酶（不含内含肽）与酵母中的同源基因（含内含肽）之间的序列比较而发现的，该基因最初被描述为推定的钙离子转运蛋白。1990年Hirata等人。证明酵母基因中的额外序列被转录成mRNA并仅在翻译后从宿主蛋白质中去除。从那时起，在生命的所有三个领域
Cell：剪接体与疾病
剪接体（Spliceosomes）是由RNA和蛋白分子组成，大小为60S的多组分复合物，这种机器能进行Pre-mRNA剪接，即把内含子去除并把外显子序列连接成为成熟的mRNA，这是基因表达与调控的重要环节之一。从作用机制上来看，剪接体作为动态分子机器，需要由亚基从头逐步组装组合，来完成每个剪接事
关于基因剪接的意义介绍
①参与DNA复制。 ②参与DNA修复。 ③参与基因表达调控。 ④在真核细胞分裂时促进染色体正确分离。 ⑤维持遗传多样性。 ⑥在胚胎发育过程中实现程序性基因重排 。
RNA剪接为什么会出错
“这项研究不仅提出了用小分子药物治疗维斯科特-奥尔德里奇综合征的新目标，而且为RNA剪切的基础生物学提供了新的线索，这是一个重要的但尚未完全被理解的过程，”共同通信作者Juan Carlos Izpisua Belmonte说，他是Salk基因表达实验室的教授和Roger Guillemin主席。患